MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_012804	CT	4	8	661251	661258	0 %	50 %	0 %	50 %	240102753
12002	NC_012804	AGG	2	6	661309	661314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102753
12003	NC_012804	CGC	2	6	661320	661325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102753
12004	NC_012804	CCG	2	6	661346	661351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102753
12005	NC_012804	CTC	2	6	661378	661383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102753
12006	NC_012804	ATA	2	6	661471	661476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102753
12007	NC_012804	GTC	2	6	661522	661527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102753
12008	NC_012804	CGA	2	6	661536	661541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102753
12009	NC_012804	CTCC	2	8	661614	661621	0 %	25 %	0 %	75 %	240102753
12010	NC_012804	CCT	2	6	661659	661664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102753
12011	NC_012804	CGA	2	6	661683	661688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102753
12012	NC_012804	GAAGTT	2	12	661723	661734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102753
12013	NC_012804	AG	3	6	661745	661750	50 %	0 %	50 %	0 %	240102753
12014	NC_012804	GCGG	2	8	661770	661777	0 %	0 %	75 %	25 %	240102753
12015	NC_012804	GAG	2	6	661783	661788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102753
12016	NC_012804	AG	3	6	661820	661825	50 %	0 %	50 %	0 %	240102753
12017	NC_012804	CTGG	2	8	661850	661857	0 %	25 %	50 %	25 %	240102753
12018	NC_012804	ACT	2	6	661877	661882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102753
12019	NC_012804	GA	3	6	661900	661905	50 %	0 %	50 %	0 %	240102753
12020	NC_012804	GA	3	6	661912	661917	50 %	0 %	50 %	0 %	240102753
12021	NC_012804	TGA	2	6	661937	661942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102753
12022	NC_012804	GAG	2	6	661948	661953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102753
12023	NC_012804	CTT	2	6	661954	661959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102753
12024	NC_012804	GCGATA	2	12	662002	662013	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240102753
12025	NC_012804	AACG	2	8	662070	662077	50 %	0 %	25 %	25 %	240102753
12026	NC_012804	GAA	2	6	662097	662102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102753
12027	NC_012804	GAAA	2	8	662127	662134	75 %	0 %	25 %	0 %	240102753
12028	NC_012804	ATA	2	6	662149	662154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102753
12029	NC_012804	TCT	2	6	662193	662198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102754
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12031	NC_012804	GAG	2	6	662260	662265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102754
12032	NC_012804	CT	3	6	662270	662275	0 %	50 %	0 %	50 %	240102754
12033	NC_012804	GAT	2	6	662307	662312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102754
12034	NC_012804	TTG	2	6	662324	662329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102754
12035	NC_012804	AGCGA	2	10	662333	662342	40 %	0 %	40 %	20 %	240102754
12036	NC_012804	CT	3	6	662393	662398	0 %	50 %	0 %	50 %	240102754
12037	NC_012804	AAG	2	6	662419	662424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102754
12038	NC_012804	TGA	2	6	662427	662432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102754
12039	NC_012804	AAG	2	6	662476	662481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102754
12040	NC_012804	GC	3	6	662539	662544	0 %	0 %	50 %	50 %	240102754
12041	NC_012804	CGT	2	6	662592	662597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102754
12042	NC_012804	TTA	2	6	662610	662615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102754
12043	NC_012804	TCC	2	6	662690	662695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102754
12044	NC_012804	TTC	2	6	662711	662716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102754
12045	NC_012804	TCA	2	6	662762	662767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102754
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12048	NC_012804	GCTCC	2	10	662919	662928	0 %	20 %	20 %	60 %	240102754
12049	NC_012804	GTC	2	6	662993	662998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102754
12050	NC_012804	TTC	2	6	663140	663145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102754
12051	NC_012804	CCCT	2	8	663197	663204	0 %	25 %	0 %	75 %	240102754
12052	NC_012804	AGA	2	6	663210	663215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102754
12053	NC_012804	CCT	2	6	663246	663251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102754
12054	NC_012804	CTC	2	6	663263	663268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102754
12055	NC_012804	GTT	2	6	663382	663387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102754
12056	NC_012804	TCC	2	6	663500	663505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102754
12057	NC_012804	CTC	2	6	663547	663552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102754
12058	NC_012804	GTC	2	6	663601	663606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102754
12059	NC_012804	CGA	2	6	663732	663737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102754
12060	NC_012804	GCTC	2	8	663759	663766	0 %	25 %	25 %	50 %	240102754
12061	NC_012804	AGT	2	6	663825	663830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102754
12062	NC_012804	CGA	2	6	663900	663905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102754
12063	NC_012804	GT	3	6	663996	664001	0 %	50 %	50 %	0 %	240102754
12064	NC_012804	TC	3	6	664014	664019	0 %	50 %	0 %	50 %	240102754
12065	NC_012804	CTT	2	6	664027	664032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102754
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12088	NC_012804	CCG	2	6	664963	664968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102756
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12091	NC_012804	GCT	2	6	665069	665074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102757
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12098	NC_012804	TCA	2	6	665268	665273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102757
12099	NC_012804	CGA	2	6	665280	665285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102757
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12101	NC_012804	CT	3	6	665479	665484	0 %	50 %	0 %	50 %	240102757
12102	NC_012804	CTT	2	6	665491	665496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102757
12103	NC_012804	CGA	2	6	665514	665519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102757
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12105	NC_012804	CTC	2	6	665555	665560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102757
12106	NC_012804	GA	3	6	665581	665586	50 %	0 %	50 %	0 %	240102757
12107	NC_012804	ACC	2	6	665587	665592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102757
12108	NC_012804	AG	3	6	665608	665613	50 %	0 %	50 %	0 %	240102757
12109	NC_012804	T	6	6	665748	665753	0 %	100 %	0 %	0 %	240102758
12110	NC_012804	TCCC	2	8	665759	665766	0 %	25 %	0 %	75 %	240102758
12111	NC_012804	TC	3	6	665874	665879	0 %	50 %	0 %	50 %	240102758
12112	NC_012804	GAC	2	6	665899	665904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102758
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12114	NC_012804	TCC	2	6	666075	666080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102758
12115	NC_012804	GGCC	2	8	666115	666122	0 %	0 %	50 %	50 %	240102758
12116	NC_012804	TCG	3	9	666173	666181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102758
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12120	NC_012804	TCG	2	6	666533	666538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102758
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12349	NC_012804	CTCC	2	8	678021	678028	0 %	25 %	0 %	75 %	240102773
12350	NC_012804	ACCGA	2	10	678051	678060	40 %	0 %	20 %	40 %	240102773
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12352	NC_012804	GGAG	2	8	678089	678096	25 %	0 %	75 %	0 %	240102773
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12356	NC_012804	GTC	2	6	678189	678194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102773
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12477	NC_012804	TAC	2	6	684422	684427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102780
12478	NC_012804	CG	3	6	684428	684433	0 %	0 %	50 %	50 %	240102780
12479	NC_012804	CTG	2	6	684438	684443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102780
12480	NC_012804	GAG	2	6	684500	684505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102780
12481	NC_012804	GTC	2	6	684590	684595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102780
12482	NC_012804	AGA	2	6	684609	684614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102780
12483	NC_012804	CGG	2	6	684721	684726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102780
12484	NC_012804	GAGG	2	8	684748	684755	25 %	0 %	75 %	0 %	240102780
12485	NC_012804	CGG	2	6	684781	684786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102780
12486	NC_012804	GA	3	6	684809	684814	50 %	0 %	50 %	0 %	240102780
12487	NC_012804	TGG	3	9	684906	684914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102780
12488	NC_012804	T	6	6	684991	684996	0 %	100 %	0 %	0 %	240102781
12489	NC_012804	CGA	2	6	685089	685094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102781
12490	NC_012804	TCT	2	6	685116	685121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102781
12491	NC_012804	CCT	2	6	685297	685302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102781
12492	NC_012804	TC	3	6	685306	685311	0 %	50 %	0 %	50 %	240102781
12493	NC_012804	TTGC	2	8	685403	685410	0 %	50 %	25 %	25 %	240102781
12494	NC_012804	AGGA	2	8	685412	685419	50 %	0 %	50 %	0 %	240102781
12495	NC_012804	GAG	2	6	685438	685443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102781
12496	NC_012804	CCTT	2	8	685587	685594	0 %	50 %	0 %	50 %	240102781
12497	NC_012804	AGA	2	6	685611	685616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102781
12498	NC_012804	CT	3	6	685622	685627	0 %	50 %	0 %	50 %	240102781
12499	NC_012804	CCT	2	6	685629	685634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102781
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