MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012804	GGA	2	6	24416	24421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102077
502	NC_012804	AG	3	6	24428	24433	50 %	0 %	50 %	0 %	240102077
503	NC_012804	TTC	2	6	24507	24512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102077
504	NC_012804	TGA	2	6	24553	24558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102077
505	NC_012804	GGA	2	6	24585	24590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102077
506	NC_012804	CGA	2	6	24599	24604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102077
507	NC_012804	CTG	2	6	24606	24611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102077
508	NC_012804	CTC	2	6	24705	24710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102077
509	NC_012804	GCCA	2	8	24836	24843	25 %	0 %	25 %	50 %	240102078
510	NC_012804	GTC	2	6	24859	24864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102078
511	NC_012804	CG	3	6	24878	24883	0 %	0 %	50 %	50 %	240102078
512	NC_012804	TAC	2	6	24897	24902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102078
513	NC_012804	GAA	2	6	24932	24937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102078
514	NC_012804	AAG	2	6	24954	24959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102078
515	NC_012804	GCGA	2	8	24979	24986	25 %	0 %	50 %	25 %	240102078
516	NC_012804	GGA	2	6	25005	25010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102078
517	NC_012804	GTT	2	6	25020	25025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102078
518	NC_012804	TCG	2	6	25072	25077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102078
519	NC_012804	CGA	2	6	25205	25210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102078
520	NC_012804	CTC	2	6	25290	25295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102078
521	NC_012804	CGA	3	9	25349	25357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102078
522	NC_012804	TTC	2	6	25381	25386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102078
523	NC_012804	GAA	2	6	25408	25413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102078
524	NC_012804	AAC	2	6	25512	25517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102078
525	NC_012804	GGA	2	6	25595	25600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102078
526	NC_012804	GA	3	6	25599	25604	50 %	0 %	50 %	0 %	240102078
527	NC_012804	GAA	2	6	25676	25681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102078
528	NC_012804	CGA	2	6	25720	25725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102078
529	NC_012804	GAG	2	6	25914	25919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102079
530	NC_012804	GAG	2	6	25923	25928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102079
531	NC_012804	CGG	2	6	26072	26077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102079
532	NC_012804	GGA	2	6	26146	26151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102080
533	NC_012804	GAA	2	6	26197	26202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102080
534	NC_012804	AGCG	2	8	26212	26219	25 %	0 %	50 %	25 %	240102080
535	NC_012804	TGGGCG	2	12	26231	26242	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	240102080
536	NC_012804	CCT	2	6	26257	26262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102080
537	NC_012804	GAAG	2	8	26297	26304	50 %	0 %	50 %	0 %	240102080
538	NC_012804	GCA	2	6	26327	26332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102080
539	NC_012804	TCG	2	6	26346	26351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102080
540	NC_012804	AG	3	6	26353	26358	50 %	0 %	50 %	0 %	240102080
541	NC_012804	CT	3	6	26454	26459	0 %	50 %	0 %	50 %	240102080
542	NC_012804	ATG	2	6	26490	26495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102080
543	NC_012804	CTC	2	6	26531	26536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102080
544	NC_012804	CTC	2	6	26608	26613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102080
545	NC_012804	CT	3	6	26619	26624	0 %	50 %	0 %	50 %	240102080
546	NC_012804	GCATTC	2	12	26657	26668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	240102080
547	NC_012804	GAA	2	6	26721	26726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102081
548	NC_012804	CGA	2	6	26761	26766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102081
549	NC_012804	CTG	2	6	26787	26792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102081
550	NC_012804	CCG	2	6	26842	26847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102081
551	NC_012804	GAG	2	6	26877	26882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102081
552	NC_012804	TAC	2	6	26901	26906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102081
553	NC_012804	GAG	2	6	26915	26920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102081
554	NC_012804	TCG	2	6	26932	26937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102081
555	NC_012804	GAT	2	6	27003	27008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102081
556	NC_012804	GGGC	2	8	27159	27166	0 %	0 %	75 %	25 %	240102082
557	NC_012804	GTT	2	6	27214	27219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102082
558	NC_012804	GGA	2	6	27279	27284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102082
559	NC_012804	TTC	2	6	27314	27319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102082
560	NC_012804	GAA	2	6	27343	27348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102082
561	NC_012804	GCTCT	2	10	27421	27430	0 %	40 %	20 %	40 %	240102082
562	NC_012804	A	6	6	27466	27471	100 %	0 %	0 %	0 %	240102082
563	NC_012804	TTG	2	6	27479	27484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102082
564	NC_012804	CTC	2	6	27567	27572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102082
565	NC_012804	A	7	7	27611	27617	100 %	0 %	0 %	0 %	240102082
566	NC_012804	GAG	2	6	27834	27839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102083
567	NC_012804	CCTCTT	2	12	27855	27866	0 %	50 %	0 %	50 %	240102083
568	NC_012804	GC	3	6	27880	27885	0 %	0 %	50 %	50 %	240102083
569	NC_012804	TTC	2	6	27925	27930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102083
570	NC_012804	GAG	2	6	27936	27941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102083
571	NC_012804	TGT	2	6	28025	28030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102083
572	NC_012804	GGA	2	6	28037	28042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102083
573	NC_012804	TCC	2	6	28081	28086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102083
574	NC_012804	AGG	2	6	28106	28111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102083
575	NC_012804	CTT	2	6	28141	28146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102083
576	NC_012804	TCG	2	6	28153	28158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102083
577	NC_012804	GAA	2	6	28205	28210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102083
578	NC_012804	CGT	2	6	28293	28298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102083
579	NC_012804	GAG	2	6	28326	28331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102083
580	NC_012804	TCG	2	6	28348	28353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102083
581	NC_012804	GGA	2	6	28553	28558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102084
582	NC_012804	TGGC	2	8	28647	28654	0 %	25 %	50 %	25 %	240102084
583	NC_012804	TAC	2	6	28668	28673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102084
584	NC_012804	AATCT	2	10	28710	28719	40 %	40 %	0 %	20 %	240102084
585	NC_012804	GGA	2	6	28910	28915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102084
586	NC_012804	TAC	2	6	29050	29055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102084
587	NC_012804	TCG	3	9	29098	29106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102084
588	NC_012804	CCT	2	6	29247	29252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102085
589	NC_012804	CTC	2	6	29281	29286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102085
590	NC_012804	CGG	2	6	29390	29395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102085
591	NC_012804	GAT	2	6	29471	29476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102085
592	NC_012804	CTC	2	6	29513	29518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102086
593	NC_012804	CTCA	2	8	29614	29621	25 %	25 %	0 %	50 %	240102086
594	NC_012804	GA	3	6	29726	29731	50 %	0 %	50 %	0 %	240102086
595	NC_012804	TAA	2	6	29742	29747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102086
596	NC_012804	TCC	2	6	29793	29798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102086
597	NC_012804	GA	3	6	29969	29974	50 %	0 %	50 %	0 %	240102086
598	NC_012804	CTC	2	6	30011	30016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102086
599	NC_012804	CTC	2	6	30210	30215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102087
600	NC_012804	CCTC	2	8	30239	30246	0 %	25 %	0 %	75 %	240102087
601	NC_012804	TCC	2	6	30253	30258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102087
602	NC_012804	TTC	2	6	30259	30264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102087
603	NC_012804	AAC	2	6	30274	30279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102087
604	NC_012804	CGA	2	6	30311	30316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102087
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606	NC_012804	CGA	2	6	30446	30451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102087
607	NC_012804	CAC	2	6	30489	30494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102087
608	NC_012804	CTC	2	6	30511	30516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102087
609	NC_012804	CTTGAC	2	12	30618	30629	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	240102087
610	NC_012804	GAG	2	6	30684	30689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102087
611	NC_012804	GGA	2	6	30728	30733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102087
612	NC_012804	CCT	2	6	30746	30751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102087
613	NC_012804	CGT	2	6	30752	30757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102087
614	NC_012804	ATT	2	6	30808	30813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102087
615	NC_012804	CTC	2	6	30822	30827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102087
616	NC_012804	TCCTC	2	10	30851	30860	0 %	40 %	0 %	60 %	240102087
617	NC_012804	CT	3	6	30901	30906	0 %	50 %	0 %	50 %	240102087
618	NC_012804	TCC	3	9	30922	30930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102087
619	NC_012804	TCGCC	2	10	30962	30971	0 %	20 %	20 %	60 %	240102087
620	NC_012804	TCG	2	6	31006	31011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102087
621	NC_012804	GGC	2	6	31092	31097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102087
622	NC_012804	TGG	2	6	31114	31119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102087
623	NC_012804	TTC	2	6	31159	31164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102087
624	NC_012804	TCT	2	6	31223	31228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102087
625	NC_012804	CCGGGG	2	12	31238	31249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102087
626	NC_012804	CCT	2	6	31430	31435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102087
627	NC_012804	CGC	2	6	31499	31504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102087
628	NC_012804	TCCA	2	8	31697	31704	25 %	25 %	0 %	50 %	240102087
629	NC_012804	CCT	2	6	31811	31816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102087
630	NC_012804	GTCG	2	8	31833	31840	0 %	25 %	50 %	25 %	240102087
631	NC_012804	GCT	2	6	31880	31885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102087
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633	NC_012804	GGA	2	6	31937	31942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102087
634	NC_012804	GTC	2	6	31953	31958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102087
635	NC_012804	CGA	2	6	32105	32110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102087
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643	NC_012804	GC	3	6	32487	32492	0 %	0 %	50 %	50 %	240102088
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647	NC_012804	TCC	2	6	32854	32859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102089
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649	NC_012804	AGG	2	6	32956	32961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102089
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651	NC_012804	TCG	2	6	33064	33069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102089
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658	NC_012804	GGA	2	6	33564	33569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102090
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744	NC_012804	CT	3	6	38283	38288	0 %	50 %	0 %	50 %	240102095
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752	NC_012804	CCA	2	6	38523	38528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102096
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756	NC_012804	CGT	2	6	38661	38666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102096
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876	NC_012804	ACC	2	6	44742	44747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102106
877	NC_012804	AGG	2	6	44809	44814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102106
878	NC_012804	TCC	2	6	44852	44857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102106
879	NC_012804	GCGAAG	2	12	44893	44904	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	240102106
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