MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_012804	T	6	6	1015332	1015337	0 %	100 %	0 %	0 %	240103115
18502	NC_012804	ATC	2	6	1015342	1015347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103115
18503	NC_012804	ATT	2	6	1015364	1015369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103115
18504	NC_012804	T	6	6	1015411	1015416	0 %	100 %	0 %	0 %	240103115
18505	NC_012804	GGGA	2	8	1015440	1015447	25 %	0 %	75 %	0 %	240103115
18506	NC_012804	GAG	2	6	1015459	1015464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103115
18507	NC_012804	CCTT	2	8	1015470	1015477	0 %	50 %	0 %	50 %	240103115
18508	NC_012804	TCA	2	6	1015478	1015483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103115
18509	NC_012804	GTC	2	6	1015487	1015492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103115
18510	NC_012804	GCTC	2	8	1015518	1015525	0 %	25 %	25 %	50 %	240103115
18511	NC_012804	GAG	2	6	1015655	1015660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103115
18512	NC_012804	ATG	2	6	1015673	1015678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103115
18513	NC_012804	AGG	2	6	1015721	1015726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103115
18514	NC_012804	AC	3	6	1015784	1015789	50 %	0 %	0 %	50 %	240103115
18515	NC_012804	AAGGG	2	10	1015958	1015967	40 %	0 %	60 %	0 %	240103116
18516	NC_012804	CTT	2	6	1016060	1016065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103116
18517	NC_012804	GCTG	2	8	1016078	1016085	0 %	25 %	50 %	25 %	240103116
18518	NC_012804	ACG	2	6	1016094	1016099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103116
18519	NC_012804	AAG	2	6	1016114	1016119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103116
18520	NC_012804	GA	3	6	1016162	1016167	50 %	0 %	50 %	0 %	240103116
18521	NC_012804	CCG	2	6	1016191	1016196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103116
18522	NC_012804	GAGG	2	8	1016230	1016237	25 %	0 %	75 %	0 %	240103116
18523	NC_012804	AG	3	6	1016247	1016252	50 %	0 %	50 %	0 %	240103116
18524	NC_012804	ATC	2	6	1016336	1016341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103116
18525	NC_012804	CTC	2	6	1016403	1016408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103117
18526	NC_012804	GGT	2	6	1016430	1016435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103117
18527	NC_012804	TC	3	6	1016495	1016500	0 %	50 %	0 %	50 %	240103117
18528	NC_012804	AAG	2	6	1016510	1016515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103117
18529	NC_012804	CGT	2	6	1016543	1016548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103117
18530	NC_012804	CGA	2	6	1016605	1016610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103117
18531	NC_012804	CTC	2	6	1016640	1016645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103117
18532	NC_012804	GTC	2	6	1016681	1016686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103117
18533	NC_012804	GAC	2	6	1016703	1016708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103117
18534	NC_012804	CGAG	2	8	1016840	1016847	25 %	0 %	50 %	25 %	240103117
18535	NC_012804	GC	3	6	1016921	1016926	0 %	0 %	50 %	50 %	240103117
18536	NC_012804	GAT	2	6	1016960	1016965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103117
18537	NC_012804	GAT	2	6	1016996	1017001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103117
18538	NC_012804	TATCCT	2	12	1017199	1017210	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	240103118
18539	NC_012804	TCT	2	6	1017217	1017222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103118
18540	NC_012804	C	6	6	1017488	1017493	0 %	0 %	0 %	100 %	240103118
18541	NC_012804	G	6	6	1017505	1017510	0 %	0 %	100 %	0 %	240103118
18542	NC_012804	CTC	2	6	1017577	1017582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103118
18543	NC_012804	CTC	2	6	1017626	1017631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103118
18544	NC_012804	CGGC	2	8	1017648	1017655	0 %	0 %	50 %	50 %	240103118
18545	NC_012804	GTC	2	6	1017773	1017778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103118
18546	NC_012804	TC	3	6	1017820	1017825	0 %	50 %	0 %	50 %	240103118
18547	NC_012804	ACG	2	6	1017891	1017896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103118
18548	NC_012804	AGG	2	6	1017926	1017931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103118
18549	NC_012804	GTACCT	2	12	1017940	1017951	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	240103118
18550	NC_012804	TGGC	2	8	1017957	1017964	0 %	25 %	50 %	25 %	240103118
18551	NC_012804	CCA	2	6	1017981	1017986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103118
18552	NC_012804	TCT	2	6	1018038	1018043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103118
18553	NC_012804	A	6	6	1018077	1018082	100 %	0 %	0 %	0 %	240103119
18554	NC_012804	GCC	2	6	1018095	1018100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103119
18555	NC_012804	GTG	2	6	1018128	1018133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103119
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18557	NC_012804	GAAA	2	8	1018159	1018166	75 %	0 %	25 %	0 %	240103119
18558	NC_012804	GGA	2	6	1018175	1018180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103119
18559	NC_012804	AACC	2	8	1018196	1018203	50 %	0 %	0 %	50 %	240103119
18560	NC_012804	CCT	2	6	1018246	1018251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103119
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18585	NC_012804	CT	3	6	1019730	1019735	0 %	50 %	0 %	50 %	240103122
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18588	NC_012804	GCCA	2	8	1019867	1019874	25 %	0 %	25 %	50 %	240103122
18589	NC_012804	CTT	2	6	1019949	1019954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103122
18590	NC_012804	GGCC	2	8	1019968	1019975	0 %	0 %	50 %	50 %	240103122
18591	NC_012804	TGGTA	2	10	1020122	1020131	20 %	40 %	40 %	0 %	240103122
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18599	NC_012804	TGA	2	6	1020303	1020308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103123
18600	NC_012804	GCG	2	6	1020317	1020322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103123
18601	NC_012804	ACG	2	6	1020329	1020334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103123
18602	NC_012804	TTA	2	6	1020351	1020356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103123
18603	NC_012804	TCA	2	6	1020362	1020367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103123
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18605	NC_012804	CCT	2	6	1020387	1020392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103123
18606	NC_012804	TCC	2	6	1020437	1020442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103123
18607	NC_012804	TCG	2	6	1020531	1020536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103123
18608	NC_012804	C	6	6	1020563	1020568	0 %	0 %	0 %	100 %	240103123
18609	NC_012804	GAGG	2	8	1020766	1020773	25 %	0 %	75 %	0 %	240103124
18610	NC_012804	GGA	2	6	1020778	1020783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103124
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18612	NC_012804	ACC	2	6	1020964	1020969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103124
18613	NC_012804	AGG	2	6	1020995	1021000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103124
18614	NC_012804	CAG	2	6	1021018	1021023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103124
18615	NC_012804	TC	3	6	1021039	1021044	0 %	50 %	0 %	50 %	240103124
18616	NC_012804	A	6	6	1021053	1021058	100 %	0 %	0 %	0 %	240103124
18617	NC_012804	TCA	2	6	1021176	1021181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103124
18618	NC_012804	GTA	2	6	1021381	1021386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103125
18619	NC_012804	CGT	3	9	1021404	1021412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103125
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18731	NC_012804	C	7	7	1027506	1027512	0 %	0 %	0 %	100 %	240103133
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18733	NC_012804	TCA	2	6	1027561	1027566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103133
18734	NC_012804	CTT	2	6	1027604	1027609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103133
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18843	NC_012804	T	6	6	1033833	1033838	0 %	100 %	0 %	0 %	240103142
18844	NC_012804	GC	3	6	1033885	1033890	0 %	0 %	50 %	50 %	240103142
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18847	NC_012804	TCA	2	6	1033983	1033988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103142
18848	NC_012804	CACC	2	8	1034042	1034049	25 %	0 %	0 %	75 %	240103142
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18850	NC_012804	CTC	3	9	1034078	1034086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103142
18851	NC_012804	CGT	2	6	1034125	1034130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103142
18852	NC_012804	GAC	2	6	1034222	1034227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103142
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18857	NC_012804	CGA	2	6	1034462	1034467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103143
18858	NC_012804	GTA	2	6	1034475	1034480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103143
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18863	NC_012804	CCT	3	9	1034795	1034803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103143
18864	NC_012804	TCC	2	6	1034849	1034854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103143
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18879	NC_012804	TAT	2	6	1035663	1035668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103144
18880	NC_012804	CTG	2	6	1035688	1035693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103144
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18962	NC_012804	GTC	2	6	1039020	1039025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103145
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