MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012804	GGAGT	2	10	824177	824186	20 %	20 %	60 %	0 %	240102939
15002	NC_012804	TC	3	6	824247	824252	0 %	50 %	0 %	50 %	240102939
15003	NC_012804	CAAG	2	8	824265	824272	50 %	0 %	25 %	25 %	240102939
15004	NC_012804	CAG	2	6	824279	824284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102939
15005	NC_012804	AAT	2	6	824299	824304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102939
15006	NC_012804	TAT	2	6	824368	824373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102939
15007	NC_012804	GA	3	6	824405	824410	50 %	0 %	50 %	0 %	240102939
15008	NC_012804	ATT	2	6	824474	824479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102939
15009	NC_012804	T	6	6	824478	824483	0 %	100 %	0 %	0 %	240102939
15010	NC_012804	CTT	3	9	824710	824718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102940
15011	NC_012804	CCT	2	6	824721	824726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102940
15012	NC_012804	GAG	2	6	824727	824732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102940
15013	NC_012804	GCA	2	6	824743	824748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102940
15014	NC_012804	CTT	2	6	824756	824761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102940
15015	NC_012804	GA	3	6	824824	824829	50 %	0 %	50 %	0 %	240102940
15016	NC_012804	GACA	2	8	824862	824869	50 %	0 %	25 %	25 %	240102940
15017	NC_012804	TGT	3	9	824924	824932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102940
15018	NC_012804	GTC	2	6	825397	825402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102941
15019	NC_012804	CCT	2	6	825458	825463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102941
15020	NC_012804	CCT	2	6	825509	825514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102941
15021	NC_012804	TCA	2	6	825562	825567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102941
15022	NC_012804	CTC	3	9	825582	825590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102941
15023	NC_012804	TGT	2	6	825807	825812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102942
15024	NC_012804	CTT	2	6	825822	825827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102942
15025	NC_012804	TCC	2	6	825890	825895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102942
15026	NC_012804	AAG	2	6	825967	825972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102942
15027	NC_012804	TAA	2	6	825980	825985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102942
15028	NC_012804	CT	3	6	826087	826092	0 %	50 %	0 %	50 %	240102942
15029	NC_012804	TCA	2	6	826127	826132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102942
15030	NC_012804	TCA	2	6	826253	826258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102942
15031	NC_012804	CCT	2	6	826296	826301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102942
15032	NC_012804	TCT	2	6	826353	826358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102942
15033	NC_012804	TCACT	2	10	826447	826456	20 %	40 %	0 %	40 %	240102943
15034	NC_012804	CAA	2	6	826597	826602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102943
15035	NC_012804	AT	3	6	826664	826669	50 %	50 %	0 %	0 %	240102943
15036	NC_012804	AAC	2	6	826722	826727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102943
15037	NC_012804	GTT	2	6	826728	826733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102943
15038	NC_012804	GGAAAG	2	12	826887	826898	50 %	0 %	50 %	0 %	240102943
15039	NC_012804	CTG	2	6	826906	826911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102943
15040	NC_012804	CACC	2	8	826996	827003	25 %	0 %	0 %	75 %	240102944
15041	NC_012804	TTG	2	6	827010	827015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102944
15042	NC_012804	CTG	2	6	827031	827036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102944
15043	NC_012804	TCC	2	6	827077	827082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102944
15044	NC_012804	T	6	6	827140	827145	0 %	100 %	0 %	0 %	240102944
15045	NC_012804	ACTT	2	8	827184	827191	25 %	50 %	0 %	25 %	240102944
15046	NC_012804	CAC	2	6	827221	827226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102944
15047	NC_012804	CTC	3	9	827248	827256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102944
15048	NC_012804	GGA	2	6	827359	827364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102945
15049	NC_012804	ATC	2	6	827372	827377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102945
15050	NC_012804	CTG	2	6	827442	827447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102945
15051	NC_012804	CAA	2	6	827488	827493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102945
15052	NC_012804	TGCC	2	8	827502	827509	0 %	25 %	25 %	50 %	240102945
15053	NC_012804	CAGT	2	8	827523	827530	25 %	25 %	25 %	25 %	240102945
15054	NC_012804	TAG	2	6	827553	827558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102945
15055	NC_012804	AGT	2	6	827587	827592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102945
15056	NC_012804	ACA	2	6	827622	827627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102945
15057	NC_012804	TC	3	6	827665	827670	0 %	50 %	0 %	50 %	240102945
15058	NC_012804	T	6	6	827686	827691	0 %	100 %	0 %	0 %	240102945
15059	NC_012804	TAA	2	6	827721	827726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102945
15060	NC_012804	A	6	6	827747	827752	100 %	0 %	0 %	0 %	240102945
15061	NC_012804	TGT	2	6	827785	827790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102945
15062	NC_012804	CAG	2	6	827793	827798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102945
15063	NC_012804	TGT	2	6	827815	827820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102945
15064	NC_012804	GAT	2	6	827822	827827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102945
15065	NC_012804	GTAC	2	8	827857	827864	25 %	25 %	25 %	25 %	240102945
15066	NC_012804	T	6	6	828047	828052	0 %	100 %	0 %	0 %	240102946
15067	NC_012804	TCC	2	6	828108	828113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102946
15068	NC_012804	CAT	2	6	828122	828127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102946
15069	NC_012804	TAT	2	6	828137	828142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102946
15070	NC_012804	TAG	2	6	828206	828211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102946
15071	NC_012804	CAGT	2	8	828249	828256	25 %	25 %	25 %	25 %	240102946
15072	NC_012804	TGT	2	6	828271	828276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102946
15073	NC_012804	AG	3	6	828357	828362	50 %	0 %	50 %	0 %	240102946
15074	NC_012804	TCT	2	6	828363	828368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102946
15075	NC_012804	CAAG	2	8	828457	828464	50 %	0 %	25 %	25 %	240102946
15076	NC_012804	CCA	2	6	828556	828561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102946
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15078	NC_012804	TA	3	6	828617	828622	50 %	50 %	0 %	0 %	240102946
15079	NC_012804	GT	3	6	828646	828651	0 %	50 %	50 %	0 %	240102946
15080	NC_012804	GTA	2	6	828776	828781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102947
15081	NC_012804	GGA	2	6	828785	828790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102947
15082	NC_012804	CTTTTG	2	12	828793	828804	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	240102947
15083	NC_012804	CCA	2	6	828880	828885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102947
15084	NC_012804	CTTC	2	8	828932	828939	0 %	50 %	0 %	50 %	240102947
15085	NC_012804	CTC	3	9	828954	828962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102947
15086	NC_012804	AATGC	2	10	829048	829057	40 %	20 %	20 %	20 %	240102948
15087	NC_012804	CTC	2	6	829191	829196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102948
15088	NC_012804	CGA	2	6	829217	829222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102948
15089	NC_012804	ATGAA	2	10	829294	829303	60 %	20 %	20 %	0 %	240102948
15090	NC_012804	CAA	2	6	829308	829313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102948
15091	NC_012804	ATA	2	6	829332	829337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102948
15092	NC_012804	AAC	2	6	829430	829435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102948
15093	NC_012804	AG	3	6	829484	829489	50 %	0 %	50 %	0 %	240102948
15094	NC_012804	CCA	2	6	829544	829549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102948
15095	NC_012804	A	7	7	829549	829555	100 %	0 %	0 %	0 %	240102948
15096	NC_012804	GTA	2	6	829871	829876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102949
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15098	NC_012804	TCA	2	6	829908	829913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102949
15099	NC_012804	CT	3	6	829919	829924	0 %	50 %	0 %	50 %	240102949
15100	NC_012804	GCTCGT	2	12	829927	829938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102949
15101	NC_012804	CTT	2	6	830004	830009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102949
15102	NC_012804	CTG	2	6	830128	830133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102950
15103	NC_012804	CAGT	2	8	830209	830216	25 %	25 %	25 %	25 %	240102950
15104	NC_012804	GA	3	6	830221	830226	50 %	0 %	50 %	0 %	240102950
15105	NC_012804	TAA	2	6	830236	830241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102950
15106	NC_012804	TAA	2	6	830275	830280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102950
15107	NC_012804	TGGA	2	8	830285	830292	25 %	25 %	50 %	0 %	240102950
15108	NC_012804	GAT	2	6	830296	830301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102950
15109	NC_012804	TGA	2	6	830303	830308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102950
15110	NC_012804	CTT	2	6	830327	830332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102950
15111	NC_012804	CTT	2	6	830357	830362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102950
15112	NC_012804	TTTCC	2	10	830467	830476	0 %	60 %	0 %	40 %	240102950
15113	NC_012804	TCA	2	6	830500	830505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102950
15114	NC_012804	TGGG	2	8	830526	830533	0 %	25 %	75 %	0 %	240102950
15115	NC_012804	G	6	6	830531	830536	0 %	0 %	100 %	0 %	240102950
15116	NC_012804	ACC	2	6	830605	830610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102950
15117	NC_012804	GCCA	2	8	830616	830623	25 %	0 %	25 %	50 %	240102950
15118	NC_012804	AATTCT	2	12	830765	830776	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	240102951
15119	NC_012804	GTT	2	6	830780	830785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102951
15120	NC_012804	CTTC	2	8	830853	830860	0 %	50 %	0 %	50 %	240102951
15121	NC_012804	CCA	2	6	830868	830873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102951
15122	NC_012804	CTC	3	9	830875	830883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102951
15123	NC_012804	TCT	2	6	830931	830936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102951
15124	NC_012804	TCC	2	6	830969	830974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102951
15125	NC_012804	CGTTGA	2	12	831069	831080	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	240102951
15126	NC_012804	TCTT	2	8	831095	831102	0 %	75 %	0 %	25 %	240102951
15127	NC_012804	GCT	2	6	831148	831153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102951
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15137	NC_012804	ACG	2	6	831927	831932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102952
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15154	NC_012804	GAG	2	6	832839	832844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102953
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15227	NC_012804	CCTCGC	2	12	836128	836139	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	240102956
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15231	NC_012804	CCT	2	6	836322	836327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102957
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15238	NC_012804	C	6	6	836550	836555	0 %	0 %	0 %	100 %	240102957
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15240	NC_012804	ACT	2	6	836597	836602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102957
15241	NC_012804	ATC	2	6	836650	836655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102957
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15245	NC_012804	CTC	2	6	836755	836760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102957
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15350	NC_012804	GTATC	2	10	842146	842155	20 %	40 %	20 %	20 %	240102965
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15352	NC_012804	TGA	2	6	842218	842223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102965
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15354	NC_012804	T	6	6	842374	842379	0 %	100 %	0 %	0 %	240102965
15355	NC_012804	GGA	2	6	842465	842470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102965
15356	NC_012804	GAA	2	6	842519	842524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102965
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15482	NC_012804	ACG	2	6	849741	849746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102974
15483	NC_012804	GGA	2	6	849844	849849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102974
15484	NC_012804	GTG	2	6	849885	849890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102974
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