MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_012804	GC	3	6	601906	601911	0 %	0 %	50 %	50 %	240102688
11002	NC_012804	CGT	2	6	601988	601993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102688
11003	NC_012804	AGAGG	2	10	602017	602026	40 %	0 %	60 %	0 %	240102688
11004	NC_012804	TCG	2	6	602038	602043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102688
11005	NC_012804	ATA	2	6	602091	602096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102688
11006	NC_012804	GACA	2	8	602105	602112	50 %	0 %	25 %	25 %	240102688
11007	NC_012804	GAG	2	6	602151	602156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102688
11008	NC_012804	ACG	2	6	602161	602166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102688
11009	NC_012804	GTTC	2	8	602171	602178	0 %	50 %	25 %	25 %	240102688
11010	NC_012804	CTC	2	6	602394	602399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102688
11011	NC_012804	GGC	2	6	602418	602423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102688
11012	NC_012804	AAC	2	6	602445	602450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102688
11013	NC_012804	AT	3	6	602465	602470	50 %	50 %	0 %	0 %	240102688
11014	NC_012804	GC	3	6	602473	602478	0 %	0 %	50 %	50 %	240102688
11015	NC_012804	CCTG	2	8	602489	602496	0 %	25 %	25 %	50 %	240102688
11016	NC_012804	CGA	2	6	602513	602518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102688
11017	NC_012804	GAC	2	6	602556	602561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102688
11018	NC_012804	CCGA	2	8	602565	602572	25 %	0 %	25 %	50 %	240102688
11019	NC_012804	CG	3	6	602677	602682	0 %	0 %	50 %	50 %	240102688
11020	NC_012804	CCT	2	6	602708	602713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102688
11021	NC_012804	CGT	2	6	602714	602719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102688
11022	NC_012804	GC	3	6	602745	602750	0 %	0 %	50 %	50 %	240102688
11023	NC_012804	TCC	2	6	602764	602769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102688
11024	NC_012804	AGG	2	6	602791	602796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102688
11025	NC_012804	AGCG	2	8	602811	602818	25 %	0 %	50 %	25 %	240102688
11026	NC_012804	GAG	2	6	602937	602942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102688
11027	NC_012804	GAG	2	6	602979	602984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102688
11028	NC_012804	TGA	2	6	602993	602998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102688
11029	NC_012804	GAG	2	6	603111	603116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102688
11030	NC_012804	GAG	2	6	603123	603128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102688
11031	NC_012804	ACA	2	6	603169	603174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102688
11032	NC_012804	GAG	2	6	603191	603196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102688
11033	NC_012804	GC	3	6	603320	603325	0 %	0 %	50 %	50 %	240102688
11034	NC_012804	CGG	2	6	603332	603337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102688
11035	NC_012804	ACA	2	6	603656	603661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102689
11036	NC_012804	TCC	2	6	603728	603733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102689
11037	NC_012804	CAA	2	6	603828	603833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102689
11038	NC_012804	T	6	6	603932	603937	0 %	100 %	0 %	0 %	240102690
11039	NC_012804	CGACCT	2	12	604048	604059	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	240102690
11040	NC_012804	AG	3	6	604124	604129	50 %	0 %	50 %	0 %	240102690
11041	NC_012804	AAC	2	6	604199	604204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102690
11042	NC_012804	TCA	2	6	604221	604226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102690
11043	NC_012804	TC	3	6	604238	604243	0 %	50 %	0 %	50 %	240102690
11044	NC_012804	AATG	2	8	604270	604277	50 %	25 %	25 %	0 %	240102690
11045	NC_012804	CT	3	6	604290	604295	0 %	50 %	0 %	50 %	240102690
11046	NC_012804	CCT	2	6	604378	604383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102690
11047	NC_012804	G	6	6	604407	604412	0 %	0 %	100 %	0 %	240102690
11048	NC_012804	CTT	2	6	604459	604464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102690
11049	NC_012804	CAGA	2	8	604586	604593	50 %	0 %	25 %	25 %	240102691
11050	NC_012804	CGG	2	6	604751	604756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102691
11051	NC_012804	CGA	2	6	604807	604812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102691
11052	NC_012804	TCG	2	6	604822	604827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102691
11053	NC_012804	TCG	2	6	604845	604850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102691
11054	NC_012804	GAGCTT	2	12	604895	604906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	240102691
11055	NC_012804	TCC	2	6	604948	604953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102691
11056	NC_012804	GCG	2	6	605019	605024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102691
11057	NC_012804	CT	3	6	605073	605078	0 %	50 %	0 %	50 %	240102691
11058	NC_012804	TGTCC	2	10	605123	605132	0 %	40 %	20 %	40 %	240102691
11059	NC_012804	GTG	3	9	605177	605185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102691
11060	NC_012804	GAG	2	6	605228	605233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102691
11061	NC_012804	CTCG	2	8	605309	605316	0 %	25 %	25 %	50 %	240102691
11062	NC_012804	AGGA	2	8	605487	605494	50 %	0 %	50 %	0 %	240102691
11063	NC_012804	GAGC	2	8	605648	605655	25 %	0 %	50 %	25 %	240102691
11064	NC_012804	GAGC	2	8	605815	605822	25 %	0 %	50 %	25 %	240102691
11065	NC_012804	GTA	2	6	605828	605833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102691
11066	NC_012804	CTT	2	6	605837	605842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102691
11067	NC_012804	TC	3	6	605881	605886	0 %	50 %	0 %	50 %	240102691
11068	NC_012804	CCA	2	6	605893	605898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102691
11069	NC_012804	CGA	2	6	606086	606091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102692
11070	NC_012804	AAG	2	6	606144	606149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102692
11071	NC_012804	GGCT	2	8	606168	606175	0 %	25 %	50 %	25 %	240102692
11072	NC_012804	GAG	2	6	606213	606218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102692
11073	NC_012804	ACA	2	6	606256	606261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102692
11074	NC_012804	TCG	2	6	606268	606273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102692
11075	NC_012804	GTC	2	6	606303	606308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102692
11076	NC_012804	GAA	2	6	606332	606337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102692
11077	NC_012804	CTA	2	6	606389	606394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102692
11078	NC_012804	GAC	2	6	606399	606404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102692
11079	NC_012804	GAT	2	6	606419	606424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102692
11080	NC_012804	GAG	2	6	606459	606464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102692
11081	NC_012804	GA	3	6	606480	606485	50 %	0 %	50 %	0 %	240102692
11082	NC_012804	GAA	2	6	606569	606574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102692
11083	NC_012804	GA	3	6	606583	606588	50 %	0 %	50 %	0 %	240102692
11084	NC_012804	GAT	2	6	606748	606753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102692
11085	NC_012804	TTCTAT	2	12	606784	606795	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	240102693
11086	NC_012804	CCT	2	6	606796	606801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102693
11087	NC_012804	CCT	2	6	606828	606833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102693
11088	NC_012804	CTC	2	6	606850	606855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102693
11089	NC_012804	AAGG	2	8	606856	606863	50 %	0 %	50 %	0 %	240102693
11090	NC_012804	ATA	2	6	606993	606998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102694
11091	NC_012804	TTG	2	6	607000	607005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102694
11092	NC_012804	CCT	3	9	607019	607027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102694
11093	NC_012804	TCC	2	6	607030	607035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102694
11094	NC_012804	CGA	2	6	607049	607054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102694
11095	NC_012804	TCC	2	6	607087	607092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102694
11096	NC_012804	TCC	2	6	607191	607196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102694
11097	NC_012804	CTCGTA	2	12	607305	607316	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	240102694
11098	NC_012804	CGA	2	6	607448	607453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102694
11099	NC_012804	CGTTCA	2	12	607655	607666	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	240102694
11100	NC_012804	CGA	2	6	607715	607720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102694
11101	NC_012804	GTC	2	6	607744	607749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102694
11102	NC_012804	GAG	2	6	607776	607781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102694
11103	NC_012804	AGT	2	6	607787	607792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102694
11104	NC_012804	CCT	2	6	607827	607832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102694
11105	NC_012804	ATG	2	6	607861	607866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102694
11106	NC_012804	AGA	2	6	608101	608106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102695
11107	NC_012804	CTT	2	6	608112	608117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102695
11108	NC_012804	GATA	2	8	608187	608194	50 %	25 %	25 %	0 %	240102695
11109	NC_012804	CGT	2	6	608270	608275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102695
11110	NC_012804	GA	3	6	608414	608419	50 %	0 %	50 %	0 %	240102695
11111	NC_012804	AGG	2	6	608431	608436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102695
11112	NC_012804	CTACGC	2	12	608456	608467	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	240102695
11113	NC_012804	CTC	2	6	608540	608545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102695
11114	NC_012804	AAAG	2	8	608609	608616	75 %	0 %	25 %	0 %	240102695
11115	NC_012804	GAG	2	6	608646	608651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102695
11116	NC_012804	ACG	2	6	608698	608703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102695
11117	NC_012804	GGT	2	6	608714	608719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102695
11118	NC_012804	TAC	2	6	608720	608725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102695
11119	NC_012804	CAGC	2	8	608781	608788	25 %	0 %	25 %	50 %	240102695
11120	NC_012804	CGG	2	6	608852	608857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102695
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11124	NC_012804	ATC	2	6	609346	609351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102696
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11229	NC_012804	AGGG	2	8	614879	614886	25 %	0 %	75 %	0 %	240102702
11230	NC_012804	TCC	2	6	615071	615076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102703
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11234	NC_012804	TGA	2	6	615168	615173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102703
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11237	NC_012804	CT	3	6	615361	615366	0 %	50 %	0 %	50 %	240102703
11238	NC_012804	CTCTTC	2	12	615377	615388	0 %	50 %	0 %	50 %	240102703
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11240	NC_012804	GGAA	2	8	615647	615654	50 %	0 %	50 %	0 %	240102704
11241	NC_012804	GAA	3	9	615652	615660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102704
11242	NC_012804	AG	3	6	615727	615732	50 %	0 %	50 %	0 %	240102704
11243	NC_012804	GGGA	2	8	615753	615760	25 %	0 %	75 %	0 %	240102704
11244	NC_012804	GGAA	2	8	615778	615785	50 %	0 %	50 %	0 %	240102704
11245	NC_012804	CTC	2	6	615818	615823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102704
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11253	NC_012804	AGG	2	6	616242	616247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102704
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11281	NC_012804	TCT	2	6	617736	617741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102704
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11349	NC_012804	GAAGT	2	10	622286	622295	40 %	20 %	40 %	0 %	240102708
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11358	NC_012804	CGGT	2	8	623438	623445	0 %	25 %	50 %	25 %	240102709
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11360	NC_012804	TATGA	2	10	623536	623545	40 %	40 %	20 %	0 %	240102709
11361	NC_012804	CTT	2	6	623556	623561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102709
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11477	NC_012804	CTA	2	6	630070	630075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102716
11478	NC_012804	CAAGGT	2	12	630076	630087	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240102716
11479	NC_012804	CGT	2	6	630136	630141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102716
11480	NC_012804	ACT	2	6	630146	630151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102716
11481	NC_012804	ACA	3	9	630183	630191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102716
11482	NC_012804	ACG	2	6	630231	630236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102716
11483	NC_012804	CTA	2	6	630247	630252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102716
11484	NC_012804	ACA	2	6	630291	630296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102716
11485	NC_012804	TCC	2	6	630441	630446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102716
11486	NC_012804	ATG	2	6	630511	630516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102717
11487	NC_012804	TTC	2	6	630528	630533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102717
11488	NC_012804	GTC	2	6	630553	630558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102717
11489	NC_012804	T	7	7	630584	630590	0 %	100 %	0 %	0 %	240102717
11490	NC_012804	CTA	2	6	630594	630599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102717
11491	NC_012804	TTG	2	6	630677	630682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102717
11492	NC_012804	CGG	2	6	630758	630763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102717
11493	NC_012804	ACA	2	6	630773	630778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102717
11494	NC_012804	AAG	2	6	630817	630822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102717
11495	NC_012804	GAGAAG	2	12	630862	630873	50 %	0 %	50 %	0 %	240102717
11496	NC_012804	AT	4	8	631029	631036	50 %	50 %	0 %	0 %	240102718
11497	NC_012804	GGC	2	6	631064	631069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102718
11498	NC_012804	AACGG	2	10	631209	631218	40 %	0 %	40 %	20 %	240102718
11499	NC_012804	CAAA	2	8	631350	631357	75 %	0 %	0 %	25 %	240102718
11500	NC_012804	AG	3	6	631371	631376	50 %	0 %	50 %	0 %	240102718

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