MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32002	NC_011978	TAAT	2	8	1534610	1534617	50 %	50 %	0 %	0 %	222100540
32003	NC_011978	T	6	6	1534637	1534642	0 %	100 %	0 %	0 %	222100540
32004	NC_011978	GAA	2	6	1534648	1534653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100540
32005	NC_011978	CTT	2	6	1534709	1534714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100540
32006	NC_011978	GTCG	2	8	1534814	1534821	0 %	25 %	50 %	25 %	222100540
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32013	NC_011978	GAA	2	6	1535207	1535212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100541
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32110	NC_011978	CT	4	8	1539625	1539632	0 %	50 %	0 %	50 %	222100545
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32117	NC_011978	CGT	2	6	1540035	1540040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100546
32118	NC_011978	GTT	2	6	1540123	1540128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100546
32119	NC_011978	TCA	2	6	1540191	1540196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100546
32120	NC_011978	CTC	2	6	1540228	1540233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100546
32121	NC_011978	A	7	7	1540272	1540278	100 %	0 %	0 %	0 %	222100546
32122	NC_011978	ATC	2	6	1540282	1540287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100546
32123	NC_011978	TGG	2	6	1540424	1540429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100546
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32129	NC_011978	TC	3	6	1540625	1540630	0 %	50 %	0 %	50 %	222100546
32130	NC_011978	GAAG	2	8	1540653	1540660	50 %	0 %	50 %	0 %	222100546
32131	NC_011978	ATTG	2	8	1540682	1540689	25 %	50 %	25 %	0 %	222100546
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32134	NC_011978	A	6	6	1540842	1540847	100 %	0 %	0 %	0 %	222100547
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32142	NC_011978	GA	3	6	1541238	1541243	50 %	0 %	50 %	0 %	222100547
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32149	NC_011978	TCCT	2	8	1541542	1541549	0 %	50 %	0 %	50 %	222100547
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32155	NC_011978	TAC	2	6	1541820	1541825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100548
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32172	NC_011978	AAG	2	6	1542565	1542570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100549
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32211	NC_011978	CGTTC	2	10	1544911	1544920	0 %	40 %	20 %	40 %	222100554
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32220	NC_011978	AAT	2	6	1545415	1545420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100554
32221	NC_011978	TGA	2	6	1545492	1545497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100554
32222	NC_011978	TTTG	2	8	1545529	1545536	0 %	75 %	25 %	0 %	222100554
32223	NC_011978	GT	3	6	1545618	1545623	0 %	50 %	50 %	0 %	222100554
32224	NC_011978	CAG	2	6	1545656	1545661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100554
32225	NC_011978	CTT	2	6	1545674	1545679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100554
32226	NC_011978	CGTC	2	8	1545711	1545718	0 %	25 %	25 %	50 %	222100554
32227	NC_011978	GA	3	6	1545775	1545780	50 %	0 %	50 %	0 %	222100554
32228	NC_011978	CTT	2	6	1545866	1545871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100554
32229	NC_011978	GAAA	2	8	1545873	1545880	75 %	0 %	25 %	0 %	222100554
32230	NC_011978	ACTT	2	8	1545890	1545897	25 %	50 %	0 %	25 %	222100554
32231	NC_011978	GTT	2	6	1545908	1545913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100554
32232	NC_011978	T	6	6	1545912	1545917	0 %	100 %	0 %	0 %	222100554
32233	NC_011978	A	6	6	1545971	1545976	100 %	0 %	0 %	0 %	222100555
32234	NC_011978	ACAG	2	8	1546013	1546020	50 %	0 %	25 %	25 %	222100555
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32355	NC_011978	CCT	2	6	1553317	1553322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100560
32356	NC_011978	ACA	2	6	1553411	1553416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100560
32357	NC_011978	GGA	2	6	1553436	1553441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100560
32358	NC_011978	CCT	2	6	1553524	1553529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100561
32359	NC_011978	GTT	2	6	1553565	1553570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100561
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32362	NC_011978	CAT	2	6	1553649	1553654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100561
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32365	NC_011978	CTTTCA	2	12	1553954	1553965	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222100561
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32369	NC_011978	TG	3	6	1554208	1554213	0 %	50 %	50 %	0 %	222100561
32370	NC_011978	ATG	2	6	1554221	1554226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100561
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32373	NC_011978	TCGA	2	8	1554430	1554437	25 %	25 %	25 %	25 %	222100561
32374	NC_011978	TTC	2	6	1554661	1554666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100561
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32384	NC_011978	AT	3	6	1555221	1555226	50 %	50 %	0 %	0 %	222100561
32385	NC_011978	CTT	2	6	1555251	1555256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100561
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32402	NC_011978	GA	3	6	1555988	1555993	50 %	0 %	50 %	0 %	222100561
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32411	NC_011978	T	6	6	1556315	1556320	0 %	100 %	0 %	0 %	222100561
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32418	NC_011978	CTT	2	6	1556929	1556934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100562
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32420	NC_011978	GAAC	2	8	1556962	1556969	50 %	0 %	25 %	25 %	222100562
32421	NC_011978	CTTT	2	8	1557066	1557073	0 %	75 %	0 %	25 %	222100563
32422	NC_011978	GAAT	2	8	1557075	1557082	50 %	25 %	25 %	0 %	222100563
32423	NC_011978	ATC	2	6	1557131	1557136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100563
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32428	NC_011978	CT	3	6	1557532	1557537	0 %	50 %	0 %	50 %	222100563
32429	NC_011978	TCG	2	6	1557658	1557663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100563
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32432	NC_011978	T	7	7	1557710	1557716	0 %	100 %	0 %	0 %	222100563
32433	NC_011978	CTT	2	6	1557741	1557746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100563
32434	NC_011978	TTC	2	6	1557788	1557793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100563
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32439	NC_011978	CTT	2	6	1558072	1558077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100563
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32442	NC_011978	GTA	2	6	1558144	1558149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100563
32443	NC_011978	TTTC	2	8	1558182	1558189	0 %	75 %	0 %	25 %	222100563
32444	NC_011978	ACA	2	6	1558268	1558273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100563
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32452	NC_011978	T	6	6	1558752	1558757	0 %	100 %	0 %	0 %	222100563
32453	NC_011978	GCT	2	6	1558810	1558815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100563
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32455	NC_011978	CCAGAA	2	12	1558870	1558881	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222100563
32456	NC_011978	T	6	6	1558969	1558974	0 %	100 %	0 %	0 %	222100563
32457	NC_011978	TGG	2	6	1559010	1559015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100563
32458	NC_011978	ATC	2	6	1559087	1559092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100563
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32460	NC_011978	TGTA	2	8	1559369	1559376	25 %	50 %	25 %	0 %	222100563
32461	NC_011978	TCC	2	6	1559419	1559424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100563
32462	NC_011978	TTC	3	9	1559475	1559483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100563
32463	NC_011978	CGA	2	6	1559529	1559534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100563
32464	NC_011978	TCG	2	6	1559537	1559542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100563
32465	NC_011978	GT	3	6	1559565	1559570	0 %	50 %	50 %	0 %	222100563
32466	NC_011978	CCA	2	6	1559582	1559587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100563
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32468	NC_011978	TTC	2	6	1559635	1559640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100563
32469	NC_011978	CCT	2	6	1559657	1559662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100563
32470	NC_011978	T	6	6	1559747	1559752	0 %	100 %	0 %	0 %	222100563
32471	NC_011978	CGG	2	6	1559759	1559764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100563
32472	NC_011978	TCG	2	6	1559813	1559818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100563
32473	NC_011978	CGA	2	6	1559901	1559906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100563
32474	NC_011978	CCCTT	2	10	1559997	1560006	0 %	40 %	0 %	60 %	222100563
32475	NC_011978	CT	3	6	1560053	1560058	0 %	50 %	0 %	50 %	222100563
32476	NC_011978	T	6	6	1560081	1560086	0 %	100 %	0 %	0 %	222100563
32477	NC_011978	GAG	2	6	1560157	1560162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100563
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32479	NC_011978	AG	4	8	1560186	1560193	50 %	0 %	50 %	0 %	222100563
32480	NC_011978	TCT	2	6	1560211	1560216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100563
32481	NC_011978	CT	3	6	1560215	1560220	0 %	50 %	0 %	50 %	222100563
32482	NC_011978	TCC	2	6	1560389	1560394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100563
32483	NC_011978	TCA	2	6	1560417	1560422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100563
32484	NC_011978	CA	3	6	1560421	1560426	50 %	0 %	0 %	50 %	222100563
32485	NC_011978	TCT	2	6	1560450	1560455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100564
32486	NC_011978	CTT	2	6	1560518	1560523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100564
32487	NC_011978	TCC	2	6	1560527	1560532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100564
32488	NC_011978	GTA	2	6	1560567	1560572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100564
32489	NC_011978	AGT	2	6	1560677	1560682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100564
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32491	NC_011978	GT	3	6	1560806	1560811	0 %	50 %	50 %	0 %	222100564
32492	NC_011978	TCTCT	2	10	1560840	1560849	0 %	60 %	0 %	40 %	222100564
32493	NC_011978	CTG	2	6	1560862	1560867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100564
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32496	NC_011978	TAG	2	6	1561037	1561042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100564
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32500	NC_011978	CAG	2	6	1561152	1561157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100564

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