MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_012804	TAA	2	6	1319606	1319611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103460
24002	NC_012804	GACC	2	8	1319696	1319703	25 %	0 %	25 %	50 %	240103460
24003	NC_012804	T	6	6	1319731	1319736	0 %	100 %	0 %	0 %	240103461
24004	NC_012804	GTC	2	6	1319760	1319765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103461
24005	NC_012804	GAAC	2	8	1319806	1319813	50 %	0 %	25 %	25 %	240103461
24006	NC_012804	CGT	2	6	1319894	1319899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103461
24007	NC_012804	CGC	2	6	1319978	1319983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103461
24008	NC_012804	CGC	2	6	1320041	1320046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103461
24009	NC_012804	CAC	2	6	1320059	1320064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103461
24010	NC_012804	ACT	2	6	1320070	1320075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103461
24011	NC_012804	CAG	2	6	1320129	1320134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103461
24012	NC_012804	GCG	2	6	1320150	1320155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103461
24013	NC_012804	TACG	2	8	1320291	1320298	25 %	25 %	25 %	25 %	240103461
24014	NC_012804	GGC	2	6	1320311	1320316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103461
24015	NC_012804	TGG	2	6	1320341	1320346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103461
24016	NC_012804	TCG	3	9	1320349	1320357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103461
24017	NC_012804	GAAGA	2	10	1320396	1320405	60 %	0 %	40 %	0 %	240103461
24018	NC_012804	TCA	2	6	1320530	1320535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103462
24019	NC_012804	CT	3	6	1320599	1320604	0 %	50 %	0 %	50 %	240103462
24020	NC_012804	CAC	2	6	1320640	1320645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103462
24021	NC_012804	GTG	2	6	1320648	1320653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103462
24022	NC_012804	CTT	2	6	1320711	1320716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103462
24023	NC_012804	AT	3	6	1320721	1320726	50 %	50 %	0 %	0 %	240103462
24024	NC_012804	CCG	2	6	1320785	1320790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103462
24025	NC_012804	GGA	2	6	1320844	1320849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103462
24026	NC_012804	GAA	3	9	1320906	1320914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103462
24027	NC_012804	TTCT	2	8	1320940	1320947	0 %	75 %	0 %	25 %	240103462
24028	NC_012804	GAT	2	6	1321056	1321061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103462
24029	NC_012804	GGTA	2	8	1321231	1321238	25 %	25 %	50 %	0 %	240103463
24030	NC_012804	GAG	2	6	1321273	1321278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103463
24031	NC_012804	CGC	2	6	1321292	1321297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103463
24032	NC_012804	A	6	6	1321301	1321306	100 %	0 %	0 %	0 %	240103463
24033	NC_012804	CGT	2	6	1321338	1321343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103463
24034	NC_012804	GGC	2	6	1321362	1321367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103463
24035	NC_012804	ACCG	2	8	1321482	1321489	25 %	0 %	25 %	50 %	240103463
24036	NC_012804	GAT	2	6	1321498	1321503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103463
24037	NC_012804	ATC	2	6	1321597	1321602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103463
24038	NC_012804	CAG	2	6	1321632	1321637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103463
24039	NC_012804	AGG	2	6	1321643	1321648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103463
24040	NC_012804	TCG	2	6	1321670	1321675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103463
24041	NC_012804	TCC	2	6	1321712	1321717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103463
24042	NC_012804	TCAGGC	2	12	1321922	1321933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	240103464
24043	NC_012804	GAT	2	6	1321942	1321947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103464
24044	NC_012804	CAACTA	2	12	1321962	1321973	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	240103464
24045	NC_012804	C	6	6	1322015	1322020	0 %	0 %	0 %	100 %	240103464
24046	NC_012804	GGCT	2	8	1322021	1322028	0 %	25 %	50 %	25 %	240103464
24047	NC_012804	AGG	2	6	1322030	1322035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103464
24048	NC_012804	AG	3	6	1322087	1322092	50 %	0 %	50 %	0 %	240103464
24049	NC_012804	TCG	2	6	1322149	1322154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103464
24050	NC_012804	ATA	2	6	1322305	1322310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103464
24051	NC_012804	ACA	2	6	1322333	1322338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103464
24052	NC_012804	CTC	2	6	1322404	1322409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103464
24053	NC_012804	TAC	2	6	1322506	1322511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103464
24054	NC_012804	AGG	2	6	1322784	1322789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103465
24055	NC_012804	GA	3	6	1322835	1322840	50 %	0 %	50 %	0 %	240103465
24056	NC_012804	TCG	2	6	1322971	1322976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103465
24057	NC_012804	GGC	2	6	1323141	1323146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103465
24058	NC_012804	ACC	2	6	1323230	1323235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103465
24059	NC_012804	TCC	2	6	1323244	1323249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103465
24060	NC_012804	CGT	2	6	1323326	1323331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103465
24061	NC_012804	AAAAG	2	10	1323401	1323410	80 %	0 %	20 %	0 %	240103465
24062	NC_012804	GACGA	2	10	1323465	1323474	40 %	0 %	40 %	20 %	240103465
24063	NC_012804	GA	4	8	1323483	1323490	50 %	0 %	50 %	0 %	240103465
24064	NC_012804	CG	3	6	1323541	1323546	0 %	0 %	50 %	50 %	240103465
24065	NC_012804	GCC	2	6	1323564	1323569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103465
24066	NC_012804	CAT	2	6	1323719	1323724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103465
24067	NC_012804	AGA	2	6	1323804	1323809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103465
24068	NC_012804	ACGT	2	8	1323810	1323817	25 %	25 %	25 %	25 %	240103465
24069	NC_012804	AGG	2	6	1323823	1323828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103465
24070	NC_012804	CAA	3	9	1324174	1324182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103466
24071	NC_012804	TGA	2	6	1324191	1324196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103466
24072	NC_012804	CCT	2	6	1324282	1324287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103466
24073	NC_012804	ACCTC	2	10	1324403	1324412	20 %	20 %	0 %	60 %	240103466
24074	NC_012804	AGA	2	6	1324415	1324420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103466
24075	NC_012804	CAC	2	6	1324694	1324699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103467
24076	NC_012804	GGA	2	6	1324714	1324719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103467
24077	NC_012804	CG	3	6	1324723	1324728	0 %	0 %	50 %	50 %	240103467
24078	NC_012804	CGA	2	6	1324777	1324782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103467
24079	NC_012804	GGA	2	6	1324800	1324805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103467
24080	NC_012804	ACG	2	6	1324848	1324853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103467
24081	NC_012804	ACG	2	6	1324904	1324909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103467
24082	NC_012804	GAA	2	6	1324998	1325003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103467
24083	NC_012804	GAG	2	6	1325011	1325016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103467
24084	NC_012804	GAA	2	6	1325089	1325094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103467
24085	NC_012804	TCG	2	6	1325181	1325186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103467
24086	NC_012804	GAC	2	6	1325213	1325218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103467
24087	NC_012804	AGG	2	6	1325229	1325234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103467
24088	NC_012804	GAG	2	6	1325264	1325269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103467
24089	NC_012804	CGT	2	6	1325323	1325328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103467
24090	NC_012804	TGAC	2	8	1325331	1325338	25 %	25 %	25 %	25 %	240103467
24091	NC_012804	ATA	2	6	1325351	1325356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103467
24092	NC_012804	ACT	2	6	1325375	1325380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103467
24093	NC_012804	GAG	2	6	1325461	1325466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103467
24094	NC_012804	TGA	2	6	1325470	1325475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103467
24095	NC_012804	CCTT	2	8	1325483	1325490	0 %	50 %	0 %	50 %	240103467
24096	NC_012804	GAG	2	6	1325492	1325497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103467
24097	NC_012804	CGA	2	6	1325636	1325641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103468
24098	NC_012804	TCC	2	6	1325713	1325718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103468
24099	NC_012804	AGG	2	6	1325719	1325724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103468
24100	NC_012804	AAG	2	6	1325952	1325957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103468
24101	NC_012804	GAA	2	6	1325961	1325966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103468
24102	NC_012804	GGA	2	6	1325987	1325992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103468
24103	NC_012804	TC	4	8	1325998	1326005	0 %	50 %	0 %	50 %	240103468
24104	NC_012804	CGG	2	6	1326046	1326051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103469
24105	NC_012804	CGG	2	6	1326139	1326144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103469
24106	NC_012804	ACC	2	6	1326225	1326230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103469
24107	NC_012804	GGT	2	6	1326266	1326271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103469
24108	NC_012804	ACCC	2	8	1326520	1326527	25 %	0 %	0 %	75 %	240103469
24109	NC_012804	CGAGAC	2	12	1326589	1326600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103469
24110	NC_012804	CGT	2	6	1326642	1326647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103469
24111	NC_012804	AGGC	2	8	1326735	1326742	25 %	0 %	50 %	25 %	240103469
24112	NC_012804	GC	3	6	1326784	1326789	0 %	0 %	50 %	50 %	240103469
24113	NC_012804	TCA	2	6	1326837	1326842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103469
24114	NC_012804	GTC	2	6	1326851	1326856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103469
24115	NC_012804	GAG	2	6	1326865	1326870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103469
24116	NC_012804	GAT	2	6	1326941	1326946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103470
24117	NC_012804	GAG	2	6	1326989	1326994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103470
24118	NC_012804	CTGAC	2	10	1327041	1327050	20 %	20 %	20 %	40 %	240103470
24119	NC_012804	GAG	3	9	1327238	1327246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103470
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24131	NC_012804	ACG	2	6	1328016	1328021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103470
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24134	NC_012804	GAG	2	6	1328057	1328062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103470
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24230	NC_012804	CGA	2	6	1333832	1333837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103477
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24232	NC_012804	CTC	2	6	1333896	1333901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103477
24233	NC_012804	TCA	2	6	1333982	1333987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103477
24234	NC_012804	TCT	2	6	1334060	1334065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103477
24235	NC_012804	AGCGT	2	10	1334081	1334090	20 %	20 %	40 %	20 %	240103477
24236	NC_012804	CTC	2	6	1334094	1334099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103477
24237	NC_012804	GCCG	2	8	1334242	1334249	0 %	0 %	50 %	50 %	240103477
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24248	NC_012804	TC	3	6	1334814	1334819	0 %	50 %	0 %	50 %	240103478
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24263	NC_012804	GT	3	6	1335559	1335564	0 %	50 %	50 %	0 %	240103479
24264	NC_012804	TGA	2	6	1335570	1335575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103479
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24463	NC_012804	TCG	2	6	1346154	1346159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103491
24464	NC_012804	TC	3	6	1346186	1346191	0 %	50 %	0 %	50 %	240103491
24465	NC_012804	CTC	2	6	1346198	1346203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103491
24466	NC_012804	ATC	2	6	1346234	1346239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103491
24467	NC_012804	TCC	3	9	1346292	1346300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103491
24468	NC_012804	GGT	2	6	1346308	1346313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103491
24469	NC_012804	GAG	2	6	1346345	1346350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103491
24470	NC_012804	CTC	2	6	1346429	1346434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103491
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24472	NC_012804	CTG	2	6	1346972	1346977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103492
24473	NC_012804	CGT	2	6	1346980	1346985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103492
24474	NC_012804	GGC	2	6	1346986	1346991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103492
24475	NC_012804	AGA	2	6	1347019	1347024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103492
24476	NC_012804	CGTTC	2	10	1347058	1347067	0 %	40 %	20 %	40 %	240103492
24477	NC_012804	GAG	2	6	1347101	1347106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103492
24478	NC_012804	GTTAAG	2	12	1347116	1347127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103492
24479	NC_012804	GAA	2	6	1347184	1347189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103492
24480	NC_012804	CGCT	2	8	1347413	1347420	0 %	25 %	25 %	50 %	240103492
24481	NC_012804	TAC	3	9	1347443	1347451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103492
24482	NC_012804	TCG	2	6	1347474	1347479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103492
24483	NC_012804	AGA	2	6	1347480	1347485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103492
24484	NC_012804	GAA	2	6	1347541	1347546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103492
24485	NC_012804	GTC	2	6	1347554	1347559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103492
24486	NC_012804	TCG	2	6	1347591	1347596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103492
24487	NC_012804	ACT	2	6	1347612	1347617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103492
24488	NC_012804	AGC	2	6	1347642	1347647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103492
24489	NC_012804	GAG	2	6	1347674	1347679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103492
24490	NC_012804	ACT	2	6	1347708	1347713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103492
24491	NC_012804	GAA	2	6	1347793	1347798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103492
24492	NC_012804	C	6	6	1347801	1347806	0 %	0 %	0 %	100 %	240103492
24493	NC_012804	TCC	2	6	1347837	1347842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103492
24494	NC_012804	ACC	2	6	1347876	1347881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103492
24495	NC_012804	GCC	2	6	1347895	1347900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103492
24496	NC_012804	GAG	2	6	1347923	1347928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103492
24497	NC_012804	CCT	2	6	1348160	1348165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103493
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24499	NC_012804	CTC	2	6	1348314	1348319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103493
24500	NC_012804	CG	3	6	1348408	1348413	0 %	0 %	50 %	50 %	240103493

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