MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_012804	TGA	2	6	1348430	1348435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103493
24502	NC_012804	TCT	3	9	1348483	1348491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103493
24503	NC_012804	TCG	2	6	1348582	1348587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103493
24504	NC_012804	CTA	2	6	1348589	1348594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103493
24505	NC_012804	CAA	2	6	1348631	1348636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103493
24506	NC_012804	GGA	2	6	1348723	1348728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103493
24507	NC_012804	TCC	2	6	1348856	1348861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103494
24508	NC_012804	AAT	2	6	1348878	1348883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103494
24509	NC_012804	CGG	2	6	1348911	1348916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103494
24510	NC_012804	ACA	2	6	1349006	1349011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103494
24511	NC_012804	CCT	2	6	1349100	1349105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103494
24512	NC_012804	TCG	3	9	1349168	1349176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103494
24513	NC_012804	TCC	2	6	1349189	1349194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103494
24514	NC_012804	CGA	2	6	1349196	1349201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103494
24515	NC_012804	TCT	2	6	1349387	1349392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103494
24516	NC_012804	GTGA	2	8	1349401	1349408	25 %	25 %	50 %	0 %	240103494
24517	NC_012804	ATA	2	6	1349440	1349445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103494
24518	NC_012804	AGG	2	6	1349464	1349469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103494
24519	NC_012804	ATA	2	6	1349548	1349553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103494
24520	NC_012804	GAG	2	6	1349617	1349622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103494
24521	NC_012804	AAG	2	6	1349723	1349728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103494
24522	NC_012804	GC	3	6	1349750	1349755	0 %	0 %	50 %	50 %	240103494
24523	NC_012804	T	6	6	1349762	1349767	0 %	100 %	0 %	0 %	240103494
24524	NC_012804	GAA	2	6	1349768	1349773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103494
24525	NC_012804	TA	3	6	1349848	1349853	50 %	50 %	0 %	0 %	240103495
24526	NC_012804	ATAAC	2	10	1349866	1349875	60 %	20 %	0 %	20 %	240103495
24527	NC_012804	GGA	2	6	1349969	1349974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103495
24528	NC_012804	GAA	2	6	1349975	1349980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103495
24529	NC_012804	GATG	2	8	1349987	1349994	25 %	25 %	50 %	0 %	240103495
24530	NC_012804	GGA	2	6	1350038	1350043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103495
24531	NC_012804	AACCTC	2	12	1350109	1350120	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	240103496
24532	NC_012804	CAC	2	6	1350157	1350162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103496
24533	NC_012804	GCTG	2	8	1350270	1350277	0 %	25 %	50 %	25 %	240103496
24534	NC_012804	CGA	2	6	1350330	1350335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103496
24535	NC_012804	GGCC	2	8	1350431	1350438	0 %	0 %	50 %	50 %	240103496
24536	NC_012804	TCG	2	6	1350447	1350452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103496
24537	NC_012804	ACC	2	6	1350511	1350516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103496
24538	NC_012804	CT	5	10	1350536	1350545	0 %	50 %	0 %	50 %	240103496
24539	NC_012804	CTT	2	6	1350561	1350566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103496
24540	NC_012804	GAA	2	6	1350588	1350593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103496
24541	NC_012804	AGA	2	6	1350600	1350605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103496
24542	NC_012804	CTC	2	6	1350697	1350702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103496
24543	NC_012804	ATT	2	6	1350722	1350727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103496
24544	NC_012804	CAG	2	6	1350781	1350786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103496
24545	NC_012804	CTT	2	6	1350817	1350822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103496
24546	NC_012804	CCCT	2	8	1350911	1350918	0 %	25 %	0 %	75 %	240103496
24547	NC_012804	TCG	2	6	1351037	1351042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103496
24548	NC_012804	CCG	2	6	1351116	1351121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103496
24549	NC_012804	AGGG	2	8	1351131	1351138	25 %	0 %	75 %	0 %	240103496
24550	NC_012804	TCC	2	6	1351160	1351165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103496
24551	NC_012804	CTT	2	6	1351200	1351205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103496
24552	NC_012804	CT	3	6	1351252	1351257	0 %	50 %	0 %	50 %	240103496
24553	NC_012804	ACTC	2	8	1351290	1351297	25 %	25 %	0 %	50 %	240103497
24554	NC_012804	GCCT	2	8	1351319	1351326	0 %	25 %	25 %	50 %	240103497
24555	NC_012804	GGCA	2	8	1351374	1351381	25 %	0 %	50 %	25 %	240103497
24556	NC_012804	TCA	2	6	1351435	1351440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103497
24557	NC_012804	TCA	2	6	1351468	1351473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103497
24558	NC_012804	ACA	2	6	1351578	1351583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103497
24559	NC_012804	CAA	2	6	1351606	1351611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103497
24560	NC_012804	TCT	2	6	1351630	1351635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103497
24561	NC_012804	AC	3	6	1351659	1351664	50 %	0 %	0 %	50 %	240103497
24562	NC_012804	TTC	2	6	1351674	1351679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103497
24563	NC_012804	CGA	2	6	1351690	1351695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103497
24564	NC_012804	TCT	2	6	1351713	1351718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103497
24565	NC_012804	CTT	2	6	1351769	1351774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103497
24566	NC_012804	CTC	2	6	1351782	1351787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103497
24567	NC_012804	ATG	2	6	1351819	1351824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103498
24568	NC_012804	TAA	2	6	1351839	1351844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103498
24569	NC_012804	T	6	6	1351888	1351893	0 %	100 %	0 %	0 %	240103498
24570	NC_012804	GAG	2	6	1352005	1352010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103498
24571	NC_012804	GAG	2	6	1352014	1352019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103498
24572	NC_012804	GAGCT	2	10	1352068	1352077	20 %	20 %	40 %	20 %	240103498
24573	NC_012804	ATA	2	6	1352104	1352109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103498
24574	NC_012804	CGA	2	6	1352112	1352117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103498
24575	NC_012804	AGCTG	2	10	1352129	1352138	20 %	20 %	40 %	20 %	240103498
24576	NC_012804	CTT	2	6	1352169	1352174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103499
24577	NC_012804	CTT	2	6	1352176	1352181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103499
24578	NC_012804	CCT	2	6	1352230	1352235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103499
24579	NC_012804	CTT	2	6	1352277	1352282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103499
24580	NC_012804	CCG	2	6	1352310	1352315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103499
24581	NC_012804	CGT	2	6	1352327	1352332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103499
24582	NC_012804	GAG	2	6	1352375	1352380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103499
24583	NC_012804	CCGC	2	8	1352384	1352391	0 %	0 %	25 %	75 %	240103499
24584	NC_012804	TCC	2	6	1352402	1352407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103499
24585	NC_012804	CCT	2	6	1352572	1352577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103499
24586	NC_012804	CG	3	6	1352653	1352658	0 %	0 %	50 %	50 %	240103499
24587	NC_012804	ATCGGA	2	12	1352796	1352807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240103499
24588	NC_012804	GAG	2	6	1352835	1352840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103499
24589	NC_012804	AGCG	2	8	1352846	1352853	25 %	0 %	50 %	25 %	240103499
24590	NC_012804	TCCGT	2	10	1352856	1352865	0 %	40 %	20 %	40 %	240103499
24591	NC_012804	CTGG	2	8	1352935	1352942	0 %	25 %	50 %	25 %	240103499
24592	NC_012804	TCA	2	6	1353024	1353029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103499
24593	NC_012804	CT	3	6	1353052	1353057	0 %	50 %	0 %	50 %	240103499
24594	NC_012804	C	6	6	1353080	1353085	0 %	0 %	0 %	100 %	240103499
24595	NC_012804	TAT	2	6	1353092	1353097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103499
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24597	NC_012804	ATC	2	6	1353218	1353223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103500
24598	NC_012804	AGGA	2	8	1353260	1353267	50 %	0 %	50 %	0 %	240103500
24599	NC_012804	AGCC	2	8	1353293	1353300	25 %	0 %	25 %	50 %	240103500
24600	NC_012804	AAAGAC	2	12	1353319	1353330	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	240103500
24601	NC_012804	TA	3	6	1353427	1353432	50 %	50 %	0 %	0 %	240103500
24602	NC_012804	GAAC	2	8	1353444	1353451	50 %	0 %	25 %	25 %	240103500
24603	NC_012804	TC	3	6	1353621	1353626	0 %	50 %	0 %	50 %	240103500
24604	NC_012804	ACCG	2	8	1353694	1353701	25 %	0 %	25 %	50 %	240103500
24605	NC_012804	TCT	3	9	1353759	1353767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103500
24606	NC_012804	TCCC	2	8	1353773	1353780	0 %	25 %	0 %	75 %	240103500
24607	NC_012804	GAT	2	6	1353802	1353807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103500
24608	NC_012804	AGG	2	6	1353809	1353814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103500
24609	NC_012804	CAG	2	6	1353817	1353822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103500
24610	NC_012804	CAT	2	6	1353940	1353945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103500
24611	NC_012804	GGA	2	6	1353985	1353990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103500
24612	NC_012804	CCA	2	6	1354069	1354074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103500
24613	NC_012804	CT	3	6	1354202	1354207	0 %	50 %	0 %	50 %	240103500
24614	NC_012804	ATC	2	6	1354286	1354291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103500
24615	NC_012804	GCT	2	6	1354294	1354299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103500
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24617	NC_012804	CT	3	6	1354421	1354426	0 %	50 %	0 %	50 %	240103501
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24733	NC_012804	CTA	2	6	1360704	1360709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103509
24734	NC_012804	AGG	2	6	1360712	1360717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103509
24735	NC_012804	TGA	2	6	1360725	1360730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103509
24736	NC_012804	CAG	2	6	1360747	1360752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103509
24737	NC_012804	GTA	2	6	1360807	1360812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103509
24738	NC_012804	ATC	2	6	1360823	1360828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103509
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24764	NC_012804	CGC	2	6	1362067	1362072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103509
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24846	NC_012804	CTCGAA	2	12	1366486	1366497	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	240103512
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24849	NC_012804	GAG	2	6	1366558	1366563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103512
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24851	NC_012804	GAG	2	6	1366672	1366677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103512
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