MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_012804	CGT	2	6	1237099	1237104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103369
22502	NC_012804	CCA	2	6	1237111	1237116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103369
22503	NC_012804	CTTT	2	8	1237120	1237127	0 %	75 %	0 %	25 %	240103369
22504	NC_012804	CGG	2	6	1237138	1237143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103369
22505	NC_012804	CGA	2	6	1237168	1237173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103369
22506	NC_012804	GCG	2	6	1237407	1237412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103369
22507	NC_012804	CTT	2	6	1237553	1237558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103369
22508	NC_012804	TC	5	10	1237773	1237782	0 %	50 %	0 %	50 %	240103370
22509	NC_012804	ACCC	2	8	1237788	1237795	25 %	0 %	0 %	75 %	240103370
22510	NC_012804	TCA	2	6	1237822	1237827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103370
22511	NC_012804	GGAG	2	8	1237875	1237882	25 %	0 %	75 %	0 %	240103370
22512	NC_012804	TAT	2	6	1237893	1237898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103370
22513	NC_012804	CTG	2	6	1237938	1237943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103370
22514	NC_012804	GAT	2	6	1237989	1237994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103370
22515	NC_012804	TC	3	6	1238004	1238009	0 %	50 %	0 %	50 %	240103370
22516	NC_012804	GAG	2	6	1238019	1238024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103370
22517	NC_012804	GAG	2	6	1238049	1238054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103370
22518	NC_012804	GAG	2	6	1238094	1238099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103370
22519	NC_012804	CTT	2	6	1238130	1238135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103370
22520	NC_012804	AAG	2	6	1238155	1238160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103370
22521	NC_012804	CTC	2	6	1238178	1238183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103370
22522	NC_012804	TTG	2	6	1238198	1238203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103370
22523	NC_012804	GGA	2	6	1238252	1238257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103370
22524	NC_012804	TGA	2	6	1238375	1238380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103370
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22527	NC_012804	CGA	2	6	1238480	1238485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103370
22528	NC_012804	TCC	2	6	1238540	1238545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103370
22529	NC_012804	TCC	2	6	1238575	1238580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103370
22530	NC_012804	TGA	2	6	1238639	1238644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103370
22531	NC_012804	GGCCC	2	10	1238690	1238699	0 %	0 %	40 %	60 %	240103370
22532	NC_012804	TCC	2	6	1238767	1238772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103370
22533	NC_012804	CCT	2	6	1238790	1238795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103370
22534	NC_012804	TCC	2	6	1238803	1238808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103370
22535	NC_012804	ACG	2	6	1238809	1238814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103370
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22537	NC_012804	GCCC	2	8	1239020	1239027	0 %	0 %	25 %	75 %	240103371
22538	NC_012804	GTC	2	6	1239062	1239067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103371
22539	NC_012804	GAA	2	6	1239157	1239162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103371
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22541	NC_012804	AAG	2	6	1239268	1239273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103371
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22543	NC_012804	GTA	3	9	1239334	1239342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103371
22544	NC_012804	TCG	2	6	1239344	1239349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103371
22545	NC_012804	CGCTC	2	10	1239366	1239375	0 %	20 %	20 %	60 %	240103371
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22549	NC_012804	TCC	2	6	1239437	1239442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103371
22550	NC_012804	GAAC	2	8	1239564	1239571	50 %	0 %	25 %	25 %	240103371
22551	NC_012804	GAG	2	6	1239580	1239585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103371
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22553	NC_012804	CTC	2	6	1239775	1239780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103371
22554	NC_012804	GAG	2	6	1239793	1239798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103371
22555	NC_012804	TC	3	6	1239874	1239879	0 %	50 %	0 %	50 %	240103371
22556	NC_012804	GCC	2	6	1239887	1239892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103371
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22559	NC_012804	CCA	2	6	1239911	1239916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103371
22560	NC_012804	CT	3	6	1240067	1240072	0 %	50 %	0 %	50 %	240103371
22561	NC_012804	TCG	2	6	1240074	1240079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103371
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22564	NC_012804	GA	3	6	1240581	1240586	50 %	0 %	50 %	0 %	240103372
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22572	NC_012804	TCC	2	6	1240895	1240900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103372
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22591	NC_012804	GCC	2	6	1242008	1242013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103374
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22593	NC_012804	CTTT	2	8	1242183	1242190	0 %	75 %	0 %	25 %	240103374
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22597	NC_012804	CCAG	2	8	1242268	1242275	25 %	0 %	25 %	50 %	240103374
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22602	NC_012804	TG	3	6	1242456	1242461	0 %	50 %	50 %	0 %	240103374
22603	NC_012804	CG	3	6	1242473	1242478	0 %	0 %	50 %	50 %	240103374
22604	NC_012804	GAGC	2	8	1242486	1242493	25 %	0 %	50 %	25 %	240103374
22605	NC_012804	GC	3	6	1242492	1242497	0 %	0 %	50 %	50 %	240103374
22606	NC_012804	CAT	2	6	1242501	1242506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103374
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22611	NC_012804	TAT	2	6	1242591	1242596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103374
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22735	NC_012804	CAA	2	6	1249363	1249368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103379
22736	NC_012804	CCT	2	6	1249372	1249377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103379
22737	NC_012804	CGAGC	2	10	1249405	1249414	20 %	0 %	40 %	40 %	240103379
22738	NC_012804	GAC	2	6	1249463	1249468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103379
22739	NC_012804	TCA	2	6	1249488	1249493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103379
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22742	NC_012804	TAC	2	6	1249574	1249579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103379
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22750	NC_012804	GTC	2	6	1250295	1250300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103380
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22753	NC_012804	TC	3	6	1250512	1250517	0 %	50 %	0 %	50 %	240103381
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22757	NC_012804	TCCC	2	8	1250850	1250857	0 %	25 %	0 %	75 %	240103381
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22764	NC_012804	AAG	2	6	1250996	1251001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103381
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22841	NC_012804	ACGATA	2	12	1255907	1255918	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	240103388
22842	NC_012804	GGC	2	6	1255953	1255958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103388
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22966	NC_012804	AG	3	6	1263304	1263309	50 %	0 %	50 %	0 %	240103395
22967	NC_012804	GAC	2	6	1263424	1263429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103395
22968	NC_012804	TCC	2	6	1263496	1263501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103396
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22970	NC_012804	GAC	2	6	1263559	1263564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103396
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22981	NC_012804	TGA	2	6	1263936	1263941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103397
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22997	NC_012804	GCTG	2	8	1264618	1264625	0 %	25 %	50 %	25 %	240103398
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