MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28004	NC_012804	ACT	2	6	1537195	1537200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103686
28005	NC_012804	TGA	2	6	1537355	1537360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103686
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28007	NC_012804	GAG	2	6	1537446	1537451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103686
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28009	NC_012804	GCC	2	6	1537524	1537529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103686
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28012	NC_012804	GGA	2	6	1537616	1537621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103686
28013	NC_012804	GA	3	6	1537626	1537631	50 %	0 %	50 %	0 %	240103686
28014	NC_012804	GAA	2	6	1537661	1537666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103686
28015	NC_012804	TAC	2	6	1537725	1537730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103686
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28019	NC_012804	CTT	2	6	1537815	1537820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103686
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28031	NC_012804	TGA	2	6	1538570	1538575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103686
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28232	NC_012804	GAAG	2	8	1549537	1549544	50 %	0 %	50 %	0 %	240103698
28233	NC_012804	TCA	2	6	1549594	1549599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103698
28234	NC_012804	CAT	2	6	1549639	1549644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103698
28235	NC_012804	GCA	2	6	1549780	1549785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103698
28236	NC_012804	CATCCT	2	12	1549825	1549836	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	240103698
28237	NC_012804	C	6	6	1549860	1549865	0 %	0 %	0 %	100 %	240103698
28238	NC_012804	AAT	2	6	1549921	1549926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103698
28239	NC_012804	TCA	2	6	1549929	1549934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103698
28240	NC_012804	ACCG	2	8	1549964	1549971	25 %	0 %	25 %	50 %	240103698
28241	NC_012804	C	6	6	1550028	1550033	0 %	0 %	0 %	100 %	240103698
28242	NC_012804	CTC	2	6	1550036	1550041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103698
28243	NC_012804	GAT	2	6	1550047	1550052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103698
28244	NC_012804	GTG	2	6	1550066	1550071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103698
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28247	NC_012804	CCA	2	6	1550318	1550323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103698
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28252	NC_012804	GTGA	2	8	1550877	1550884	25 %	25 %	50 %	0 %	240103698
28253	NC_012804	CTC	2	6	1550967	1550972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103699
28254	NC_012804	G	6	6	1551017	1551022	0 %	0 %	100 %	0 %	240103699
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28260	NC_012804	C	6	6	1551390	1551395	0 %	0 %	0 %	100 %	240103699
28261	NC_012804	TC	3	6	1551428	1551433	0 %	50 %	0 %	50 %	240103699
28262	NC_012804	TCA	2	6	1551442	1551447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103699
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28334	NC_012804	GAAA	2	8	1555195	1555202	75 %	0 %	25 %	0 %	240103704
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28336	NC_012804	TAT	2	6	1555272	1555277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103705
28337	NC_012804	CCCT	2	8	1555300	1555307	0 %	25 %	0 %	75 %	240103705
28338	NC_012804	TGA	2	6	1555361	1555366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103705
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28341	NC_012804	GACGT	2	10	1555465	1555474	20 %	20 %	40 %	20 %	240103705
28342	NC_012804	TCCC	2	8	1555504	1555511	0 %	25 %	0 %	75 %	240103705
28343	NC_012804	GA	4	8	1555770	1555777	50 %	0 %	50 %	0 %	240103706
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28345	NC_012804	C	6	6	1555881	1555886	0 %	0 %	0 %	100 %	240103706
28346	NC_012804	TGA	2	6	1556098	1556103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103706
28347	NC_012804	TCC	2	6	1556125	1556130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103706
28348	NC_012804	GTC	2	6	1556214	1556219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103706
28349	NC_012804	GGC	2	6	1556247	1556252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103706
28350	NC_012804	TAC	2	6	1556253	1556258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103706
28351	NC_012804	ATA	2	6	1556280	1556285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103706
28352	NC_012804	GAA	2	6	1556444	1556449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103706
28353	NC_012804	AG	3	6	1556532	1556537	50 %	0 %	50 %	0 %	240103706
28354	NC_012804	GAACG	2	10	1556573	1556582	40 %	0 %	40 %	20 %	240103706
28355	NC_012804	GGA	2	6	1556618	1556623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103706
28356	NC_012804	GGGA	2	8	1556707	1556714	25 %	0 %	75 %	0 %	240103706
28357	NC_012804	CTAC	2	8	1556735	1556742	25 %	25 %	0 %	50 %	240103706
28358	NC_012804	GAG	2	6	1556770	1556775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103707
28359	NC_012804	GTC	2	6	1557103	1557108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103707
28360	NC_012804	AG	3	6	1557116	1557121	50 %	0 %	50 %	0 %	240103707
28361	NC_012804	CGA	2	6	1557153	1557158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103707
28362	NC_012804	GTT	2	6	1557266	1557271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103708
28363	NC_012804	TG	3	6	1557283	1557288	0 %	50 %	50 %	0 %	240103708
28364	NC_012804	GTG	2	6	1557293	1557298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103708
28365	NC_012804	GTT	2	6	1557305	1557310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103708
28366	NC_012804	AAT	2	6	1557316	1557321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103708
28367	NC_012804	CCTCGC	2	12	1557322	1557333	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	240103708
28368	NC_012804	TACC	2	8	1557346	1557353	25 %	25 %	0 %	50 %	240103708
28369	NC_012804	GCT	2	6	1557367	1557372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103708
28370	NC_012804	GCC	2	6	1557395	1557400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103708
28371	NC_012804	ATA	2	6	1557416	1557421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103708
28372	NC_012804	TC	3	6	1557427	1557432	0 %	50 %	0 %	50 %	240103708
28373	NC_012804	ACG	2	6	1557468	1557473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103708
28374	NC_012804	TCC	2	6	1557536	1557541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103708
28375	NC_012804	CTA	2	6	1557667	1557672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103708
28376	NC_012804	GGA	2	6	1557691	1557696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103708
28377	NC_012804	GGGA	2	8	1557701	1557708	25 %	0 %	75 %	0 %	240103708
28378	NC_012804	CCT	2	6	1557718	1557723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103708
28379	NC_012804	AGGA	2	8	1557734	1557741	50 %	0 %	50 %	0 %	240103708
28380	NC_012804	GCC	2	6	1557764	1557769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103708
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28382	NC_012804	CCTTC	2	10	1557916	1557925	0 %	40 %	0 %	60 %	240103708
28383	NC_012804	TGGC	2	8	1557931	1557938	0 %	25 %	50 %	25 %	240103708
28384	NC_012804	C	6	6	1558029	1558034	0 %	0 %	0 %	100 %	240103708
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28407	NC_012804	CTGG	2	8	1559112	1559119	0 %	25 %	50 %	25 %	240103709
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28422	NC_012804	GGA	2	6	1560226	1560231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103711
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28433	NC_012804	CTG	2	6	1560926	1560931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103712
28434	NC_012804	ATG	2	6	1560953	1560958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103712
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28437	NC_012804	GA	4	8	1561133	1561140	50 %	0 %	50 %	0 %	240103712
28438	NC_012804	ACA	2	6	1561200	1561205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103712
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28442	NC_012804	TGAC	2	8	1561353	1561360	25 %	25 %	25 %	25 %	240103712
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28444	NC_012804	GAGG	2	8	1561430	1561437	25 %	0 %	75 %	0 %	240103712
28445	NC_012804	ACGT	2	8	1561463	1561470	25 %	25 %	25 %	25 %	240103712
28446	NC_012804	GCT	2	6	1561491	1561496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103712
28447	NC_012804	TCAA	2	8	1561529	1561536	50 %	25 %	0 %	25 %	240103712
28448	NC_012804	GAA	2	6	1561537	1561542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103712
28449	NC_012804	TGA	2	6	1561560	1561565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103712
28450	NC_012804	TCC	2	6	1561608	1561613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103712
28451	NC_012804	TGA	2	6	1561628	1561633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103712
28452	NC_012804	GAT	2	6	1561635	1561640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103713
28453	NC_012804	AAAG	2	8	1561707	1561714	75 %	0 %	25 %	0 %	240103713
28454	NC_012804	CAC	2	6	1561758	1561763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103713
28455	NC_012804	AAG	3	9	1561873	1561881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103713
28456	NC_012804	CAT	2	6	1561944	1561949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103713
28457	NC_012804	GA	3	6	1561978	1561983	50 %	0 %	50 %	0 %	240103713
28458	NC_012804	AGG	2	6	1561987	1561992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103713
28459	NC_012804	AG	3	6	1561996	1562001	50 %	0 %	50 %	0 %	240103713
28460	NC_012804	CTC	2	6	1562011	1562016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103713
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28462	NC_012804	CTC	2	6	1562077	1562082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103713
28463	NC_012804	TAA	2	6	1562096	1562101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103713
28464	NC_012804	CTC	2	6	1562113	1562118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103713
28465	NC_012804	ATA	2	6	1562176	1562181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103713
28466	NC_012804	AGG	2	6	1562182	1562187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103713
28467	NC_012804	AGA	2	6	1562189	1562194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103713
28468	NC_012804	AGG	2	6	1562195	1562200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103713
28469	NC_012804	TCT	2	6	1562213	1562218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103713
28470	NC_012804	GAG	2	6	1562242	1562247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103713
28471	NC_012804	ACA	2	6	1562306	1562311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103713
28472	NC_012804	CCAA	2	8	1562413	1562420	50 %	0 %	0 %	50 %	240103713
28473	NC_012804	TCC	2	6	1562492	1562497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103713
28474	NC_012804	AGA	2	6	1562523	1562528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103713
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28477	NC_012804	CTC	2	6	1562580	1562585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103714
28478	NC_012804	TTTC	2	8	1562587	1562594	0 %	75 %	0 %	25 %	240103714
28479	NC_012804	TCG	2	6	1562603	1562608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103714
28480	NC_012804	CCG	2	6	1562642	1562647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103714
28481	NC_012804	GTC	2	6	1562739	1562744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103714
28482	NC_012804	TCA	2	6	1562761	1562766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103714
28483	NC_012804	ACG	2	6	1562773	1562778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103714
28484	NC_012804	GCCGTC	2	12	1562826	1562837	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	240103714
28485	NC_012804	CCT	2	6	1562881	1562886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103714
28486	NC_012804	TCA	2	6	1563016	1563021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103714
28487	NC_012804	GAC	2	6	1563042	1563047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103714
28488	NC_012804	TCC	2	6	1563168	1563173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103714
28489	NC_012804	GCTC	2	8	1563209	1563216	0 %	25 %	25 %	50 %	240103714
28490	NC_012804	TAG	2	6	1563260	1563265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103714
28491	NC_012804	AGA	2	6	1563277	1563282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103714
28492	NC_012804	CGA	3	9	1563296	1563304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103714
28493	NC_012804	CTC	2	6	1563318	1563323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103714
28494	NC_012804	TCT	2	6	1563389	1563394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103714
28495	NC_012804	CAT	2	6	1563405	1563410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103714
28496	NC_012804	CCG	2	6	1563481	1563486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103714
28497	NC_012804	AAG	2	6	1563519	1563524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103714
28498	NC_012804	TTC	2	6	1563544	1563549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103714
28499	NC_012804	GAG	2	6	1563583	1563588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103714
28500	NC_012804	TCA	2	6	1563793	1563798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103714

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