MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012804	CGA	2	6	75943	75948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102138
1502	NC_012804	TGG	2	6	76002	76007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102138
1503	NC_012804	AAG	2	6	76035	76040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102138
1504	NC_012804	A	7	7	76403	76409	100 %	0 %	0 %	0 %	240102139
1505	NC_012804	GAA	2	6	76518	76523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102139
1506	NC_012804	CGG	2	6	76572	76577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102139
1507	NC_012804	GGT	2	6	76597	76602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102139
1508	NC_012804	GAAC	2	8	76667	76674	50 %	0 %	25 %	25 %	240102139
1509	NC_012804	GTC	2	6	76741	76746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102139
1510	NC_012804	GAC	2	6	76768	76773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102139
1511	NC_012804	AGA	2	6	76809	76814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102139
1512	NC_012804	CGA	2	6	76973	76978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102139
1513	NC_012804	GAG	2	6	77017	77022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102139
1514	NC_012804	CG	4	8	77043	77050	0 %	0 %	50 %	50 %	240102139
1515	NC_012804	G	6	6	77120	77125	0 %	0 %	100 %	0 %	240102139
1516	NC_012804	GGCG	2	8	77133	77140	0 %	0 %	75 %	25 %	240102139
1517	NC_012804	CCG	2	6	77158	77163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102139
1518	NC_012804	TGC	2	6	77218	77223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102139
1519	NC_012804	GAA	2	6	77519	77524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102140
1520	NC_012804	CGAG	2	8	77587	77594	25 %	0 %	50 %	25 %	240102140
1521	NC_012804	AAG	2	6	77613	77618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102140
1522	NC_012804	TAC	2	6	77661	77666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102140
1523	NC_012804	AG	3	6	77694	77699	50 %	0 %	50 %	0 %	240102140
1524	NC_012804	AGA	2	6	77792	77797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102140
1525	NC_012804	CCA	2	6	77839	77844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102140
1526	NC_012804	TCC	2	6	77890	77895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102140
1527	NC_012804	GAA	2	6	77922	77927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102140
1528	NC_012804	ACC	2	6	77979	77984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102140
1529	NC_012804	CTCC	2	8	77996	78003	0 %	25 %	0 %	75 %	240102140
1530	NC_012804	CAC	2	6	78020	78025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102140
1531	NC_012804	ATG	2	6	78054	78059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102140
1532	NC_012804	TAT	2	6	78078	78083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102140
1533	NC_012804	CGA	2	6	78212	78217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102140
1534	NC_012804	CAAA	2	8	78290	78297	75 %	0 %	0 %	25 %	240102140
1535	NC_012804	TCC	2	6	78298	78303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102140
1536	NC_012804	ACTCA	2	10	78308	78317	40 %	20 %	0 %	40 %	240102140
1537	NC_012804	A	6	6	78328	78333	100 %	0 %	0 %	0 %	240102140
1538	NC_012804	A	6	6	78341	78346	100 %	0 %	0 %	0 %	240102140
1539	NC_012804	AT	3	6	78364	78369	50 %	50 %	0 %	0 %	240102140
1540	NC_012804	AGACAA	2	12	78410	78421	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	240102140
1541	NC_012804	AT	3	6	78444	78449	50 %	50 %	0 %	0 %	240102140
1542	NC_012804	TTTG	2	8	78542	78549	0 %	75 %	25 %	0 %	240102141
1543	NC_012804	TTTTC	2	10	78551	78560	0 %	80 %	0 %	20 %	240102141
1544	NC_012804	TCC	2	6	78568	78573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102141
1545	NC_012804	G	6	6	78579	78584	0 %	0 %	100 %	0 %	240102141
1546	NC_012804	CTC	2	6	78681	78686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102141
1547	NC_012804	AAT	2	6	78716	78721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102141
1548	NC_012804	GA	3	6	78802	78807	50 %	0 %	50 %	0 %	240102141
1549	NC_012804	AGA	2	6	78812	78817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102141
1550	NC_012804	CAA	2	6	78823	78828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102141
1551	NC_012804	TCC	2	6	78829	78834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102141
1552	NC_012804	ACA	2	6	78849	78854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102141
1553	NC_012804	GAG	2	6	78888	78893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102141
1554	NC_012804	CAG	2	6	78989	78994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102141
1555	NC_012804	TGG	2	6	79150	79155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102141
1556	NC_012804	TAA	2	6	79222	79227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102141
1557	NC_012804	AAGGA	2	10	79252	79261	60 %	0 %	40 %	0 %	240102141
1558	NC_012804	TG	3	6	79299	79304	0 %	50 %	50 %	0 %	240102141
1559	NC_012804	AG	3	6	79310	79315	50 %	0 %	50 %	0 %	240102141
1560	NC_012804	GAA	2	6	79436	79441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102141
1561	NC_012804	AGA	2	6	79485	79490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102141
1562	NC_012804	GCTT	2	8	79550	79557	0 %	50 %	25 %	25 %	240102142
1563	NC_012804	ATT	2	6	79567	79572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102142
1564	NC_012804	ATC	2	6	79617	79622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102142
1565	NC_012804	GA	3	6	79651	79656	50 %	0 %	50 %	0 %	240102142
1566	NC_012804	ACGG	2	8	79726	79733	25 %	0 %	50 %	25 %	240102142
1567	NC_012804	AG	3	6	79763	79768	50 %	0 %	50 %	0 %	240102142
1568	NC_012804	AACG	2	8	79795	79802	50 %	0 %	25 %	25 %	240102142
1569	NC_012804	CAA	2	6	79986	79991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102142
1570	NC_012804	CGG	2	6	80052	80057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102142
1571	NC_012804	GTC	2	6	80110	80115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102142
1572	NC_012804	ATT	2	6	80137	80142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102142
1573	NC_012804	TGG	2	6	80167	80172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102142
1574	NC_012804	GGA	2	6	80314	80319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102142
1575	NC_012804	A	6	6	80396	80401	100 %	0 %	0 %	0 %	240102142
1576	NC_012804	GAG	2	6	80430	80435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102142
1577	NC_012804	CTG	2	6	80474	80479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102142
1578	NC_012804	GGAA	2	8	80483	80490	50 %	0 %	50 %	0 %	240102142
1579	NC_012804	AGGT	2	8	80569	80576	25 %	25 %	50 %	0 %	240102143
1580	NC_012804	GCC	2	6	80634	80639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102143
1581	NC_012804	TCG	2	6	80657	80662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102143
1582	NC_012804	AGT	2	6	80684	80689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102143
1583	NC_012804	CAT	2	6	80760	80765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102143
1584	NC_012804	TGT	2	6	80777	80782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102143
1585	NC_012804	GCA	2	6	80801	80806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102143
1586	NC_012804	ACG	2	6	80917	80922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102143
1587	NC_012804	CCT	2	6	80945	80950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102143
1588	NC_012804	GAACCG	2	12	81001	81012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102143
1589	NC_012804	GACG	2	8	81014	81021	25 %	0 %	50 %	25 %	240102143
1590	NC_012804	CTT	2	6	81024	81029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102143
1591	NC_012804	GGA	2	6	81044	81049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102143
1592	NC_012804	GCG	2	6	81103	81108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102143
1593	NC_012804	CTT	2	6	81114	81119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102143
1594	NC_012804	CTC	2	6	81261	81266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102143
1595	NC_012804	CGA	2	6	81269	81274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102143
1596	NC_012804	CCG	2	6	81275	81280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102143
1597	NC_012804	TCC	2	6	81302	81307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102143
1598	NC_012804	GCG	2	6	81346	81351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102143
1599	NC_012804	ACC	2	6	81354	81359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102143
1600	NC_012804	ACG	2	6	81469	81474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102143
1601	NC_012804	CCT	2	6	81527	81532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102143
1602	NC_012804	GGGA	2	8	81608	81615	25 %	0 %	75 %	0 %	240102143
1603	NC_012804	T	7	7	81627	81633	0 %	100 %	0 %	0 %	240102143
1604	NC_012804	TAACTC	2	12	81636	81647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102143
1605	NC_012804	T	6	6	81928	81933	0 %	100 %	0 %	0 %	240102144
1606	NC_012804	GTA	2	6	82003	82008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102144
1607	NC_012804	CTC	2	6	82141	82146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102144
1608	NC_012804	CGCT	2	8	82166	82173	0 %	25 %	25 %	50 %	240102144
1609	NC_012804	TGT	2	6	82176	82181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102144
1610	NC_012804	TC	3	6	82199	82204	0 %	50 %	0 %	50 %	240102144
1611	NC_012804	ATC	2	6	82291	82296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102144
1612	NC_012804	GA	3	6	82430	82435	50 %	0 %	50 %	0 %	240102144
1613	NC_012804	AGT	2	6	82481	82486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102144
1614	NC_012804	CGC	2	6	82494	82499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102144
1615	NC_012804	TCC	2	6	82583	82588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102144
1616	NC_012804	TCA	2	6	82757	82762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102144
1617	NC_012804	CGGG	2	8	82768	82775	0 %	0 %	75 %	25 %	240102144
1618	NC_012804	CTT	2	6	82783	82788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102144
1619	NC_012804	CGT	2	6	82800	82805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102144
1620	NC_012804	GAG	2	6	82831	82836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102144
1621	NC_012804	CGGG	2	8	83144	83151	0 %	0 %	75 %	25 %	240102145
1622	NC_012804	GAG	2	6	83188	83193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102145
1623	NC_012804	CT	3	6	83346	83351	0 %	50 %	0 %	50 %	240102145
1624	NC_012804	CTGC	2	8	83365	83372	0 %	25 %	25 %	50 %	240102145
1625	NC_012804	GAG	2	6	83470	83475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102145
1626	NC_012804	TCG	2	6	83495	83500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102145
1627	NC_012804	GGAA	2	8	83525	83532	50 %	0 %	50 %	0 %	240102145
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1752	NC_012804	TCA	2	6	90617	90622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102156
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1997	NC_012804	ACG	2	6	103458	103463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102170
1998	NC_012804	GCT	2	6	103619	103624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102170
1999	NC_012804	GTT	2	6	103628	103633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102170
2000	NC_012804	GTC	2	6	103692	103697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102170

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