MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_012804	CGG	2	6	1401564	1401569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103550
25502	NC_012804	TCC	2	6	1401580	1401585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103550
25503	NC_012804	CTT	2	6	1401643	1401648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103550
25504	NC_012804	CTT	2	6	1401688	1401693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103550
25505	NC_012804	GGA	2	6	1401729	1401734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103550
25506	NC_012804	CCT	2	6	1401790	1401795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103550
25507	NC_012804	TCG	2	6	1401863	1401868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103550
25508	NC_012804	TCG	2	6	1402019	1402024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103550
25509	NC_012804	GGA	2	6	1402078	1402083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103550
25510	NC_012804	CTTCTC	2	12	1402114	1402125	0 %	50 %	0 %	50 %	240103550
25511	NC_012804	GTG	2	6	1402129	1402134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103550
25512	NC_012804	GAGG	2	8	1402189	1402196	25 %	0 %	75 %	0 %	240103550
25513	NC_012804	AGG	2	6	1402284	1402289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103550
25514	NC_012804	GCCGA	2	10	1402361	1402370	20 %	0 %	40 %	40 %	240103550
25515	NC_012804	TGG	2	6	1402391	1402396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103550
25516	NC_012804	AGG	2	6	1402400	1402405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103550
25517	NC_012804	GGA	2	6	1402431	1402436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103550
25518	NC_012804	CT	3	6	1402485	1402490	0 %	50 %	0 %	50 %	240103551
25519	NC_012804	TAT	2	6	1402670	1402675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103551
25520	NC_012804	TTC	2	6	1402712	1402717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103551
25521	NC_012804	CAC	2	6	1402766	1402771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103551
25522	NC_012804	GGC	2	6	1402802	1402807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103552
25523	NC_012804	CTT	2	6	1402858	1402863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103552
25524	NC_012804	CTC	2	6	1402921	1402926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103552
25525	NC_012804	GGCCTT	2	12	1402930	1402941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103552
25526	NC_012804	TCG	2	6	1402988	1402993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103552
25527	NC_012804	CTT	2	6	1403020	1403025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103552
25528	NC_012804	CTTCTG	2	12	1403050	1403061	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	240103552
25529	NC_012804	GAG	2	6	1403068	1403073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103552
25530	NC_012804	GCT	3	9	1403079	1403087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103552
25531	NC_012804	AGG	2	6	1403285	1403290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103553
25532	NC_012804	AGG	2	6	1403309	1403314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103553
25533	NC_012804	AGG	2	6	1403384	1403389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103553
25534	NC_012804	GTA	2	6	1403417	1403422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103553
25535	NC_012804	TTG	2	6	1403424	1403429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103553
25536	NC_012804	ACG	2	6	1403481	1403486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103553
25537	NC_012804	ATG	2	6	1403504	1403509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103553
25538	NC_012804	CTC	2	6	1403527	1403532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103553
25539	NC_012804	GCA	2	6	1403576	1403581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103553
25540	NC_012804	TCA	2	6	1403634	1403639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103553
25541	NC_012804	TCC	2	6	1403884	1403889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103554
25542	NC_012804	AATC	2	8	1403902	1403909	50 %	25 %	0 %	25 %	240103554
25543	NC_012804	TCG	2	6	1403979	1403984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103554
25544	NC_012804	TCC	2	6	1404062	1404067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103555
25545	NC_012804	GTT	2	6	1404187	1404192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103555
25546	NC_012804	CG	3	6	1404225	1404230	0 %	0 %	50 %	50 %	240103555
25547	NC_012804	CCG	2	6	1404242	1404247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103555
25548	NC_012804	GGT	2	6	1404304	1404309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103555
25549	NC_012804	ACG	2	6	1404311	1404316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103555
25550	NC_012804	AGGTAG	2	12	1404386	1404397	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	240103555
25551	NC_012804	GTC	2	6	1404412	1404417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103555
25552	NC_012804	TGA	2	6	1404429	1404434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103555
25553	NC_012804	TCT	2	6	1404528	1404533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103555
25554	NC_012804	TCC	2	6	1404597	1404602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103555
25555	NC_012804	CAT	2	6	1404631	1404636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103555
25556	NC_012804	CCCT	2	8	1404853	1404860	0 %	25 %	0 %	75 %	240103556
25557	NC_012804	CT	3	6	1404958	1404963	0 %	50 %	0 %	50 %	240103556
25558	NC_012804	GTC	2	6	1405070	1405075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103556
25559	NC_012804	CGA	2	6	1405154	1405159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103556
25560	NC_012804	TTC	2	6	1405267	1405272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103556
25561	NC_012804	CAT	2	6	1405349	1405354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103556
25562	NC_012804	CGA	2	6	1405373	1405378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103556
25563	NC_012804	TCC	2	6	1405414	1405419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103556
25564	NC_012804	GAT	2	6	1405434	1405439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103556
25565	NC_012804	TTC	2	6	1405450	1405455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103556
25566	NC_012804	CATT	2	8	1405464	1405471	25 %	50 %	0 %	25 %	240103556
25567	NC_012804	TCC	2	6	1405474	1405479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103557
25568	NC_012804	TCC	2	6	1405516	1405521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103557
25569	NC_012804	AGT	2	6	1405538	1405543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103557
25570	NC_012804	CCT	2	6	1405574	1405579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103557
25571	NC_012804	TC	3	6	1405587	1405592	0 %	50 %	0 %	50 %	240103557
25572	NC_012804	CTT	2	6	1405629	1405634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103557
25573	NC_012804	ACC	2	6	1405786	1405791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103557
25574	NC_012804	GCG	2	6	1405898	1405903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103557
25575	NC_012804	GT	3	6	1405912	1405917	0 %	50 %	50 %	0 %	240103557
25576	NC_012804	CTC	2	6	1406037	1406042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103557
25577	NC_012804	GT	3	6	1406117	1406122	0 %	50 %	50 %	0 %	240103557
25578	NC_012804	CGA	2	6	1406195	1406200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103557
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25581	NC_012804	TGG	2	6	1406795	1406800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103558
25582	NC_012804	GAGGTT	2	12	1406833	1406844	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	240103558
25583	NC_012804	CTC	2	6	1406890	1406895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103558
25584	NC_012804	AGA	2	6	1406948	1406953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103558
25585	NC_012804	AGG	2	6	1407023	1407028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103558
25586	NC_012804	GTTC	2	8	1407096	1407103	0 %	50 %	25 %	25 %	240103558
25587	NC_012804	GA	3	6	1407132	1407137	50 %	0 %	50 %	0 %	240103559
25588	NC_012804	TTA	2	6	1407140	1407145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103559
25589	NC_012804	TAG	2	6	1407272	1407277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103559
25590	NC_012804	GA	3	6	1407280	1407285	50 %	0 %	50 %	0 %	240103559
25591	NC_012804	AG	3	6	1407289	1407294	50 %	0 %	50 %	0 %	240103559
25592	NC_012804	TCGAGC	2	12	1407299	1407310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	240103559
25593	NC_012804	TTC	2	6	1407334	1407339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103559
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25596	NC_012804	GGT	2	6	1407423	1407428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103559
25597	NC_012804	ATA	2	6	1407526	1407531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103559
25598	NC_012804	ACAGGG	2	12	1407545	1407556	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	240103559
25599	NC_012804	ACG	2	6	1407610	1407615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103559
25600	NC_012804	CG	3	6	1407633	1407638	0 %	0 %	50 %	50 %	240103559
25601	NC_012804	CTC	2	6	1407681	1407686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103559
25602	NC_012804	CGT	2	6	1407741	1407746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103559
25603	NC_012804	AGA	2	6	1407764	1407769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103559
25604	NC_012804	GAG	2	6	1407853	1407858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103559
25605	NC_012804	CCT	2	6	1407870	1407875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103559
25606	NC_012804	CGAG	2	8	1407923	1407930	25 %	0 %	50 %	25 %	240103559
25607	NC_012804	AACGAC	2	12	1407997	1408008	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	240103559
25608	NC_012804	TTC	2	6	1408018	1408023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103559
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25611	NC_012804	AG	3	6	1408261	1408266	50 %	0 %	50 %	0 %	240103560
25612	NC_012804	GAA	2	6	1408321	1408326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103560
25613	NC_012804	CGT	2	6	1408327	1408332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103560
25614	NC_012804	GAC	2	6	1408340	1408345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103560
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25616	NC_012804	CTA	2	6	1408426	1408431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103560
25617	NC_012804	CTCGG	2	10	1408433	1408442	0 %	20 %	40 %	40 %	240103560
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25728	NC_012804	AAGA	2	8	1414478	1414485	75 %	0 %	25 %	0 %	240103565
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25730	NC_012804	CCCT	2	8	1414515	1414522	0 %	25 %	0 %	75 %	240103565
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25848	NC_012804	TCC	2	6	1420356	1420361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103572
25849	NC_012804	GAA	2	6	1420507	1420512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103572
25850	NC_012804	TCG	2	6	1420518	1420523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103572
25851	NC_012804	TGA	2	6	1420620	1420625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103572
25852	NC_012804	CGA	2	6	1420675	1420680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103572
25853	NC_012804	CTG	2	6	1420836	1420841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103573
25854	NC_012804	CTC	3	9	1420845	1420853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103573
25855	NC_012804	TCC	2	6	1420855	1420860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103573
25856	NC_012804	AACCCT	2	12	1420865	1420876	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	240103573
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25859	NC_012804	GGCC	2	8	1420978	1420985	0 %	0 %	50 %	50 %	240103573
25860	NC_012804	TGG	2	6	1421015	1421020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103573
25861	NC_012804	TCC	2	6	1421101	1421106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103573
25862	NC_012804	GGA	2	6	1421108	1421113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103573
25863	NC_012804	CCCG	2	8	1421139	1421146	0 %	0 %	25 %	75 %	240103573
25864	NC_012804	CT	3	6	1421160	1421165	0 %	50 %	0 %	50 %	240103573
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25869	NC_012804	CTA	2	6	1421480	1421485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103573
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25964	NC_012804	TCT	3	9	1426831	1426839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103577
25965	NC_012804	GGAGA	2	10	1426975	1426984	40 %	0 %	60 %	0 %	240103578
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25967	NC_012804	CGG	2	6	1427121	1427126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103578
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25969	NC_012804	CGG	2	6	1427265	1427270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103578
25970	NC_012804	CGA	2	6	1427352	1427357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103578
25971	NC_012804	GGGT	2	8	1427472	1427479	0 %	25 %	75 %	0 %	240103578
25972	NC_012804	TCC	2	6	1427525	1427530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103579
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25975	NC_012804	TTC	2	6	1427846	1427851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103579
25976	NC_012804	CTT	2	6	1427875	1427880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103579
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25984	NC_012804	GAG	2	6	1428946	1428951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103580
25985	NC_012804	TAC	2	6	1429012	1429017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103580
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25988	NC_012804	GAT	2	6	1429188	1429193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103580
25989	NC_012804	ACT	2	6	1429220	1429225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103580
25990	NC_012804	GGAA	2	8	1429235	1429242	50 %	0 %	50 %	0 %	240103580
25991	NC_012804	GGA	2	6	1429266	1429271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103580
25992	NC_012804	CAT	2	6	1429281	1429286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103580
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25994	NC_012804	CGA	2	6	1429521	1429526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103580
25995	NC_012804	TAC	2	6	1429579	1429584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103580
25996	NC_012804	GCC	2	6	1429615	1429620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103580
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25999	NC_012804	CGA	2	6	1429686	1429691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103580
26000	NC_012804	GAG	2	6	1429732	1429737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103580

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