MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_012804	TCT	2	6	934923	934928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103040
17002	NC_012804	TTG	2	6	934946	934951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103040
17003	NC_012804	TCG	2	6	934965	934970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103040
17004	NC_012804	CTTT	2	8	935001	935008	0 %	75 %	0 %	25 %	240103040
17005	NC_012804	TCT	2	6	935064	935069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103040
17006	NC_012804	TTG	2	6	935108	935113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103040
17007	NC_012804	TTCT	2	8	935132	935139	0 %	75 %	0 %	25 %	240103040
17008	NC_012804	GAA	2	6	935155	935160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103040
17009	NC_012804	CTC	4	12	935169	935180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103041
17010	NC_012804	CGAG	2	8	935192	935199	25 %	0 %	50 %	25 %	240103041
17011	NC_012804	CCT	2	6	935216	935221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103041
17012	NC_012804	CTC	2	6	935292	935297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103041
17013	NC_012804	CCA	2	6	935339	935344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103041
17014	NC_012804	TCG	2	6	935347	935352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103041
17015	NC_012804	TTTATC	2	12	935371	935382	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	240103041
17016	NC_012804	GCT	2	6	935396	935401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103041
17017	NC_012804	ATG	2	6	935470	935475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103041
17018	NC_012804	TTC	2	6	935479	935484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103041
17019	NC_012804	CTTGAG	2	12	935520	935531	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	240103041
17020	NC_012804	TCT	3	9	935573	935581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103041
17021	NC_012804	CCT	2	6	935603	935608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103041
17022	NC_012804	GCT	2	6	935615	935620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103041
17023	NC_012804	TCT	2	6	935627	935632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103041
17024	NC_012804	CTT	2	6	935649	935654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103041
17025	NC_012804	TTC	2	6	935671	935676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103041
17026	NC_012804	TTC	2	6	935728	935733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103041
17027	NC_012804	GAG	2	6	935811	935816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103042
17028	NC_012804	CCT	2	6	935820	935825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103042
17029	NC_012804	TC	3	6	935871	935876	0 %	50 %	0 %	50 %	240103042
17030	NC_012804	CCT	2	6	935889	935894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103042
17031	NC_012804	CTC	2	6	935895	935900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103042
17032	NC_012804	CCTCT	2	10	935918	935927	0 %	40 %	0 %	60 %	240103042
17033	NC_012804	GGCG	2	8	935949	935956	0 %	0 %	75 %	25 %	240103042
17034	NC_012804	CGT	2	6	935960	935965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103042
17035	NC_012804	CTCC	2	8	936050	936057	0 %	25 %	0 %	75 %	240103042
17036	NC_012804	TGC	2	6	936104	936109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103042
17037	NC_012804	ACC	2	6	936127	936132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103042
17038	NC_012804	CTT	2	6	936153	936158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103042
17039	NC_012804	CTC	2	6	936214	936219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103043
17040	NC_012804	TC	3	6	936224	936229	0 %	50 %	0 %	50 %	240103043
17041	NC_012804	T	6	6	936235	936240	0 %	100 %	0 %	0 %	240103043
17042	NC_012804	CAG	2	6	936457	936462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103043
17043	NC_012804	CAG	2	6	936481	936486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103043
17044	NC_012804	CTT	2	6	936566	936571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103043
17045	NC_012804	CGA	2	6	936573	936578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103043
17046	NC_012804	CCT	2	6	936619	936624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17047	NC_012804	CTT	2	6	936733	936738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103044
17048	NC_012804	TCC	2	6	936964	936969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17049	NC_012804	GAG	2	6	936995	937000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103044
17050	NC_012804	TTC	2	6	937014	937019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103044
17051	NC_012804	TC	3	6	937023	937028	0 %	50 %	0 %	50 %	240103044
17052	NC_012804	GAG	2	6	937040	937045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103044
17053	NC_012804	ATT	2	6	937134	937139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103044
17054	NC_012804	TCC	2	6	937140	937145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17055	NC_012804	GAG	2	6	937154	937159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103044
17056	NC_012804	CTT	2	6	937160	937165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103044
17057	NC_012804	ACA	2	6	937179	937184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103044
17058	NC_012804	CTC	2	6	937265	937270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17059	NC_012804	TCC	2	6	937291	937296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17060	NC_012804	GAG	2	6	937298	937303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103044
17061	NC_012804	CAT	2	6	937355	937360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103044
17062	NC_012804	AGCT	2	8	937409	937416	25 %	25 %	25 %	25 %	240103044
17063	NC_012804	CTTC	2	8	937450	937457	0 %	50 %	0 %	50 %	240103044
17064	NC_012804	TCCT	2	8	937473	937480	0 %	50 %	0 %	50 %	240103044
17065	NC_012804	TCTG	2	8	937498	937505	0 %	50 %	25 %	25 %	240103044
17066	NC_012804	TCC	3	9	937530	937538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17067	NC_012804	TCC	2	6	937563	937568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17068	NC_012804	CTG	2	6	937575	937580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103044
17069	NC_012804	TCC	2	6	937587	937592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17070	NC_012804	CTG	2	6	937623	937628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103044
17071	NC_012804	GCCTT	2	10	937642	937651	0 %	40 %	20 %	40 %	240103044
17072	NC_012804	CTC	2	6	937652	937657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17073	NC_012804	TCT	2	6	937667	937672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103044
17074	NC_012804	TTC	2	6	937676	937681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103044
17075	NC_012804	TCT	2	6	937730	937735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103044
17076	NC_012804	CTC	2	6	937742	937747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17077	NC_012804	TCC	2	6	937765	937770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17078	NC_012804	GTA	2	6	938015	938020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103044
17079	NC_012804	ATC	2	6	938061	938066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103044
17080	NC_012804	CGT	2	6	938074	938079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103044
17081	NC_012804	CCT	2	6	938150	938155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
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17083	NC_012804	CTC	2	6	938325	938330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103044
17084	NC_012804	CCG	2	6	938341	938346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103044
17085	NC_012804	CCTT	2	8	938358	938365	0 %	50 %	0 %	50 %	240103044
17086	NC_012804	CGGA	2	8	938381	938388	25 %	0 %	50 %	25 %	240103044
17087	NC_012804	TTC	2	6	938410	938415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103044
17088	NC_012804	TCG	2	6	938418	938423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103044
17089	NC_012804	ACC	2	6	938439	938444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103044
17090	NC_012804	CTATC	2	10	938468	938477	20 %	40 %	0 %	40 %	240103045
17091	NC_012804	AGA	2	6	938482	938487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103045
17092	NC_012804	CAA	2	6	938489	938494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103045
17093	NC_012804	C	6	6	938535	938540	0 %	0 %	0 %	100 %	240103045
17094	NC_012804	CCTT	2	8	938568	938575	0 %	50 %	0 %	50 %	240103045
17095	NC_012804	CCT	2	6	938678	938683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103045
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17098	NC_012804	TCTT	2	8	938726	938733	0 %	75 %	0 %	25 %	240103045
17099	NC_012804	CCTC	2	8	938735	938742	0 %	25 %	0 %	75 %	240103045
17100	NC_012804	CTC	2	6	938796	938801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103045
17101	NC_012804	CTT	2	6	938853	938858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103045
17102	NC_012804	GAG	2	6	938886	938891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103045
17103	NC_012804	CGT	2	6	938915	938920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103045
17104	NC_012804	AT	3	6	938941	938946	50 %	50 %	0 %	0 %	240103045
17105	NC_012804	CAC	2	6	938955	938960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103045
17106	NC_012804	GACCCT	2	12	939289	939300	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	240103046
17107	NC_012804	TAT	2	6	939307	939312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103046
17108	NC_012804	CTC	2	6	939352	939357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103046
17109	NC_012804	TGATC	2	10	939369	939378	20 %	40 %	20 %	20 %	240103046
17110	NC_012804	GTT	2	6	939460	939465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103046
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17117	NC_012804	ATT	2	6	939644	939649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103046
17118	NC_012804	CCT	2	6	939660	939665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103046
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17120	NC_012804	CAT	2	6	939718	939723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103046
17121	NC_012804	CTGA	2	8	939727	939734	25 %	25 %	25 %	25 %	240103046
17122	NC_012804	AGA	2	6	939774	939779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103046
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17124	NC_012804	GCG	2	6	939848	939853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103046
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17478	NC_012804	CGT	2	6	959143	959148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103065
17479	NC_012804	AGG	3	9	959186	959194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103065
17480	NC_012804	TCA	2	6	959232	959237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103065
17481	NC_012804	AGA	2	6	959250	959255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103065
17482	NC_012804	CAG	2	6	959299	959304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103065
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17484	NC_012804	GAG	2	6	959382	959387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103066
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17487	NC_012804	GAG	2	6	959475	959480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103066
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17491	NC_012804	TTATC	2	10	959696	959705	20 %	60 %	0 %	20 %	240103066
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