MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_012804	ATA	2	6	1291872	1291877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103427
23502	NC_012804	CAT	2	6	1291982	1291987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103427
23503	NC_012804	AGG	2	6	1291998	1292003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103427
23504	NC_012804	GAA	2	6	1292011	1292016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103427
23505	NC_012804	GGGA	2	8	1292025	1292032	25 %	0 %	75 %	0 %	240103427
23506	NC_012804	CAG	2	6	1292050	1292055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103427
23507	NC_012804	ATTCT	2	10	1292056	1292065	20 %	60 %	0 %	20 %	240103427
23508	NC_012804	TGA	2	6	1292095	1292100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103427
23509	NC_012804	ATA	2	6	1292141	1292146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103427
23510	NC_012804	TTC	2	6	1292207	1292212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103427
23511	NC_012804	TC	3	6	1292211	1292216	0 %	50 %	0 %	50 %	240103427
23512	NC_012804	CAT	2	6	1292299	1292304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103427
23513	NC_012804	A	7	7	1292412	1292418	100 %	0 %	0 %	0 %	240103427
23514	NC_012804	CTTC	2	8	1292449	1292456	0 %	50 %	0 %	50 %	240103427
23515	NC_012804	G	6	6	1292474	1292479	0 %	0 %	100 %	0 %	240103427
23516	NC_012804	TACT	2	8	1292507	1292514	25 %	50 %	0 %	25 %	240103428
23517	NC_012804	CCT	2	6	1292592	1292597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103428
23518	NC_012804	TGACT	2	10	1292692	1292701	20 %	40 %	20 %	20 %	240103428
23519	NC_012804	GT	3	6	1292703	1292708	0 %	50 %	50 %	0 %	240103428
23520	NC_012804	TATTT	2	10	1292789	1292798	20 %	80 %	0 %	0 %	240103428
23521	NC_012804	T	6	6	1292844	1292849	0 %	100 %	0 %	0 %	240103428
23522	NC_012804	TTC	2	6	1292854	1292859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103428
23523	NC_012804	CTTCCC	2	12	1292953	1292964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103428
23524	NC_012804	CTT	2	6	1292965	1292970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103428
23525	NC_012804	TCT	2	6	1292982	1292987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103428
23526	NC_012804	ATA	2	6	1293040	1293045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103428
23527	NC_012804	CT	3	6	1293097	1293102	0 %	50 %	0 %	50 %	240103428
23528	NC_012804	CTC	2	6	1293199	1293204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103428
23529	NC_012804	TGG	2	6	1293264	1293269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103428
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23532	NC_012804	C	6	6	1293430	1293435	0 %	0 %	0 %	100 %	240103428
23533	NC_012804	GA	3	6	1293464	1293469	50 %	0 %	50 %	0 %	240103428
23534	NC_012804	AAC	2	6	1293488	1293493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103428
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23536	NC_012804	AAT	2	6	1293608	1293613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103429
23537	NC_012804	ACT	2	6	1293627	1293632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103429
23538	NC_012804	T	6	6	1293698	1293703	0 %	100 %	0 %	0 %	240103429
23539	NC_012804	CTC	2	6	1293734	1293739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103429
23540	NC_012804	TGA	2	6	1293754	1293759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103429
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23542	NC_012804	GAA	2	6	1293890	1293895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103429
23543	NC_012804	TGA	2	6	1293991	1293996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103429
23544	NC_012804	CGTGCC	2	12	1294015	1294026	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	240103429
23545	NC_012804	A	6	6	1294141	1294146	100 %	0 %	0 %	0 %	240103430
23546	NC_012804	GGT	2	6	1294155	1294160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103430
23547	NC_012804	GAG	2	6	1294171	1294176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103430
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23550	NC_012804	GAC	2	6	1294396	1294401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103430
23551	NC_012804	TCA	2	6	1294403	1294408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103430
23552	NC_012804	TCG	2	6	1294430	1294435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103430
23553	NC_012804	GAGAA	2	10	1294468	1294477	60 %	0 %	40 %	0 %	240103430
23554	NC_012804	CTG	2	6	1294507	1294512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103430
23555	NC_012804	GAG	2	6	1294522	1294527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103430
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23557	NC_012804	GAA	2	6	1294581	1294586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103430
23558	NC_012804	T	6	6	1294611	1294616	0 %	100 %	0 %	0 %	240103431
23559	NC_012804	CCA	2	6	1294747	1294752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103431
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23570	NC_012804	CCT	2	6	1295232	1295237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103432
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23593	NC_012804	GGA	2	6	1296206	1296211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103433
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23600	NC_012804	AGTCGA	2	12	1296481	1296492	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240103434
23601	NC_012804	CAG	2	6	1296515	1296520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103434
23602	NC_012804	CTC	2	6	1296626	1296631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103434
23603	NC_012804	TCC	2	6	1296676	1296681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103434
23604	NC_012804	TGA	2	6	1296682	1296687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103434
23605	NC_012804	TCG	2	6	1296732	1296737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103434
23606	NC_012804	TGG	2	6	1296788	1296793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103434
23607	NC_012804	CCT	3	9	1296832	1296840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103434
23608	NC_012804	GCTG	2	8	1296842	1296849	0 %	25 %	50 %	25 %	240103434
23609	NC_012804	TC	3	6	1296857	1296862	0 %	50 %	0 %	50 %	240103434
23610	NC_012804	CTCAGG	2	12	1296878	1296889	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	240103434
23611	NC_012804	ACG	2	6	1296939	1296944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103434
23612	NC_012804	TGGC	2	8	1297091	1297098	0 %	25 %	50 %	25 %	240103434
23613	NC_012804	ACC	2	6	1297109	1297114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103434
23614	NC_012804	CAT	2	6	1297118	1297123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103434
23615	NC_012804	GAC	3	9	1297127	1297135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103434
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23617	NC_012804	TAT	2	6	1297241	1297246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103434
23618	NC_012804	CGC	2	6	1297247	1297252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103434
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23849	NC_012804	GAA	2	6	1311525	1311530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103452
23850	NC_012804	C	6	6	1311541	1311546	0 %	0 %	0 %	100 %	240103452
23851	NC_012804	ATA	2	6	1311643	1311648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103452
23852	NC_012804	ATA	2	6	1311763	1311768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103452
23853	NC_012804	GAG	2	6	1311834	1311839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103452
23854	NC_012804	CTC	2	6	1311889	1311894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103452
23855	NC_012804	GAG	2	6	1311955	1311960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103452
23856	NC_012804	CTGGGA	2	12	1312023	1312034	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	240103452
23857	NC_012804	CTG	2	6	1312114	1312119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103452
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23964	NC_012804	CAA	2	6	1317451	1317456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103458
23965	NC_012804	TGA	2	6	1317643	1317648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103458
23966	NC_012804	CCT	2	6	1317740	1317745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103459
23967	NC_012804	ATT	2	6	1317907	1317912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103459
23968	NC_012804	CGC	2	6	1317923	1317928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103459
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23970	NC_012804	AGCA	2	8	1317957	1317964	50 %	0 %	25 %	25 %	240103459
23971	NC_012804	GCTCC	2	10	1317989	1317998	0 %	20 %	20 %	60 %	240103459
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23975	NC_012804	GTA	2	6	1318161	1318166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103459
23976	NC_012804	CCG	2	6	1318205	1318210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103459
23977	NC_012804	CGC	2	6	1318239	1318244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103459
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23979	NC_012804	CGT	2	6	1318380	1318385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103459
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23982	NC_012804	ATC	2	6	1318465	1318470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103459
23983	NC_012804	TCC	2	6	1318516	1318521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103459
23984	NC_012804	C	8	8	1318586	1318593	0 %	0 %	0 %	100 %	240103459
23985	NC_012804	CCT	2	6	1318632	1318637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103459
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23987	NC_012804	TTC	2	6	1318894	1318899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103460
23988	NC_012804	CTG	2	6	1318990	1318995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103460
23989	NC_012804	GCT	2	6	1319158	1319163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103460
23990	NC_012804	CTC	2	6	1319179	1319184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103460
23991	NC_012804	TCG	2	6	1319252	1319257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103460
23992	NC_012804	ATA	2	6	1319278	1319283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103460
23993	NC_012804	CTC	2	6	1319338	1319343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103460
23994	NC_012804	TCA	2	6	1319387	1319392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103460
23995	NC_012804	ACA	2	6	1319396	1319401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103460
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23997	NC_012804	CGA	3	9	1319432	1319440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103460
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23999	NC_012804	CGG	3	9	1319516	1319524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103460
24000	NC_012804	ATC	2	6	1319545	1319550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103460

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