MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012804	AG	3	6	546861	546866	50 %	0 %	50 %	0 %	240102638
10002	NC_012804	G	6	6	546892	546897	0 %	0 %	100 %	0 %	240102638
10003	NC_012804	CCT	2	6	546925	546930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102638
10004	NC_012804	CAG	2	6	546967	546972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102638
10005	NC_012804	ACG	2	6	547011	547016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102638
10006	NC_012804	CGA	2	6	547063	547068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102638
10007	NC_012804	GCC	2	6	547088	547093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102638
10008	NC_012804	CGC	2	6	547276	547281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102638
10009	NC_012804	TGT	2	6	547294	547299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102638
10010	NC_012804	CTA	2	6	547309	547314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102638
10011	NC_012804	CTTT	2	8	547351	547358	0 %	75 %	0 %	25 %	240102639
10012	NC_012804	T	6	6	547356	547361	0 %	100 %	0 %	0 %	240102639
10013	NC_012804	CCCA	2	8	547426	547433	25 %	0 %	0 %	75 %	240102639
10014	NC_012804	CTC	2	6	547463	547468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102639
10015	NC_012804	CGT	2	6	547564	547569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102639
10016	NC_012804	CAT	2	6	547594	547599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102639
10017	NC_012804	CGA	2	6	547710	547715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102639
10018	NC_012804	CGA	2	6	547755	547760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102639
10019	NC_012804	TCAT	2	8	547802	547809	25 %	50 %	0 %	25 %	240102639
10020	NC_012804	GTG	3	9	547886	547894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102640
10021	NC_012804	AGG	2	6	547973	547978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102640
10022	NC_012804	GCT	2	6	548041	548046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102640
10023	NC_012804	TGA	2	6	548053	548058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102640
10024	NC_012804	GAGAG	2	10	548082	548091	40 %	0 %	60 %	0 %	240102640
10025	NC_012804	CGG	2	6	548158	548163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102640
10026	NC_012804	CGG	2	6	548170	548175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102640
10027	NC_012804	TGG	2	6	548223	548228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102640
10028	NC_012804	CGA	2	6	548233	548238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102640
10029	NC_012804	TACCTC	2	12	548258	548269	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	240102640
10030	NC_012804	CCT	2	6	548284	548289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102640
10031	NC_012804	GAG	2	6	548309	548314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102640
10032	NC_012804	GCTGA	2	10	548321	548330	20 %	20 %	40 %	20 %	240102640
10033	NC_012804	AG	3	6	548357	548362	50 %	0 %	50 %	0 %	240102640
10034	NC_012804	ATA	2	6	548384	548389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102640
10035	NC_012804	CTC	2	6	548423	548428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102640
10036	NC_012804	GCAG	2	8	548495	548502	25 %	0 %	50 %	25 %	240102640
10037	NC_012804	GAA	2	6	548548	548553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102640
10038	NC_012804	CTA	2	6	548569	548574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102640
10039	NC_012804	TCG	2	6	548619	548624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102640
10040	NC_012804	AAG	2	6	548672	548677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102640
10041	NC_012804	CTA	3	9	548686	548694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102640
10042	NC_012804	GGA	2	6	548752	548757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102640
10043	NC_012804	GAAA	2	8	548773	548780	75 %	0 %	25 %	0 %	240102641
10044	NC_012804	TTC	2	6	548804	548809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102641
10045	NC_012804	CCT	2	6	548876	548881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102641
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10050	NC_012804	CTAT	2	8	549009	549016	25 %	50 %	0 %	25 %	240102641
10051	NC_012804	TGG	2	6	549076	549081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102641
10052	NC_012804	AGG	2	6	549129	549134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102641
10053	NC_012804	TTC	2	6	549167	549172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102641
10054	NC_012804	CTC	3	9	549175	549183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102641
10055	NC_012804	CTG	2	6	549247	549252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102641
10056	NC_012804	G	7	7	549310	549316	0 %	0 %	100 %	0 %	240102641
10057	NC_012804	TTC	2	6	549344	549349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102641
10058	NC_012804	CGG	2	6	549384	549389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102641
10059	NC_012804	CGG	2	6	549474	549479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102641
10060	NC_012804	GCC	2	6	549532	549537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102641
10061	NC_012804	GAG	2	6	549680	549685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102642
10062	NC_012804	CGTC	2	8	549922	549929	0 %	25 %	25 %	50 %	240102642
10063	NC_012804	GCG	2	6	549974	549979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102642
10064	NC_012804	GCC	2	6	550043	550048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102642
10065	NC_012804	TGG	2	6	550097	550102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102642
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10068	NC_012804	GAG	2	6	550222	550227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102642
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10074	NC_012804	GA	3	6	550328	550333	50 %	0 %	50 %	0 %	240102642
10075	NC_012804	GAG	2	6	550379	550384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102642
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10083	NC_012804	GGA	2	6	550691	550696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102643
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10085	NC_012804	GCG	2	6	550738	550743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102643
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10088	NC_012804	CT	3	6	550904	550909	0 %	50 %	0 %	50 %	240102643
10089	NC_012804	ACA	2	6	550973	550978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102643
10090	NC_012804	TC	3	6	551125	551130	0 %	50 %	0 %	50 %	240102644
10091	NC_012804	ATC	2	6	551159	551164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102644
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10093	NC_012804	TC	3	6	551311	551316	0 %	50 %	0 %	50 %	240102644
10094	NC_012804	CGG	2	6	551326	551331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102644
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10098	NC_012804	CGC	2	6	551550	551555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102644
10099	NC_012804	ACC	2	6	551573	551578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102644
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10101	NC_012804	C	6	6	551666	551671	0 %	0 %	0 %	100 %	240102644
10102	NC_012804	TAAA	2	8	551696	551703	75 %	25 %	0 %	0 %	240102644
10103	NC_012804	G	6	6	551732	551737	0 %	0 %	100 %	0 %	240102644
10104	NC_012804	CTTCG	2	10	551749	551758	0 %	40 %	20 %	40 %	240102644
10105	NC_012804	GAT	2	6	551825	551830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102645
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10107	NC_012804	AAC	2	6	551901	551906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102645
10108	NC_012804	AAG	2	6	551913	551918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102645
10109	NC_012804	CAG	2	6	551927	551932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102645
10110	NC_012804	TAC	2	6	551949	551954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102645
10111	NC_012804	CCG	2	6	551967	551972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102645
10112	NC_012804	AAG	2	6	552141	552146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102645
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10114	NC_012804	CAA	2	6	552206	552211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102645
10115	NC_012804	TGGA	2	8	552252	552259	25 %	25 %	50 %	0 %	240102645
10116	NC_012804	AAG	2	6	552321	552326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102645
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10118	NC_012804	TCC	2	6	552364	552369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102645
10119	NC_012804	AGGA	2	8	552432	552439	50 %	0 %	50 %	0 %	240102645
10120	NC_012804	CCT	2	6	552488	552493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102645
10121	NC_012804	GAG	2	6	552594	552599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102645
10122	NC_012804	TCG	2	6	552622	552627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102645
10123	NC_012804	GAG	2	6	552669	552674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102645
10124	NC_012804	AGGAG	2	10	552680	552689	40 %	0 %	60 %	0 %	240102645
10125	NC_012804	GAG	2	6	552846	552851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102645
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10128	NC_012804	CTG	2	6	553034	553039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102645
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10224	NC_012804	CGA	2	6	558420	558425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102648
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10226	NC_012804	CTGG	2	8	558527	558534	0 %	25 %	50 %	25 %	240102648
10227	NC_012804	GA	3	6	558567	558572	50 %	0 %	50 %	0 %	240102648
10228	NC_012804	CTG	2	6	558616	558621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102648
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10349	NC_012804	CTGC	2	8	565602	565609	0 %	25 %	25 %	50 %	240102656
10350	NC_012804	GGGCT	2	10	565675	565684	0 %	20 %	60 %	20 %	240102656
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10361	NC_012804	CGT	2	6	565887	565892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102656
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10479	NC_012804	ACG	2	6	571958	571963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102660
10480	NC_012804	AGG	2	6	572009	572014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102660
10481	NC_012804	CGAG	2	8	572039	572046	25 %	0 %	50 %	25 %	240102660
10482	NC_012804	GAT	2	6	572091	572096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102660
10483	NC_012804	GAG	2	6	572119	572124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102660
10484	NC_012804	GAG	2	6	572188	572193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102660
10485	NC_012804	AGC	2	6	572209	572214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102660
10486	NC_012804	TGG	2	6	572386	572391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102660
10487	NC_012804	CCG	2	6	572485	572490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102660
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10491	NC_012804	C	6	6	572591	572596	0 %	0 %	0 %	100 %	240102660
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