MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012804	GTCGAG	2	12	768528	768539	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	240102873
14002	NC_012804	GAG	2	6	768576	768581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102874
14003	NC_012804	CTTGGG	2	12	768651	768662	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	240102874
14004	NC_012804	GAG	2	6	768681	768686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102874
14005	NC_012804	TCT	2	6	768716	768721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102874
14006	NC_012804	CCT	3	9	768866	768874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102874
14007	NC_012804	ATG	2	6	769009	769014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102874
14008	NC_012804	TGG	2	6	769028	769033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102874
14009	NC_012804	GGTT	2	8	769061	769068	0 %	50 %	50 %	0 %	240102874
14010	NC_012804	CTT	2	6	769089	769094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102874
14011	NC_012804	TCG	2	6	769109	769114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102874
14012	NC_012804	TCGCTC	2	12	769159	769170	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	240102874
14013	NC_012804	GCG	2	6	769183	769188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102874
14014	NC_012804	CGA	2	6	769238	769243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102874
14015	NC_012804	CTC	2	6	769312	769317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102874
14016	NC_012804	ATT	2	6	769396	769401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102874
14017	NC_012804	CCT	2	6	769445	769450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102874
14018	NC_012804	TAT	3	9	769491	769499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102874
14019	NC_012804	TCC	2	6	769603	769608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102874
14020	NC_012804	TC	3	6	769642	769647	0 %	50 %	0 %	50 %	240102874
14021	NC_012804	CT	3	6	769969	769974	0 %	50 %	0 %	50 %	240102875
14022	NC_012804	CT	3	6	770001	770006	0 %	50 %	0 %	50 %	240102875
14023	NC_012804	GAC	2	6	770032	770037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102875
14024	NC_012804	TAA	2	6	770147	770152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102875
14025	NC_012804	TCGC	2	8	770240	770247	0 %	25 %	25 %	50 %	240102875
14026	NC_012804	GAG	2	6	770248	770253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102875
14027	NC_012804	TTA	2	6	770493	770498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102875
14028	NC_012804	GTC	2	6	770575	770580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102875
14029	NC_012804	GGC	2	6	770581	770586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102875
14030	NC_012804	CTC	2	6	770671	770676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102875
14031	NC_012804	CCA	2	6	770819	770824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102875
14032	NC_012804	AGG	2	6	770825	770830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102875
14033	NC_012804	CGA	2	6	770913	770918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102875
14034	NC_012804	CCT	2	6	770938	770943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102875
14035	NC_012804	TC	3	6	770989	770994	0 %	50 %	0 %	50 %	240102875
14036	NC_012804	CCT	2	6	771021	771026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102875
14037	NC_012804	TC	3	6	771046	771051	0 %	50 %	0 %	50 %	240102875
14038	NC_012804	TGT	2	6	771096	771101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102875
14039	NC_012804	AGA	2	6	771107	771112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102875
14040	NC_012804	CTC	2	6	771258	771263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102876
14041	NC_012804	CCT	2	6	771373	771378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102876
14042	NC_012804	CGT	2	6	771402	771407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102876
14043	NC_012804	C	7	7	771430	771436	0 %	0 %	0 %	100 %	240102876
14044	NC_012804	GTT	2	6	771490	771495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102876
14045	NC_012804	CAC	2	6	771567	771572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102876
14046	NC_012804	TCGT	2	8	771581	771588	0 %	50 %	25 %	25 %	240102876
14047	NC_012804	CTC	2	6	771604	771609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102876
14048	NC_012804	CTT	2	6	771630	771635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102876
14049	NC_012804	CGA	2	6	771636	771641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102876
14050	NC_012804	CCT	2	6	771682	771687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102876
14051	NC_012804	GAG	2	6	771691	771696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102876
14052	NC_012804	CTCCCC	2	12	771892	771903	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	240102876
14053	NC_012804	ATC	2	6	771971	771976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102876
14054	NC_012804	GAG	2	6	771996	772001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102877
14055	NC_012804	GC	3	6	772016	772021	0 %	0 %	50 %	50 %	240102877
14056	NC_012804	AGGA	2	8	772024	772031	50 %	0 %	50 %	0 %	240102877
14057	NC_012804	GAG	2	6	772098	772103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102877
14058	NC_012804	AGCG	2	8	772135	772142	25 %	0 %	50 %	25 %	240102877
14059	NC_012804	G	6	6	772175	772180	0 %	0 %	100 %	0 %	240102877
14060	NC_012804	ATCTC	2	10	772300	772309	20 %	40 %	0 %	40 %	240102877
14061	NC_012804	TGA	2	6	772340	772345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102877
14062	NC_012804	GCA	2	6	772441	772446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102877
14063	NC_012804	GGT	2	6	772479	772484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102877
14064	NC_012804	GTT	2	6	772626	772631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102877
14065	NC_012804	GAG	2	6	772833	772838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102877
14066	NC_012804	GTC	2	6	772848	772853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102877
14067	NC_012804	GAG	2	6	772869	772874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102877
14068	NC_012804	TCG	2	6	773021	773026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102878
14069	NC_012804	CCG	2	6	773074	773079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102878
14070	NC_012804	CGA	2	6	773114	773119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102878
14071	NC_012804	CGG	2	6	773147	773152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102878
14072	NC_012804	GTA	2	6	773196	773201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102878
14073	NC_012804	GA	3	6	773286	773291	50 %	0 %	50 %	0 %	240102878
14074	NC_012804	GTC	2	6	773319	773324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102878
14075	NC_012804	ACC	2	6	773340	773345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102878
14076	NC_012804	TCG	2	6	773347	773352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102878
14077	NC_012804	CTTC	2	8	773372	773379	0 %	50 %	0 %	50 %	240102878
14078	NC_012804	TGT	2	6	773444	773449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102878
14079	NC_012804	GTA	2	6	773475	773480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102878
14080	NC_012804	TCC	2	6	773523	773528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102878
14081	NC_012804	CTG	2	6	773580	773585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102878
14082	NC_012804	TGA	2	6	773591	773596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102878
14083	NC_012804	TAT	2	6	773601	773606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102878
14084	NC_012804	CTC	2	6	773619	773624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102878
14085	NC_012804	GAA	2	6	773661	773666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102878
14086	NC_012804	TCT	2	6	773726	773731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102878
14087	NC_012804	GCC	2	6	773829	773834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102878
14088	NC_012804	CTC	2	6	773913	773918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102878
14089	NC_012804	ACC	2	6	773926	773931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102878
14090	NC_012804	TTC	2	6	774020	774025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102878
14091	NC_012804	GAG	2	6	774091	774096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102878
14092	NC_012804	CGG	2	6	774122	774127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102878
14093	NC_012804	CAG	2	6	774138	774143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102878
14094	NC_012804	GAG	2	6	774150	774155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102878
14095	NC_012804	AGA	2	6	774269	774274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102879
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14097	NC_012804	TC	3	6	774424	774429	0 %	50 %	0 %	50 %	240102879
14098	NC_012804	CTT	2	6	774451	774456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102879
14099	NC_012804	GCG	2	6	774512	774517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102879
14100	NC_012804	GAC	2	6	774559	774564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102879
14101	NC_012804	TC	3	6	774636	774641	0 %	50 %	0 %	50 %	240102879
14102	NC_012804	TA	3	6	774655	774660	50 %	50 %	0 %	0 %	240102879
14103	NC_012804	GAG	2	6	774676	774681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102879
14104	NC_012804	CGG	2	6	774705	774710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102879
14105	NC_012804	GAG	2	6	774736	774741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102879
14106	NC_012804	TTG	2	6	774872	774877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102879
14107	NC_012804	CCT	2	6	774900	774905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102879
14108	NC_012804	TCA	2	6	774947	774952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102879
14109	NC_012804	CG	3	6	774975	774980	0 %	0 %	50 %	50 %	240102879
14110	NC_012804	CGC	2	6	775023	775028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102879
14111	NC_012804	TTA	2	6	775038	775043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102879
14112	NC_012804	CTC	2	6	775057	775062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102879
14113	NC_012804	GTTC	2	8	775079	775086	0 %	50 %	25 %	25 %	240102879
14114	NC_012804	CTC	2	6	775093	775098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102879
14115	NC_012804	CTT	2	6	775114	775119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102879
14116	NC_012804	TCT	2	6	775130	775135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102879
14117	NC_012804	CT	3	6	775150	775155	0 %	50 %	0 %	50 %	240102879
14118	NC_012804	A	6	6	775170	775175	100 %	0 %	0 %	0 %	240102879
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14361	NC_012804	GAGCG	2	10	788094	788103	20 %	0 %	60 %	20 %	240102895
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14478	NC_012804	GCG	2	6	794122	794127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102904
14479	NC_012804	T	6	6	794130	794135	0 %	100 %	0 %	0 %	240102904
14480	NC_012804	GAG	2	6	794193	794198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102904
14481	NC_012804	GCC	2	6	794199	794204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102904
14482	NC_012804	CGA	2	6	794240	794245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102904
14483	NC_012804	CTT	2	6	794266	794271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102904
14484	NC_012804	GAA	2	6	794280	794285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102904
14485	NC_012804	ATC	3	9	794287	794295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102904
14486	NC_012804	CGA	2	6	794393	794398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102904
14487	NC_012804	AGCC	2	8	794524	794531	25 %	0 %	25 %	50 %	240102904
14488	NC_012804	CTATCG	2	12	794543	794554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	240102904
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14490	NC_012804	GATG	2	8	794770	794777	25 %	25 %	50 %	0 %	240102905
14491	NC_012804	GA	3	6	794786	794791	50 %	0 %	50 %	0 %	240102905
14492	NC_012804	CGGTG	2	10	794836	794845	0 %	20 %	60 %	20 %	240102905
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14498	NC_012804	CTCTGG	2	12	795104	795115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102905
14499	NC_012804	CCCG	2	8	795214	795221	0 %	0 %	25 %	75 %	240102905
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