MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_012804	T	6	6	1376574	1376579	0 %	100 %	0 %	0 %	240103522
25002	NC_012804	TAT	2	6	1376666	1376671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103522
25003	NC_012804	TC	3	6	1376690	1376695	0 %	50 %	0 %	50 %	240103522
25004	NC_012804	CGT	2	6	1376698	1376703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103522
25005	NC_012804	CTC	2	6	1376735	1376740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103522
25006	NC_012804	CGA	2	6	1376797	1376802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103522
25007	NC_012804	TCC	2	6	1376845	1376850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103522
25008	NC_012804	TCG	2	6	1376871	1376876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103522
25009	NC_012804	TCG	2	6	1376964	1376969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103522
25010	NC_012804	CAT	2	6	1376978	1376983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103522
25011	NC_012804	AAC	2	6	1377307	1377312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103523
25012	NC_012804	ATGG	2	8	1377314	1377321	25 %	25 %	50 %	0 %	240103523
25013	NC_012804	ACC	2	6	1377322	1377327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103523
25014	NC_012804	ACC	2	6	1377398	1377403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103523
25015	NC_012804	GGGA	2	8	1377474	1377481	25 %	0 %	75 %	0 %	240103523
25016	NC_012804	CTC	2	6	1377508	1377513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103523
25017	NC_012804	AGG	2	6	1377545	1377550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103523
25018	NC_012804	GAC	2	6	1377589	1377594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103523
25019	NC_012804	AGGGCG	2	12	1377661	1377672	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	240103523
25020	NC_012804	GAC	2	6	1377676	1377681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103523
25021	NC_012804	TTGG	2	8	1377694	1377701	0 %	50 %	50 %	0 %	240103523
25022	NC_012804	GACA	2	8	1377743	1377750	50 %	0 %	25 %	25 %	240103523
25023	NC_012804	GAC	2	6	1377778	1377783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103523
25024	NC_012804	AAAAT	2	10	1377788	1377797	80 %	20 %	0 %	0 %	240103523
25025	NC_012804	CTC	2	6	1377817	1377822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103523
25026	NC_012804	CCCCGG	2	12	1377948	1377959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103523
25027	NC_012804	AAT	2	6	1377972	1377977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103523
25028	NC_012804	GCG	2	6	1378004	1378009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103523
25029	NC_012804	GAG	2	6	1378027	1378032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103523
25030	NC_012804	GCG	2	6	1378064	1378069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103523
25031	NC_012804	GCG	2	6	1378079	1378084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103523
25032	NC_012804	TTC	2	6	1378086	1378091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103523
25033	NC_012804	A	6	6	1378102	1378107	100 %	0 %	0 %	0 %	240103523
25034	NC_012804	AAG	2	6	1378199	1378204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103523
25035	NC_012804	ACC	2	6	1378396	1378401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103523
25036	NC_012804	TGG	2	6	1378409	1378414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103523
25037	NC_012804	TCA	2	6	1378499	1378504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103523
25038	NC_012804	CTC	2	6	1378509	1378514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103523
25039	NC_012804	GAG	2	6	1378519	1378524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103523
25040	NC_012804	ACG	2	6	1378526	1378531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103523
25041	NC_012804	CAA	2	6	1378599	1378604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103523
25042	NC_012804	AG	3	6	1378629	1378634	50 %	0 %	50 %	0 %	240103523
25043	NC_012804	CTG	2	6	1378660	1378665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103523
25044	NC_012804	GGAC	2	8	1378715	1378722	25 %	0 %	50 %	25 %	240103523
25045	NC_012804	ATAA	2	8	1378723	1378730	75 %	25 %	0 %	0 %	240103523
25046	NC_012804	GAG	2	6	1378861	1378866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103523
25047	NC_012804	ACGG	2	8	1378924	1378931	25 %	0 %	50 %	25 %	240103523
25048	NC_012804	GAT	2	6	1378938	1378943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103523
25049	NC_012804	GAC	2	6	1378963	1378968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103523
25050	NC_012804	AAG	2	6	1378969	1378974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103523
25051	NC_012804	ACA	2	6	1379003	1379008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103523
25052	NC_012804	TAA	3	9	1379024	1379032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103523
25053	NC_012804	ATG	2	6	1379033	1379038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103523
25054	NC_012804	AGA	2	6	1379101	1379106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103523
25055	NC_012804	AGT	2	6	1379146	1379151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103523
25056	NC_012804	TAC	2	6	1379250	1379255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103523
25057	NC_012804	TAT	2	6	1379269	1379274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103523
25058	NC_012804	TC	3	6	1379307	1379312	0 %	50 %	0 %	50 %	240103523
25059	NC_012804	CATA	2	8	1379328	1379335	50 %	25 %	0 %	25 %	240103523
25060	NC_012804	AAT	2	6	1379344	1379349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103523
25061	NC_012804	AGTGGA	2	12	1379351	1379362	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	240103523
25062	NC_012804	AGT	2	6	1379389	1379394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103523
25063	NC_012804	GGA	2	6	1379420	1379425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103523
25064	NC_012804	GGT	2	6	1379700	1379705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103523
25065	NC_012804	GTT	2	6	1379723	1379728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103524
25066	NC_012804	CT	3	6	1379731	1379736	0 %	50 %	0 %	50 %	240103524
25067	NC_012804	ACTC	2	8	1379744	1379751	25 %	25 %	0 %	50 %	240103524
25068	NC_012804	CTCC	2	8	1379780	1379787	0 %	25 %	0 %	75 %	240103524
25069	NC_012804	CGA	2	6	1379828	1379833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103524
25070	NC_012804	ATC	2	6	1379927	1379932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103524
25071	NC_012804	AGG	2	6	1379949	1379954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103524
25072	NC_012804	AG	3	6	1379960	1379965	50 %	0 %	50 %	0 %	240103524
25073	NC_012804	CA	3	6	1380031	1380036	50 %	0 %	0 %	50 %	240103524
25074	NC_012804	CTC	2	6	1380045	1380050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103524
25075	NC_012804	GAA	2	6	1380075	1380080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103524
25076	NC_012804	CCGG	2	8	1380122	1380129	0 %	0 %	50 %	50 %	240103524
25077	NC_012804	AACC	2	8	1380206	1380213	50 %	0 %	0 %	50 %	240103524
25078	NC_012804	GTG	2	6	1380345	1380350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103524
25079	NC_012804	CCT	2	6	1380448	1380453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103524
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25082	NC_012804	TC	3	6	1380655	1380660	0 %	50 %	0 %	50 %	240103525
25083	NC_012804	TCC	2	6	1380663	1380668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103525
25084	NC_012804	GCTTAC	2	12	1380680	1380691	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	240103525
25085	NC_012804	A	6	6	1380729	1380734	100 %	0 %	0 %	0 %	240103525
25086	NC_012804	AG	3	6	1380749	1380754	50 %	0 %	50 %	0 %	240103525
25087	NC_012804	CTA	2	6	1380775	1380780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103525
25088	NC_012804	CTC	2	6	1380781	1380786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103525
25089	NC_012804	AG	3	6	1380800	1380805	50 %	0 %	50 %	0 %	240103525
25090	NC_012804	AG	3	6	1380832	1380837	50 %	0 %	50 %	0 %	240103525
25091	NC_012804	ATT	2	6	1380930	1380935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103525
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25097	NC_012804	TAG	2	6	1381236	1381241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103525
25098	NC_012804	A	6	6	1381252	1381257	100 %	0 %	0 %	0 %	240103525
25099	NC_012804	A	6	6	1381288	1381293	100 %	0 %	0 %	0 %	240103525
25100	NC_012804	AAG	2	6	1381359	1381364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103525
25101	NC_012804	TCC	2	6	1381380	1381385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103525
25102	NC_012804	CAT	2	6	1381482	1381487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103525
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25104	NC_012804	GAA	2	6	1381592	1381597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103525
25105	NC_012804	GAT	2	6	1381653	1381658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103526
25106	NC_012804	CT	3	6	1381679	1381684	0 %	50 %	0 %	50 %	240103526
25107	NC_012804	TGCTTA	2	12	1381716	1381727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	240103526
25108	NC_012804	A	6	6	1381766	1381771	100 %	0 %	0 %	0 %	240103526
25109	NC_012804	GA	4	8	1381785	1381792	50 %	0 %	50 %	0 %	240103526
25110	NC_012804	TAC	2	6	1381813	1381818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103526
25111	NC_012804	AG	3	6	1381837	1381842	50 %	0 %	50 %	0 %	240103526
25112	NC_012804	AG	3	6	1381869	1381874	50 %	0 %	50 %	0 %	240103526
25113	NC_012804	AGA	2	6	1381935	1381940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103526
25114	NC_012804	TCT	2	6	1381946	1381951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103526
25115	NC_012804	ACT	2	6	1381967	1381972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103526
25116	NC_012804	CAA	2	6	1381982	1381987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103526
25117	NC_012804	CAA	2	6	1382019	1382024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103526
25118	NC_012804	GAA	2	6	1382065	1382070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103526
25119	NC_012804	CCAA	2	8	1382082	1382089	50 %	0 %	0 %	50 %	240103526
25120	NC_012804	ATA	2	6	1382170	1382175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103526
25121	NC_012804	CTC	2	6	1382178	1382183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103526
25122	NC_012804	TTG	2	6	1382227	1382232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103526
25123	NC_012804	TTC	2	6	1382234	1382239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103526
25124	NC_012804	AAC	2	6	1382248	1382253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103526
25125	NC_012804	ATC	2	6	1382269	1382274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103526
25126	NC_012804	TGAA	2	8	1382288	1382295	50 %	25 %	25 %	0 %	240103526
25127	NC_012804	TTA	2	6	1382306	1382311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103526
25128	NC_012804	GA	3	6	1382350	1382355	50 %	0 %	50 %	0 %	240103526
25129	NC_012804	CA	3	6	1382499	1382504	50 %	0 %	0 %	50 %	240103526
25130	NC_012804	AGGAG	2	10	1382596	1382605	40 %	0 %	60 %	0 %	240103526
25131	NC_012804	CATACT	2	12	1382615	1382626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103526
25132	NC_012804	TAGTTT	2	12	1382667	1382678	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	240103527
25133	NC_012804	GCTTAC	2	12	1382702	1382713	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	240103527
25134	NC_012804	TTA	2	6	1382797	1382802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103527
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25141	NC_012804	CTCC	2	8	1383133	1383140	0 %	25 %	0 %	75 %	240103527
25142	NC_012804	CAC	2	6	1383157	1383162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103527
25143	NC_012804	TGA	2	6	1383205	1383210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103527
25144	NC_012804	TAT	2	6	1383215	1383220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103527
25145	NC_012804	CGA	2	6	1383349	1383354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103527
25146	NC_012804	TAC	2	6	1383371	1383376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103527
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25148	NC_012804	TTC	2	6	1383435	1383440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103527
25149	NC_012804	A	6	6	1383465	1383470	100 %	0 %	0 %	0 %	240103527
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25151	NC_012804	AT	3	6	1383596	1383601	50 %	50 %	0 %	0 %	240103527
25152	NC_012804	A	6	6	1383609	1383614	100 %	0 %	0 %	0 %	240103527
25153	NC_012804	TCA	2	6	1383636	1383641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103527
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25155	NC_012804	A	6	6	1383670	1383675	100 %	0 %	0 %	0 %	240103528
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25220	NC_012804	GTT	2	6	1387155	1387160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103531
25221	NC_012804	TAG	2	6	1387216	1387221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103531
25222	NC_012804	ACA	2	6	1387261	1387266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103531
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25228	NC_012804	GTT	2	6	1387592	1387597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103532
25229	NC_012804	CT	3	6	1387600	1387605	0 %	50 %	0 %	50 %	240103532
25230	NC_012804	ACTC	2	8	1387613	1387620	25 %	25 %	0 %	50 %	240103532
25231	NC_012804	CTCC	2	8	1387649	1387656	0 %	25 %	0 %	75 %	240103532
25232	NC_012804	CGA	2	6	1387697	1387702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103532
25233	NC_012804	TCC	2	6	1387807	1387812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103532
25234	NC_012804	ACT	2	6	1387852	1387857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103532
25235	NC_012804	CTT	2	6	1387881	1387886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103532
25236	NC_012804	GAA	2	6	1387887	1387892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103532
25237	NC_012804	GAAA	2	8	1387940	1387947	75 %	0 %	25 %	0 %	240103532
25238	NC_012804	ACAAGA	2	12	1387990	1388001	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	240103532
25239	NC_012804	TAC	2	6	1388022	1388027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103532
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25241	NC_012804	GCA	2	6	1388050	1388055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103532
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25245	NC_012804	GTC	2	6	1388196	1388201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103532
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25247	NC_012804	TAC	2	6	1388412	1388417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103532
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25250	NC_012804	CT	3	6	1388626	1388631	0 %	50 %	0 %	50 %	240103533
25251	NC_012804	GA	3	6	1388731	1388736	50 %	0 %	50 %	0 %	240103533
25252	NC_012804	A	6	6	1388877	1388882	100 %	0 %	0 %	0 %	240103533
25253	NC_012804	CTC	2	6	1388909	1388914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103533
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25269	NC_012804	A	6	6	1389686	1389691	100 %	0 %	0 %	0 %	240103534
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25272	NC_012804	A	7	7	1389785	1389791	100 %	0 %	0 %	0 %	240103534
25273	NC_012804	TCT	2	6	1389839	1389844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103534
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25350	NC_012804	GAA	2	6	1393628	1393633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103538
25351	NC_012804	CGG	2	6	1393643	1393648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103538
25352	NC_012804	ATG	2	6	1393752	1393757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103538
25353	NC_012804	GCGA	2	8	1393872	1393879	25 %	0 %	50 %	25 %	240103538
25354	NC_012804	AGG	2	6	1393915	1393920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103538
25355	NC_012804	CCTG	2	8	1393967	1393974	0 %	25 %	25 %	50 %	240103538
25356	NC_012804	ATA	2	6	1394007	1394012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103538
25357	NC_012804	GAG	2	6	1394025	1394030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103538
25358	NC_012804	GAG	2	6	1394061	1394066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103538
25359	NC_012804	TGA	2	6	1394085	1394090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103538
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25366	NC_012804	CCT	2	6	1394315	1394320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103540
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25370	NC_012804	CCT	2	6	1394460	1394465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103540
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25372	NC_012804	GAG	2	6	1394578	1394583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103540
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25374	NC_012804	TCG	2	6	1394645	1394650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103540
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25376	NC_012804	TCA	2	6	1394714	1394719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103540
25377	NC_012804	CTG	2	6	1394899	1394904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103541
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25381	NC_012804	CGA	2	6	1395048	1395053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103541
25382	NC_012804	GGA	2	6	1395075	1395080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103541
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25402	NC_012804	TA	3	6	1396067	1396072	50 %	50 %	0 %	0 %	240103542
25403	NC_012804	TGA	2	6	1396110	1396115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103542
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25422	NC_012804	ACG	2	6	1397426	1397431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103543
25423	NC_012804	CT	3	6	1397436	1397441	0 %	50 %	0 %	50 %	240103543
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25451	NC_012804	GAT	2	6	1399156	1399161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103544
25452	NC_012804	GATC	2	8	1399206	1399213	25 %	25 %	25 %	25 %	240103545
25453	NC_012804	TGG	2	6	1399296	1399301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103545
25454	NC_012804	CCT	2	6	1399326	1399331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103545
25455	NC_012804	TCC	2	6	1399340	1399345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103545
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25457	NC_012804	CTG	2	6	1399385	1399390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103545
25458	NC_012804	C	6	6	1399392	1399397	0 %	0 %	0 %	100 %	240103545
25459	NC_012804	GA	3	6	1399407	1399412	50 %	0 %	50 %	0 %	240103545
25460	NC_012804	TCG	2	6	1399431	1399436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103545
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25463	NC_012804	CTC	2	6	1399526	1399531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103545
25464	NC_012804	CTA	2	6	1399756	1399761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103545
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25467	NC_012804	TGA	2	6	1399935	1399940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103546
25468	NC_012804	CCG	2	6	1399949	1399954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103546
25469	NC_012804	CGA	2	6	1399962	1399967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103546
25470	NC_012804	TAG	2	6	1399998	1400003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103546
25471	NC_012804	GGA	2	6	1400055	1400060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103546
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