MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_012804	TCG	2	6	1264890	1264895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103399
23002	NC_012804	GCC	2	6	1264916	1264921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103399
23003	NC_012804	CTC	2	6	1264940	1264945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103399
23004	NC_012804	C	6	6	1265019	1265024	0 %	0 %	0 %	100 %	240103399
23005	NC_012804	TC	3	6	1265111	1265116	0 %	50 %	0 %	50 %	240103399
23006	NC_012804	CTC	2	6	1265120	1265125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103399
23007	NC_012804	CTC	2	6	1265204	1265209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103399
23008	NC_012804	TCC	2	6	1265214	1265219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103399
23009	NC_012804	GAACG	2	10	1265225	1265234	40 %	0 %	40 %	20 %	240103399
23010	NC_012804	TGA	2	6	1265260	1265265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103399
23011	NC_012804	CAA	2	6	1265293	1265298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103399
23012	NC_012804	AGTGGC	2	12	1265356	1265367	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	240103399
23013	NC_012804	TGT	2	6	1265416	1265421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103399
23014	NC_012804	AAGG	2	8	1265507	1265514	50 %	0 %	50 %	0 %	240103399
23015	NC_012804	AGT	2	6	1265530	1265535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103399
23016	NC_012804	CGA	2	6	1265539	1265544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103399
23017	NC_012804	GTAC	2	8	1265545	1265552	25 %	25 %	25 %	25 %	240103399
23018	NC_012804	CCT	2	6	1265606	1265611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103400
23019	NC_012804	GAG	2	6	1265624	1265629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103400
23020	NC_012804	CGT	2	6	1265711	1265716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103400
23021	NC_012804	GTG	2	6	1265736	1265741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103400
23022	NC_012804	GGT	2	6	1265759	1265764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103400
23023	NC_012804	TGT	2	6	1265768	1265773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103400
23024	NC_012804	GTT	2	6	1265775	1265780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103400
23025	NC_012804	TG	3	6	1265786	1265791	0 %	50 %	50 %	0 %	240103400
23026	NC_012804	GTG	2	6	1265814	1265819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103400
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23028	NC_012804	TCC	2	6	1265918	1265923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103400
23029	NC_012804	AC	3	6	1266019	1266024	50 %	0 %	0 %	50 %	240103400
23030	NC_012804	AGGGA	2	10	1266106	1266115	40 %	0 %	60 %	0 %	240103400
23031	NC_012804	GGAC	2	8	1266157	1266164	25 %	0 %	50 %	25 %	240103400
23032	NC_012804	TCC	2	6	1266285	1266290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103400
23033	NC_012804	CAA	2	6	1266301	1266306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103400
23034	NC_012804	GTTC	2	8	1266335	1266342	0 %	50 %	25 %	25 %	240103400
23035	NC_012804	TTG	2	6	1266372	1266377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103400
23036	NC_012804	CAT	2	6	1266427	1266432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103400
23037	NC_012804	ATCC	2	8	1266440	1266447	25 %	25 %	0 %	50 %	240103400
23038	NC_012804	TC	3	6	1266464	1266469	0 %	50 %	0 %	50 %	240103400
23039	NC_012804	TC	3	6	1266487	1266492	0 %	50 %	0 %	50 %	240103400
23040	NC_012804	GCCA	2	8	1266501	1266508	25 %	0 %	25 %	50 %	240103400
23041	NC_012804	CCG	2	6	1266546	1266551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103400
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23043	NC_012804	CGG	2	6	1266676	1266681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103400
23044	NC_012804	TTCCGT	2	12	1266697	1266708	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	240103400
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23046	NC_012804	C	6	6	1266813	1266818	0 %	0 %	0 %	100 %	240103400
23047	NC_012804	CAC	2	6	1266932	1266937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103400
23048	NC_012804	GAT	2	6	1266980	1266985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103400
23049	NC_012804	CAT	2	6	1267043	1267048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103400
23050	NC_012804	ATA	2	6	1267144	1267149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103400
23051	NC_012804	TCC	3	9	1267202	1267210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103401
23052	NC_012804	TC	3	6	1267279	1267284	0 %	50 %	0 %	50 %	240103401
23053	NC_012804	TTG	2	6	1267439	1267444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103401
23054	NC_012804	CTCG	2	8	1267486	1267493	0 %	25 %	25 %	50 %	240103401
23055	NC_012804	TAT	2	6	1267510	1267515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103401
23056	NC_012804	ACG	2	6	1267532	1267537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103401
23057	NC_012804	GTC	2	6	1267579	1267584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103402
23058	NC_012804	GTA	2	6	1267678	1267683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103402
23059	NC_012804	CTC	2	6	1267706	1267711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103402
23060	NC_012804	A	6	6	1267721	1267726	100 %	0 %	0 %	0 %	240103402
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23063	NC_012804	TC	3	6	1267833	1267838	0 %	50 %	0 %	50 %	240103402
23064	NC_012804	GAC	2	6	1267969	1267974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103403
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23066	NC_012804	GCG	2	6	1268176	1268181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103403
23067	NC_012804	CCT	2	6	1268247	1268252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103403
23068	NC_012804	TTC	2	6	1268324	1268329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103403
23069	NC_012804	AAG	2	6	1268386	1268391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103403
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23101	NC_012804	A	6	6	1269831	1269836	100 %	0 %	0 %	0 %	240103405
23102	NC_012804	AGGG	2	8	1269937	1269944	25 %	0 %	75 %	0 %	240103406
23103	NC_012804	CT	3	6	1269951	1269956	0 %	50 %	0 %	50 %	240103406
23104	NC_012804	CTC	2	6	1270001	1270006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103406
23105	NC_012804	A	6	6	1270053	1270058	100 %	0 %	0 %	0 %	240103406
23106	NC_012804	ACCTCT	2	12	1270080	1270091	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	240103406
23107	NC_012804	GT	3	6	1270191	1270196	0 %	50 %	50 %	0 %	240103406
23108	NC_012804	GGC	2	6	1270210	1270215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103406
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23112	NC_012804	TTC	2	6	1270417	1270422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103407
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23114	NC_012804	TCC	2	6	1270449	1270454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103407
23115	NC_012804	TC	3	6	1270486	1270491	0 %	50 %	0 %	50 %	240103407
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23117	NC_012804	TCTCC	2	10	1270596	1270605	0 %	40 %	0 %	60 %	240103407
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23233	NC_012804	AACGAG	2	12	1276973	1276984	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	240103415
23234	NC_012804	CTCG	2	8	1277045	1277052	0 %	25 %	25 %	50 %	240103415
23235	NC_012804	GAA	3	9	1277135	1277143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103415
23236	NC_012804	GCA	2	6	1277145	1277150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103415
23237	NC_012804	GAA	2	6	1277300	1277305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103415
23238	NC_012804	CT	3	6	1277348	1277353	0 %	50 %	0 %	50 %	240103415
23239	NC_012804	TCA	2	6	1277419	1277424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103415
23240	NC_012804	GTG	2	6	1277438	1277443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103415
23241	NC_012804	CCT	2	6	1277464	1277469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103415
23242	NC_012804	GAA	2	6	1277555	1277560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103415
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23244	NC_012804	CCG	2	6	1277616	1277621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103415
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23248	NC_012804	CGA	2	6	1277881	1277886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103415
23249	NC_012804	AGGGA	2	10	1277910	1277919	40 %	0 %	60 %	0 %	240103415
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23254	NC_012804	ATCT	2	8	1278418	1278425	25 %	50 %	0 %	25 %	240103416
23255	NC_012804	TC	3	6	1278474	1278479	0 %	50 %	0 %	50 %	240103416
23256	NC_012804	CTC	2	6	1278595	1278600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103416
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23347	NC_012804	GGA	2	6	1284336	1284341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103421
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23349	NC_012804	GAA	2	6	1284483	1284488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103421
23350	NC_012804	AGG	2	6	1284520	1284525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103421
23351	NC_012804	AGAA	2	8	1284536	1284543	75 %	0 %	25 %	0 %	240103421
23352	NC_012804	GGGA	2	8	1284559	1284566	25 %	0 %	75 %	0 %	240103421
23353	NC_012804	CTG	2	6	1285264	1285269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103422
23354	NC_012804	CTG	2	6	1285279	1285284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103422
23355	NC_012804	ACGG	2	8	1285345	1285352	25 %	0 %	50 %	25 %	240103422
23356	NC_012804	TTGG	2	8	1285474	1285481	0 %	50 %	50 %	0 %	240103422
23357	NC_012804	CTG	2	6	1285558	1285563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103422
23358	NC_012804	ACGG	2	8	1285570	1285577	25 %	0 %	50 %	25 %	240103422
23359	NC_012804	GTC	2	6	1285603	1285608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103422
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23365	NC_012804	GGACGG	2	12	1285749	1285760	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	240103422
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23369	NC_012804	ACCGAC	2	12	1285966	1285977	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	240103422
23370	NC_012804	GAG	2	6	1285999	1286004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103422
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23429	NC_012804	GAGG	2	8	1288922	1288929	25 %	0 %	75 %	0 %	240103423
23430	NC_012804	CGA	2	6	1288990	1288995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103423
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23433	NC_012804	GGA	2	6	1289113	1289118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103423
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23442	NC_012804	CA	3	6	1289553	1289558	50 %	0 %	0 %	50 %	240103424
23443	NC_012804	GAA	2	6	1289563	1289568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103424
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23451	NC_012804	CTC	3	9	1289807	1289815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103424
23452	NC_012804	CAA	2	6	1289836	1289841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103424
23453	NC_012804	A	6	6	1289851	1289856	100 %	0 %	0 %	0 %	240103424
23454	NC_012804	AGG	2	6	1289865	1289870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103424
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23458	NC_012804	TGA	2	6	1290030	1290035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103424
23459	NC_012804	TTC	3	9	1290086	1290094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103424
23460	NC_012804	CGG	2	6	1290118	1290123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103424
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23462	NC_012804	CTC	2	6	1290155	1290160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103424
23463	NC_012804	CGT	2	6	1290175	1290180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103424
23464	NC_012804	CCG	2	6	1290207	1290212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103424
23465	NC_012804	GAC	2	6	1290259	1290264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103424
23466	NC_012804	GAA	2	6	1290286	1290291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103424
23467	NC_012804	CGT	2	6	1290304	1290309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103424
23468	NC_012804	CTA	2	6	1290322	1290327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103424
23469	NC_012804	GCTG	2	8	1290356	1290363	0 %	25 %	50 %	25 %	240103424
23470	NC_012804	CGA	2	6	1290444	1290449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103424
23471	NC_012804	GGC	2	6	1290534	1290539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103425
23472	NC_012804	GGT	2	6	1290546	1290551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103425
23473	NC_012804	AGGC	2	8	1290558	1290565	25 %	0 %	50 %	25 %	240103425
23474	NC_012804	GAG	2	6	1290568	1290573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103425
23475	NC_012804	GGT	2	6	1290600	1290605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103425
23476	NC_012804	TTCA	2	8	1290643	1290650	25 %	50 %	0 %	25 %	240103425
23477	NC_012804	TCG	2	6	1290662	1290667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103425
23478	NC_012804	CAC	2	6	1290723	1290728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103425
23479	NC_012804	GAT	2	6	1290817	1290822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103425
23480	NC_012804	C	6	6	1290865	1290870	0 %	0 %	0 %	100 %	240103426
23481	NC_012804	ACG	2	6	1290931	1290936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103426
23482	NC_012804	CTTTC	2	10	1290939	1290948	0 %	60 %	0 %	40 %	240103426
23483	NC_012804	TC	3	6	1290982	1290987	0 %	50 %	0 %	50 %	240103426
23484	NC_012804	CTC	2	6	1291116	1291121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103426
23485	NC_012804	CGA	2	6	1291136	1291141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103426
23486	NC_012804	TGT	2	6	1291196	1291201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103426
23487	NC_012804	GCT	2	6	1291232	1291237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103426
23488	NC_012804	TCTCGA	2	12	1291367	1291378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	240103426
23489	NC_012804	GAC	2	6	1291478	1291483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103427
23490	NC_012804	GAG	2	6	1291490	1291495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103427
23491	NC_012804	C	6	6	1291545	1291550	0 %	0 %	0 %	100 %	240103427
23492	NC_012804	CGG	2	6	1291579	1291584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103427
23493	NC_012804	AGT	2	6	1291585	1291590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103427
23494	NC_012804	AAG	2	6	1291632	1291637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103427
23495	NC_012804	GGA	2	6	1291690	1291695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103427
23496	NC_012804	GA	3	6	1291748	1291753	50 %	0 %	50 %	0 %	240103427
23497	NC_012804	GT	3	6	1291762	1291767	0 %	50 %	50 %	0 %	240103427
23498	NC_012804	AAC	2	6	1291784	1291789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103427
23499	NC_012804	CATT	2	8	1291813	1291820	25 %	50 %	0 %	25 %	240103427
23500	NC_012804	TA	3	6	1291827	1291832	50 %	50 %	0 %	0 %	240103427

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