MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012804	AAT	2	6	712530	712535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102809
13002	NC_012804	GA	3	6	712678	712683	50 %	0 %	50 %	0 %	240102809
13003	NC_012804	GCTT	2	8	712727	712734	0 %	50 %	25 %	25 %	240102809
13004	NC_012804	ACA	2	6	712768	712773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102809
13005	NC_012804	CTG	2	6	712890	712895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102809
13006	NC_012804	ATC	2	6	712904	712909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102809
13007	NC_012804	CAA	2	6	713053	713058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102809
13008	NC_012804	GTT	2	6	713435	713440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102810
13009	NC_012804	ATG	2	6	713519	713524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102810
13010	NC_012804	CAG	2	6	713531	713536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102810
13011	NC_012804	CGT	2	6	713545	713550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102810
13012	NC_012804	TCC	2	6	713568	713573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102810
13013	NC_012804	CGG	2	6	713575	713580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102810
13014	NC_012804	CGC	2	6	713635	713640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102810
13015	NC_012804	TGG	2	6	713675	713680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102810
13016	NC_012804	TCG	2	6	713715	713720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102810
13017	NC_012804	AG	3	6	713767	713772	50 %	0 %	50 %	0 %	240102810
13018	NC_012804	TCC	2	6	713870	713875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102810
13019	NC_012804	TGG	2	6	713930	713935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102810
13020	NC_012804	GGA	2	6	713944	713949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102810
13021	NC_012804	CTC	2	6	713974	713979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102810
13022	NC_012804	TTC	2	6	714029	714034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102810
13023	NC_012804	CT	3	6	714237	714242	0 %	50 %	0 %	50 %	240102810
13024	NC_012804	AT	3	6	714398	714403	50 %	50 %	0 %	0 %	240102810
13025	NC_012804	GAA	2	6	714575	714580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102810
13026	NC_012804	AAGG	2	8	714708	714715	50 %	0 %	50 %	0 %	240102811
13027	NC_012804	TTCGAG	2	12	714801	714812	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	240102811
13028	NC_012804	GGA	2	6	714830	714835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102811
13029	NC_012804	CTC	2	6	714861	714866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102811
13030	NC_012804	AAGG	2	8	714984	714991	50 %	0 %	50 %	0 %	240102812
13031	NC_012804	GCCGAG	2	12	714997	715008	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	240102812
13032	NC_012804	GGC	2	6	715060	715065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102812
13033	NC_012804	GCC	2	6	715102	715107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102812
13034	NC_012804	AGA	2	6	715112	715117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102812
13035	NC_012804	GGA	2	6	715122	715127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102812
13036	NC_012804	GAG	2	6	715144	715149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102812
13037	NC_012804	CCT	2	6	715203	715208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102812
13038	NC_012804	TAA	2	6	715319	715324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102812
13039	NC_012804	ACT	2	6	715352	715357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102812
13040	NC_012804	GAC	2	6	715363	715368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102812
13041	NC_012804	CGA	2	6	715401	715406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102812
13042	NC_012804	GAA	2	6	715423	715428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102812
13043	NC_012804	GCG	2	6	715459	715464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102812
13044	NC_012804	AACG	2	8	715471	715478	50 %	0 %	25 %	25 %	240102812
13045	NC_012804	GAG	2	6	715581	715586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102812
13046	NC_012804	GAG	2	6	715607	715612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102813
13047	NC_012804	CGAA	2	8	715644	715651	50 %	0 %	25 %	25 %	240102813
13048	NC_012804	GAGC	2	8	715681	715688	25 %	0 %	50 %	25 %	240102813
13049	NC_012804	CAG	2	6	715705	715710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102813
13050	NC_012804	CTC	2	6	715724	715729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102813
13051	NC_012804	CGA	3	9	715789	715797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102813
13052	NC_012804	GA	3	6	715961	715966	50 %	0 %	50 %	0 %	240102813
13053	NC_012804	CGA	2	6	716056	716061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102813
13054	NC_012804	TCG	2	6	716166	716171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102813
13055	NC_012804	CGAG	2	8	716214	716221	25 %	0 %	50 %	25 %	240102813
13056	NC_012804	GAA	2	6	716240	716245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102813
13057	NC_012804	CTC	2	6	716288	716293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102813
13058	NC_012804	G	6	6	716350	716355	0 %	0 %	100 %	0 %	240102813
13059	NC_012804	GCC	2	6	716372	716377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102813
13060	NC_012804	AAG	2	6	716393	716398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102813
13061	NC_012804	TCCGC	2	10	716431	716440	0 %	20 %	20 %	60 %	240102813
13062	NC_012804	GGA	2	6	716512	716517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102813
13063	NC_012804	GAG	2	6	716522	716527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102813
13064	NC_012804	GAG	2	6	716543	716548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102813
13065	NC_012804	CGT	2	6	716566	716571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102813
13066	NC_012804	GAG	2	6	716585	716590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102813
13067	NC_012804	GTC	2	6	716600	716605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102813
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13071	NC_012804	CGT	2	6	717166	717171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102813
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13080	NC_012804	GAG	2	6	717572	717577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102813
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13084	NC_012804	GAG	2	6	717722	717727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102813
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13087	NC_012804	TCG	2	6	717962	717967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102814
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13089	NC_012804	CGCT	2	8	718024	718031	0 %	25 %	25 %	50 %	240102814
13090	NC_012804	GAG	2	6	718048	718053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102814
13091	NC_012804	ACG	2	6	718079	718084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102814
13092	NC_012804	CGA	2	6	718089	718094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102814
13093	NC_012804	CCGG	2	8	718101	718108	0 %	0 %	50 %	50 %	240102814
13094	NC_012804	GGA	2	6	718178	718183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102814
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13101	NC_012804	GAAC	2	8	718592	718599	50 %	0 %	25 %	25 %	240102814
13102	NC_012804	AGG	2	6	718660	718665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102814
13103	NC_012804	GAGG	2	8	718680	718687	25 %	0 %	75 %	0 %	240102814
13104	NC_012804	AGA	2	6	718692	718697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102814
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13110	NC_012804	TCT	2	6	718917	718922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102815
13111	NC_012804	ATTT	2	8	719026	719033	25 %	75 %	0 %	0 %	240102815
13112	NC_012804	TCGA	2	8	719097	719104	25 %	25 %	25 %	25 %	240102815
13113	NC_012804	GAAC	2	8	719182	719189	50 %	0 %	25 %	25 %	240102815
13114	NC_012804	GAG	2	6	719198	719203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102815
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13119	NC_012804	GAA	2	6	719477	719482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102815
13120	NC_012804	ATG	2	6	719598	719603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102815
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13122	NC_012804	A	7	7	719697	719703	100 %	0 %	0 %	0 %	240102815
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13237	NC_012804	A	6	6	725768	725773	100 %	0 %	0 %	0 %	240102823
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13239	NC_012804	GTTT	2	8	725963	725970	0 %	75 %	25 %	0 %	240102823
13240	NC_012804	AGG	2	6	726057	726062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102823
13241	NC_012804	GTT	2	6	726095	726100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102823
13242	NC_012804	GTTCCG	2	12	726159	726170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102823
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13248	NC_012804	CCG	2	6	726510	726515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102823
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13339	NC_012804	GTA	2	6	731452	731457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102828
13340	NC_012804	GTC	2	6	731492	731497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102828
13341	NC_012804	CTG	2	6	731611	731616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102828
13342	NC_012804	CGT	2	6	731620	731625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102828
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13347	NC_012804	CTCAT	2	10	731913	731922	20 %	40 %	0 %	40 %	240102829
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13354	NC_012804	CTT	2	6	732257	732262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102829
13355	NC_012804	TGA	2	6	732284	732289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102829
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13358	NC_012804	ATC	2	6	732420	732425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102830
13359	NC_012804	CTT	2	6	732456	732461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102830
13360	NC_012804	CTC	2	6	732462	732467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102830
13361	NC_012804	CTT	2	6	732470	732475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102830
13362	NC_012804	TGA	2	6	732518	732523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102830
13363	NC_012804	TTCT	2	8	732524	732531	0 %	75 %	0 %	25 %	240102830
13364	NC_012804	GCTCTC	2	12	732534	732545	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	240102830
13365	NC_012804	CAACCT	2	12	732569	732580	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	240102830
13366	NC_012804	CG	3	6	732581	732586	0 %	0 %	50 %	50 %	240102830
13367	NC_012804	TCTG	2	8	732633	732640	0 %	50 %	25 %	25 %	240102830
13368	NC_012804	CT	3	6	732928	732933	0 %	50 %	0 %	50 %	240102830
13369	NC_012804	ATC	2	6	732949	732954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102830
13370	NC_012804	CCT	2	6	732983	732988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102830
13371	NC_012804	TTG	3	9	732994	733002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102830
13372	NC_012804	TAT	2	6	733011	733016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102830
13373	NC_012804	GGC	2	6	733053	733058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102830
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13375	NC_012804	CTC	2	6	733131	733136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102830
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13377	NC_012804	CCA	3	9	733180	733188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102830
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13379	NC_012804	GAG	2	6	733237	733242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102830
13380	NC_012804	TC	3	6	733267	733272	0 %	50 %	0 %	50 %	240102830
13381	NC_012804	TCC	2	6	733346	733351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102830
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13384	NC_012804	GAG	2	6	733633	733638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102831
13385	NC_012804	TCG	2	6	733642	733647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102831
13386	NC_012804	TTC	2	6	733679	733684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102831
13387	NC_012804	CTC	2	6	733827	733832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102831
13388	NC_012804	GA	3	6	733972	733977	50 %	0 %	50 %	0 %	240102831
13389	NC_012804	CCA	2	6	733979	733984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102831
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13392	NC_012804	CTT	2	6	734070	734075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102831
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13395	NC_012804	GT	3	6	734191	734196	0 %	50 %	50 %	0 %	240102831
13396	NC_012804	GCCA	2	8	734210	734217	25 %	0 %	25 %	50 %	240102831
13397	NC_012804	GTA	2	6	734355	734360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102831
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13402	NC_012804	TGAAG	2	10	734579	734588	40 %	20 %	40 %	0 %	240102831
13403	NC_012804	GTA	3	9	734604	734612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102831
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13465	NC_012804	TCC	2	6	738617	738622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102836
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13470	NC_012804	TCG	2	6	738740	738745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102837
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13473	NC_012804	GTA	2	6	738874	738879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102837
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13477	NC_012804	TC	4	8	739313	739320	0 %	50 %	0 %	50 %	240102837
13478	NC_012804	GGT	2	6	739496	739501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102838
13479	NC_012804	GAGGTT	2	12	739508	739519	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	240102838
13480	NC_012804	TCG	2	6	739572	739577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102838
13481	NC_012804	TCA	2	6	739611	739616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102838
13482	NC_012804	GAG	2	6	739658	739663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102838
13483	NC_012804	AGG	2	6	739667	739672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102838
13484	NC_012804	TTC	2	6	739694	739699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102838
13485	NC_012804	TCC	2	6	739764	739769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102838
13486	NC_012804	CGAGCG	2	12	739774	739785	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	240102838
13487	NC_012804	AGC	2	6	739825	739830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102838
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13489	NC_012804	CGT	2	6	739981	739986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102838
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13491	NC_012804	TGG	2	6	740096	740101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102838
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13499	NC_012804	AGCG	2	8	740520	740527	25 %	0 %	50 %	25 %	240102839
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