MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011978	A	6	6	204	209	100 %	0 %	0 %	0 %	222098975
2	NC_011978	ACTC	2	8	227	234	25 %	25 %	0 %	50 %	222098975
3	NC_011978	AGG	2	6	235	240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222098975
4	NC_011978	GAAC	2	8	249	256	50 %	0 %	25 %	25 %	222098975
5	NC_011978	AC	3	6	316	321	50 %	0 %	0 %	50 %	222098975
6	NC_011978	GA	3	6	324	329	50 %	0 %	50 %	0 %	222098975
7	NC_011978	CTT	2	6	362	367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222098975
8	NC_011978	A	6	6	399	404	100 %	0 %	0 %	0 %	222098975
9	NC_011978	ACG	2	6	424	429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222098975
10	NC_011978	TGA	2	6	457	462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222098975
11	NC_011978	GTG	2	6	463	468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222098975
12	NC_011978	GGA	2	6	470	475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222098975
13	NC_011978	CAGA	2	8	519	526	50 %	0 %	25 %	25 %	222098975
14	NC_011978	GAA	2	6	528	533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098975
15	NC_011978	GATC	2	8	578	585	25 %	25 %	25 %	25 %	222098975
16	NC_011978	GAAG	2	8	614	621	50 %	0 %	50 %	0 %	222098975
17	NC_011978	CTA	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098975
18	NC_011978	GAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098975
19	NC_011978	AAG	3	9	675	683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098975
20	NC_011978	GGGA	2	8	726	733	25 %	0 %	75 %	0 %	222098976
21	NC_011978	TGG	2	6	761	766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222098976
22	NC_011978	TCC	2	6	884	889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222098976
23	NC_011978	GTG	2	6	902	907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222098976
24	NC_011978	TGG	2	6	908	913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222098976
25	NC_011978	TGC	2	6	963	968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222098976
26	NC_011978	GATC	2	8	969	976	25 %	25 %	25 %	25 %	222098976
27	NC_011978	A	6	6	1027	1032	100 %	0 %	0 %	0 %	222098976
28	NC_011978	ACG	2	6	1082	1087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222098976
29	NC_011978	GGA	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222098976
30	NC_011978	CGC	2	6	1109	1114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222098976
31	NC_011978	GAG	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222098976
32	NC_011978	GT	3	6	1136	1141	0 %	50 %	50 %	0 %	222098977
33	NC_011978	TAC	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098977
34	NC_011978	AAC	2	6	1211	1216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222098977
35	NC_011978	ACA	2	6	1337	1342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222098977
36	NC_011978	GAA	2	6	1408	1413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098977
37	NC_011978	TCA	2	6	1419	1424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098977
38	NC_011978	GGA	2	6	1430	1435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222098977
39	NC_011978	GGA	2	6	1439	1444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222098977
40	NC_011978	GCG	2	6	1520	1525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222098977
41	NC_011978	CCT	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222098977
42	NC_011978	CGA	2	6	1558	1563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222098977
43	NC_011978	TCA	3	9	1632	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098977
44	NC_011978	CGG	2	6	1659	1664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222098977
45	NC_011978	GGGC	2	8	1669	1676	0 %	0 %	75 %	25 %	222098977
46	NC_011978	GAG	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222098977
47	NC_011978	ACG	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222098977
48	NC_011978	GAAG	2	8	1720	1727	50 %	0 %	50 %	0 %	222098977
49	NC_011978	TCT	2	6	1734	1739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222098977
50	NC_011978	GGA	2	6	1750	1755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222098977
51	NC_011978	ACC	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222098977
52	NC_011978	CAA	2	6	1936	1941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222098977
53	NC_011978	TAC	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098977
54	NC_011978	GAA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098977
55	NC_011978	CCT	2	6	1977	1982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222098977
56	NC_011978	GAA	2	6	2002	2007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098977
57	NC_011978	GAACGA	2	12	2134	2145	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222098978
58	NC_011978	TCT	2	6	2164	2169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222098978
59	NC_011978	GAAG	2	8	2173	2180	50 %	0 %	50 %	0 %	222098978
60	NC_011978	TCA	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098978
61	NC_011978	GAA	2	6	2244	2249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098978
62	NC_011978	GAG	2	6	2255	2260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222098978
63	NC_011978	AAAG	2	8	2304	2311	75 %	0 %	25 %	0 %	222098978
64	NC_011978	AG	3	6	2351	2356	50 %	0 %	50 %	0 %	222098978
65	NC_011978	GA	3	6	2366	2371	50 %	0 %	50 %	0 %	222098978
66	NC_011978	A	6	6	2426	2431	100 %	0 %	0 %	0 %	222098978
67	NC_011978	ACC	2	6	2466	2471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222098978
68	NC_011978	AC	4	8	2481	2488	50 %	0 %	0 %	50 %	222098978
69	NC_011978	CAC	2	6	2516	2521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222098978
70	NC_011978	ATC	2	6	2534	2539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098978
71	NC_011978	GGGAA	2	10	2587	2596	40 %	0 %	60 %	0 %	222098978
72	NC_011978	A	6	6	2633	2638	100 %	0 %	0 %	0 %	222098978
73	NC_011978	CTC	2	6	2716	2721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222098978
74	NC_011978	CTC	2	6	2732	2737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222098978
75	NC_011978	CCT	2	6	2784	2789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222098978
76	NC_011978	A	6	6	2830	2835	100 %	0 %	0 %	0 %	222098978
77	NC_011978	GAAG	2	8	2917	2924	50 %	0 %	50 %	0 %	222098978
78	NC_011978	CTC	2	6	2936	2941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222098978
79	NC_011978	AGATC	2	10	2946	2955	40 %	20 %	20 %	20 %	222098978
80	NC_011978	CAT	2	6	2986	2991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098978
81	NC_011978	ACGGAA	2	12	3005	3016	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222098978
82	NC_011978	TAC	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098978
83	NC_011978	GAC	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222098978
84	NC_011978	GAA	2	6	3140	3145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098978
85	NC_011978	AGA	2	6	3180	3185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098978
86	NC_011978	ATC	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098978
87	NC_011978	ATC	2	6	3293	3298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098978
88	NC_011978	GAT	2	6	3319	3324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222098978
89	NC_011978	GGT	2	6	3382	3387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222098978
90	NC_011978	TCT	3	9	3416	3424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222098978
91	NC_011978	TGG	2	6	3460	3465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222098979
92	NC_011978	CTTT	2	8	3471	3478	0 %	75 %	0 %	25 %	222098979
93	NC_011978	GGT	2	6	3518	3523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222098979
94	NC_011978	TCGA	2	8	3531	3538	25 %	25 %	25 %	25 %	222098979
95	NC_011978	GCA	2	6	3565	3570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222098979
96	NC_011978	CTT	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222098979
97	NC_011978	AGA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098979
98	NC_011978	AAC	2	6	3711	3716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222098979
99	NC_011978	GAA	2	6	3813	3818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098979
100	NC_011978	TTC	2	6	3895	3900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222098979
101	NC_011978	TCCTC	2	10	3949	3958	0 %	40 %	0 %	60 %	222098979
102	NC_011978	CAT	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098979
103	NC_011978	GA	3	6	4052	4057	50 %	0 %	50 %	0 %	222098979
104	NC_011978	CAC	2	6	4068	4073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222098979
105	NC_011978	GTC	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222098979
106	NC_011978	AG	3	6	4127	4132	50 %	0 %	50 %	0 %	222098979
107	NC_011978	AG	3	6	4176	4181	50 %	0 %	50 %	0 %	222098979
108	NC_011978	CGT	2	6	4338	4343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222098980
109	NC_011978	GAA	2	6	4355	4360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098980
110	NC_011978	AGA	2	6	4449	4454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098980
111	NC_011978	CGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222098980
112	NC_011978	CAT	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098980
113	NC_011978	GAACC	2	10	4627	4636	40 %	0 %	20 %	40 %	222098980
114	NC_011978	ACG	2	6	4663	4668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222098980
115	NC_011978	CTT	2	6	4672	4677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222098980
116	NC_011978	CGA	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222098980
117	NC_011978	TC	3	6	4719	4724	0 %	50 %	0 %	50 %	222098980
118	NC_011978	GAA	2	6	4788	4793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098980
119	NC_011978	AAAGG	2	10	4801	4810	60 %	0 %	40 %	0 %	222098980
120	NC_011978	GAGG	2	8	4826	4833	25 %	0 %	75 %	0 %	222098980
121	NC_011978	TCG	2	6	4856	4861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222098980
122	NC_011978	AGG	2	6	4946	4951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222098980
123	NC_011978	CGG	2	6	4952	4957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222098980
124	NC_011978	AAC	2	6	4975	4980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222098980
125	NC_011978	GT	3	6	4988	4993	0 %	50 %	50 %	0 %	222098980
126	NC_011978	TGA	2	6	5028	5033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222098980
127	NC_011978	GAAA	2	8	5179	5186	75 %	0 %	25 %	0 %	222098981
128	NC_011978	TAC	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098981
129	NC_011978	GAA	2	6	5229	5234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222098981
130	NC_011978	CCT	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222098981
131	NC_011978	TCC	3	9	5261	5269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222098981
132	NC_011978	TC	5	10	5290	5299	0 %	50 %	0 %	50 %	222098981
133	NC_011978	TCA	2	6	5382	5387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222098981
134	NC_011978	TGG	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222098981
135	NC_011978	A	6	6	5444	5449	100 %	0 %	0 %	0 %	222098981
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