MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012804	GGC	2	6	878837	878842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102999
16002	NC_012804	GTT	2	6	878868	878873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102999
16003	NC_012804	ACG	2	6	878917	878922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102999
16004	NC_012804	CAA	2	6	879086	879091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102999
16005	NC_012804	GGCC	2	8	879163	879170	0 %	0 %	50 %	50 %	240102999
16006	NC_012804	ATG	2	6	879207	879212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102999
16007	NC_012804	GTG	3	9	879327	879335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102999
16008	NC_012804	CCT	2	6	879407	879412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102999
16009	NC_012804	GGC	2	6	879464	879469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102999
16010	NC_012804	GGA	2	6	879621	879626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103000
16011	NC_012804	CGT	2	6	879723	879728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103000
16012	NC_012804	AAG	2	6	879817	879822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103001
16013	NC_012804	GAG	2	6	879901	879906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103001
16014	NC_012804	CCA	2	6	879967	879972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103001
16015	NC_012804	GTG	2	6	879982	879987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103001
16016	NC_012804	GAT	2	6	880048	880053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103001
16017	NC_012804	TCC	2	6	880113	880118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103002
16018	NC_012804	AAG	2	6	880124	880129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103002
16019	NC_012804	GTG	2	6	880161	880166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103002
16020	NC_012804	ACA	3	9	880175	880183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103002
16021	NC_012804	GCC	2	6	880187	880192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103002
16022	NC_012804	AGA	2	6	880459	880464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103002
16023	NC_012804	GAG	2	6	880508	880513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103002
16024	NC_012804	ATA	2	6	880520	880525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103002
16025	NC_012804	CGC	2	6	880536	880541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103002
16026	NC_012804	AGG	3	9	880707	880715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103002
16027	NC_012804	GAG	2	6	880754	880759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103002
16028	NC_012804	TGT	2	6	880804	880809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103002
16029	NC_012804	CAA	2	6	880906	880911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103002
16030	NC_012804	AAG	2	6	880991	880996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240103002
16031	NC_012804	ATA	2	6	881012	881017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103002
16032	NC_012804	GGA	2	6	881053	881058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103002
16033	NC_012804	AGG	2	6	881097	881102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103002
16034	NC_012804	GGACAT	2	12	881144	881155	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240103003
16035	NC_012804	TAC	2	6	881367	881372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103003
16036	NC_012804	ACG	2	6	881380	881385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103003
16037	NC_012804	TTG	2	6	881430	881435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103004
16038	NC_012804	GCA	2	6	881510	881515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103004
16039	NC_012804	CGG	2	6	881573	881578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103004
16040	NC_012804	CTC	2	6	881649	881654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103004
16041	NC_012804	CTA	2	6	881774	881779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103004
16042	NC_012804	AGG	2	6	881871	881876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103004
16043	NC_012804	TCG	2	6	881899	881904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103004
16044	NC_012804	TCT	2	6	881962	881967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103004
16045	NC_012804	AGG	2	6	882001	882006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103004
16046	NC_012804	AGG	2	6	882209	882214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103005
16047	NC_012804	GGA	2	6	882240	882245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103005
16048	NC_012804	TTA	2	6	882254	882259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103005
16049	NC_012804	GCC	2	6	882264	882269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103005
16050	NC_012804	CGA	2	6	882378	882383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103005
16051	NC_012804	GAC	2	6	882603	882608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103006
16052	NC_012804	TCC	2	6	882676	882681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103006
16053	NC_012804	AAC	2	6	882729	882734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240103006
16054	NC_012804	GAGGAT	2	12	882756	882767	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	240103006
16055	NC_012804	TTC	2	6	882775	882780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103006
16056	NC_012804	GGT	2	6	882801	882806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103006
16057	NC_012804	GGTTG	2	10	882850	882859	0 %	40 %	60 %	0 %	240103007
16058	NC_012804	AC	3	6	882987	882992	50 %	0 %	0 %	50 %	240103007
16059	NC_012804	AAT	2	6	883014	883019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240103007
16060	NC_012804	CGG	2	6	883074	883079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103007
16061	NC_012804	TCA	2	6	883138	883143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103007
16062	NC_012804	TC	3	6	883227	883232	0 %	50 %	0 %	50 %	240103007
16063	NC_012804	CTC	2	6	883252	883257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103007
16064	NC_012804	AG	3	6	883366	883371	50 %	0 %	50 %	0 %	240103007
16065	NC_012804	TTG	2	6	883568	883573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103007
16066	NC_012804	TAT	2	6	883659	883664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240103008
16067	NC_012804	CCT	2	6	883733	883738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103008
16068	NC_012804	GGA	2	6	883919	883924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103008
16069	NC_012804	GGA	2	6	883927	883932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103008
16070	NC_012804	TATG	2	8	883942	883949	25 %	50 %	25 %	0 %	240103008
16071	NC_012804	TTCG	2	8	883956	883963	0 %	50 %	25 %	25 %	240103008
16072	NC_012804	CG	3	6	884114	884119	0 %	0 %	50 %	50 %	240103008
16073	NC_012804	CTTTTC	2	12	884313	884324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103008
16074	NC_012804	CTC	2	6	884332	884337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103008
16075	NC_012804	GAC	2	6	884344	884349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103008
16076	NC_012804	CTC	2	6	884389	884394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103008
16077	NC_012804	GAGG	2	8	884406	884413	25 %	0 %	75 %	0 %	240103008
16078	NC_012804	GGA	2	6	884424	884429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103008
16079	NC_012804	GGT	2	6	884526	884531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103008
16080	NC_012804	CCTC	2	8	884557	884564	0 %	25 %	0 %	75 %	240103009
16081	NC_012804	GAT	2	6	884570	884575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103009
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16083	NC_012804	T	6	6	884658	884663	0 %	100 %	0 %	0 %	240103009
16084	NC_012804	TCC	2	6	884797	884802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103009
16085	NC_012804	CGA	2	6	884824	884829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103009
16086	NC_012804	TCC	2	6	884847	884852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103009
16087	NC_012804	GAC	2	6	884909	884914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103009
16088	NC_012804	CGT	2	6	884920	884925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103009
16089	NC_012804	TCG	2	6	884932	884937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103009
16090	NC_012804	GTA	2	6	885008	885013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103009
16091	NC_012804	TCG	2	6	885063	885068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103009
16092	NC_012804	CGT	2	6	885073	885078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103009
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16098	NC_012804	CGTT	2	8	885448	885455	0 %	50 %	25 %	25 %	240103009
16099	NC_012804	ACG	2	6	885549	885554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103009
16100	NC_012804	CA	3	6	885751	885756	50 %	0 %	0 %	50 %	240103010
16101	NC_012804	CCG	2	6	885831	885836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240103010
16102	NC_012804	ACG	2	6	885871	885876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103010
16103	NC_012804	GGC	2	6	885920	885925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240103010
16104	NC_012804	CGT	2	6	885935	885940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103010
16105	NC_012804	AGG	2	6	885970	885975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103010
16106	NC_012804	CAT	2	6	886042	886047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103010
16107	NC_012804	GAG	2	6	886143	886148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103010
16108	NC_012804	CGT	2	6	886184	886189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103010
16109	NC_012804	CG	3	6	886318	886323	0 %	0 %	50 %	50 %	240103010
16110	NC_012804	CCT	2	6	886358	886363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103010
16111	NC_012804	ACG	2	6	886467	886472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103010
16112	NC_012804	GAG	2	6	886575	886580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240103010
16113	NC_012804	TTC	2	6	886602	886607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103010
16114	NC_012804	TGAG	2	8	886628	886635	25 %	25 %	50 %	0 %	240103010
16115	NC_012804	TGG	2	6	886644	886649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103011
16116	NC_012804	TTC	2	6	886751	886756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103011
16117	NC_012804	CCGAAG	2	12	886768	886779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103011
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16119	NC_012804	TA	3	6	886914	886919	50 %	50 %	0 %	0 %	240103011
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16355	NC_012804	GGT	2	6	899918	899923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103025
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16358	NC_012804	TCC	2	6	900012	900017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240103025
16359	NC_012804	TCA	2	6	900178	900183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240103025
16360	NC_012804	CGA	2	6	900203	900208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103025
16361	NC_012804	TCTT	2	8	900217	900224	0 %	75 %	0 %	25 %	240103025
16362	NC_012804	CGGG	2	8	900299	900306	0 %	0 %	75 %	25 %	240103025
16363	NC_012804	TGG	2	6	900328	900333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103025
16364	NC_012804	TTC	2	6	900360	900365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240103025
16365	NC_012804	GGCTTC	2	12	900397	900408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103025
16366	NC_012804	TC	3	6	900407	900412	0 %	50 %	0 %	50 %	240103025
16367	NC_012804	ACC	2	6	900444	900449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240103025
16368	NC_012804	TGAAG	2	10	900537	900546	40 %	20 %	40 %	0 %	240103025
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16370	NC_012804	GTA	2	6	900562	900567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240103025
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16372	NC_012804	TGT	2	6	900606	900611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103025
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16380	NC_012804	TGCT	2	8	901007	901014	0 %	50 %	25 %	25 %	240103025
16381	NC_012804	TTGG	2	8	901088	901095	0 %	50 %	50 %	0 %	240103025
16382	NC_012804	GTG	2	6	901108	901113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240103025
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16394	NC_012804	GTT	2	6	901675	901680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240103025
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16474	NC_012804	CAG	2	6	906245	906250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240103027
16475	NC_012804	CGT	2	6	906340	906345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240103027
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