MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20003	NC_012804	CCG	2	6	1097403	1097408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103210
20004	NC_012804	ATG	2	6	1097430	1097435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103210
20005	NC_012804	TCA	2	6	1097544	1097549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103211
20006	NC_012804	GAT	2	6	1097569	1097574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103211
20007	NC_012804	CT	3	6	1097804	1097809	0 %	50 %	0 %	50 %	240103211
20008	NC_012804	CTC	2	6	1097829	1097834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103211
20009	NC_012804	CTT	3	9	1097836	1097844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103211
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20012	NC_012804	ACC	2	6	1098007	1098012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103212
20013	NC_012804	TCC	2	6	1098016	1098021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103212
20014	NC_012804	CCT	2	6	1098227	1098232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103212
20015	NC_012804	GAT	2	6	1098287	1098292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103213
20016	NC_012804	ATG	2	6	1098309	1098314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103213
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20049	NC_012804	TGAT	2	8	1099960	1099967	25 %	50 %	25 %	0 %	240103215
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20054	NC_012804	CCCT	2	8	1100294	1100301	0 %	25 %	0 %	75 %	240103215
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20117	NC_012804	TTCA	2	8	1104832	1104839	25 %	50 %	0 %	25 %	240103219
20118	NC_012804	AAC	2	6	1104864	1104869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103220
20119	NC_012804	CTCG	2	8	1104894	1104901	0 %	25 %	25 %	50 %	240103220
20120	NC_012804	TC	3	6	1104986	1104991	0 %	50 %	0 %	50 %	240103220
20121	NC_012804	TCA	2	6	1105078	1105083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103220
20122	NC_012804	CCTT	2	8	1105114	1105121	0 %	50 %	0 %	50 %	240103220
20123	NC_012804	CTC	2	6	1105176	1105181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103220
20124	NC_012804	GC	3	6	1105205	1105210	0 %	0 %	50 %	50 %	240103220
20125	NC_012804	TC	3	6	1105228	1105233	0 %	50 %	0 %	50 %	240103220
20126	NC_012804	TCC	2	6	1105253	1105258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103220
20127	NC_012804	TCC	2	6	1105277	1105282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103220
20128	NC_012804	ACC	2	6	1105456	1105461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103220
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20132	NC_012804	GA	4	8	1105705	1105712	50 %	0 %	50 %	0 %	240103221
20133	NC_012804	ATT	2	6	1105768	1105773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103221
20134	NC_012804	CGG	2	6	1105778	1105783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103221
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20140	NC_012804	GA	3	6	1106019	1106024	50 %	0 %	50 %	0 %	240103221
20141	NC_012804	CTC	2	6	1106110	1106115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103221
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20146	NC_012804	GCTC	2	8	1106395	1106402	0 %	25 %	25 %	50 %	240103222
20147	NC_012804	TCGAC	2	10	1106467	1106476	20 %	20 %	20 %	40 %	240103222
20148	NC_012804	GC	3	6	1106540	1106545	0 %	0 %	50 %	50 %	240103222
20149	NC_012804	TCG	2	6	1106716	1106721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103222
20150	NC_012804	CGT	2	6	1106741	1106746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103222
20151	NC_012804	TGAAG	2	10	1106776	1106785	40 %	20 %	40 %	0 %	240103222
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20156	NC_012804	G	6	6	1106956	1106961	0 %	0 %	100 %	0 %	240103223
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20218	NC_012804	GTT	2	6	1110275	1110280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103225
20219	NC_012804	TTGA	2	8	1110354	1110361	25 %	50 %	25 %	0 %	240103225
20220	NC_012804	GAA	2	6	1110392	1110397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103225
20221	NC_012804	GAA	2	6	1110410	1110415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103225
20222	NC_012804	AGGT	2	8	1110531	1110538	25 %	25 %	50 %	0 %	240103225
20223	NC_012804	T	7	7	1110582	1110588	0 %	100 %	0 %	0 %	240103226
20224	NC_012804	ACAT	2	8	1110599	1110606	50 %	25 %	0 %	25 %	240103226
20225	NC_012804	CATGTG	2	12	1110616	1110627	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	240103226
20226	NC_012804	T	6	6	1110636	1110641	0 %	100 %	0 %	0 %	240103226
20227	NC_012804	TTTA	2	8	1110735	1110742	25 %	75 %	0 %	0 %	240103226
20228	NC_012804	GGA	2	6	1110771	1110776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103226
20229	NC_012804	CGT	2	6	1110793	1110798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103226
20230	NC_012804	AGG	2	6	1110923	1110928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103226
20231	NC_012804	TC	3	6	1110958	1110963	0 %	50 %	0 %	50 %	240103226
20232	NC_012804	GAG	2	6	1111031	1111036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103226
20233	NC_012804	GGA	2	6	1111072	1111077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103226
20234	NC_012804	GAT	2	6	1111136	1111141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103226
20235	NC_012804	GTC	2	6	1111338	1111343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103227
20236	NC_012804	CTT	2	6	1111422	1111427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103227
20237	NC_012804	CTT	2	6	1111455	1111460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103227
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20345	NC_012804	CGA	2	6	1115681	1115686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103229
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20350	NC_012804	TTG	2	6	1116000	1116005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103230
20351	NC_012804	GTT	2	6	1116053	1116058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103230
20352	NC_012804	TGC	2	6	1116126	1116131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103230
20353	NC_012804	TCG	2	6	1116150	1116155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103230
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20355	NC_012804	GTT	2	6	1116176	1116181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103230
20356	NC_012804	TGG	2	6	1116182	1116187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103230
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20362	NC_012804	G	6	6	1116452	1116457	0 %	0 %	100 %	0 %	240103230
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20424	NC_012804	GAG	2	6	1119721	1119726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103235
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20440	NC_012804	ACG	2	6	1120308	1120313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103236
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20453	NC_012804	GAG	2	6	1121045	1121050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103236
20454	NC_012804	CAC	2	6	1121069	1121074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103236
20455	NC_012804	CGA	2	6	1121092	1121097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103236
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20460	NC_012804	AGG	2	6	1121302	1121307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103237
20461	NC_012804	TGT	2	6	1121399	1121404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103237
20462	NC_012804	CGGC	2	8	1121446	1121453	0 %	0 %	50 %	50 %	240103237
20463	NC_012804	CCT	2	6	1121474	1121479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103237
20464	NC_012804	CAT	2	6	1121510	1121515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103237
20465	NC_012804	CT	3	6	1121519	1121524	0 %	50 %	0 %	50 %	240103237
20466	NC_012804	CTGG	2	8	1121609	1121616	0 %	25 %	50 %	25 %	240103237
20467	NC_012804	GTC	2	6	1121617	1121622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103237
20468	NC_012804	TTC	2	6	1121735	1121740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103237
20469	NC_012804	GTC	2	6	1121829	1121834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103237
20470	NC_012804	AGG	2	6	1121839	1121844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103237
20471	NC_012804	TTG	2	6	1121845	1121850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103237
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20473	NC_012804	GCC	2	6	1121913	1121918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103237
20474	NC_012804	TCG	2	6	1121929	1121934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103237
20475	NC_012804	CT	3	6	1122098	1122103	0 %	50 %	0 %	50 %	240103238
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20482	NC_012804	ACC	2	6	1122350	1122355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103238
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20486	NC_012804	TCCC	2	8	1122478	1122485	0 %	25 %	0 %	75 %	240103238
20487	NC_012804	TCC	2	6	1122509	1122514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103238
20488	NC_012804	CCG	2	6	1122546	1122551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103238
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20491	NC_012804	T	6	6	1122775	1122780	0 %	100 %	0 %	0 %	240103239
20492	NC_012804	TCT	2	6	1122844	1122849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103239
20493	NC_012804	CTT	2	6	1122851	1122856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103239
20494	NC_012804	ACG	2	6	1122954	1122959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103239
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20496	NC_012804	CAT	2	6	1122998	1123003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103239
20497	NC_012804	CTC	2	6	1123175	1123180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103239
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20499	NC_012804	TCC	2	6	1123227	1123232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103239
20500	NC_012804	AGT	2	6	1123237	1123242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103239

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