MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_012804	CCT	2	6	381255	381260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102453
7002	NC_012804	GA	3	6	381282	381287	50 %	0 %	50 %	0 %	240102453
7003	NC_012804	TTA	2	6	381392	381397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102453
7004	NC_012804	GGTC	2	8	381468	381475	0 %	25 %	50 %	25 %	240102453
7005	NC_012804	AAG	2	6	381482	381487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102453
7006	NC_012804	ATC	2	6	381506	381511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102453
7007	NC_012804	TG	3	6	381537	381542	0 %	50 %	50 %	0 %	240102453
7008	NC_012804	CCT	2	6	381543	381548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102453
7009	NC_012804	GAG	2	6	381550	381555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102453
7010	NC_012804	GTTG	2	8	381568	381575	0 %	50 %	50 %	0 %	240102453
7011	NC_012804	TGT	2	6	381576	381581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102453
7012	NC_012804	TC	3	6	381601	381606	0 %	50 %	0 %	50 %	240102453
7013	NC_012804	CGG	2	6	381708	381713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102453
7014	NC_012804	TCT	2	6	381740	381745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102453
7015	NC_012804	TGG	2	6	381750	381755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102453
7016	NC_012804	CTC	2	6	381793	381798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102453
7017	NC_012804	GTA	2	6	381811	381816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102453
7018	NC_012804	ACA	2	6	381854	381859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102453
7019	NC_012804	A	7	7	381932	381938	100 %	0 %	0 %	0 %	240102453
7020	NC_012804	GAA	2	6	382483	382488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102454
7021	NC_012804	GAA	2	6	382657	382662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102454
7022	NC_012804	AGA	2	6	382677	382682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102454
7023	NC_012804	AAG	2	6	382751	382756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102454
7024	NC_012804	TTC	2	6	382784	382789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102454
7025	NC_012804	TCG	2	6	382836	382841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102454
7026	NC_012804	AGG	2	6	382915	382920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102454
7027	NC_012804	GCG	2	6	382965	382970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102454
7028	NC_012804	CTA	2	6	382981	382986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102454
7029	NC_012804	CGG	2	6	383041	383046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102454
7030	NC_012804	GAG	2	6	383051	383056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102454
7031	NC_012804	TTA	2	6	383079	383084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102454
7032	NC_012804	AGCAG	2	10	383110	383119	40 %	0 %	40 %	20 %	240102454
7033	NC_012804	AAG	2	6	383141	383146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102454
7034	NC_012804	CCG	2	6	383150	383155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102454
7035	NC_012804	GGTTC	2	10	383235	383244	0 %	40 %	40 %	20 %	240102454
7036	NC_012804	GCTC	2	8	383271	383278	0 %	25 %	25 %	50 %	240102454
7037	NC_012804	CGA	3	9	383298	383306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102454
7038	NC_012804	CTG	2	6	383351	383356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102454
7039	NC_012804	AGA	2	6	383409	383414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102454
7040	NC_012804	GCC	2	6	383438	383443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102454
7041	NC_012804	GTG	2	6	383447	383452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102454
7042	NC_012804	TTC	2	6	383471	383476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102454
7043	NC_012804	TCC	2	6	383505	383510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102454
7044	NC_012804	CAA	2	6	383541	383546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102454
7045	NC_012804	AGCG	2	8	383554	383561	25 %	0 %	50 %	25 %	240102454
7046	NC_012804	GAG	2	6	383618	383623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102454
7047	NC_012804	CTA	2	6	383683	383688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102454
7048	NC_012804	TGA	2	6	383781	383786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102455
7049	NC_012804	GGA	2	6	383791	383796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102455
7050	NC_012804	CCG	2	6	383855	383860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102455
7051	NC_012804	CTC	2	6	383888	383893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102455
7052	NC_012804	GAG	2	6	383906	383911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102455
7053	NC_012804	CTTCA	2	10	384038	384047	20 %	40 %	0 %	40 %	240102455
7054	NC_012804	ACG	2	6	384057	384062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102455
7055	NC_012804	CCG	2	6	384068	384073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102455
7056	NC_012804	ACG	2	6	384140	384145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102455
7057	NC_012804	G	6	6	384154	384159	0 %	0 %	100 %	0 %	240102455
7058	NC_012804	CGC	2	6	384175	384180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102455
7059	NC_012804	GCG	2	6	384252	384257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102455
7060	NC_012804	GGA	2	6	384280	384285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102455
7061	NC_012804	GATAGG	2	12	384340	384351	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	240102455
7062	NC_012804	CGT	2	6	384373	384378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102455
7063	NC_012804	TCG	2	6	384453	384458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102455
7064	NC_012804	AG	3	6	384565	384570	50 %	0 %	50 %	0 %	240102455
7065	NC_012804	ACA	2	6	384585	384590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102455
7066	NC_012804	AGG	2	6	384623	384628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102455
7067	NC_012804	GAG	2	6	384638	384643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102455
7068	NC_012804	GGA	2	6	384661	384666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102455
7069	NC_012804	TAC	2	6	384857	384862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102455
7070	NC_012804	CGGGC	2	10	384892	384901	0 %	0 %	60 %	40 %	240102455
7071	NC_012804	CGA	2	6	384925	384930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102455
7072	NC_012804	ACG	2	6	384935	384940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102455
7073	NC_012804	CTC	2	6	384980	384985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102455
7074	NC_012804	GGA	2	6	385025	385030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102456
7075	NC_012804	AGG	2	6	385048	385053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102456
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7078	NC_012804	CGA	2	6	385205	385210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102456
7079	NC_012804	ACGG	2	8	385245	385252	25 %	0 %	50 %	25 %	240102456
7080	NC_012804	TCA	2	6	385363	385368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102456
7081	NC_012804	CGG	2	6	385424	385429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102456
7082	NC_012804	GAG	2	6	385473	385478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102456
7083	NC_012804	ACG	2	6	385513	385518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102456
7084	NC_012804	CGT	2	6	385535	385540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102456
7085	NC_012804	TCG	2	6	385573	385578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102456
7086	NC_012804	GTC	2	6	385602	385607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102456
7087	NC_012804	CGGGGC	2	12	385613	385624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102456
7088	NC_012804	CCA	2	6	385652	385657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102456
7089	NC_012804	TCG	2	6	385678	385683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102456
7090	NC_012804	AAT	2	6	385697	385702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102456
7091	NC_012804	GAAG	2	8	385711	385718	50 %	0 %	50 %	0 %	240102456
7092	NC_012804	AGG	3	9	385738	385746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102456
7093	NC_012804	CGA	2	6	385919	385924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102456
7094	NC_012804	AGG	2	6	385930	385935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102456
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7100	NC_012804	GAG	2	6	386103	386108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102456
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7102	NC_012804	GAA	2	6	386210	386215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102456
7103	NC_012804	GGA	2	6	386234	386239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102456
7104	NC_012804	AGG	2	6	386256	386261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102456
7105	NC_012804	GAG	2	6	386268	386273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102456
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7108	NC_012804	GAA	2	6	386480	386485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102457
7109	NC_012804	GAGC	2	8	386510	386517	25 %	0 %	50 %	25 %	240102457
7110	NC_012804	T	6	6	386522	386527	0 %	100 %	0 %	0 %	240102457
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7114	NC_012804	CT	3	6	386687	386692	0 %	50 %	0 %	50 %	240102457
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7118	NC_012804	CTTT	2	8	386943	386950	0 %	75 %	0 %	25 %	240102458
7119	NC_012804	CGC	2	6	386977	386982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102458
7120	NC_012804	ACG	2	6	387083	387088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102458
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7122	NC_012804	CTC	2	6	387121	387126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102458
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7244	NC_012804	CCT	2	6	394392	394397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102463
7245	NC_012804	GTA	2	6	394420	394425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102463
7246	NC_012804	G	7	7	394457	394463	0 %	0 %	100 %	0 %	240102463
7247	NC_012804	CACC	2	8	394603	394610	25 %	0 %	0 %	75 %	240102463
7248	NC_012804	GGT	2	6	394734	394739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102463
7249	NC_012804	GCG	2	6	394763	394768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102463
7250	NC_012804	T	6	6	394770	394775	0 %	100 %	0 %	0 %	240102463
7251	NC_012804	TTG	2	6	394781	394786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102463
7252	NC_012804	CTT	2	6	394804	394809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102463
7253	NC_012804	CT	3	6	394815	394820	0 %	50 %	0 %	50 %	240102463
7254	NC_012804	GTG	2	6	394913	394918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102464
7255	NC_012804	CTG	2	6	394982	394987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102464
7256	NC_012804	GCG	2	6	394997	395002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102464
7257	NC_012804	GGTTGA	2	12	395191	395202	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	240102464
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7267	NC_012804	AGGTG	2	10	395766	395775	20 %	20 %	60 %	0 %	240102465
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7269	NC_012804	TAG	2	6	395885	395890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102465
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7272	NC_012804	CTT	2	6	396079	396084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102465
7273	NC_012804	AGG	2	6	396160	396165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102465
7274	NC_012804	CCT	2	6	396177	396182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102465
7275	NC_012804	TTC	2	6	396202	396207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102465
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7277	NC_012804	CGATA	2	10	396356	396365	40 %	20 %	20 %	20 %	240102465
7278	NC_012804	GGC	2	6	396413	396418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102465
7279	NC_012804	TCC	2	6	396497	396502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102465
7280	NC_012804	AAGG	2	8	396622	396629	50 %	0 %	50 %	0 %	240102465
7281	NC_012804	CGGAT	2	10	396641	396650	20 %	20 %	40 %	20 %	240102465
7282	NC_012804	CTT	2	6	396657	396662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102465
7283	NC_012804	GAG	2	6	396682	396687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102465
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7285	NC_012804	G	6	6	396700	396705	0 %	0 %	100 %	0 %	240102465
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7297	NC_012804	CCTGAG	2	12	397097	397108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	240102466
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7318	NC_012804	TGC	2	6	397936	397941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102466
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7349	NC_012804	TACC	2	8	400239	400246	25 %	25 %	0 %	50 %	240102467
7350	NC_012804	CCG	2	6	400399	400404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102467
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7352	NC_012804	ATC	2	6	400590	400595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102467
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7358	NC_012804	ACGTCA	2	12	400861	400872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	240102467
7359	NC_012804	CCGA	2	8	400932	400939	25 %	0 %	25 %	50 %	240102467
7360	NC_012804	CGT	2	6	400955	400960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102467
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7366	NC_012804	CTACAC	2	12	401492	401503	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	240102467
7367	NC_012804	GCA	2	6	401675	401680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102467
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7369	NC_012804	ACC	2	6	401745	401750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102467
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7481	NC_012804	AGCC	2	8	407554	407561	25 %	0 %	25 %	50 %	240102469
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7486	NC_012804	GAG	2	6	407871	407876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102470
7487	NC_012804	TCC	2	6	407983	407988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102470
7488	NC_012804	CT	3	6	408030	408035	0 %	50 %	0 %	50 %	240102470
7489	NC_012804	GTA	2	6	408057	408062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102470
7490	NC_012804	TCA	2	6	408068	408073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102470
7491	NC_012804	TCG	2	6	408139	408144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102470
7492	NC_012804	GCG	2	6	408179	408184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102470
7493	NC_012804	AAG	2	6	408279	408284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102470
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7495	NC_012804	CCT	2	6	408362	408367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102470
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7499	NC_012804	TTCCT	2	10	408599	408608	0 %	60 %	0 %	40 %	240102471
7500	NC_012804	CTT	2	6	408623	408628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102471

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