MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_012804	GTC	2	6	1178296	1178301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103310
21502	NC_012804	TGG	2	6	1178328	1178333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103310
21503	NC_012804	GTC	2	6	1178377	1178382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103310
21504	NC_012804	ATG	2	6	1178387	1178392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103310
21505	NC_012804	TCCA	2	8	1178432	1178439	25 %	25 %	0 %	50 %	240103310
21506	NC_012804	AGT	2	6	1178604	1178609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103310
21507	NC_012804	GTGG	2	8	1178629	1178636	0 %	25 %	75 %	0 %	240103310
21508	NC_012804	GAC	2	6	1178671	1178676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103310
21509	NC_012804	TCC	2	6	1178982	1178987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103311
21510	NC_012804	AAAG	2	8	1179257	1179264	75 %	0 %	25 %	0 %	240103311
21511	NC_012804	AGC	2	6	1179326	1179331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103311
21512	NC_012804	TGG	2	6	1179386	1179391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103311
21513	NC_012804	GAA	2	6	1179516	1179521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103311
21514	NC_012804	TCAA	2	8	1179535	1179542	50 %	25 %	0 %	25 %	240103311
21515	NC_012804	CTC	2	6	1179585	1179590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103311
21516	NC_012804	AGG	3	9	1179637	1179645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103311
21517	NC_012804	AAT	2	6	1179654	1179659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103311
21518	NC_012804	AGGG	2	8	1179775	1179782	25 %	0 %	75 %	0 %	240103311
21519	NC_012804	GGAAT	2	10	1180010	1180019	40 %	20 %	40 %	0 %	240103311
21520	NC_012804	AG	3	6	1180086	1180091	50 %	0 %	50 %	0 %	240103311
21521	NC_012804	GGT	2	6	1180126	1180131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103311
21522	NC_012804	CGT	2	6	1180258	1180263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103312
21523	NC_012804	GAG	2	6	1180301	1180306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103312
21524	NC_012804	CG	3	6	1180432	1180437	0 %	0 %	50 %	50 %	240103312
21525	NC_012804	GAG	2	6	1180438	1180443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103312
21526	NC_012804	ACC	2	6	1180451	1180456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103312
21527	NC_012804	CG	3	6	1180476	1180481	0 %	0 %	50 %	50 %	240103312
21528	NC_012804	CAT	2	6	1180672	1180677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103312
21529	NC_012804	CGT	2	6	1180734	1180739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103313
21530	NC_012804	AGA	2	6	1180753	1180758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103313
21531	NC_012804	GATTT	2	10	1180771	1180780	20 %	60 %	20 %	0 %	240103313
21532	NC_012804	CTG	2	6	1180837	1180842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103313
21533	NC_012804	ATGGAC	2	12	1180852	1180863	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240103313
21534	NC_012804	CTT	2	6	1180881	1180886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103313
21535	NC_012804	AAGG	2	8	1180900	1180907	50 %	0 %	50 %	0 %	240103313
21536	NC_012804	CCT	2	6	1181043	1181048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103313
21537	NC_012804	CGG	2	6	1181049	1181054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103313
21538	NC_012804	CAC	2	6	1181223	1181228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103313
21539	NC_012804	GAG	2	6	1181253	1181258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103313
21540	NC_012804	AGC	2	6	1181261	1181266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103313
21541	NC_012804	ATTC	2	8	1181404	1181411	25 %	50 %	0 %	25 %	240103313
21542	NC_012804	GGA	2	6	1181500	1181505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103313
21543	NC_012804	AGG	2	6	1181525	1181530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103313
21544	NC_012804	CAAA	2	8	1181603	1181610	75 %	0 %	0 %	25 %	240103313
21545	NC_012804	CGA	2	6	1181628	1181633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103313
21546	NC_012804	GGC	2	6	1181646	1181651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103313
21547	NC_012804	CG	3	6	1181665	1181670	0 %	0 %	50 %	50 %	240103313
21548	NC_012804	CAA	2	6	1181700	1181705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103313
21549	NC_012804	GGCGAA	2	12	1181709	1181720	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	240103313
21550	NC_012804	GGA	2	6	1181727	1181732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103313
21551	NC_012804	GTC	2	6	1181746	1181751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103313
21552	NC_012804	ACA	2	6	1181786	1181791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103313
21553	NC_012804	TCAAGG	2	12	1181801	1181812	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240103313
21554	NC_012804	TGT	2	6	1182008	1182013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103314
21555	NC_012804	A	7	7	1182051	1182057	100 %	0 %	0 %	0 %	240103314
21556	NC_012804	ACG	2	6	1182076	1182081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103314
21557	NC_012804	CAA	2	6	1182257	1182262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103314
21558	NC_012804	TGA	2	6	1182304	1182309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103314
21559	NC_012804	GGA	2	6	1182317	1182322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103314
21560	NC_012804	GAG	2	6	1182354	1182359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103315
21561	NC_012804	GGCGA	2	10	1182453	1182462	20 %	0 %	60 %	20 %	240103315
21562	NC_012804	GCA	2	6	1182499	1182504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103315
21563	NC_012804	CGG	2	6	1182567	1182572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103315
21564	NC_012804	TTC	2	6	1182700	1182705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103315
21565	NC_012804	CTC	2	6	1182709	1182714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103315
21566	NC_012804	CCT	2	6	1182737	1182742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103315
21567	NC_012804	CCA	2	6	1182836	1182841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103315
21568	NC_012804	C	6	6	1182997	1183002	0 %	0 %	0 %	100 %	240103316
21569	NC_012804	CTA	2	6	1183012	1183017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103316
21570	NC_012804	GGGT	2	8	1183038	1183045	0 %	25 %	75 %	0 %	240103316
21571	NC_012804	TCG	2	6	1183060	1183065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103316
21572	NC_012804	GAA	2	6	1183085	1183090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103316
21573	NC_012804	CAG	2	6	1183124	1183129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103316
21574	NC_012804	GC	3	6	1183138	1183143	0 %	0 %	50 %	50 %	240103316
21575	NC_012804	AACC	2	8	1183265	1183272	50 %	0 %	0 %	50 %	240103316
21576	NC_012804	GGC	2	6	1183274	1183279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103316
21577	NC_012804	ACA	2	6	1183396	1183401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103316
21578	NC_012804	CAA	2	6	1183418	1183423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103316
21579	NC_012804	CGT	2	6	1183586	1183591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103316
21580	NC_012804	CTC	2	6	1183610	1183615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103316
21581	NC_012804	ACT	2	6	1183654	1183659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103316
21582	NC_012804	AGG	2	6	1183708	1183713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103316
21583	NC_012804	GCT	2	6	1183807	1183812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103317
21584	NC_012804	CTTTCT	2	12	1183819	1183830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103317
21585	NC_012804	GTC	2	6	1183892	1183897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103317
21586	NC_012804	GGA	2	6	1183909	1183914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103317
21587	NC_012804	GAC	2	6	1183991	1183996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103317
21588	NC_012804	CTG	2	6	1184003	1184008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103317
21589	NC_012804	TGG	2	6	1184077	1184082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103317
21590	NC_012804	CGC	2	6	1184104	1184109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103317
21591	NC_012804	AG	3	6	1184127	1184132	50 %	0 %	50 %	0 %	240103317
21592	NC_012804	A	6	6	1184230	1184235	100 %	0 %	0 %	0 %	240103317
21593	NC_012804	G	6	6	1184385	1184390	0 %	0 %	100 %	0 %	240103317
21594	NC_012804	TCG	2	6	1184427	1184432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103317
21595	NC_012804	CTA	2	6	1184442	1184447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103317
21596	NC_012804	ACGTTT	2	12	1184454	1184465	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	240103317
21597	NC_012804	CCA	2	6	1184472	1184477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103317
21598	NC_012804	TTA	3	9	1184529	1184537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103317
21599	NC_012804	GA	3	6	1184543	1184548	50 %	0 %	50 %	0 %	240103317
21600	NC_012804	GTG	2	6	1184588	1184593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103317
21601	NC_012804	GAC	2	6	1184778	1184783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103317
21602	NC_012804	TTC	2	6	1184839	1184844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103317
21603	NC_012804	GAT	2	6	1184929	1184934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103317
21604	NC_012804	CAA	2	6	1184947	1184952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103317
21605	NC_012804	GCC	2	6	1184995	1185000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103317
21606	NC_012804	ACG	2	6	1185003	1185008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103317
21607	NC_012804	TTC	2	6	1185009	1185014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103317
21608	NC_012804	AG	3	6	1185023	1185028	50 %	0 %	50 %	0 %	240103317
21609	NC_012804	GGT	2	6	1185043	1185048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103317
21610	NC_012804	GTC	2	6	1185065	1185070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103317
21611	NC_012804	GGT	2	6	1185105	1185110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103317
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21613	NC_012804	AGG	2	6	1185197	1185202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103318
21614	NC_012804	CTT	2	6	1185223	1185228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103318
21615	NC_012804	TCT	2	6	1185275	1185280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103318
21616	NC_012804	AT	3	6	1185307	1185312	50 %	50 %	0 %	0 %	240103318
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21730	NC_012804	TCCT	2	8	1191311	1191318	0 %	50 %	0 %	50 %	240103326
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