MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_012804	GGAA	2	8	1512471	1512478	50 %	0 %	50 %	0 %	240103663
27502	NC_012804	CGA	3	9	1512517	1512525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103663
27503	NC_012804	CTA	2	6	1512565	1512570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103663
27504	NC_012804	AGA	2	6	1512722	1512727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103663
27505	NC_012804	GAG	2	6	1512796	1512801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103663
27506	NC_012804	GTTC	2	8	1512807	1512814	0 %	50 %	25 %	25 %	240103664
27507	NC_012804	GAG	2	6	1512891	1512896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103664
27508	NC_012804	CGT	2	6	1512999	1513004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103664
27509	NC_012804	GAG	2	6	1513006	1513011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103664
27510	NC_012804	CCTTC	2	10	1513041	1513050	0 %	40 %	0 %	60 %	240103664
27511	NC_012804	CTC	2	6	1513094	1513099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103664
27512	NC_012804	ACT	2	6	1513154	1513159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103664
27513	NC_012804	GTCGAG	2	12	1513174	1513185	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	240103664
27514	NC_012804	TAA	2	6	1513187	1513192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103664
27515	NC_012804	TCG	2	6	1513289	1513294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103664
27516	NC_012804	AGA	2	6	1513349	1513354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103664
27517	NC_012804	AGG	2	6	1513394	1513399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103664
27518	NC_012804	AGG	2	6	1513527	1513532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103665
27519	NC_012804	ATC	2	6	1513577	1513582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103665
27520	NC_012804	GA	3	6	1513630	1513635	50 %	0 %	50 %	0 %	240103665
27521	NC_012804	GCTC	2	8	1513656	1513663	0 %	25 %	25 %	50 %	240103665
27522	NC_012804	GGA	2	6	1513689	1513694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103665
27523	NC_012804	CGG	2	6	1513711	1513716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103665
27524	NC_012804	ATG	2	6	1513739	1513744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103665
27525	NC_012804	GAC	2	6	1513789	1513794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103665
27526	NC_012804	AGG	2	6	1513857	1513862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103665
27527	NC_012804	GAA	2	6	1513918	1513923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103665
27528	NC_012804	GTC	2	6	1513988	1513993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103665
27529	NC_012804	CAGC	2	8	1514080	1514087	25 %	0 %	25 %	50 %	240103665
27530	NC_012804	GAC	2	6	1514122	1514127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103665
27531	NC_012804	GGA	2	6	1514131	1514136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103665
27532	NC_012804	CGG	2	6	1514325	1514330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103665
27533	NC_012804	G	6	6	1514365	1514370	0 %	0 %	100 %	0 %	240103665
27534	NC_012804	GCG	2	6	1514372	1514377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103665
27535	NC_012804	GGA	2	6	1514443	1514448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103665
27536	NC_012804	GAGGGA	2	12	1514455	1514466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103665
27537	NC_012804	AGG	2	6	1514510	1514515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103665
27538	NC_012804	CAC	2	6	1514686	1514691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103666
27539	NC_012804	GGA	2	6	1514697	1514702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103666
27540	NC_012804	GAG	2	6	1514722	1514727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103666
27541	NC_012804	GAC	2	6	1514785	1514790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103666
27542	NC_012804	GCTGA	2	10	1514839	1514848	20 %	20 %	40 %	20 %	240103666
27543	NC_012804	GAG	2	6	1514863	1514868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103666
27544	NC_012804	GC	3	6	1514911	1514916	0 %	0 %	50 %	50 %	240103666
27545	NC_012804	CTA	2	6	1514927	1514932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103666
27546	NC_012804	CAC	2	6	1514965	1514970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103666
27547	NC_012804	CTG	2	6	1515055	1515060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103666
27548	NC_012804	GAG	2	6	1515233	1515238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103667
27549	NC_012804	ACG	2	6	1515259	1515264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103667
27550	NC_012804	CTC	2	6	1515300	1515305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103667
27551	NC_012804	GAG	2	6	1515318	1515323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103667
27552	NC_012804	TACTTC	2	12	1515462	1515473	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	240103667
27553	NC_012804	CTA	2	6	1515482	1515487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103667
27554	NC_012804	AGG	2	6	1515499	1515504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103667
27555	NC_012804	GGT	2	6	1515548	1515553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103667
27556	NC_012804	TCCA	2	8	1515598	1515605	25 %	25 %	0 %	50 %	240103667
27557	NC_012804	CGGA	2	8	1515614	1515621	25 %	0 %	50 %	25 %	240103667
27558	NC_012804	AGG	2	6	1515648	1515653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103667
27559	NC_012804	GGA	2	6	1515691	1515696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103668
27560	NC_012804	GAA	2	6	1515720	1515725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103668
27561	NC_012804	AGTT	2	8	1515779	1515786	25 %	50 %	25 %	0 %	240103668
27562	NC_012804	CGT	2	6	1515798	1515803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103668
27563	NC_012804	CGG	3	9	1515891	1515899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103668
27564	NC_012804	GAG	2	6	1515903	1515908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103668
27565	NC_012804	AG	3	6	1515921	1515926	50 %	0 %	50 %	0 %	240103668
27566	NC_012804	CTCGA	2	10	1516030	1516039	20 %	20 %	20 %	40 %	240103668
27567	NC_012804	GGCT	2	8	1516063	1516070	0 %	25 %	50 %	25 %	240103668
27568	NC_012804	GGGAC	2	10	1516151	1516160	20 %	0 %	60 %	20 %	240103668
27569	NC_012804	GAG	2	6	1516201	1516206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103668
27570	NC_012804	CGT	2	6	1516242	1516247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103668
27571	NC_012804	TCG	2	6	1516280	1516285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103668
27572	NC_012804	CCT	2	6	1516323	1516328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103668
27573	NC_012804	GGT	2	6	1516332	1516337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103668
27574	NC_012804	ATA	2	6	1516356	1516361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103669
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27576	NC_012804	AGG	2	6	1516462	1516467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103669
27577	NC_012804	TCG	2	6	1516534	1516539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103669
27578	NC_012804	GAG	2	6	1516551	1516556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103669
27579	NC_012804	GAA	2	6	1516599	1516604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103669
27580	NC_012804	ATA	2	6	1516614	1516619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103669
27581	NC_012804	GCC	2	6	1516653	1516658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103669
27582	NC_012804	CCGG	2	8	1516664	1516671	0 %	0 %	50 %	50 %	240103669
27583	NC_012804	GGT	2	6	1516694	1516699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103669
27584	NC_012804	GGAG	2	8	1516770	1516777	25 %	0 %	75 %	0 %	240103669
27585	NC_012804	CTC	2	6	1516845	1516850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103669
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27587	NC_012804	ACT	2	6	1517092	1517097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103669
27588	NC_012804	TGA	2	6	1517117	1517122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103670
27589	NC_012804	GAG	2	6	1517231	1517236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103670
27590	NC_012804	ACT	3	9	1517260	1517268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103670
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27598	NC_012804	AG	3	6	1517564	1517569	50 %	0 %	50 %	0 %	240103670
27599	NC_012804	AAG	2	6	1517577	1517582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103670
27600	NC_012804	TCG	2	6	1517608	1517613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103670
27601	NC_012804	CCG	2	6	1517644	1517649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103670
27602	NC_012804	ACC	2	6	1517659	1517664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103670
27603	NC_012804	ACG	2	6	1517686	1517691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103670
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27610	NC_012804	GAGG	2	8	1517914	1517921	25 %	0 %	75 %	0 %	240103671
27611	NC_012804	CGA	2	6	1517977	1517982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103671
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27613	NC_012804	GAGG	2	8	1518103	1518110	25 %	0 %	75 %	0 %	240103671
27614	NC_012804	CAA	2	6	1518181	1518186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103671
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