MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_012804	TTC	2	6	408688	408693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102471
7502	NC_012804	TTC	2	6	408791	408796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102471
7503	NC_012804	GTT	2	6	409030	409035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102472
7504	NC_012804	TC	3	6	409047	409052	0 %	50 %	0 %	50 %	240102472
7505	NC_012804	GA	3	6	409121	409126	50 %	0 %	50 %	0 %	240102472
7506	NC_012804	TC	3	6	409379	409384	0 %	50 %	0 %	50 %	240102472
7507	NC_012804	CA	3	6	409417	409422	50 %	0 %	0 %	50 %	240102472
7508	NC_012804	TAG	2	6	409430	409435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102472
7509	NC_012804	AGT	2	6	409497	409502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102472
7510	NC_012804	TC	3	6	409512	409517	0 %	50 %	0 %	50 %	240102472
7511	NC_012804	CTT	2	6	409518	409523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102472
7512	NC_012804	GAG	2	6	409715	409720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102472
7513	NC_012804	AG	3	6	409728	409733	50 %	0 %	50 %	0 %	240102472
7514	NC_012804	AGT	2	6	409774	409779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102472
7515	NC_012804	CTT	2	6	409843	409848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102472
7516	NC_012804	CCTTAC	2	12	409862	409873	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	240102472
7517	NC_012804	CCAA	2	8	410018	410025	50 %	0 %	0 %	50 %	240102472
7518	NC_012804	GGT	2	6	410032	410037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102472
7519	NC_012804	GTG	2	6	410057	410062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102472
7520	NC_012804	TGG	2	6	410071	410076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102472
7521	NC_012804	TCG	2	6	410193	410198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102473
7522	NC_012804	TGA	2	6	410290	410295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102473
7523	NC_012804	GAA	2	6	410305	410310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102473
7524	NC_012804	GGA	2	6	410326	410331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102473
7525	NC_012804	GA	4	8	410387	410394	50 %	0 %	50 %	0 %	240102473
7526	NC_012804	TCAC	2	8	410400	410407	25 %	25 %	0 %	50 %	240102474
7527	NC_012804	CCT	2	6	410553	410558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102474
7528	NC_012804	TTC	2	6	410622	410627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102474
7529	NC_012804	TCC	2	6	410674	410679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102474
7530	NC_012804	GAG	2	6	410682	410687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102474
7531	NC_012804	TTC	2	6	410708	410713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102474
7532	NC_012804	CCA	2	6	410829	410834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102475
7533	NC_012804	TGACGG	2	12	410874	410885	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	240102475
7534	NC_012804	AG	3	6	410907	410912	50 %	0 %	50 %	0 %	240102475
7535	NC_012804	GAA	2	6	410944	410949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102475
7536	NC_012804	T	6	6	411054	411059	0 %	100 %	0 %	0 %	240102475
7537	NC_012804	A	7	7	411077	411083	100 %	0 %	0 %	0 %	240102475
7538	NC_012804	GAA	2	6	411091	411096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102475
7539	NC_012804	CCGTT	2	10	411134	411143	0 %	40 %	20 %	40 %	240102475
7540	NC_012804	CTC	2	6	411215	411220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102475
7541	NC_012804	ACT	2	6	411342	411347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102475
7542	NC_012804	CGCCTT	2	12	411429	411440	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	240102475
7543	NC_012804	TGGA	2	8	411592	411599	25 %	25 %	50 %	0 %	240102475
7544	NC_012804	TCCT	2	8	411636	411643	0 %	50 %	0 %	50 %	240102475
7545	NC_012804	GGA	2	6	411650	411655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102475
7546	NC_012804	ACT	2	6	411716	411721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102475
7547	NC_012804	ACT	2	6	411734	411739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102475
7548	NC_012804	AGG	2	6	411790	411795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102475
7549	NC_012804	GGAA	2	8	411829	411836	50 %	0 %	50 %	0 %	240102475
7550	NC_012804	TCT	2	6	411971	411976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102475
7551	NC_012804	ACT	2	6	411983	411988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102475
7552	NC_012804	CT	3	6	412011	412016	0 %	50 %	0 %	50 %	240102475
7553	NC_012804	TAC	2	6	412075	412080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102475
7554	NC_012804	CTC	2	6	412087	412092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102475
7555	NC_012804	TGA	2	6	412184	412189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102475
7556	NC_012804	CTC	2	6	412243	412248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102475
7557	NC_012804	ACC	2	6	412265	412270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102475
7558	NC_012804	CGT	2	6	412371	412376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102475
7559	NC_012804	CAT	2	6	412431	412436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102475
7560	NC_012804	CCT	3	9	412580	412588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102476
7561	NC_012804	CCT	2	6	412626	412631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102476
7562	NC_012804	GAT	2	6	412686	412691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102476
7563	NC_012804	ACG	2	6	412699	412704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102476
7564	NC_012804	CCGGG	2	10	412802	412811	0 %	0 %	60 %	40 %	240102476
7565	NC_012804	CTC	2	6	412942	412947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102476
7566	NC_012804	CCA	2	6	412973	412978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102476
7567	NC_012804	TCG	2	6	413032	413037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102476
7568	NC_012804	GAA	3	9	413067	413075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102476
7569	NC_012804	CCGA	2	8	413077	413084	25 %	0 %	25 %	50 %	240102476
7570	NC_012804	CTATCA	2	12	413180	413191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102476
7571	NC_012804	TCC	2	6	413200	413205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102476
7572	NC_012804	TAT	2	6	413271	413276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102476
7573	NC_012804	ACA	2	6	413308	413313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102476
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7576	NC_012804	CGT	2	6	413525	413530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102476
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7582	NC_012804	TC	3	6	413787	413792	0 %	50 %	0 %	50 %	240102476
7583	NC_012804	CTC	2	6	413811	413816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102476
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7589	NC_012804	GTCCTT	2	12	414098	414109	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	240102477
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7592	NC_012804	GTTCGG	2	12	414206	414217	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	240102477
7593	NC_012804	AACGCG	2	12	414236	414247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102477
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7602	NC_012804	AGGC	2	8	414606	414613	25 %	0 %	50 %	25 %	240102478
7603	NC_012804	CCT	2	6	414622	414627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102478
7604	NC_012804	CTT	2	6	414638	414643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102478
7605	NC_012804	CCT	2	6	414646	414651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102478
7606	NC_012804	GAC	2	6	414656	414661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102478
7607	NC_012804	GAC	2	6	414701	414706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102478
7608	NC_012804	CTT	2	6	414707	414712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102478
7609	NC_012804	GTGGA	2	10	414728	414737	20 %	20 %	60 %	0 %	240102478
7610	NC_012804	TC	3	6	414761	414766	0 %	50 %	0 %	50 %	240102478
7611	NC_012804	AGCG	2	8	414908	414915	25 %	0 %	50 %	25 %	240102478
7612	NC_012804	CCA	2	6	414938	414943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102478
7613	NC_012804	CA	3	6	415139	415144	50 %	0 %	0 %	50 %	240102479
7614	NC_012804	TCCA	2	8	415150	415157	25 %	25 %	0 %	50 %	240102479
7615	NC_012804	CGA	2	6	415198	415203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102479
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7617	NC_012804	GTG	2	6	415292	415297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102479
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7619	NC_012804	GCCA	2	8	415425	415432	25 %	0 %	25 %	50 %	240102479
7620	NC_012804	GAGC	2	8	415538	415545	25 %	0 %	50 %	25 %	240102479
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7622	NC_012804	CGT	2	6	415624	415629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102479
7623	NC_012804	TCT	2	6	415795	415800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102479
7624	NC_012804	TCG	2	6	415809	415814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102479
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7638	NC_012804	TCC	2	6	416533	416538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102479
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7644	NC_012804	TCC	2	6	416700	416705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102479
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7651	NC_012804	TCG	2	6	417159	417164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102479
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7653	NC_012804	GTA	2	6	417329	417334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102479
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7984	NC_012804	CCT	2	6	435696	435701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102499
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7986	NC_012804	CGA	2	6	435789	435794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102499
7987	NC_012804	AGCG	2	8	435810	435817	25 %	0 %	50 %	25 %	240102499
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