MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_012804	TGA	2	6	1041075	1041080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103148
19002	NC_012804	GGA	2	6	1041099	1041104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103148
19003	NC_012804	A	6	6	1041123	1041128	100 %	0 %	0 %	0 %	240103148
19004	NC_012804	GAG	2	6	1041141	1041146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103148
19005	NC_012804	TGA	2	6	1041159	1041164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103148
19006	NC_012804	AAT	2	6	1041165	1041170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103148
19007	NC_012804	GAT	2	6	1041181	1041186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103148
19008	NC_012804	AGA	2	6	1041210	1041215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103148
19009	NC_012804	AGG	2	6	1041329	1041334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103148
19010	NC_012804	GCC	2	6	1041427	1041432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103148
19011	NC_012804	GGT	2	6	1041447	1041452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103148
19012	NC_012804	CTT	2	6	1041534	1041539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103148
19013	NC_012804	TAC	2	6	1041547	1041552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103148
19014	NC_012804	GAG	2	6	1041582	1041587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103148
19015	NC_012804	A	6	6	1041615	1041620	100 %	0 %	0 %	0 %	240103148
19016	NC_012804	GA	3	6	1041631	1041636	50 %	0 %	50 %	0 %	240103148
19017	NC_012804	TTCG	2	8	1041660	1041667	0 %	50 %	25 %	25 %	240103148
19018	NC_012804	CTT	2	6	1041696	1041701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103149
19019	NC_012804	TC	3	6	1041726	1041731	0 %	50 %	0 %	50 %	240103149
19020	NC_012804	CCT	2	6	1041732	1041737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103149
19021	NC_012804	CTT	2	6	1041756	1041761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103149
19022	NC_012804	CGGT	2	8	1041788	1041795	0 %	25 %	50 %	25 %	240103149
19023	NC_012804	CT	3	6	1041833	1041838	0 %	50 %	0 %	50 %	240103149
19024	NC_012804	CCT	2	6	1041842	1041847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103149
19025	NC_012804	TTTC	2	8	1041852	1041859	0 %	75 %	0 %	25 %	240103149
19026	NC_012804	TCT	2	6	1041860	1041865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103149
19027	NC_012804	CAA	2	6	1041878	1041883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103149
19028	NC_012804	CCT	2	6	1041885	1041890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103149
19029	NC_012804	GAC	2	6	1041969	1041974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103149
19030	NC_012804	CCG	2	6	1041989	1041994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103149
19031	NC_012804	A	6	6	1042063	1042068	100 %	0 %	0 %	0 %	240103149
19032	NC_012804	CAG	2	6	1042161	1042166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103149
19033	NC_012804	GTTGG	2	10	1042171	1042180	0 %	40 %	60 %	0 %	240103149
19034	NC_012804	GAAGTG	2	12	1042203	1042214	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	240103149
19035	NC_012804	CAC	2	6	1042332	1042337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103149
19036	NC_012804	AGG	2	6	1042360	1042365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103149
19037	NC_012804	GCCG	2	8	1042389	1042396	0 %	0 %	50 %	50 %	240103149
19038	NC_012804	AGT	2	6	1042502	1042507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103149
19039	NC_012804	TCC	2	6	1042580	1042585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103149
19040	NC_012804	GGA	2	6	1042619	1042624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103149
19041	NC_012804	TCC	2	6	1042697	1042702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103149
19042	NC_012804	AGG	2	6	1042714	1042719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103149
19043	NC_012804	AG	3	6	1042727	1042732	50 %	0 %	50 %	0 %	240103149
19044	NC_012804	CGA	2	6	1042733	1042738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103149
19045	NC_012804	GGGTC	2	10	1042787	1042796	0 %	20 %	60 %	20 %	240103149
19046	NC_012804	CGA	2	6	1042802	1042807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103149
19047	NC_012804	GAGG	2	8	1042821	1042828	25 %	0 %	75 %	0 %	240103149
19048	NC_012804	GAG	2	6	1042860	1042865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103149
19049	NC_012804	GAAG	2	8	1042877	1042884	50 %	0 %	50 %	0 %	240103149
19050	NC_012804	TGT	2	6	1043003	1043008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103149
19051	NC_012804	GTA	2	6	1043040	1043045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103149
19052	NC_012804	TGT	2	6	1043060	1043065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103149
19053	NC_012804	ATG	2	6	1043173	1043178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103149
19054	NC_012804	TCG	2	6	1043215	1043220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103149
19055	NC_012804	TCG	2	6	1043323	1043328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103149
19056	NC_012804	GCCG	2	8	1043397	1043404	0 %	0 %	50 %	50 %	240103149
19057	NC_012804	AG	3	6	1043593	1043598	50 %	0 %	50 %	0 %	240103150
19058	NC_012804	GA	3	6	1043607	1043612	50 %	0 %	50 %	0 %	240103150
19059	NC_012804	CAGG	2	8	1043696	1043703	25 %	0 %	50 %	25 %	240103150
19060	NC_012804	TGGA	2	8	1043709	1043716	25 %	25 %	50 %	0 %	240103150
19061	NC_012804	GGGATA	2	12	1043817	1043828	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	240103150
19062	NC_012804	TCT	2	6	1043836	1043841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103150
19063	NC_012804	ATTGAC	2	12	1043871	1043882	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	240103150
19064	NC_012804	CG	3	6	1043900	1043905	0 %	0 %	50 %	50 %	240103150
19065	NC_012804	TCT	2	6	1044001	1044006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103150
19066	NC_012804	GA	3	6	1044036	1044041	50 %	0 %	50 %	0 %	240103150
19067	NC_012804	TCC	2	6	1044122	1044127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103150
19068	NC_012804	TGGAG	2	10	1044153	1044162	20 %	20 %	60 %	0 %	240103150
19069	NC_012804	GAG	2	6	1044236	1044241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103150
19070	NC_012804	GAC	2	6	1044447	1044452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103150
19071	NC_012804	ACT	2	6	1044466	1044471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103150
19072	NC_012804	CGT	2	6	1044488	1044493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103150
19073	NC_012804	TCCGG	2	10	1044512	1044521	0 %	20 %	40 %	40 %	240103150
19074	NC_012804	GAG	2	6	1044536	1044541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103150
19075	NC_012804	AG	3	6	1044540	1044545	50 %	0 %	50 %	0 %	240103150
19076	NC_012804	GA	3	6	1044633	1044638	50 %	0 %	50 %	0 %	240103150
19077	NC_012804	ATC	2	6	1044672	1044677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103150
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19079	NC_012804	TCT	2	6	1044716	1044721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103151
19080	NC_012804	GTCTC	2	10	1044782	1044791	0 %	40 %	20 %	40 %	240103151
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19082	NC_012804	CTT	2	6	1044828	1044833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103151
19083	NC_012804	TCG	2	6	1044859	1044864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103151
19084	NC_012804	CT	3	6	1044945	1044950	0 %	50 %	0 %	50 %	240103152
19085	NC_012804	ATA	2	6	1045026	1045031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103152
19086	NC_012804	CTA	2	6	1045049	1045054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103152
19087	NC_012804	CGG	2	6	1045079	1045084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103152
19088	NC_012804	CGA	2	6	1045103	1045108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103152
19089	NC_012804	GAA	2	6	1045140	1045145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103152
19090	NC_012804	AAG	2	6	1045227	1045232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103152
19091	NC_012804	TGA	2	6	1045313	1045318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103152
19092	NC_012804	TCA	2	6	1045321	1045326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103152
19093	NC_012804	GAAG	2	8	1045349	1045356	50 %	0 %	50 %	0 %	240103152
19094	NC_012804	ATGAAG	2	12	1045473	1045484	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	240103152
19095	NC_012804	ATA	2	6	1045512	1045517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103152
19096	NC_012804	AG	3	6	1045571	1045576	50 %	0 %	50 %	0 %	240103152
19097	NC_012804	TCG	2	6	1045585	1045590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103152
19098	NC_012804	CGA	2	6	1045595	1045600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103152
19099	NC_012804	GC	3	6	1045603	1045608	0 %	0 %	50 %	50 %	240103152
19100	NC_012804	ACG	2	6	1045632	1045637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103152
19101	NC_012804	AGA	2	6	1045705	1045710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103152
19102	NC_012804	TACGGC	2	12	1045785	1045796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	240103152
19103	NC_012804	ACT	2	6	1045798	1045803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103152
19104	NC_012804	CGA	2	6	1045868	1045873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103152
19105	NC_012804	TAA	2	6	1045897	1045902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103152
19106	NC_012804	CGG	2	6	1045934	1045939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103152
19107	NC_012804	TCA	2	6	1045963	1045968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103152
19108	NC_012804	AGG	2	6	1045983	1045988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103152
19109	NC_012804	CTAAT	2	10	1046010	1046019	40 %	40 %	0 %	20 %	240103152
19110	NC_012804	TGA	2	6	1046063	1046068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103153
19111	NC_012804	TCC	2	6	1046093	1046098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103153
19112	NC_012804	AGG	2	6	1046117	1046122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103153
19113	NC_012804	TGA	2	6	1046198	1046203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103153
19114	NC_012804	GA	3	6	1046202	1046207	50 %	0 %	50 %	0 %	240103153
19115	NC_012804	GGA	2	6	1046211	1046216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103153
19116	NC_012804	AGG	2	6	1046243	1046248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103153
19117	NC_012804	CTT	2	6	1046342	1046347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103154
19118	NC_012804	TGA	2	6	1046446	1046451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103154
19119	NC_012804	AGG	2	6	1046549	1046554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103155
19120	NC_012804	AGGA	2	8	1046834	1046841	50 %	0 %	50 %	0 %	240103155
19121	NC_012804	CGT	2	6	1046844	1046849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103155
19122	NC_012804	CAC	2	6	1046878	1046883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103155
19123	NC_012804	GTC	2	6	1046938	1046943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103155
19124	NC_012804	CGA	2	6	1046946	1046951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103155
19125	NC_012804	TGG	2	6	1046996	1047001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103155
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19128	NC_012804	GAG	2	6	1047055	1047060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103155
19129	NC_012804	TCG	2	6	1047131	1047136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103155
19130	NC_012804	AGG	2	6	1047155	1047160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103155
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19132	NC_012804	TCA	2	6	1047257	1047262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103155
19133	NC_012804	AGG	2	6	1047308	1047313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103155
19134	NC_012804	CTC	2	6	1047421	1047426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103155
19135	NC_012804	CGA	2	6	1047432	1047437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103155
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19139	NC_012804	CTG	2	6	1047854	1047859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103156
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19141	NC_012804	GTA	3	9	1047982	1047990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103157
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19144	NC_012804	CGA	2	6	1048369	1048374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103158
19145	NC_012804	TCC	2	6	1048389	1048394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103158
19146	NC_012804	CAA	2	6	1048441	1048446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103158
19147	NC_012804	AC	3	6	1048501	1048506	50 %	0 %	0 %	50 %	240103158
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19150	NC_012804	TCA	2	6	1048723	1048728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103158
19151	NC_012804	GAG	2	6	1048751	1048756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103158
19152	NC_012804	TCCC	2	8	1048758	1048765	0 %	25 %	0 %	75 %	240103158
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19216	NC_012804	GCCT	2	8	1052361	1052368	0 %	25 %	25 %	50 %	240103162
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19218	NC_012804	CCTCGG	2	12	1052392	1052403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	240103162
19219	NC_012804	CGA	2	6	1052440	1052445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103162
19220	NC_012804	CCGC	2	8	1052496	1052503	0 %	0 %	25 %	75 %	240103162
19221	NC_012804	TCA	2	6	1052511	1052516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103162
19222	NC_012804	TCG	2	6	1052523	1052528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103162
19223	NC_012804	TCG	2	6	1052553	1052558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103162
19224	NC_012804	CAG	2	6	1052614	1052619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103162
19225	NC_012804	GAG	2	6	1052633	1052638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103162
19226	NC_012804	TCC	2	6	1052667	1052672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103162
19227	NC_012804	GA	3	6	1052708	1052713	50 %	0 %	50 %	0 %	240103162
19228	NC_012804	GA	3	6	1052822	1052827	50 %	0 %	50 %	0 %	240103162
19229	NC_012804	GGCG	2	8	1052878	1052885	0 %	0 %	75 %	25 %	240103162
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19231	NC_012804	GGT	2	6	1052948	1052953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103162
19232	NC_012804	GCG	2	6	1052958	1052963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103162
19233	NC_012804	GAGG	2	8	1052971	1052978	25 %	0 %	75 %	0 %	240103162
19234	NC_012804	GAT	2	6	1052980	1052985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103162
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19348	NC_012804	CTT	2	6	1059550	1059555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103170
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