MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_012804	TCG	3	9	1484502	1484510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103631
27002	NC_012804	CGAA	2	8	1484559	1484566	50 %	0 %	25 %	25 %	240103631
27003	NC_012804	GGA	2	6	1484574	1484579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103631
27004	NC_012804	TCC	2	6	1484598	1484603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103631
27005	NC_012804	GAG	2	6	1484678	1484683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103631
27006	NC_012804	GAGTT	2	10	1484715	1484724	20 %	40 %	40 %	0 %	240103631
27007	NC_012804	GA	3	6	1484743	1484748	50 %	0 %	50 %	0 %	240103631
27008	NC_012804	GAG	2	6	1484803	1484808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103631
27009	NC_012804	GA	3	6	1484831	1484836	50 %	0 %	50 %	0 %	240103631
27010	NC_012804	A	6	6	1484902	1484907	100 %	0 %	0 %	0 %	240103631
27011	NC_012804	AAGG	2	8	1484965	1484972	50 %	0 %	50 %	0 %	240103631
27012	NC_012804	CTG	2	6	1485020	1485025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103631
27013	NC_012804	GA	4	8	1485038	1485045	50 %	0 %	50 %	0 %	240103631
27014	NC_012804	GAG	2	6	1485218	1485223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103631
27015	NC_012804	AGGA	2	8	1485269	1485276	50 %	0 %	50 %	0 %	240103631
27016	NC_012804	AG	3	6	1485277	1485282	50 %	0 %	50 %	0 %	240103631
27017	NC_012804	GGC	2	6	1485304	1485309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103631
27018	NC_012804	CCG	2	6	1485378	1485383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103631
27019	NC_012804	CG	3	6	1485382	1485387	0 %	0 %	50 %	50 %	240103631
27020	NC_012804	AGGA	2	8	1485479	1485486	50 %	0 %	50 %	0 %	240103631
27021	NC_012804	GAAG	2	8	1485487	1485494	50 %	0 %	50 %	0 %	240103631
27022	NC_012804	ATG	2	6	1485770	1485775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103632
27023	NC_012804	CAA	2	6	1485776	1485781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103632
27024	NC_012804	AGG	2	6	1485815	1485820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103632
27025	NC_012804	GAG	2	6	1485862	1485867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103632
27026	NC_012804	GCC	2	6	1485899	1485904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103632
27027	NC_012804	GAG	2	6	1485940	1485945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103632
27028	NC_012804	GAA	2	6	1485973	1485978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103632
27029	NC_012804	GTC	2	6	1486004	1486009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103632
27030	NC_012804	TCG	2	6	1486182	1486187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103632
27031	NC_012804	ATG	2	6	1486202	1486207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103632
27032	NC_012804	AGA	2	6	1486244	1486249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103632
27033	NC_012804	AGG	2	6	1486652	1486657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103632
27034	NC_012804	ACT	2	6	1486683	1486688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103632
27035	NC_012804	GGT	2	6	1486860	1486865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103632
27036	NC_012804	GAA	2	6	1486900	1486905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103632
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27038	NC_012804	GAG	2	6	1487069	1487074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103632
27039	NC_012804	CTC	2	6	1487215	1487220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103633
27040	NC_012804	CTC	2	6	1487293	1487298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103633
27041	NC_012804	TCC	2	6	1487400	1487405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103633
27042	NC_012804	CCTC	2	8	1487409	1487416	0 %	25 %	0 %	75 %	240103633
27043	NC_012804	TTC	2	6	1487485	1487490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103633
27044	NC_012804	ACC	3	9	1487499	1487507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103633
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27046	NC_012804	GTC	2	6	1487596	1487601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103633
27047	NC_012804	GGTA	2	8	1487640	1487647	25 %	25 %	50 %	0 %	240103633
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27049	NC_012804	AAC	2	6	1487862	1487867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103634
27050	NC_012804	CGTC	2	8	1487966	1487973	0 %	25 %	25 %	50 %	240103634
27051	NC_012804	CTC	2	6	1487977	1487982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103634
27052	NC_012804	CCG	2	6	1487986	1487991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103634
27053	NC_012804	TCG	2	6	1487995	1488000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103634
27054	NC_012804	TCT	2	6	1488008	1488013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103634
27055	NC_012804	CTT	2	6	1488021	1488026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103634
27056	NC_012804	TCG	2	6	1488106	1488111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103634
27057	NC_012804	CCT	2	6	1488146	1488151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103634
27058	NC_012804	TG	3	6	1488242	1488247	0 %	50 %	50 %	0 %	240103634
27059	NC_012804	GAA	2	6	1488252	1488257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103634
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27064	NC_012804	CCG	2	6	1488490	1488495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103634
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27082	NC_012804	TATCG	2	10	1489562	1489571	20 %	40 %	20 %	20 %	240103635
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27084	NC_012804	TGA	2	6	1489762	1489767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103635
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27089	NC_012804	CCT	2	6	1490040	1490045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103636
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27099	NC_012804	CTT	2	6	1490483	1490488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103636
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27101	NC_012804	AGCC	2	8	1490581	1490588	25 %	0 %	25 %	50 %	240103636
27102	NC_012804	CGA	2	6	1490624	1490629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103636
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27104	NC_012804	GAT	2	6	1490766	1490771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103636
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27106	NC_012804	CCT	2	6	1490956	1490961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103637
27107	NC_012804	TCA	2	6	1491007	1491012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103637
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27112	NC_012804	GTA	2	6	1491297	1491302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103637
27113	NC_012804	GAT	2	6	1491347	1491352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103637
27114	NC_012804	CTTT	2	8	1491373	1491380	0 %	75 %	0 %	25 %	240103637
27115	NC_012804	TC	3	6	1491470	1491475	0 %	50 %	0 %	50 %	240103637
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27234	NC_012804	CTC	2	6	1498001	1498006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103646
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27346	NC_012804	ATG	2	6	1503279	1503284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103652
27347	NC_012804	CTC	2	6	1503327	1503332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103652
27348	NC_012804	CGT	2	6	1503370	1503375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103652
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27350	NC_012804	TCCA	2	8	1503651	1503658	25 %	25 %	0 %	50 %	240103652
27351	NC_012804	CAG	2	6	1503666	1503671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103653
27352	NC_012804	CTC	2	6	1503681	1503686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103653
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27464	NC_012804	ACA	2	6	1510007	1510012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103661
27465	NC_012804	CGA	2	6	1510143	1510148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103661
27466	NC_012804	TCG	2	6	1510209	1510214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103661
27467	NC_012804	GAA	2	6	1510255	1510260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103661
27468	NC_012804	TGGT	2	8	1510271	1510278	0 %	50 %	50 %	0 %	240103661
27469	NC_012804	CCT	2	6	1510371	1510376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103661
27470	NC_012804	ACC	2	6	1510418	1510423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103661
27471	NC_012804	GAT	2	6	1510435	1510440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103661
27472	NC_012804	AG	3	6	1510444	1510449	50 %	0 %	50 %	0 %	240103661
27473	NC_012804	CAG	2	6	1510645	1510650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103661
27474	NC_012804	AGG	2	6	1510658	1510663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103661
27475	NC_012804	AGG	2	6	1510784	1510789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103661
27476	NC_012804	GTA	2	6	1510855	1510860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103661
27477	NC_012804	GAG	2	6	1510924	1510929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103661
27478	NC_012804	GAG	2	6	1511151	1511156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103662
27479	NC_012804	ACG	2	6	1511182	1511187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103662
27480	NC_012804	GTG	2	6	1511235	1511240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103662
27481	NC_012804	CCT	2	6	1511246	1511251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103662
27482	NC_012804	ATC	2	6	1511406	1511411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103662
27483	NC_012804	GCG	2	6	1511413	1511418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103662
27484	NC_012804	ACA	2	6	1511425	1511430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103662
27485	NC_012804	GAG	2	6	1511517	1511522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103662
27486	NC_012804	CTC	2	6	1511553	1511558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103662
27487	NC_012804	TCG	2	6	1511572	1511577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103662
27488	NC_012804	ACGGGA	2	12	1511614	1511625	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	240103662
27489	NC_012804	TCG	2	6	1511637	1511642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103662
27490	NC_012804	TGG	3	9	1511659	1511667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103662
27491	NC_012804	AGC	2	6	1511681	1511686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103662
27492	NC_012804	GGT	2	6	1512013	1512018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103663
27493	NC_012804	ACA	2	6	1512075	1512080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103663
27494	NC_012804	CTA	2	6	1512154	1512159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103663
27495	NC_012804	AAGTG	2	10	1512163	1512172	40 %	20 %	40 %	0 %	240103663
27496	NC_012804	CGG	2	6	1512220	1512225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103663
27497	NC_012804	GAG	2	6	1512293	1512298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103663
27498	NC_012804	GAG	2	6	1512388	1512393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103663
27499	NC_012804	TGA	2	6	1512424	1512429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103663
27500	NC_012804	AGG	2	6	1512438	1512443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103663

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