MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_012804	TCCG	2	8	464738	464745	0 %	25 %	25 %	50 %	240102533
8502	NC_012804	GTC	2	6	464775	464780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102533
8503	NC_012804	GGA	2	6	464816	464821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102533
8504	NC_012804	TC	3	6	464876	464881	0 %	50 %	0 %	50 %	240102533
8505	NC_012804	CA	4	8	464946	464953	50 %	0 %	0 %	50 %	240102533
8506	NC_012804	TTC	2	6	465052	465057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102533
8507	NC_012804	GTG	2	6	465179	465184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102534
8508	NC_012804	CTT	2	6	465200	465205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102534
8509	NC_012804	GGC	2	6	465251	465256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102534
8510	NC_012804	GCA	2	6	465273	465278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102534
8511	NC_012804	CCTT	2	8	465283	465290	0 %	50 %	0 %	50 %	240102534
8512	NC_012804	TGCC	2	8	465595	465602	0 %	25 %	25 %	50 %	240102535
8513	NC_012804	CT	3	6	465614	465619	0 %	50 %	0 %	50 %	240102535
8514	NC_012804	CAT	2	6	465644	465649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102535
8515	NC_012804	ATC	2	6	465663	465668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102535
8516	NC_012804	AGG	2	6	465669	465674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102535
8517	NC_012804	GCC	2	6	465684	465689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102535
8518	NC_012804	GTTC	2	8	465807	465814	0 %	50 %	25 %	25 %	240102536
8519	NC_012804	TCC	2	6	465850	465855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102536
8520	NC_012804	GAG	2	6	465976	465981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102536
8521	NC_012804	GAGCTC	2	12	465994	466005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	240102536
8522	NC_012804	CAT	2	6	466008	466013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102536
8523	NC_012804	AAG	2	6	466015	466020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102536
8524	NC_012804	GAC	2	6	466075	466080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102536
8525	NC_012804	AGG	2	6	466084	466089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102536
8526	NC_012804	ATC	2	6	466165	466170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102536
8527	NC_012804	AGA	2	6	466180	466185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102536
8528	NC_012804	AGGG	2	8	466204	466211	25 %	0 %	75 %	0 %	240102536
8529	NC_012804	AGG	2	6	466226	466231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102536
8530	NC_012804	CGC	2	6	466335	466340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102536
8531	NC_012804	GAG	2	6	466360	466365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102536
8532	NC_012804	TCC	2	6	466713	466718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102537
8533	NC_012804	ATG	2	6	466721	466726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102537
8534	NC_012804	TCC	2	6	466769	466774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102537
8535	NC_012804	CTT	2	6	466803	466808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102537
8536	NC_012804	CTA	2	6	466863	466868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102537
8537	NC_012804	ACT	2	6	466871	466876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102537
8538	NC_012804	CAG	2	6	466878	466883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102537
8539	NC_012804	GAG	2	6	466966	466971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102537
8540	NC_012804	GGA	2	6	466999	467004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102537
8541	NC_012804	CTA	2	6	467008	467013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102537
8542	NC_012804	C	6	6	467063	467068	0 %	0 %	0 %	100 %	240102537
8543	NC_012804	GGT	2	6	467093	467098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102537
8544	NC_012804	CA	3	6	467223	467228	50 %	0 %	0 %	50 %	240102537
8545	NC_012804	AGG	2	6	467295	467300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102537
8546	NC_012804	GAG	2	6	467327	467332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102537
8547	NC_012804	CTCAG	2	10	467333	467342	20 %	20 %	20 %	40 %	240102537
8548	NC_012804	TGT	2	6	467377	467382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102537
8549	NC_012804	TCA	2	6	467421	467426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102537
8550	NC_012804	ATA	2	6	467432	467437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102537
8551	NC_012804	CTG	2	6	467484	467489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102537
8552	NC_012804	C	6	6	467538	467543	0 %	0 %	0 %	100 %	240102537
8553	NC_012804	TGC	2	6	467581	467586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102537
8554	NC_012804	TGG	2	6	467619	467624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102537
8555	NC_012804	AGAACG	2	12	467625	467636	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	240102537
8556	NC_012804	CATC	2	8	467641	467648	25 %	25 %	0 %	50 %	240102537
8557	NC_012804	CTC	2	6	467690	467695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102537
8558	NC_012804	GCC	2	6	467872	467877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102537
8559	NC_012804	GGT	2	6	467903	467908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102537
8560	NC_012804	CCT	2	6	468067	468072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102537
8561	NC_012804	GAG	2	6	468092	468097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102537
8562	NC_012804	TTC	2	6	468182	468187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102537
8563	NC_012804	CTA	2	6	468196	468201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102537
8564	NC_012804	GGA	2	6	468264	468269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102537
8565	NC_012804	ATA	2	6	468317	468322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102537
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8570	NC_012804	TCC	2	6	468507	468512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102537
8571	NC_012804	TC	3	6	468680	468685	0 %	50 %	0 %	50 %	240102538
8572	NC_012804	AAC	2	6	468707	468712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102538
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8574	NC_012804	A	7	7	468798	468804	100 %	0 %	0 %	0 %	240102538
8575	NC_012804	TACA	2	8	468866	468873	50 %	25 %	0 %	25 %	240102538
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8580	NC_012804	GAGG	2	8	469018	469025	25 %	0 %	75 %	0 %	240102538
8581	NC_012804	TGA	2	6	469044	469049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102538
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8583	NC_012804	CTT	2	6	469168	469173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102538
8584	NC_012804	TC	3	6	469198	469203	0 %	50 %	0 %	50 %	240102538
8585	NC_012804	GGT	2	6	469213	469218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102538
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8587	NC_012804	CAC	2	6	469342	469347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102538
8588	NC_012804	ATA	2	6	469523	469528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102538
8589	NC_012804	AGG	2	6	469711	469716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102539
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8591	NC_012804	TTC	2	6	469724	469729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102539
8592	NC_012804	CAAC	2	8	469736	469743	50 %	0 %	0 %	50 %	240102539
8593	NC_012804	GAG	2	6	469744	469749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102539
8594	NC_012804	CTA	2	6	469755	469760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102539
8595	NC_012804	TGC	2	6	469773	469778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102539
8596	NC_012804	CTTCG	2	10	469818	469827	0 %	40 %	20 %	40 %	240102539
8597	NC_012804	GCCC	2	8	469851	469858	0 %	0 %	25 %	75 %	240102539
8598	NC_012804	AAC	2	6	469860	469865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102539
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8602	NC_012804	A	6	6	470143	470148	100 %	0 %	0 %	0 %	240102539
8603	NC_012804	AGCC	2	8	470159	470166	25 %	0 %	25 %	50 %	240102539
8604	NC_012804	AGG	3	9	470175	470183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102539
8605	NC_012804	CGA	2	6	470268	470273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102539
8606	NC_012804	GA	3	6	470296	470301	50 %	0 %	50 %	0 %	240102539
8607	NC_012804	TGGG	2	8	470306	470313	0 %	25 %	75 %	0 %	240102539
8608	NC_012804	TA	3	6	470322	470327	50 %	50 %	0 %	0 %	240102539
8609	NC_012804	TGA	2	6	470633	470638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102540
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8616	NC_012804	AG	3	6	470885	470890	50 %	0 %	50 %	0 %	240102540
8617	NC_012804	GGT	2	6	470952	470957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102540
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8991	NC_012804	TCG	2	6	491566	491571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102569
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