MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012804	TATC	2	8	132357	132364	25 %	50 %	0 %	25 %	240102192
2502	NC_012804	TGC	2	6	132427	132432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102192
2503	NC_012804	GCC	2	6	132513	132518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102192
2504	NC_012804	GC	3	6	132771	132776	0 %	0 %	50 %	50 %	240102192
2505	NC_012804	CAG	2	6	132779	132784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102192
2506	NC_012804	TGT	2	6	132850	132855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102192
2507	NC_012804	TCC	2	6	132909	132914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102192
2508	NC_012804	GATG	2	8	133079	133086	25 %	25 %	50 %	0 %	240102192
2509	NC_012804	GGT	2	6	133305	133310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102193
2510	NC_012804	GAAA	2	8	133337	133344	75 %	0 %	25 %	0 %	240102193
2511	NC_012804	CAC	2	6	133443	133448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102193
2512	NC_012804	CGC	2	6	133456	133461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102193
2513	NC_012804	GAG	2	6	133551	133556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102193
2514	NC_012804	AAG	2	6	133605	133610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102193
2515	NC_012804	GAG	2	6	133682	133687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102193
2516	NC_012804	CTA	2	6	133771	133776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102193
2517	NC_012804	ATA	2	6	133812	133817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102193
2518	NC_012804	ACG	2	6	133897	133902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102193
2519	NC_012804	AAC	2	6	133956	133961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102193
2520	NC_012804	CTT	2	6	133977	133982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102193
2521	NC_012804	AAG	2	6	133983	133988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102193
2522	NC_012804	GAG	2	6	134007	134012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102193
2523	NC_012804	TGTT	2	8	134047	134054	0 %	75 %	25 %	0 %	240102193
2524	NC_012804	GTG	2	6	134164	134169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102194
2525	NC_012804	GGT	2	6	134202	134207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102194
2526	NC_012804	TTCT	2	8	134209	134216	0 %	75 %	0 %	25 %	240102194
2527	NC_012804	GGT	2	6	134274	134279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102194
2528	NC_012804	CTA	2	6	134307	134312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102194
2529	NC_012804	TTCGC	2	10	134342	134351	0 %	40 %	20 %	40 %	240102194
2530	NC_012804	CGG	2	6	134378	134383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102194
2531	NC_012804	TGA	2	6	134454	134459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102194
2532	NC_012804	TAT	2	6	134518	134523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102194
2533	NC_012804	TCAACG	2	12	134534	134545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	240102194
2534	NC_012804	TGG	2	6	134552	134557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102194
2535	NC_012804	CTT	2	6	134640	134645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102195
2536	NC_012804	AC	3	6	134675	134680	50 %	0 %	0 %	50 %	240102195
2537	NC_012804	AGG	2	6	134690	134695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102195
2538	NC_012804	TCA	2	6	134713	134718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102195
2539	NC_012804	TTA	2	6	134755	134760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102195
2540	NC_012804	TCG	2	6	134791	134796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102195
2541	NC_012804	CG	3	6	134980	134985	0 %	0 %	50 %	50 %	240102195
2542	NC_012804	GAAG	2	8	135275	135282	50 %	0 %	50 %	0 %	240102195
2543	NC_012804	CGT	2	6	135383	135388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102195
2544	NC_012804	CGA	2	6	135395	135400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102195
2545	NC_012804	CTT	2	6	135407	135412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102195
2546	NC_012804	CAG	2	6	135452	135457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102195
2547	NC_012804	CA	3	6	135496	135501	50 %	0 %	0 %	50 %	240102195
2548	NC_012804	CAA	3	9	135602	135610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102195
2549	NC_012804	ACG	2	6	135820	135825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102195
2550	NC_012804	ACG	2	6	135859	135864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102195
2551	NC_012804	GAC	2	6	135869	135874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102195
2552	NC_012804	CGA	2	6	135923	135928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102195
2553	NC_012804	GGA	2	6	135950	135955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102195
2554	NC_012804	TCC	2	6	135983	135988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102196
2555	NC_012804	CTC	2	6	135995	136000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102196
2556	NC_012804	CTC	2	6	136169	136174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102196
2557	NC_012804	TTC	2	6	136209	136214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102196
2558	NC_012804	ATT	2	6	136257	136262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102196
2559	NC_012804	TCC	2	6	136465	136470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102197
2560	NC_012804	GAT	2	6	136497	136502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102197
2561	NC_012804	CGC	2	6	136604	136609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102197
2562	NC_012804	TTA	2	6	136619	136624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102197
2563	NC_012804	TCA	2	6	136691	136696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102197
2564	NC_012804	TCCTC	2	10	136709	136718	0 %	40 %	0 %	60 %	240102197
2565	NC_012804	G	6	6	136733	136738	0 %	0 %	100 %	0 %	240102197
2566	NC_012804	CT	3	6	136794	136799	0 %	50 %	0 %	50 %	240102197
2567	NC_012804	ATT	2	6	136801	136806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102197
2568	NC_012804	TCC	2	6	136909	136914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102197
2569	NC_012804	ACC	2	6	136954	136959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102197
2570	NC_012804	TCG	2	6	137020	137025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102197
2571	NC_012804	T	6	6	137118	137123	0 %	100 %	0 %	0 %	240102197
2572	NC_012804	ATT	2	6	137167	137172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102197
2573	NC_012804	GGA	2	6	137361	137366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102198
2574	NC_012804	TCA	2	6	137369	137374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102198
2575	NC_012804	TTG	2	6	137381	137386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102198
2576	NC_012804	AAG	2	6	137396	137401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102198
2577	NC_012804	GAG	3	9	137479	137487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102198
2578	NC_012804	ATC	2	6	137488	137493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102198
2579	NC_012804	TCG	2	6	137522	137527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102198
2580	NC_012804	AAGG	2	8	137539	137546	50 %	0 %	50 %	0 %	240102198
2581	NC_012804	AGG	2	6	137552	137557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102198
2582	NC_012804	GAG	2	6	137593	137598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102198
2583	NC_012804	CCGG	2	8	137678	137685	0 %	0 %	50 %	50 %	240102199
2584	NC_012804	GA	3	6	137718	137723	50 %	0 %	50 %	0 %	240102199
2585	NC_012804	AGGGG	2	10	137895	137904	20 %	0 %	80 %	0 %	240102199
2586	NC_012804	G	6	6	137901	137906	0 %	0 %	100 %	0 %	240102199
2587	NC_012804	GA	3	6	137937	137942	50 %	0 %	50 %	0 %	240102199
2588	NC_012804	CCCT	2	8	138186	138193	0 %	25 %	0 %	75 %	240102199
2589	NC_012804	GAG	2	6	138198	138203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102199
2590	NC_012804	CTC	2	6	138206	138211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102199
2591	NC_012804	CTC	2	6	138375	138380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102199
2592	NC_012804	TAC	2	6	138462	138467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102199
2593	NC_012804	TCT	2	6	138478	138483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102199
2594	NC_012804	CAA	2	6	138509	138514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102199
2595	NC_012804	GAG	2	6	138579	138584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102199
2596	NC_012804	AAG	2	6	138591	138596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102199
2597	NC_012804	GAG	2	6	138600	138605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102199
2598	NC_012804	AACG	2	8	138620	138627	50 %	0 %	25 %	25 %	240102199
2599	NC_012804	AAG	2	6	138648	138653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102199
2600	NC_012804	AAG	2	6	138657	138662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102199
2601	NC_012804	GAG	2	6	138672	138677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102199
2602	NC_012804	ACG	2	6	138754	138759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102199
2603	NC_012804	TTC	3	9	138798	138806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102199
2604	NC_012804	TCG	2	6	138841	138846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102199
2605	NC_012804	AAG	2	6	138879	138884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102199
2606	NC_012804	ACG	2	6	138889	138894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102199
2607	NC_012804	CCTTGC	2	12	139076	139087	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	240102199
2608	NC_012804	GAA	2	6	139142	139147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102199
2609	NC_012804	CT	3	6	139232	139237	0 %	50 %	0 %	50 %	240102199
2610	NC_012804	AGC	2	6	139316	139321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102199
2611	NC_012804	GCT	2	6	139322	139327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102199
2612	NC_012804	CTT	2	6	139340	139345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102199
2613	NC_012804	CTGGCA	2	12	139389	139400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	240102199
2614	NC_012804	TCA	2	6	139420	139425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102199
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2616	NC_012804	GTT	2	6	139514	139519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102199
2617	NC_012804	CT	3	6	139556	139561	0 %	50 %	0 %	50 %	240102199
2618	NC_012804	GAG	2	6	139634	139639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102199
2619	NC_012804	GAG	2	6	139678	139683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102199
2620	NC_012804	GCC	2	6	139725	139730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102200
2621	NC_012804	CGG	2	6	139735	139740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102200
2622	NC_012804	CTGG	2	8	139743	139750	0 %	25 %	50 %	25 %	240102200
2623	NC_012804	TGC	2	6	139784	139789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102200
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2654	NC_012804	GGA	2	6	141311	141316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102202
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2734	NC_012804	AAG	2	6	144874	144879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102205
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2742	NC_012804	CGC	2	6	145113	145118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102205
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2859	NC_012804	ACG	3	9	150627	150635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102211
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2988	NC_012804	CGA	2	6	157488	157493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102217
2989	NC_012804	GAC	2	6	157501	157506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102217
2990	NC_012804	TGA	2	6	157566	157571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102217
2991	NC_012804	CGA	2	6	157605	157610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102217
2992	NC_012804	CGA	2	6	157644	157649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102217
2993	NC_012804	CTT	2	6	157741	157746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102217
2994	NC_012804	GAC	2	6	157822	157827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102217
2995	NC_012804	CCT	2	6	157839	157844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102217
2996	NC_012804	CTC	2	6	157876	157881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102217
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2998	NC_012804	GCT	2	6	157902	157907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102217
2999	NC_012804	TCGGTC	2	12	157934	157945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102217
3000	NC_012804	TGA	2	6	157968	157973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102217

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