MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_012804	CTA	2	6	1590618	1590623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103743
29002	NC_012804	CGA	2	6	1590791	1590796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103744
29003	NC_012804	TCCCC	2	10	1591061	1591070	0 %	20 %	0 %	80 %	240103744
29004	NC_012804	AAG	2	6	1591084	1591089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103744
29005	NC_012804	TCG	2	6	1591100	1591105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103744
29006	NC_012804	GAAA	2	8	1591124	1591131	75 %	0 %	25 %	0 %	240103744
29007	NC_012804	AGG	2	6	1591166	1591171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103744
29008	NC_012804	CG	3	6	1591214	1591219	0 %	0 %	50 %	50 %	240103744
29009	NC_012804	ACA	2	6	1591268	1591273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103744
29010	NC_012804	GA	4	8	1591276	1591283	50 %	0 %	50 %	0 %	240103744
29011	NC_012804	TTG	2	6	1591415	1591420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103744
29012	NC_012804	AGG	2	6	1591980	1591985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103745
29013	NC_012804	GA	3	6	1592077	1592082	50 %	0 %	50 %	0 %	240103745
29014	NC_012804	TCA	2	6	1592121	1592126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103745
29015	NC_012804	AGGA	2	8	1592147	1592154	50 %	0 %	50 %	0 %	240103745
29016	NC_012804	GAG	3	9	1592225	1592233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103745
29017	NC_012804	CTA	2	6	1592254	1592259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103745
29018	NC_012804	AGG	2	6	1592270	1592275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103745
29019	NC_012804	TCA	2	6	1592277	1592282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103745
29020	NC_012804	GAG	2	6	1592291	1592296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103745
29021	NC_012804	ACA	2	6	1592325	1592330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103745
29022	NC_012804	AGA	2	6	1592358	1592363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103745
29023	NC_012804	AAG	2	6	1592369	1592374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103745
29024	NC_012804	AGGA	2	8	1592544	1592551	50 %	0 %	50 %	0 %	240103746
29025	NC_012804	CCAG	2	8	1592642	1592649	25 %	0 %	25 %	50 %	240103746
29026	NC_012804	CCG	3	9	1592683	1592691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103746
29027	NC_012804	CAT	2	6	1592729	1592734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103746
29028	NC_012804	GAA	2	6	1592756	1592761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103746
29029	NC_012804	CGA	2	6	1592780	1592785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103746
29030	NC_012804	AGG	2	6	1592812	1592817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29031	NC_012804	GAA	2	6	1592819	1592824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103746
29032	NC_012804	TCG	2	6	1592869	1592874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103746
29033	NC_012804	CAG	2	6	1592885	1592890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103746
29034	NC_012804	TCG	2	6	1592893	1592898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103746
29035	NC_012804	CGT	2	6	1592906	1592911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103746
29036	NC_012804	AGG	2	6	1593040	1593045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29037	NC_012804	GAT	2	6	1593122	1593127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103746
29038	NC_012804	CCG	2	6	1593204	1593209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103746
29039	NC_012804	CCT	2	6	1593224	1593229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103746
29040	NC_012804	TAC	2	6	1593300	1593305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103746
29041	NC_012804	GAG	2	6	1593315	1593320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29042	NC_012804	AG	3	6	1593327	1593332	50 %	0 %	50 %	0 %	240103746
29043	NC_012804	AGG	2	6	1593340	1593345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29044	NC_012804	AGA	2	6	1593347	1593352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103746
29045	NC_012804	CGA	2	6	1593377	1593382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103746
29046	NC_012804	GTT	2	6	1593438	1593443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103746
29047	NC_012804	CAAC	2	8	1593505	1593512	50 %	0 %	0 %	50 %	240103746
29048	NC_012804	AGG	2	6	1593540	1593545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29049	NC_012804	GCAGG	2	10	1593590	1593599	20 %	0 %	60 %	20 %	240103746
29050	NC_012804	AC	3	6	1593617	1593622	50 %	0 %	0 %	50 %	240103746
29051	NC_012804	AGG	2	6	1593651	1593656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29052	NC_012804	GAG	3	9	1593753	1593761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29053	NC_012804	ACG	2	6	1593799	1593804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103746
29054	NC_012804	CTG	2	6	1593831	1593836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103746
29055	NC_012804	GAG	2	6	1593837	1593842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29056	NC_012804	TCAC	2	8	1593853	1593860	25 %	25 %	0 %	50 %	240103746
29057	NC_012804	AG	3	6	1593894	1593899	50 %	0 %	50 %	0 %	240103746
29058	NC_012804	GCG	2	6	1593900	1593905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103746
29059	NC_012804	AGG	2	6	1593918	1593923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29060	NC_012804	TCA	2	6	1593925	1593930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103746
29061	NC_012804	AGG	2	6	1593931	1593936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29062	NC_012804	TCC	2	6	1594054	1594059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103746
29063	NC_012804	GAC	2	6	1594083	1594088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103746
29064	NC_012804	CCG	2	6	1594182	1594187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103746
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29066	NC_012804	GCGAGA	2	12	1594312	1594323	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	240103746
29067	NC_012804	TCA	2	6	1594444	1594449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103746
29068	NC_012804	CTGA	2	8	1594458	1594465	25 %	25 %	25 %	25 %	240103746
29069	NC_012804	GATG	2	8	1594466	1594473	25 %	25 %	50 %	0 %	240103746
29070	NC_012804	GTC	3	9	1594494	1594502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103746
29071	NC_012804	CCA	2	6	1594510	1594515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103746
29072	NC_012804	GGA	2	6	1594646	1594651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29073	NC_012804	GAG	2	6	1594662	1594667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29074	NC_012804	GTG	2	6	1594713	1594718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103746
29075	NC_012804	AG	3	6	1594719	1594724	50 %	0 %	50 %	0 %	240103746
29076	NC_012804	GAG	2	6	1594742	1594747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
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29078	NC_012804	CAT	2	6	1594763	1594768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103746
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29082	NC_012804	GAG	2	6	1594830	1594835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103746
29083	NC_012804	GAA	2	6	1594841	1594846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103746
29084	NC_012804	TAC	2	6	1594881	1594886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103746
29085	NC_012804	CG	3	6	1594915	1594920	0 %	0 %	50 %	50 %	240103746
29086	NC_012804	GAT	2	6	1595083	1595088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103747
29087	NC_012804	TGG	2	6	1595121	1595126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103747
29088	NC_012804	TCAGG	2	10	1595140	1595149	20 %	20 %	40 %	20 %	240103747
29089	NC_012804	ATA	2	6	1595183	1595188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103747
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29091	NC_012804	GA	3	6	1595258	1595263	50 %	0 %	50 %	0 %	240103747
29092	NC_012804	ACTC	2	8	1595421	1595428	25 %	25 %	0 %	50 %	240103748
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29095	NC_012804	AG	3	6	1595851	1595856	50 %	0 %	50 %	0 %	240103749
29096	NC_012804	ATC	2	6	1595954	1595959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103750
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29098	NC_012804	GA	4	8	1595972	1595979	50 %	0 %	50 %	0 %	240103750
29099	NC_012804	TC	3	6	1595991	1595996	0 %	50 %	0 %	50 %	240103750
29100	NC_012804	CGT	2	6	1595999	1596004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103750
29101	NC_012804	ACC	2	6	1596013	1596018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103750
29102	NC_012804	TTC	2	6	1596066	1596071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103750
29103	NC_012804	ACC	2	6	1596088	1596093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103750
29104	NC_012804	GAGC	2	8	1596106	1596113	25 %	0 %	50 %	25 %	240103750
29105	NC_012804	T	6	6	1596134	1596139	0 %	100 %	0 %	0 %	240103750
29106	NC_012804	CT	3	6	1596231	1596236	0 %	50 %	0 %	50 %	240103750
29107	NC_012804	TCAA	2	8	1596238	1596245	50 %	25 %	0 %	25 %	240103750
29108	NC_012804	TCA	2	6	1596262	1596267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103750
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29110	NC_012804	TCT	2	6	1596443	1596448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103750
29111	NC_012804	CTC	2	6	1596449	1596454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103750
29112	NC_012804	CTT	2	6	1596468	1596473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103750
29113	NC_012804	CTC	2	6	1596477	1596482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103750
29114	NC_012804	TCG	2	6	1596535	1596540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103750
29115	NC_012804	TTAG	2	8	1596565	1596572	25 %	50 %	25 %	0 %	240103750
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29117	NC_012804	GTC	2	6	1596760	1596765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103751
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29234	NC_012804	CTCC	2	8	1602748	1602755	0 %	25 %	0 %	75 %	240103756
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29351	NC_012804	TCG	2	6	1609768	1609773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103761
29352	NC_012804	AGC	2	6	1609842	1609847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103761
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29456	NC_012804	TCAG	2	8	1614801	1614808	25 %	25 %	25 %	25 %	240103766
29457	NC_012804	A	6	6	1614847	1614852	100 %	0 %	0 %	0 %	240103766
29458	NC_012804	TGG	2	6	1614880	1614885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103766
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29465	NC_012804	GAC	2	6	1615142	1615147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103767
29466	NC_012804	AGG	2	6	1615170	1615175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103767
29467	NC_012804	CCCT	2	8	1615204	1615211	0 %	25 %	0 %	75 %	240103767
29468	NC_012804	CTT	2	6	1615304	1615309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103767
29469	NC_012804	TCT	2	6	1615558	1615563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103768
29470	NC_012804	CT	3	6	1615624	1615629	0 %	50 %	0 %	50 %	240103768
29471	NC_012804	TCC	2	6	1615651	1615656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103768
29472	NC_012804	CTC	2	6	1615715	1615720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103768
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29474	NC_012804	TCC	2	6	1615758	1615763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103768
29475	NC_012804	CGGG	2	8	1615780	1615787	0 %	0 %	75 %	25 %	240103768
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29493	NC_012804	CGA	2	6	1616770	1616775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103768
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29497	NC_012804	AGG	2	6	1616976	1616981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103768
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