MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus gammatolerans EJ3 chromosome

Total Repeats: 37251

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012804	CCGAGC	2	12	238480	238491	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	240102307
4502	NC_012804	CAA	2	6	238505	238510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102307
4503	NC_012804	CGG	2	6	238547	238552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102307
4504	NC_012804	CTC	2	6	238573	238578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102307
4505	NC_012804	TCT	2	6	238601	238606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102307
4506	NC_012804	TGC	2	6	238614	238619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102307
4507	NC_012804	GGA	2	6	238625	238630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102307
4508	NC_012804	CTT	2	6	238692	238697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102307
4509	NC_012804	GCT	2	6	238700	238705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102307
4510	NC_012804	GCC	2	6	238746	238751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102307
4511	NC_012804	CAT	2	6	238761	238766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102307
4512	NC_012804	AGCTC	2	10	238852	238861	20 %	20 %	20 %	40 %	240102307
4513	NC_012804	TCG	2	6	238870	238875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102307
4514	NC_012804	TTG	2	6	238900	238905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102307
4515	NC_012804	CGC	2	6	238923	238928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102307
4516	NC_012804	CCTT	2	8	238972	238979	0 %	50 %	0 %	50 %	240102307
4517	NC_012804	TCG	2	6	239084	239089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102307
4518	NC_012804	CCTT	2	8	239105	239112	0 %	50 %	0 %	50 %	240102307
4519	NC_012804	TCT	2	6	239138	239143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102307
4520	NC_012804	CTC	2	6	239184	239189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102307
4521	NC_012804	CTC	2	6	239232	239237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102307
4522	NC_012804	AAC	2	6	239346	239351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102307
4523	NC_012804	GAA	2	6	239397	239402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102307
4524	NC_012804	CAG	2	6	239417	239422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102307
4525	NC_012804	GGT	2	6	239555	239560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102307
4526	NC_012804	TCT	2	6	239615	239620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102307
4527	NC_012804	CT	3	6	239737	239742	0 %	50 %	0 %	50 %	240102307
4528	NC_012804	CTT	2	6	239760	239765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102307
4529	NC_012804	TGA	2	6	239783	239788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102307
4530	NC_012804	GGTGG	2	10	239835	239844	0 %	20 %	80 %	0 %	240102307
4531	NC_012804	ACA	2	6	239926	239931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102307
4532	NC_012804	TGAC	2	8	239969	239976	25 %	25 %	25 %	25 %	240102307
4533	NC_012804	GA	3	6	240084	240089	50 %	0 %	50 %	0 %	240102308
4534	NC_012804	GGT	2	6	240094	240099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102308
4535	NC_012804	GAC	2	6	240104	240109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102308
4536	NC_012804	CTT	2	6	240119	240124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102308
4537	NC_012804	GATA	2	8	240289	240296	50 %	25 %	25 %	0 %	240102308
4538	NC_012804	GAA	2	6	240338	240343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102308
4539	NC_012804	CT	3	6	240383	240388	0 %	50 %	0 %	50 %	240102308
4540	NC_012804	GTC	2	6	240503	240508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102308
4541	NC_012804	CGT	2	6	240575	240580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102308
4542	NC_012804	CTT	2	6	240593	240598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102308
4543	NC_012804	AATT	2	8	240789	240796	50 %	50 %	0 %	0 %	240102309
4544	NC_012804	CTC	2	6	240799	240804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102309
4545	NC_012804	GAG	2	6	240826	240831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102309
4546	NC_012804	AC	3	6	240891	240896	50 %	0 %	0 %	50 %	240102309
4547	NC_012804	TAT	2	6	240910	240915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240102309
4548	NC_012804	CAT	2	6	240931	240936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102309
4549	NC_012804	CTT	2	6	240973	240978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102309
4550	NC_012804	TTG	2	6	240989	240994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102309
4551	NC_012804	CCAGC	2	10	241060	241069	20 %	0 %	20 %	60 %	240102309
4552	NC_012804	TCA	2	6	241146	241151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102309
4553	NC_012804	TCC	2	6	241154	241159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102309
4554	NC_012804	TAC	2	6	241363	241368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102310
4555	NC_012804	GA	3	6	241392	241397	50 %	0 %	50 %	0 %	240102310
4556	NC_012804	GAG	2	6	241405	241410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102310
4557	NC_012804	ACC	2	6	241430	241435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102310
4558	NC_012804	AG	4	8	241610	241617	50 %	0 %	50 %	0 %	240102311
4559	NC_012804	GATT	2	8	241623	241630	25 %	50 %	25 %	0 %	240102311
4560	NC_012804	ATA	2	6	241681	241686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102311
4561	NC_012804	GAG	2	6	241732	241737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102311
4562	NC_012804	TAC	3	9	241771	241779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102311
4563	NC_012804	AG	3	6	241829	241834	50 %	0 %	50 %	0 %	240102312
4564	NC_012804	TCGC	2	8	241948	241955	0 %	25 %	25 %	50 %	240102312
4565	NC_012804	AGT	2	6	241975	241980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102312
4566	NC_012804	GAG	2	6	242060	242065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102312
4567	NC_012804	ACG	2	6	242154	242159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102312
4568	NC_012804	CGT	2	6	242221	242226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102312
4569	NC_012804	CGT	2	6	242284	242289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102312
4570	NC_012804	AGA	2	6	242367	242372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102312
4571	NC_012804	CGA	2	6	242409	242414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102312
4572	NC_012804	ACG	2	6	242490	242495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102312
4573	NC_012804	TCC	2	6	242496	242501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102312
4574	NC_012804	CTC	2	6	242513	242518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102312
4575	NC_012804	AAGG	2	8	242531	242538	50 %	0 %	50 %	0 %	240102312
4576	NC_012804	GTG	2	6	242549	242554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102312
4577	NC_012804	GC	3	6	242566	242571	0 %	0 %	50 %	50 %	240102312
4578	NC_012804	GGT	2	6	242626	242631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102312
4579	NC_012804	GC	3	6	242644	242649	0 %	0 %	50 %	50 %	240102312
4580	NC_012804	GCG	2	6	242772	242777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102312
4581	NC_012804	TCT	2	6	242889	242894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102312
4582	NC_012804	GTT	2	6	242908	242913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102312
4583	NC_012804	GAG	2	6	243156	243161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102313
4584	NC_012804	AAG	2	6	243195	243200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102313
4585	NC_012804	GAA	2	6	243230	243235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102313
4586	NC_012804	AGGGG	2	10	243294	243303	20 %	0 %	80 %	0 %	240102313
4587	NC_012804	CCT	2	6	243315	243320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102313
4588	NC_012804	CGA	2	6	243364	243369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102313
4589	NC_012804	ATC	2	6	243426	243431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102313
4590	NC_012804	GCCGA	2	10	243534	243543	20 %	0 %	40 %	40 %	240102313
4591	NC_012804	GGA	2	6	243593	243598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102313
4592	NC_012804	GGC	2	6	243623	243628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102313
4593	NC_012804	TCG	2	6	243652	243657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102313
4594	NC_012804	GCGAC	2	10	243691	243700	20 %	0 %	40 %	40 %	240102313
4595	NC_012804	GAG	2	6	243705	243710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102313
4596	NC_012804	AGG	2	6	243820	243825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102313
4597	NC_012804	AGA	2	6	243840	243845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102313
4598	NC_012804	CTC	2	6	244074	244079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102313
4599	NC_012804	GAC	2	6	244107	244112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102313
4600	NC_012804	TCG	2	6	244126	244131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102313
4601	NC_012804	AGG	2	6	244137	244142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102313
4602	NC_012804	AGG	2	6	244152	244157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102313
4603	NC_012804	TCG	2	6	244375	244380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102313
4604	NC_012804	ACA	2	6	244399	244404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102313
4605	NC_012804	CTC	2	6	244449	244454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102313
4606	NC_012804	CAC	2	6	244464	244469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240102313
4607	NC_012804	AGCG	2	8	244481	244488	25 %	0 %	50 %	25 %	240102313
4608	NC_012804	GAA	2	6	244499	244504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102313
4609	NC_012804	GTG	2	6	244570	244575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102313
4610	NC_012804	ACT	2	6	244624	244629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102313
4611	NC_012804	CGGG	2	8	244639	244646	0 %	0 %	75 %	25 %	240102313
4612	NC_012804	CGT	2	6	245132	245137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102313
4613	NC_012804	G	6	6	245239	245244	0 %	0 %	100 %	0 %	240102313
4614	NC_012804	CGG	2	6	245276	245281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102313
4615	NC_012804	AGG	2	6	245308	245313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102313
4616	NC_012804	TCA	2	6	245380	245385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102314
4617	NC_012804	CGA	2	6	245411	245416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102314
4618	NC_012804	TCA	2	6	245419	245424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102314
4619	NC_012804	GAA	2	6	245445	245450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102314
4620	NC_012804	AG	3	6	245456	245461	50 %	0 %	50 %	0 %	240102314
4621	NC_012804	TCG	2	6	245506	245511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102314
4622	NC_012804	TGAGA	2	10	245567	245576	40 %	20 %	40 %	0 %	240102314
4623	NC_012804	A	6	6	245576	245581	100 %	0 %	0 %	0 %	240102314
4624	NC_012804	GAA	2	6	245647	245652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102315
4625	NC_012804	TCC	2	6	245691	245696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102315
4626	NC_012804	TCC	2	6	245729	245734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102315
4627	NC_012804	TGGAGG	2	12	245906	245917	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	240102315
4628	NC_012804	CTC	2	6	245949	245954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102316
4629	NC_012804	GA	3	6	245984	245989	50 %	0 %	50 %	0 %	240102316
4630	NC_012804	CGA	2	6	245999	246004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102316
4631	NC_012804	GACGTT	2	12	246063	246074	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	240102316
4632	NC_012804	GTTA	2	8	246158	246165	25 %	50 %	25 %	0 %	240102316
4633	NC_012804	A	6	6	246272	246277	100 %	0 %	0 %	0 %	240102317
4634	NC_012804	CTG	2	6	246383	246388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102317
4635	NC_012804	CAGA	2	8	246508	246515	50 %	0 %	25 %	25 %	240102317
4636	NC_012804	GC	3	6	246557	246562	0 %	0 %	50 %	50 %	240102317
4637	NC_012804	GAA	2	6	246581	246586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102317
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4639	NC_012804	GGA	2	6	246690	246695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102318
4640	NC_012804	GAC	2	6	246766	246771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102318
4641	NC_012804	CTT	2	6	246840	246845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102318
4642	NC_012804	CTTGGC	2	12	246918	246929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102318
4643	NC_012804	GAT	2	6	246936	246941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102318
4644	NC_012804	GGT	2	6	247044	247049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102318
4645	NC_012804	TGA	2	6	247181	247186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102318
4646	NC_012804	AGGG	2	8	247192	247199	25 %	0 %	75 %	0 %	240102318
4647	NC_012804	CGAG	2	8	247415	247422	25 %	0 %	50 %	25 %	240102318
4648	NC_012804	GTC	2	6	247474	247479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102318
4649	NC_012804	GGA	2	6	247494	247499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240102318
4650	NC_012804	GA	3	6	247525	247530	50 %	0 %	50 %	0 %	240102318
4651	NC_012804	ATA	2	6	247546	247551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240102318
4652	NC_012804	AGA	2	6	247563	247568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240102318
4653	NC_012804	CGG	2	6	247602	247607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240102318
4654	NC_012804	GCC	2	6	247623	247628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240102318
4655	NC_012804	CTC	2	6	247726	247731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102319
4656	NC_012804	CCTGC	2	10	247834	247843	0 %	20 %	20 %	60 %	240102319
4657	NC_012804	CTC	2	6	247855	247860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102319
4658	NC_012804	ACT	2	6	247886	247891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102319
4659	NC_012804	CCTC	2	8	247895	247902	0 %	25 %	0 %	75 %	240102319
4660	NC_012804	CCT	3	9	247919	247927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102319
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4663	NC_012804	GGCCG	2	10	248077	248086	0 %	0 %	60 %	40 %	240102319
4664	NC_012804	CTT	2	6	248101	248106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240102319
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4681	NC_012804	CCT	2	6	248764	248769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102320
4682	NC_012804	CTC	2	6	248774	248779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102320
4683	NC_012804	TCG	2	6	248814	248819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102320
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4687	NC_012804	CTG	2	6	248904	248909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102320
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4699	NC_012804	CGCT	2	8	249531	249538	0 %	25 %	25 %	50 %	240102320
4700	NC_012804	AG	3	6	249582	249587	50 %	0 %	50 %	0 %	240102320
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4728	NC_012804	GTC	2	6	250992	250997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240102322
4729	NC_012804	ATG	2	6	251055	251060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240102322
4730	NC_012804	ACA	2	6	251082	251087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240102322
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4732	NC_012804	CAT	2	6	251225	251230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102322
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4734	NC_012804	CT	3	6	251260	251265	0 %	50 %	0 %	50 %	240102323
4735	NC_012804	CT	3	6	251289	251294	0 %	50 %	0 %	50 %	240102323
4736	NC_012804	CGA	2	6	251352	251357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240102323
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4738	NC_012804	TGT	2	6	251388	251393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102323
4739	NC_012804	CCT	2	6	251427	251432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102323
4740	NC_012804	TCC	2	6	251498	251503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240102323
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4742	NC_012804	GCCCAT	2	12	251602	251613	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	240102323
4743	NC_012804	ATC	2	6	251651	251656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240102323
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4864	NC_012804	TTG	2	6	257976	257981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240102330
4865	NC_012804	TGG	2	6	257985	257990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240102330
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