MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012804	CTT	2	6	740582	740587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102840
13502	NC_012804	GTGAA	2	10	740622	740631	40 %	20 %	40 %	0 %	240102840
13503	NC_012804	ATCCT	2	10	740736	740745	20 %	40 %	0 %	40 %	240102840
13504	NC_012804	GAG	2	6	740882	740887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102840
13505	NC_012804	CGA	2	6	741028	741033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102841
13506	NC_012804	TTCG	2	8	741245	741252	0 %	50 %	25 %	25 %	240102841
13507	NC_012804	AAG	2	6	741290	741295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102841
13508	NC_012804	CGA	2	6	741331	741336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102841
13509	NC_012804	AGA	2	6	741347	741352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102841
13510	NC_012804	TC	3	6	741467	741472	0 %	50 %	0 %	50 %	240102842
13511	NC_012804	ACG	2	6	741813	741818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102843
13512	NC_012804	AGA	2	6	741819	741824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102843
13513	NC_012804	TCT	2	6	741828	741833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102843
13514	NC_012804	T	6	6	741856	741861	0 %	100 %	0 %	0 %	240102843
13515	NC_012804	CAG	2	6	741969	741974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102843
13516	NC_012804	CTATC	2	10	741977	741986	20 %	40 %	0 %	40 %	240102843
13517	NC_012804	AAC	2	6	742008	742013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102843
13518	NC_012804	ACC	2	6	742017	742022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102843
13519	NC_012804	ACC	2	6	742030	742035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102843
13520	NC_012804	CTC	2	6	742115	742120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102844
13521	NC_012804	GAAGAC	2	12	742217	742228	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	240102844
13522	NC_012804	GGTCGC	2	12	742504	742515	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	240102844
13523	NC_012804	GGA	2	6	742537	742542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102844
13524	NC_012804	CTC	2	6	742596	742601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102844
13525	NC_012804	ATT	2	6	742620	742625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102844
13526	NC_012804	CGAG	2	8	742626	742633	25 %	0 %	50 %	25 %	240102844
13527	NC_012804	CTT	2	6	742685	742690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102844
13528	NC_012804	CGT	2	6	742741	742746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102844
13529	NC_012804	ACG	2	6	742761	742766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102844
13530	NC_012804	GAA	2	6	742832	742837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102844
13531	NC_012804	CCT	2	6	742849	742854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102844
13532	NC_012804	GTC	2	6	742904	742909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102844
13533	NC_012804	CGA	2	6	742978	742983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102844
13534	NC_012804	CT	3	6	743025	743030	0 %	50 %	0 %	50 %	240102844
13535	NC_012804	AGT	2	6	743076	743081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102844
13536	NC_012804	AAT	2	6	743271	743276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102845
13537	NC_012804	TGA	2	6	743412	743417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102845
13538	NC_012804	CTC	2	6	743440	743445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102845
13539	NC_012804	GAA	2	6	743463	743468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102845
13540	NC_012804	A	6	6	743487	743492	100 %	0 %	0 %	0 %	240102845
13541	NC_012804	CG	3	6	743519	743524	0 %	0 %	50 %	50 %	240102845
13542	NC_012804	GC	3	6	743566	743571	0 %	0 %	50 %	50 %	240102845
13543	NC_012804	CCCT	2	8	743632	743639	0 %	25 %	0 %	75 %	240102845
13544	NC_012804	TCC	2	6	743654	743659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102845
13545	NC_012804	ATA	2	6	743662	743667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102845
13546	NC_012804	CCTC	2	8	743678	743685	0 %	25 %	0 %	75 %	240102845
13547	NC_012804	TCC	2	6	743804	743809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102845
13548	NC_012804	AGG	2	6	743882	743887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102845
13549	NC_012804	TTC	2	6	743893	743898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102845
13550	NC_012804	G	6	6	743909	743914	0 %	0 %	100 %	0 %	240102845
13551	NC_012804	GAT	2	6	743977	743982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102845
13552	NC_012804	GGC	2	6	744033	744038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102845
13553	NC_012804	CGA	2	6	744201	744206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102845
13554	NC_012804	GAG	2	6	744253	744258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102845
13555	NC_012804	GC	3	6	744274	744279	0 %	0 %	50 %	50 %	240102845
13556	NC_012804	AGA	2	6	744549	744554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102846
13557	NC_012804	GGA	2	6	744616	744621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102846
13558	NC_012804	ACC	2	6	744656	744661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102846
13559	NC_012804	AGG	2	6	744666	744671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102846
13560	NC_012804	CT	3	6	744672	744677	0 %	50 %	0 %	50 %	240102846
13561	NC_012804	AGG	2	6	744687	744692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102846
13562	NC_012804	CGT	2	6	744727	744732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102846
13563	NC_012804	CGA	2	6	744903	744908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102847
13564	NC_012804	TGT	2	6	744954	744959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102847
13565	NC_012804	TGA	2	6	744986	744991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102847
13566	NC_012804	CTT	2	6	745012	745017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102847
13567	NC_012804	TGA	2	6	745149	745154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102847
13568	NC_012804	CTGTCC	2	12	745239	745250	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	240102847
13569	NC_012804	GGA	3	9	745260	745268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102847
13570	NC_012804	GTC	2	6	745316	745321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102848
13571	NC_012804	GGA	2	6	745368	745373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102848
13572	NC_012804	GTC	2	6	745385	745390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102848
13573	NC_012804	TGG	2	6	745437	745442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102848
13574	NC_012804	GGA	2	6	745477	745482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102848
13575	NC_012804	CATA	2	8	745616	745623	50 %	25 %	0 %	25 %	240102848
13576	NC_012804	TCC	2	6	745677	745682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102848
13577	NC_012804	CCT	2	6	745693	745698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102848
13578	NC_012804	G	6	6	745707	745712	0 %	0 %	100 %	0 %	240102848
13579	NC_012804	CGC	2	6	745816	745821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102848
13580	NC_012804	TCA	2	6	745881	745886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102848
13581	NC_012804	AGGA	2	8	745893	745900	50 %	0 %	50 %	0 %	240102848
13582	NC_012804	GCTTC	2	10	745942	745951	0 %	40 %	20 %	40 %	240102848
13583	NC_012804	AGC	2	6	745955	745960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102848
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13585	NC_012804	CAT	2	6	745990	745995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102848
13586	NC_012804	CTG	2	6	746066	746071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102848
13587	NC_012804	GGGC	2	8	746082	746089	0 %	0 %	75 %	25 %	240102848
13588	NC_012804	GAA	2	6	746133	746138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102849
13589	NC_012804	CG	3	6	746175	746180	0 %	0 %	50 %	50 %	240102849
13590	NC_012804	ATC	2	6	746231	746236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102849
13591	NC_012804	GGT	2	6	746239	746244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102849
13592	NC_012804	GCT	2	6	746260	746265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102849
13593	NC_012804	AAC	2	6	746272	746277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102849
13594	NC_012804	ACG	2	6	746331	746336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102849
13595	NC_012804	GAG	2	6	746377	746382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102849
13596	NC_012804	TGTGA	2	10	746509	746518	20 %	40 %	40 %	0 %	240102849
13597	NC_012804	CTTC	2	8	746546	746553	0 %	50 %	0 %	50 %	240102850
13598	NC_012804	CCA	2	6	746576	746581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102850
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13600	NC_012804	CTT	2	6	746787	746792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102850
13601	NC_012804	TCC	2	6	746819	746824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102850
13602	NC_012804	GCC	2	6	746871	746876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102850
13603	NC_012804	GAA	2	6	747048	747053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102850
13604	NC_012804	CCG	3	9	747064	747072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102850
13605	NC_012804	CGA	2	6	747080	747085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102850
13606	NC_012804	ACC	2	6	747181	747186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102851
13607	NC_012804	GGC	2	6	747215	747220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102851
13608	NC_012804	ATG	2	6	747228	747233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102851
13609	NC_012804	CAC	2	6	747275	747280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102851
13610	NC_012804	AG	3	6	747580	747585	50 %	0 %	50 %	0 %	240102851
13611	NC_012804	GA	3	6	747594	747599	50 %	0 %	50 %	0 %	240102851
13612	NC_012804	AGC	2	6	747609	747614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102851
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13980	NC_012804	CTC	3	9	767509	767517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102872
13981	NC_012804	AGG	2	6	767573	767578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102872
13982	NC_012804	TGT	2	6	767580	767585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102872
13983	NC_012804	GAGAA	2	10	767678	767687	60 %	0 %	40 %	0 %	240102872
13984	NC_012804	TCT	2	6	767703	767708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102872
13985	NC_012804	TCG	2	6	767723	767728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102872
13986	NC_012804	TCC	2	6	767791	767796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102872
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