MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011978	TGA	2	6	165799	165804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099151
3502	NC_011978	AGA	2	6	165854	165859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099151
3503	NC_011978	AGC	2	6	165860	165865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099151
3504	NC_011978	CT	3	6	165976	165981	0 %	50 %	0 %	50 %	222099151
3505	NC_011978	TTC	2	6	166048	166053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099151
3506	NC_011978	CAG	2	6	166108	166113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099151
3507	NC_011978	GGC	2	6	166123	166128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099151
3508	NC_011978	CCT	2	6	166148	166153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099152
3509	NC_011978	GCAA	2	8	166209	166216	50 %	0 %	25 %	25 %	222099152
3510	NC_011978	AAG	2	6	166258	166263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099152
3511	NC_011978	T	6	6	166297	166302	0 %	100 %	0 %	0 %	222099152
3512	NC_011978	CAT	2	6	166304	166309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099152
3513	NC_011978	TCC	2	6	166311	166316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099152
3514	NC_011978	GGAC	2	8	166345	166352	25 %	0 %	50 %	25 %	222099152
3515	NC_011978	CTTC	2	8	166366	166373	0 %	50 %	0 %	50 %	222099152
3516	NC_011978	TC	3	6	166390	166395	0 %	50 %	0 %	50 %	222099152
3517	NC_011978	AAG	2	6	166425	166430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099152
3518	NC_011978	TTTTC	2	10	166451	166460	0 %	80 %	0 %	20 %	222099152
3519	NC_011978	TCT	2	6	166523	166528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099152
3520	NC_011978	CTT	3	9	166555	166563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099152
3521	NC_011978	TCT	2	6	166566	166571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099152
3522	NC_011978	CGA	2	6	166684	166689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099152
3523	NC_011978	CCTG	2	8	166717	166724	0 %	25 %	25 %	50 %	222099152
3524	NC_011978	CTT	2	6	166733	166738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099152
3525	NC_011978	AGA	2	6	166758	166763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099152
3526	NC_011978	TCC	2	6	166848	166853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099153
3527	NC_011978	TCT	2	6	166966	166971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099153
3528	NC_011978	TTC	2	6	166977	166982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099153
3529	NC_011978	AAG	2	6	166985	166990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099153
3530	NC_011978	ATCCT	2	10	167008	167017	20 %	40 %	0 %	40 %	222099153
3531	NC_011978	CTC	2	6	167051	167056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099153
3532	NC_011978	TGG	2	6	167076	167081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099153
3533	NC_011978	TTC	2	6	167122	167127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099153
3534	NC_011978	TCA	2	6	167146	167151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099153
3535	NC_011978	ATG	2	6	167199	167204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099153
3536	NC_011978	CTTC	2	8	167225	167232	0 %	50 %	0 %	50 %	222099153
3537	NC_011978	GGT	2	6	167302	167307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099153
3538	NC_011978	CTT	2	6	167313	167318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099153
3539	NC_011978	GAA	2	6	167407	167412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099153
3540	NC_011978	TTCT	2	8	167459	167466	0 %	75 %	0 %	25 %	222099153
3541	NC_011978	GT	3	6	167626	167631	0 %	50 %	50 %	0 %	222099153
3542	NC_011978	TCG	2	6	167652	167657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099153
3543	NC_011978	GT	3	6	167660	167665	0 %	50 %	50 %	0 %	222099153
3544	NC_011978	CCA	2	6	167746	167751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099153
3545	NC_011978	TGG	2	6	167901	167906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099154
3546	NC_011978	T	7	7	167928	167934	0 %	100 %	0 %	0 %	222099154
3547	NC_011978	GGA	2	6	167942	167947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099154
3548	NC_011978	TAC	2	6	167969	167974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099154
3549	NC_011978	ATT	2	6	167994	167999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222099154
3550	NC_011978	GAAAA	2	10	168047	168056	80 %	0 %	20 %	0 %	222099154
3551	NC_011978	CGCCTC	2	12	168079	168090	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222099154
3552	NC_011978	TC	3	6	168114	168119	0 %	50 %	0 %	50 %	222099154
3553	NC_011978	AG	3	6	168140	168145	50 %	0 %	50 %	0 %	222099154
3554	NC_011978	GA	3	6	168291	168296	50 %	0 %	50 %	0 %	222099154
3555	NC_011978	AAC	2	6	168368	168373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099154
3556	NC_011978	CTG	2	6	168459	168464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099154
3557	NC_011978	TA	3	6	168548	168553	50 %	50 %	0 %	0 %	222099155
3558	NC_011978	CTT	2	6	168587	168592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099155
3559	NC_011978	AAACC	2	10	168657	168666	60 %	0 %	0 %	40 %	222099155
3560	NC_011978	CTG	2	6	168678	168683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099155
3561	NC_011978	CA	3	6	168722	168727	50 %	0 %	0 %	50 %	222099155
3562	NC_011978	AGAC	2	8	168734	168741	50 %	0 %	25 %	25 %	222099155
3563	NC_011978	TAC	2	6	168798	168803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099155
3564	NC_011978	CGA	2	6	168878	168883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099155
3565	NC_011978	TGA	2	6	168982	168987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099155
3566	NC_011978	CT	3	6	169001	169006	0 %	50 %	0 %	50 %	222099155
3567	NC_011978	GGA	2	6	169053	169058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099155
3568	NC_011978	TGA	2	6	169094	169099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099155
3569	NC_011978	TGT	2	6	169127	169132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099155
3570	NC_011978	CAA	2	6	169142	169147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099155
3571	NC_011978	GGA	2	6	169161	169166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099155
3572	NC_011978	GGT	2	6	169216	169221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099156
3573	NC_011978	T	6	6	169221	169226	0 %	100 %	0 %	0 %	222099156
3574	NC_011978	CTT	3	9	169238	169246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099156
3575	NC_011978	AG	4	8	169263	169270	50 %	0 %	50 %	0 %	222099156
3576	NC_011978	AG	3	6	169277	169282	50 %	0 %	50 %	0 %	222099156
3577	NC_011978	GAA	2	6	169289	169294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099156
3578	NC_011978	AAT	2	6	169297	169302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099156
3579	NC_011978	ACT	2	6	169348	169353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099156
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3581	NC_011978	AGA	2	6	169376	169381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099156
3582	NC_011978	GA	3	6	169486	169491	50 %	0 %	50 %	0 %	222099156
3583	NC_011978	A	6	6	169497	169502	100 %	0 %	0 %	0 %	222099156
3584	NC_011978	AGAA	2	8	169506	169513	75 %	0 %	25 %	0 %	222099156
3585	NC_011978	GAC	2	6	169520	169525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099156
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3587	NC_011978	GAA	2	6	169673	169678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099157
3588	NC_011978	T	6	6	169729	169734	0 %	100 %	0 %	0 %	222099157
3589	NC_011978	TCT	2	6	169750	169755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099157
3590	NC_011978	TTCC	2	8	169778	169785	0 %	50 %	0 %	50 %	222099157
3591	NC_011978	GAA	2	6	169800	169805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099157
3592	NC_011978	CT	3	6	169806	169811	0 %	50 %	0 %	50 %	222099157
3593	NC_011978	AAGTC	2	10	169816	169825	40 %	20 %	20 %	20 %	222099157
3594	NC_011978	AGG	2	6	169902	169907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099157
3595	NC_011978	ATC	2	6	169918	169923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099157
3596	NC_011978	CAC	2	6	169974	169979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099157
3597	NC_011978	CAC	2	6	170099	170104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099157
3598	NC_011978	ACC	2	6	170125	170130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099157
3599	NC_011978	TTC	2	6	170175	170180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099157
3600	NC_011978	AC	3	6	170201	170206	50 %	0 %	0 %	50 %	222099157
3601	NC_011978	A	6	6	170218	170223	100 %	0 %	0 %	0 %	222099157
3602	NC_011978	T	6	6	170282	170287	0 %	100 %	0 %	0 %	222099157
3603	NC_011978	CCA	2	6	170288	170293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099157
3604	NC_011978	TGA	2	6	170300	170305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099157
3605	NC_011978	CTTTT	2	10	170310	170319	0 %	80 %	0 %	20 %	222099157
3606	NC_011978	GAT	2	6	170328	170333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099157
3607	NC_011978	TCT	2	6	170350	170355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099157
3608	NC_011978	TC	3	6	170463	170468	0 %	50 %	0 %	50 %	222099158
3609	NC_011978	TC	3	6	170483	170488	0 %	50 %	0 %	50 %	222099158
3610	NC_011978	CTCCAC	2	12	170516	170527	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	222099158
3611	NC_011978	T	6	6	170547	170552	0 %	100 %	0 %	0 %	222099158
3612	NC_011978	GTC	2	6	170604	170609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099158
3613	NC_011978	GTT	2	6	170630	170635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099158
3614	NC_011978	CAC	2	6	170675	170680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099158
3615	NC_011978	TCT	2	6	170730	170735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099158
3616	NC_011978	T	6	6	170745	170750	0 %	100 %	0 %	0 %	222099158
3617	NC_011978	TCCC	2	8	170761	170768	0 %	25 %	0 %	75 %	222099158
3618	NC_011978	AGT	2	6	170852	170857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099159
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3620	NC_011978	GGAG	2	8	170963	170970	25 %	0 %	75 %	0 %	222099159
3621	NC_011978	CGA	2	6	170975	170980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099159
3622	NC_011978	GTTC	2	8	171035	171042	0 %	50 %	25 %	25 %	222099159
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3624	NC_011978	TCT	2	6	171168	171173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099160
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3993	NC_011978	GAATG	2	10	188062	188071	40 %	20 %	40 %	0 %	222099174
3994	NC_011978	AAG	2	6	188099	188104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099174
3995	NC_011978	TCA	2	6	188133	188138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099174
3996	NC_011978	CAC	2	6	188146	188151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099174
3997	NC_011978	CGA	2	6	188374	188379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099174
3998	NC_011978	AAAC	2	8	188419	188426	75 %	0 %	0 %	25 %	222099174
3999	NC_011978	TGC	2	6	188497	188502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099174
4000	NC_011978	GAT	2	6	188503	188508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099174

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