MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012804	TCC	2	6	352342	352347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102427
6502	NC_012804	GAG	2	6	352486	352491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102427
6503	NC_012804	T	6	6	352514	352519	0 %	100 %	0 %	0 %	240102427
6504	NC_012804	GAA	2	6	352560	352565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102427
6505	NC_012804	GGA	2	6	352586	352591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102427
6506	NC_012804	C	6	6	352595	352600	0 %	0 %	0 %	100 %	240102427
6507	NC_012804	TGT	2	6	352691	352696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102427
6508	NC_012804	TCG	2	6	352707	352712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102428
6509	NC_012804	AGG	2	6	352807	352812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102428
6510	NC_012804	TCC	2	6	352851	352856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102428
6511	NC_012804	TGA	2	6	352891	352896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102428
6512	NC_012804	ACG	2	6	352908	352913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102428
6513	NC_012804	GAG	2	6	352925	352930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102428
6514	NC_012804	CGA	2	6	353032	353037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102428
6515	NC_012804	CGGG	2	8	353062	353069	0 %	0 %	75 %	25 %	240102428
6516	NC_012804	TCG	2	6	353199	353204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102428
6517	NC_012804	TCG	3	9	353265	353273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102428
6518	NC_012804	CCT	2	6	353287	353292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102428
6519	NC_012804	CCA	2	6	353509	353514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102428
6520	NC_012804	GAC	2	6	353588	353593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102428
6521	NC_012804	TTC	2	6	353615	353620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102428
6522	NC_012804	CAA	2	6	353629	353634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102428
6523	NC_012804	TCT	3	9	353710	353718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102428
6524	NC_012804	CTC	3	9	353962	353970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102429
6525	NC_012804	A	6	6	353996	354001	100 %	0 %	0 %	0 %	240102429
6526	NC_012804	TCC	2	6	354068	354073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102429
6527	NC_012804	GGGC	2	8	354077	354084	0 %	0 %	75 %	25 %	240102429
6528	NC_012804	GA	3	6	354127	354132	50 %	0 %	50 %	0 %	240102429
6529	NC_012804	GTA	3	9	354169	354177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102429
6530	NC_012804	GAG	2	6	354187	354192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102429
6531	NC_012804	GA	3	6	354265	354270	50 %	0 %	50 %	0 %	240102429
6532	NC_012804	CGG	2	6	354417	354422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102429
6533	NC_012804	TGA	2	6	354560	354565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102429
6534	NC_012804	TCC	2	6	354575	354580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102429
6535	NC_012804	GAAG	2	8	354654	354661	50 %	0 %	50 %	0 %	240102430
6536	NC_012804	GTC	2	6	354673	354678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102430
6537	NC_012804	GAAG	2	8	354855	354862	50 %	0 %	50 %	0 %	240102430
6538	NC_012804	GAG	2	6	354883	354888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102430
6539	NC_012804	AGG	2	6	354908	354913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102430
6540	NC_012804	CGT	2	6	354939	354944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102430
6541	NC_012804	ACA	2	6	354983	354988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102430
6542	NC_012804	GATGAC	2	12	355002	355013	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	240102430
6543	NC_012804	CCCT	2	8	355116	355123	0 %	25 %	0 %	75 %	240102430
6544	NC_012804	AAG	2	6	355153	355158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102430
6545	NC_012804	GAC	2	6	355392	355397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102431
6546	NC_012804	AGG	2	6	355444	355449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102431
6547	NC_012804	ATT	2	6	355644	355649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102432
6548	NC_012804	TCT	2	6	355650	355655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102432
6549	NC_012804	AGG	2	6	355665	355670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102432
6550	NC_012804	GTT	2	6	355796	355801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102432
6551	NC_012804	CAG	2	6	355905	355910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102432
6552	NC_012804	GGA	2	6	355918	355923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102432
6553	NC_012804	AT	3	6	355941	355946	50 %	50 %	0 %	0 %	240102432
6554	NC_012804	CTC	2	6	355957	355962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102432
6555	NC_012804	AGCT	2	8	356076	356083	25 %	25 %	25 %	25 %	240102432
6556	NC_012804	TTC	2	6	356098	356103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102432
6557	NC_012804	T	6	6	356152	356157	0 %	100 %	0 %	0 %	240102432
6558	NC_012804	TTC	2	6	356197	356202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102432
6559	NC_012804	TC	3	6	356259	356264	0 %	50 %	0 %	50 %	240102432
6560	NC_012804	CCT	2	6	356336	356341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102432
6561	NC_012804	AAT	2	6	356394	356399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102432
6562	NC_012804	CAT	2	6	356431	356436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102432
6563	NC_012804	ACT	2	6	356486	356491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102432
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6565	NC_012804	ATCC	2	8	356549	356556	25 %	25 %	0 %	50 %	240102432
6566	NC_012804	ACG	2	6	356798	356803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102432
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6569	NC_012804	GTG	2	6	357029	357034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102432
6570	NC_012804	AT	3	6	357120	357125	50 %	50 %	0 %	0 %	240102432
6571	NC_012804	ATT	2	6	357158	357163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102432
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6574	NC_012804	CA	3	6	357413	357418	50 %	0 %	0 %	50 %	240102432
6575	NC_012804	TTAT	2	8	357437	357444	25 %	75 %	0 %	0 %	240102432
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6579	NC_012804	CAAA	2	8	357584	357591	75 %	0 %	0 %	25 %	240102432
6580	NC_012804	ATT	2	6	357653	357658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102432
6581	NC_012804	T	6	6	357676	357681	0 %	100 %	0 %	0 %	240102432
6582	NC_012804	TAC	2	6	357685	357690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102432
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6586	NC_012804	TGT	2	6	357764	357769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102432
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6590	NC_012804	TGT	2	6	358015	358020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102432
6591	NC_012804	CTTT	2	8	358062	358069	0 %	75 %	0 %	25 %	240102432
6592	NC_012804	CATT	3	12	358085	358096	25 %	50 %	0 %	25 %	240102432
6593	NC_012804	TTTC	2	8	358126	358133	0 %	75 %	0 %	25 %	240102432
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6600	NC_012804	TC	3	6	358427	358432	0 %	50 %	0 %	50 %	240102432
6601	NC_012804	TCC	2	6	358471	358476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102432
6602	NC_012804	GGA	2	6	358491	358496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102432
6603	NC_012804	T	6	6	358531	358536	0 %	100 %	0 %	0 %	240102432
6604	NC_012804	CCT	2	6	358557	358562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102432
6605	NC_012804	ATT	2	6	358743	358748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102433
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6611	NC_012804	TGGG	2	8	358968	358975	0 %	25 %	75 %	0 %	240102433
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6613	NC_012804	AATGA	2	10	359423	359432	60 %	20 %	20 %	0 %	240102434
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6616	NC_012804	A	6	6	359568	359573	100 %	0 %	0 %	0 %	240102434
6617	NC_012804	A	6	6	359643	359648	100 %	0 %	0 %	0 %	240102434
6618	NC_012804	A	7	7	359703	359709	100 %	0 %	0 %	0 %	240102434
6619	NC_012804	ATA	2	6	359718	359723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102434
6620	NC_012804	A	6	6	359723	359728	100 %	0 %	0 %	0 %	240102434
6621	NC_012804	AAG	2	6	359748	359753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102434
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6623	NC_012804	ACA	2	6	359828	359833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102434
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6988	NC_012804	CGA	2	6	380691	380696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102453
6989	NC_012804	TCC	2	6	380741	380746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102453
6990	NC_012804	CGA	2	6	380784	380789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102453
6991	NC_012804	CGA	2	6	380817	380822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102453
6992	NC_012804	ACG	2	6	380834	380839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102453
6993	NC_012804	CTC	2	6	380953	380958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102453
6994	NC_012804	TGT	2	6	380970	380975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102453
6995	NC_012804	GGC	2	6	380998	381003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102453
6996	NC_012804	TC	3	6	381018	381023	0 %	50 %	0 %	50 %	240102453
6997	NC_012804	TCCT	2	8	381083	381090	0 %	50 %	0 %	50 %	240102453
6998	NC_012804	GTA	2	6	381148	381153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102453
6999	NC_012804	TTG	2	6	381176	381181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102453
7000	NC_012804	CGT	2	6	381198	381203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102453

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