MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012804	AAG	2	6	631468	631473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102718
11502	NC_012804	CAA	2	6	631553	631558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102718
11503	NC_012804	TGCT	2	8	631564	631571	0 %	50 %	25 %	25 %	240102718
11504	NC_012804	TACTC	2	10	631580	631589	20 %	40 %	0 %	40 %	240102718
11505	NC_012804	GAG	2	6	631614	631619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102718
11506	NC_012804	CAG	2	6	631628	631633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102718
11507	NC_012804	GAG	2	6	631719	631724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102718
11508	NC_012804	AAGGCG	2	12	631878	631889	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	240102718
11509	NC_012804	AGC	2	6	631900	631905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102718
11510	NC_012804	CAG	2	6	631932	631937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102718
11511	NC_012804	CAA	2	6	631956	631961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102718
11512	NC_012804	GAG	2	6	631962	631967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102718
11513	NC_012804	GAA	2	6	631988	631993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102718
11514	NC_012804	TCG	2	6	632002	632007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102718
11515	NC_012804	AAAAG	2	10	632077	632086	80 %	0 %	20 %	0 %	240102718
11516	NC_012804	GAA	2	6	632293	632298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102719
11517	NC_012804	GAG	2	6	632408	632413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102719
11518	NC_012804	TCA	2	6	632439	632444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102719
11519	NC_012804	AAAAG	2	10	632513	632522	80 %	0 %	20 %	0 %	240102719
11520	NC_012804	TAT	2	6	632564	632569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102719
11521	NC_012804	TTC	2	6	632592	632597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102719
11522	NC_012804	GACA	2	8	632669	632676	50 %	0 %	25 %	25 %	240102719
11523	NC_012804	CCA	2	6	632742	632747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102719
11524	NC_012804	ACA	2	6	632772	632777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102719
11525	NC_012804	TTGACT	2	12	632817	632828	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	240102719
11526	NC_012804	TCA	2	6	632829	632834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102719
11527	NC_012804	ACGG	2	8	632868	632875	25 %	0 %	50 %	25 %	240102719
11528	NC_012804	TCA	2	6	632877	632882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102719
11529	NC_012804	GGGAT	2	10	632887	632896	20 %	20 %	60 %	0 %	240102719
11530	NC_012804	CTC	2	6	632990	632995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102719
11531	NC_012804	GC	3	6	633012	633017	0 %	0 %	50 %	50 %	240102719
11532	NC_012804	TCT	2	6	633036	633041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102719
11533	NC_012804	TCA	2	6	633081	633086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102719
11534	NC_012804	CCG	2	6	633123	633128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102719
11535	NC_012804	TCT	2	6	633201	633206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102719
11536	NC_012804	TCA	2	6	633207	633212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102719
11537	NC_012804	CCT	2	6	633229	633234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102719
11538	NC_012804	TAAAC	2	10	633265	633274	60 %	20 %	0 %	20 %	240102719
11539	NC_012804	AGGG	2	8	633275	633282	25 %	0 %	75 %	0 %	240102719
11540	NC_012804	AGC	2	6	633355	633360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102719
11541	NC_012804	AAT	2	6	633370	633375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102719
11542	NC_012804	GGA	2	6	633378	633383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102719
11543	NC_012804	GAC	2	6	633395	633400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102719
11544	NC_012804	TCA	2	6	633420	633425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102719
11545	NC_012804	CAC	2	6	633555	633560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102719
11546	NC_012804	TGA	2	6	633574	633579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102720
11547	NC_012804	AGA	2	6	633601	633606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102720
11548	NC_012804	CAA	2	6	633618	633623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102720
11549	NC_012804	GAA	2	6	633681	633686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102720
11550	NC_012804	AG	3	6	633745	633750	50 %	0 %	50 %	0 %	240102720
11551	NC_012804	TCA	2	6	633751	633756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102720
11552	NC_012804	GAAA	2	8	633770	633777	75 %	0 %	25 %	0 %	240102720
11553	NC_012804	AGT	2	6	633890	633895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102720
11554	NC_012804	CGA	2	6	633953	633958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102720
11555	NC_012804	TCA	2	6	633985	633990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102720
11556	NC_012804	GAA	2	6	634064	634069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102720
11557	NC_012804	CAT	2	6	634100	634105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102720
11558	NC_012804	GTC	2	6	634125	634130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102720
11559	NC_012804	TGG	2	6	634220	634225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102720
11560	NC_012804	CAG	2	6	634387	634392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102721
11561	NC_012804	TGC	2	6	634435	634440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102721
11562	NC_012804	CCG	2	6	634447	634452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102721
11563	NC_012804	AAGA	2	8	634481	634488	75 %	0 %	25 %	0 %	240102721
11564	NC_012804	AGG	2	6	634567	634572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102721
11565	NC_012804	AGA	2	6	634582	634587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102721
11566	NC_012804	TC	3	6	634645	634650	0 %	50 %	0 %	50 %	240102722
11567	NC_012804	GAA	2	6	634671	634676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102722
11568	NC_012804	TTC	2	6	634678	634683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102722
11569	NC_012804	TTC	2	6	634732	634737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102722
11570	NC_012804	CTT	2	6	634748	634753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102722
11571	NC_012804	ATT	2	6	634780	634785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102722
11572	NC_012804	CTT	2	6	634809	634814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102722
11573	NC_012804	T	6	6	634852	634857	0 %	100 %	0 %	0 %	240102722
11574	NC_012804	AAT	2	6	634871	634876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102722
11575	NC_012804	TGG	2	6	634885	634890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102722
11576	NC_012804	TCC	2	6	634907	634912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102722
11577	NC_012804	TAT	2	6	634936	634941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102722
11578	NC_012804	GC	3	6	635016	635021	0 %	0 %	50 %	50 %	240102722
11579	NC_012804	AAT	2	6	635041	635046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102722
11580	NC_012804	ATTC	2	8	635149	635156	25 %	50 %	0 %	25 %	240102722
11581	NC_012804	AAAG	2	8	635168	635175	75 %	0 %	25 %	0 %	240102722
11582	NC_012804	AT	3	6	635280	635285	50 %	50 %	0 %	0 %	240102722
11583	NC_012804	GCT	2	6	635325	635330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102722
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11585	NC_012804	T	7	7	635371	635377	0 %	100 %	0 %	0 %	240102722
11586	NC_012804	TAG	2	6	635397	635402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102722
11587	NC_012804	AGAC	2	8	635454	635461	50 %	0 %	25 %	25 %	240102722
11588	NC_012804	ACC	2	6	635531	635536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102722
11589	NC_012804	GAA	2	6	635635	635640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102723
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11591	NC_012804	CCA	2	6	635664	635669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102723
11592	NC_012804	TCA	2	6	635690	635695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102723
11593	NC_012804	CAA	2	6	635863	635868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102723
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11595	NC_012804	AAC	2	6	635891	635896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102723
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11600	NC_012804	CCGC	2	8	636061	636068	0 %	0 %	25 %	75 %	240102723
11601	NC_012804	ATT	2	6	636094	636099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102723
11602	NC_012804	CAC	2	6	636102	636107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102723
11603	NC_012804	CTT	2	6	636139	636144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102723
11604	NC_012804	TCA	2	6	636185	636190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102723
11605	NC_012804	GGTG	2	8	636221	636228	0 %	25 %	75 %	0 %	240102723
11606	NC_012804	CCA	2	6	636252	636257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102723
11607	NC_012804	CTCA	2	8	636382	636389	25 %	25 %	0 %	50 %	240102723
11608	NC_012804	CG	3	6	636620	636625	0 %	0 %	50 %	50 %	240102724
11609	NC_012804	ATT	2	6	636954	636959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102724
11610	NC_012804	CCA	2	6	637492	637497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102725
11611	NC_012804	TGA	2	6	637503	637508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102725
11612	NC_012804	TGGA	2	8	637528	637535	25 %	25 %	50 %	0 %	240102725
11613	NC_012804	AG	3	6	637548	637553	50 %	0 %	50 %	0 %	240102725
11614	NC_012804	GAA	2	6	637672	637677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102725
11615	NC_012804	TCG	2	6	637709	637714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102725
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11618	NC_012804	CTT	2	6	637911	637916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102725
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11620	NC_012804	GGC	2	6	638058	638063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102725
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11978	NC_012804	CAC	2	6	659955	659960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102749
11979	NC_012804	GAA	2	6	659969	659974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102749
11980	NC_012804	CGT	2	6	659984	659989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102749
11981	NC_012804	TCG	2	6	660028	660033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102749
11982	NC_012804	CTT	2	6	660095	660100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102749
11983	NC_012804	GAT	2	6	660125	660130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102749
11984	NC_012804	AAG	2	6	660145	660150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102749
11985	NC_012804	CTC	2	6	660186	660191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102749
11986	NC_012804	CAA	2	6	660233	660238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102749
11987	NC_012804	GAG	2	6	660252	660257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102749
11988	NC_012804	GAGC	2	8	660266	660273	25 %	0 %	50 %	25 %	240102749
11989	NC_012804	AAG	3	9	660291	660299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102749
11990	NC_012804	GGA	2	6	660359	660364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102749
11991	NC_012804	TCA	2	6	660367	660372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102749
11992	NC_012804	GAG	2	6	660423	660428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102749
11993	NC_012804	CAG	2	6	660432	660437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102749
11994	NC_012804	G	6	6	660648	660653	0 %	0 %	100 %	0 %	240102750
11995	NC_012804	CTTT	2	8	660739	660746	0 %	75 %	0 %	25 %	240102751
11996	NC_012804	TCC	2	6	660773	660778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102752
11997	NC_012804	TTC	2	6	660856	660861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102752
11998	NC_012804	TAACG	2	10	660945	660954	40 %	20 %	20 %	20 %	240102752
11999	NC_012804	GGA	2	6	661149	661154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102753
12000	NC_012804	GAG	2	6	661201	661206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102753

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