MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_012804	GAT	2	6	988056	988061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103092
18002	NC_012804	TC	3	6	988115	988120	0 %	50 %	0 %	50 %	240103092
18003	NC_012804	GTT	2	6	988215	988220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103093
18004	NC_012804	AGC	2	6	988240	988245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103093
18005	NC_012804	CCA	2	6	988250	988255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103093
18006	NC_012804	ACTCCG	2	12	988336	988347	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	240103093
18007	NC_012804	CAG	2	6	988380	988385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103093
18008	NC_012804	TAT	2	6	988404	988409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103093
18009	NC_012804	CAT	2	6	988464	988469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103093
18010	NC_012804	GA	3	6	988477	988482	50 %	0 %	50 %	0 %	240103093
18011	NC_012804	CCG	2	6	988541	988546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103093
18012	NC_012804	CGT	2	6	988581	988586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103093
18013	NC_012804	AGG	2	6	988615	988620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103093
18014	NC_012804	GTT	2	6	988788	988793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103093
18015	NC_012804	CAG	2	6	988863	988868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103093
18016	NC_012804	GGA	2	6	988874	988879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103093
18017	NC_012804	GAG	2	6	988893	988898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103093
18018	NC_012804	GTA	2	6	988941	988946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103093
18019	NC_012804	CAT	2	6	988989	988994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103093
18020	NC_012804	TCA	2	6	989105	989110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103093
18021	NC_012804	TAT	2	6	989187	989192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103093
18022	NC_012804	AGG	2	6	989224	989229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103093
18023	NC_012804	TGA	2	6	989267	989272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103093
18024	NC_012804	AGT	2	6	989285	989290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103093
18025	NC_012804	CAG	2	6	989325	989330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103093
18026	NC_012804	GATCAG	2	12	989421	989432	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240103093
18027	NC_012804	GA	3	6	989451	989456	50 %	0 %	50 %	0 %	240103093
18028	NC_012804	GTA	2	6	989487	989492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103093
18029	NC_012804	AGA	2	6	989503	989508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103093
18030	NC_012804	TTA	2	6	989537	989542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103093
18031	NC_012804	TGG	2	6	989670	989675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103094
18032	NC_012804	GAG	2	6	989897	989902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103094
18033	NC_012804	GTG	2	6	989951	989956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103094
18034	NC_012804	CGG	2	6	989962	989967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103094
18035	NC_012804	GAG	3	9	990008	990016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103094
18036	NC_012804	GAG	2	6	990031	990036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103094
18037	NC_012804	TTA	2	6	990171	990176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103094
18038	NC_012804	CGAGG	2	10	990190	990199	20 %	0 %	60 %	20 %	240103094
18039	NC_012804	G	6	6	990198	990203	0 %	0 %	100 %	0 %	240103094
18040	NC_012804	CTA	2	6	990256	990261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103094
18041	NC_012804	GGA	2	6	990359	990364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103095
18042	NC_012804	TCG	2	6	990412	990417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103095
18043	NC_012804	AGG	2	6	990418	990423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103095
18044	NC_012804	AG	3	6	990438	990443	50 %	0 %	50 %	0 %	240103095
18045	NC_012804	CGA	2	6	990461	990466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103095
18046	NC_012804	TAC	2	6	990489	990494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103095
18047	NC_012804	CAT	2	6	990536	990541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103095
18048	NC_012804	GAGGGG	2	12	990555	990566	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	240103095
18049	NC_012804	CGG	2	6	990584	990589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103095
18050	NC_012804	ACG	2	6	990631	990636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103095
18051	NC_012804	TAG	2	6	990730	990735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103095
18052	NC_012804	CTA	2	6	990806	990811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103095
18053	NC_012804	CTG	2	6	990862	990867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103095
18054	NC_012804	CAG	2	6	991060	991065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103095
18055	NC_012804	GAAG	2	8	991118	991125	50 %	0 %	50 %	0 %	240103095
18056	NC_012804	GA	3	6	991288	991293	50 %	0 %	50 %	0 %	240103095
18057	NC_012804	GAA	2	6	991352	991357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103095
18058	NC_012804	TCG	2	6	991426	991431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103095
18059	NC_012804	ACT	2	6	991504	991509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103095
18060	NC_012804	GAA	2	6	991535	991540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103095
18061	NC_012804	CTT	2	6	991589	991594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103095
18062	NC_012804	GAG	2	6	991671	991676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103095
18063	NC_012804	GCG	2	6	991770	991775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103095
18064	NC_012804	CGA	2	6	991931	991936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103095
18065	NC_012804	CTG	2	6	991956	991961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103095
18066	NC_012804	ACG	2	6	992029	992034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103095
18067	NC_012804	TTC	2	6	992064	992069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103095
18068	NC_012804	TAG	2	6	992087	992092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103095
18069	NC_012804	GA	3	6	992156	992161	50 %	0 %	50 %	0 %	240103095
18070	NC_012804	TTC	2	6	992209	992214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103096
18071	NC_012804	CTC	2	6	992215	992220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103096
18072	NC_012804	TAT	2	6	992221	992226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103096
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18075	NC_012804	CTG	2	6	992315	992320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103096
18076	NC_012804	CCG	2	6	992484	992489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103096
18077	NC_012804	ACG	2	6	992507	992512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103096
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18083	NC_012804	GCCGTA	2	12	992830	992841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	240103096
18084	NC_012804	GAT	2	6	992842	992847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103096
18085	NC_012804	GAC	2	6	992857	992862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103096
18086	NC_012804	GTT	2	6	992872	992877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103096
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18088	NC_012804	CCCGT	2	10	993014	993023	0 %	20 %	20 %	60 %	240103096
18089	NC_012804	TCA	2	6	993159	993164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103096
18090	NC_012804	ATGA	2	8	993179	993186	50 %	25 %	25 %	0 %	240103096
18091	NC_012804	TGAAG	2	10	993264	993273	40 %	20 %	40 %	0 %	240103096
18092	NC_012804	TTA	2	6	993297	993302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103096
18093	NC_012804	AGCGG	2	10	993349	993358	20 %	0 %	60 %	20 %	240103096
18094	NC_012804	GACC	2	8	993393	993400	25 %	0 %	25 %	50 %	240103096
18095	NC_012804	TAT	2	6	993451	993456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103096
18096	NC_012804	TCCC	2	8	993488	993495	0 %	25 %	0 %	75 %	240103096
18097	NC_012804	GTTAT	2	10	993521	993530	20 %	60 %	20 %	0 %	240103096
18098	NC_012804	TAAGC	2	10	993566	993575	40 %	20 %	20 %	20 %	240103096
18099	NC_012804	TC	3	6	993586	993591	0 %	50 %	0 %	50 %	240103096
18100	NC_012804	CTC	3	9	993692	993700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103097
18101	NC_012804	ATT	2	6	993702	993707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103097
18102	NC_012804	GGA	2	6	993727	993732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103097
18103	NC_012804	GC	3	6	993751	993756	0 %	0 %	50 %	50 %	240103097
18104	NC_012804	CTT	2	6	993878	993883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103097
18105	NC_012804	GTT	2	6	993908	993913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103097
18106	NC_012804	GAA	2	6	993932	993937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103097
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18108	NC_012804	TGA	2	6	994000	994005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103097
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18110	NC_012804	CGCT	2	8	994336	994343	0 %	25 %	25 %	50 %	240103097
18111	NC_012804	CCG	2	6	994443	994448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103097
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18113	NC_012804	GCC	2	6	994488	994493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103097
18114	NC_012804	CGA	2	6	994495	994500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103097
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18116	NC_012804	AAG	2	6	994616	994621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103097
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18118	NC_012804	CAT	2	6	994781	994786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103097
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18228	NC_012804	GTC	2	6	1000847	1000852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103101
18229	NC_012804	TTCA	2	8	1000888	1000895	25 %	50 %	0 %	25 %	240103101
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18232	NC_012804	ATTC	2	8	1000987	1000994	25 %	50 %	0 %	25 %	240103101
18233	NC_012804	TCA	2	6	1000998	1001003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103101
18234	NC_012804	GCGAG	2	10	1001034	1001043	20 %	0 %	60 %	20 %	240103101
18235	NC_012804	ACT	2	6	1001079	1001084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103101
18236	NC_012804	CGA	2	6	1001140	1001145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103101
18237	NC_012804	GAC	2	6	1001167	1001172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103101
18238	NC_012804	GCCAA	2	10	1001183	1001192	40 %	0 %	20 %	40 %	240103101
18239	NC_012804	TGC	2	6	1001206	1001211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103101
18240	NC_012804	ACT	2	6	1001223	1001228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103101
18241	NC_012804	TCG	2	6	1001232	1001237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103101
18242	NC_012804	TCA	2	6	1001265	1001270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103101
18243	NC_012804	TGG	2	6	1001422	1001427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103101
18244	NC_012804	ACT	2	6	1001592	1001597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103101
18245	NC_012804	CAGAT	2	10	1001712	1001721	40 %	20 %	20 %	20 %	240103101
18246	NC_012804	CTA	2	6	1001770	1001775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103101
18247	NC_012804	CTA	2	6	1001833	1001838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103101
18248	NC_012804	CTC	2	6	1001843	1001848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103101
18249	NC_012804	ACCT	2	8	1001948	1001955	25 %	25 %	0 %	50 %	240103101
18250	NC_012804	GA	3	6	1001988	1001993	50 %	0 %	50 %	0 %	240103101
18251	NC_012804	GAT	2	6	1002121	1002126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103101
18252	NC_012804	TCA	3	9	1002150	1002158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103101
18253	NC_012804	CTA	2	6	1002169	1002174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103101
18254	NC_012804	CGT	2	6	1002187	1002192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103101
18255	NC_012804	TCA	2	6	1002243	1002248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103101
18256	NC_012804	AGG	3	9	1002336	1002344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103101
18257	NC_012804	CTC	2	6	1002413	1002418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103101
18258	NC_012804	TAC	2	6	1002449	1002454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103101
18259	NC_012804	TGAAC	2	10	1002472	1002481	40 %	20 %	20 %	20 %	240103101
18260	NC_012804	GAA	2	6	1002511	1002516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103101
18261	NC_012804	CAG	2	6	1002671	1002676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103102
18262	NC_012804	TCG	2	6	1002747	1002752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103102
18263	NC_012804	GCT	2	6	1002799	1002804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103102
18264	NC_012804	TCC	2	6	1002837	1002842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103102
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18266	NC_012804	TGA	2	6	1002857	1002862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103102
18267	NC_012804	CT	3	6	1002900	1002905	0 %	50 %	0 %	50 %	240103102
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18269	NC_012804	CGA	2	6	1002985	1002990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103102
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18289	NC_012804	CGCC	2	8	1004233	1004240	0 %	0 %	25 %	75 %	240103105
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18302	NC_012804	TCA	2	6	1004882	1004887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103107
18303	NC_012804	GGT	2	6	1004890	1004895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103107
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18307	NC_012804	TCA	2	6	1005065	1005070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103107
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18320	NC_012804	GCT	2	6	1006014	1006019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103107
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18323	NC_012804	TTC	2	6	1006108	1006113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103107
18324	NC_012804	AAT	2	6	1006340	1006345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103108
18325	NC_012804	GAG	2	6	1006455	1006460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103108
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18330	NC_012804	ATG	2	6	1006917	1006922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103108
18331	NC_012804	GGA	2	6	1006930	1006935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103108
18332	NC_012804	CGAGAC	2	12	1007000	1007011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103108
18333	NC_012804	CCA	2	6	1007030	1007035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103108
18334	NC_012804	GAC	2	6	1007036	1007041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103108
18335	NC_012804	CGA	2	6	1007090	1007095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103108
18336	NC_012804	CGA	2	6	1007116	1007121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103108
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18339	NC_012804	GGAA	2	8	1007262	1007269	50 %	0 %	50 %	0 %	240103108
18340	NC_012804	TAC	2	6	1007271	1007276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103108
18341	NC_012804	GGAA	2	8	1007334	1007341	50 %	0 %	50 %	0 %	240103108
18342	NC_012804	TCG	2	6	1007398	1007403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103108
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18345	NC_012804	GGA	3	9	1007582	1007590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103108
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18347	NC_012804	AAG	2	6	1007655	1007660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103108
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18457	NC_012804	A	7	7	1012989	1012995	100 %	0 %	0 %	0 %	240103113
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18461	NC_012804	AGA	2	6	1013160	1013165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103113
18462	NC_012804	ACG	2	6	1013216	1013221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103113
18463	NC_012804	C	6	6	1013232	1013237	0 %	0 %	0 %	100 %	240103113
18464	NC_012804	TGGA	2	8	1013258	1013265	25 %	25 %	50 %	0 %	240103113
18465	NC_012804	CAG	2	6	1013321	1013326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103113
18466	NC_012804	CGT	2	6	1013368	1013373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103113
18467	NC_012804	TAC	2	6	1013420	1013425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103113
18468	NC_012804	ACG	2	6	1013457	1013462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103113
18469	NC_012804	GAG	2	6	1013483	1013488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103113
18470	NC_012804	GAG	2	6	1013495	1013500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103113
18471	NC_012804	GAA	2	6	1013503	1013508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103113
18472	NC_012804	GGAA	2	8	1013509	1013516	50 %	0 %	50 %	0 %	240103113
18473	NC_012804	GAG	2	6	1013584	1013589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103113
18474	NC_012804	TCG	2	6	1013631	1013636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103113
18475	NC_012804	ACG	3	9	1013697	1013705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103113
18476	NC_012804	GAG	2	6	1013873	1013878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103113
18477	NC_012804	GAG	2	6	1013954	1013959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103113
18478	NC_012804	GACCA	2	10	1013983	1013992	40 %	0 %	20 %	40 %	240103113
18479	NC_012804	GGA	2	6	1013996	1014001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103113
18480	NC_012804	GGAA	2	8	1014025	1014032	50 %	0 %	50 %	0 %	240103113
18481	NC_012804	ATG	2	6	1014047	1014052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103113
18482	NC_012804	CTT	2	6	1014097	1014102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103113
18483	NC_012804	ATA	2	6	1014299	1014304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103114
18484	NC_012804	TCC	2	6	1014339	1014344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103114
18485	NC_012804	CGT	2	6	1014415	1014420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103114
18486	NC_012804	TGA	2	6	1014481	1014486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103114
18487	NC_012804	CCG	2	6	1014547	1014552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103114
18488	NC_012804	CT	3	6	1014627	1014632	0 %	50 %	0 %	50 %	240103114
18489	NC_012804	ACTG	2	8	1014685	1014692	25 %	25 %	25 %	25 %	240103114
18490	NC_012804	CAC	2	6	1014815	1014820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103114
18491	NC_012804	CGA	2	6	1014898	1014903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103114
18492	NC_012804	TCC	2	6	1014939	1014944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103114
18493	NC_012804	GAT	2	6	1014949	1014954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103114
18494	NC_012804	CT	4	8	1014955	1014962	0 %	50 %	0 %	50 %	240103114
18495	NC_012804	GGC	2	6	1014979	1014984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103114
18496	NC_012804	AGA	2	6	1014996	1015001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103114
18497	NC_012804	TTGAGG	2	12	1015023	1015034	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	240103114
18498	NC_012804	CT	3	6	1015203	1015208	0 %	50 %	0 %	50 %	240103115
18499	NC_012804	TCC	2	6	1015257	1015262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103115
18500	NC_012804	TGAC	2	8	1015304	1015311	25 %	25 %	25 %	25 %	240103115

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