MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_011978	T	6	6	1827344	1827349	0 %	100 %	0 %	0 %	222100844
38003	NC_011978	CCA	2	6	1827381	1827386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100844
38004	NC_011978	TCC	2	6	1827436	1827441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100844
38005	NC_011978	ACG	2	6	1827443	1827448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100844
38006	NC_011978	AGC	2	6	1827503	1827508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100844
38007	NC_011978	AGA	2	6	1827530	1827535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100844
38008	NC_011978	CTT	2	6	1827589	1827594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100844
38009	NC_011978	CCA	2	6	1827693	1827698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100844
38010	NC_011978	TC	3	6	1827704	1827709	0 %	50 %	0 %	50 %	222100844
38011	NC_011978	CCA	2	6	1827738	1827743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100844
38012	NC_011978	ATG	2	6	1827758	1827763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100844
38013	NC_011978	GTCT	2	8	1827774	1827781	0 %	50 %	25 %	25 %	222100844
38014	NC_011978	T	6	6	1827814	1827819	0 %	100 %	0 %	0 %	222100844
38015	NC_011978	GTTT	2	8	1827837	1827844	0 %	75 %	25 %	0 %	222100844
38016	NC_011978	CTT	2	6	1827897	1827902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100844
38017	NC_011978	ATG	2	6	1827944	1827949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100844
38018	NC_011978	TCG	2	6	1828035	1828040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100844
38019	NC_011978	CCT	2	6	1828061	1828066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100844
38020	NC_011978	TCA	2	6	1828080	1828085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100844
38021	NC_011978	CAA	2	6	1828122	1828127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100844
38022	NC_011978	CCA	2	6	1828214	1828219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100844
38023	NC_011978	TTC	2	6	1828330	1828335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100844
38024	NC_011978	TCA	2	6	1828355	1828360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100844
38025	NC_011978	GAG	2	6	1828407	1828412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100844
38026	NC_011978	A	6	6	1828422	1828427	100 %	0 %	0 %	0 %	222100844
38027	NC_011978	TCA	2	6	1828442	1828447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100844
38028	NC_011978	AG	3	6	1828449	1828454	50 %	0 %	50 %	0 %	222100844
38029	NC_011978	AGA	2	6	1828520	1828525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100844
38030	NC_011978	TGG	2	6	1828530	1828535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100844
38031	NC_011978	CCA	2	6	1828548	1828553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100844
38032	NC_011978	GA	3	6	1828561	1828566	50 %	0 %	50 %	0 %	222100844
38033	NC_011978	TGA	2	6	1828580	1828585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100844
38034	NC_011978	TC	4	8	1828615	1828622	0 %	50 %	0 %	50 %	222100844
38035	NC_011978	TCGA	2	8	1828639	1828646	25 %	25 %	25 %	25 %	222100844
38036	NC_011978	GGA	2	6	1828648	1828653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100844
38037	NC_011978	ATCT	2	8	1828716	1828723	25 %	50 %	0 %	25 %	222100844
38038	NC_011978	CGC	2	6	1828804	1828809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100844
38039	NC_011978	CA	3	6	1828810	1828815	50 %	0 %	0 %	50 %	222100844
38040	NC_011978	GTG	2	6	1828850	1828855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100844
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38042	NC_011978	T	6	6	1829056	1829061	0 %	100 %	0 %	0 %	222100845
38043	NC_011978	TCA	2	6	1829116	1829121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100845
38044	NC_011978	CT	3	6	1829193	1829198	0 %	50 %	0 %	50 %	222100845
38045	NC_011978	CGT	2	6	1829207	1829212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100845
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38048	NC_011978	A	7	7	1829356	1829362	100 %	0 %	0 %	0 %	222100845
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38050	NC_011978	C	6	6	1829491	1829496	0 %	0 %	0 %	100 %	222100845
38051	NC_011978	CT	3	6	1829511	1829516	0 %	50 %	0 %	50 %	222100846
38052	NC_011978	GTGA	2	8	1829544	1829551	25 %	25 %	50 %	0 %	222100846
38053	NC_011978	GAA	2	6	1829552	1829557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100846
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38055	NC_011978	TCT	2	6	1829607	1829612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100846
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38059	NC_011978	CT	3	6	1829797	1829802	0 %	50 %	0 %	50 %	222100846
38060	NC_011978	TTCC	2	8	1829811	1829818	0 %	50 %	0 %	50 %	222100846
38061	NC_011978	TAC	2	6	1829824	1829829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100846
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38068	NC_011978	CGT	2	6	1830144	1830149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100846
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38070	NC_011978	TC	3	6	1830207	1830212	0 %	50 %	0 %	50 %	222100846
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38075	NC_011978	CGGAA	2	10	1830558	1830567	40 %	0 %	40 %	20 %	222100847
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38081	NC_011978	CAC	2	6	1830891	1830896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100847
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38083	NC_011978	GCC	2	6	1830937	1830942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100847
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38086	NC_011978	CAG	2	6	1830997	1831002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100848
38087	NC_011978	ATC	2	6	1831040	1831045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100848
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38090	NC_011978	CCG	2	6	1831203	1831208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100848
38091	NC_011978	GA	3	6	1831323	1831328	50 %	0 %	50 %	0 %	222100848
38092	NC_011978	GAA	2	6	1831398	1831403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100848
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38094	NC_011978	CCTTT	2	10	1831488	1831497	0 %	60 %	0 %	40 %	222100848
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38099	NC_011978	GAA	2	6	1831640	1831645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100848
38100	NC_011978	CTT	2	6	1831678	1831683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100848
38101	NC_011978	TCC	2	6	1831698	1831703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100848
38102	NC_011978	TCC	2	6	1831723	1831728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100848
38103	NC_011978	TCT	2	6	1831880	1831885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100848
38104	NC_011978	GTT	2	6	1831895	1831900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100848
38105	NC_011978	CGC	2	6	1831921	1831926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100848
38106	NC_011978	TGA	2	6	1831929	1831934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100848
38107	NC_011978	TCA	2	6	1831989	1831994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100848
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38109	NC_011978	C	6	6	1832043	1832048	0 %	0 %	0 %	100 %	222100848
38110	NC_011978	A	6	6	1832110	1832115	100 %	0 %	0 %	0 %	222100848
38111	NC_011978	GAT	2	6	1832167	1832172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100848
38112	NC_011978	CAA	2	6	1832173	1832178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100848
38113	NC_011978	A	6	6	1832185	1832190	100 %	0 %	0 %	0 %	222100848
38114	NC_011978	CCTC	2	8	1832211	1832218	0 %	25 %	0 %	75 %	222100848
38115	NC_011978	ATG	2	6	1832288	1832293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100849
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