MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_012804	GAA	2	6	1563806	1563811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103714
28502	NC_012804	AAG	2	6	1563994	1563999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103715
28503	NC_012804	AG	3	6	1564023	1564028	50 %	0 %	50 %	0 %	240103715
28504	NC_012804	AAG	2	6	1564081	1564086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103715
28505	NC_012804	CCGCGT	2	12	1564107	1564118	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	240103715
28506	NC_012804	CTCAA	2	10	1564150	1564159	40 %	20 %	0 %	40 %	240103715
28507	NC_012804	CAG	2	6	1564192	1564197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103715
28508	NC_012804	ATC	2	6	1564282	1564287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103715
28509	NC_012804	TCG	2	6	1564313	1564318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103715
28510	NC_012804	CTC	2	6	1564333	1564338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103715
28511	NC_012804	GAG	2	6	1564360	1564365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103715
28512	NC_012804	CTC	2	6	1564366	1564371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103715
28513	NC_012804	TCG	2	6	1564388	1564393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103715
28514	NC_012804	ACA	2	6	1564397	1564402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103715
28515	NC_012804	GAG	2	6	1564411	1564416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103715
28516	NC_012804	CTC	2	6	1564444	1564449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103715
28517	NC_012804	GCC	2	6	1564519	1564524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103715
28518	NC_012804	CCTC	2	8	1564551	1564558	0 %	25 %	0 %	75 %	240103715
28519	NC_012804	GAG	2	6	1564609	1564614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103715
28520	NC_012804	CGT	2	6	1564629	1564634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103715
28521	NC_012804	TAA	2	6	1564709	1564714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103715
28522	NC_012804	AAC	2	6	1564780	1564785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103715
28523	NC_012804	AG	3	6	1564788	1564793	50 %	0 %	50 %	0 %	240103715
28524	NC_012804	TAG	2	6	1564805	1564810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103715
28525	NC_012804	AGGG	2	8	1564903	1564910	25 %	0 %	75 %	0 %	240103715
28526	NC_012804	CTC	2	6	1565005	1565010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103715
28527	NC_012804	AAGG	2	8	1565011	1565018	50 %	0 %	50 %	0 %	240103715
28528	NC_012804	GGC	2	6	1565056	1565061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103715
28529	NC_012804	CGA	3	9	1565148	1565156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103715
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28531	NC_012804	TAC	2	6	1565206	1565211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103715
28532	NC_012804	TAC	2	6	1565218	1565223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103715
28533	NC_012804	CG	4	8	1565266	1565273	0 %	0 %	50 %	50 %	240103715
28534	NC_012804	CTT	2	6	1565404	1565409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103716
28535	NC_012804	GAG	2	6	1565452	1565457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103716
28536	NC_012804	TAA	2	6	1565540	1565545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103716
28537	NC_012804	TCCC	2	8	1565591	1565598	0 %	25 %	0 %	75 %	240103716
28538	NC_012804	TGGA	2	8	1565731	1565738	25 %	25 %	50 %	0 %	240103716
28539	NC_012804	TCG	2	6	1565741	1565746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103716
28540	NC_012804	ACGA	2	8	1565834	1565841	50 %	0 %	25 %	25 %	240103716
28541	NC_012804	GAA	2	6	1565851	1565856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103716
28542	NC_012804	TCCG	2	8	1565873	1565880	0 %	25 %	25 %	50 %	240103716
28543	NC_012804	GAT	2	6	1565917	1565922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103716
28544	NC_012804	CAA	2	6	1566211	1566216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103717
28545	NC_012804	GA	3	6	1566281	1566286	50 %	0 %	50 %	0 %	240103717
28546	NC_012804	GATG	2	8	1566298	1566305	25 %	25 %	50 %	0 %	240103717
28547	NC_012804	GAC	3	9	1566338	1566346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103717
28548	NC_012804	CGA	2	6	1566352	1566357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103717
28549	NC_012804	GAA	2	6	1566364	1566369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103717
28550	NC_012804	TCC	2	6	1566434	1566439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103717
28551	NC_012804	AG	3	6	1566458	1566463	50 %	0 %	50 %	0 %	240103717
28552	NC_012804	GTG	2	6	1566482	1566487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103717
28553	NC_012804	G	6	6	1566586	1566591	0 %	0 %	100 %	0 %	240103717
28554	NC_012804	ACTGGT	2	12	1566603	1566614	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	240103717
28555	NC_012804	AGGC	2	8	1566649	1566656	25 %	0 %	50 %	25 %	240103717
28556	NC_012804	G	6	6	1566675	1566680	0 %	0 %	100 %	0 %	240103717
28557	NC_012804	GTC	2	6	1566722	1566727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103717
28558	NC_012804	TCA	2	6	1566777	1566782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103717
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28562	NC_012804	CGC	2	6	1567135	1567140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103717
28563	NC_012804	TCA	2	6	1567239	1567244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103717
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28566	NC_012804	GCC	2	6	1567332	1567337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103718
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28571	NC_012804	CG	3	6	1567843	1567848	0 %	0 %	50 %	50 %	240103718
28572	NC_012804	GAG	2	6	1567889	1567894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103718
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28584	NC_012804	CACC	2	8	1568359	1568366	25 %	0 %	0 %	75 %	240103718
28585	NC_012804	CTT	2	6	1568419	1568424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103718
28586	NC_012804	TCTG	2	8	1568434	1568441	0 %	50 %	25 %	25 %	240103718
28587	NC_012804	GCC	2	6	1568442	1568447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103718
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28598	NC_012804	TTCCC	2	10	1568854	1568863	0 %	40 %	0 %	60 %	240103718
28599	NC_012804	C	6	6	1568880	1568885	0 %	0 %	0 %	100 %	240103718
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28616	NC_012804	GTA	2	6	1569232	1569237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103719
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28618	NC_012804	GTC	2	6	1569256	1569261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103719
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