MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_011978	ATC	2	6	1510480	1510485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100523
31502	NC_011978	CAT	2	6	1510528	1510533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100523
31503	NC_011978	CAA	2	6	1510540	1510545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100523
31504	NC_011978	CTT	2	6	1510622	1510627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100523
31505	NC_011978	TTTAA	2	10	1510676	1510685	40 %	60 %	0 %	0 %	222100523
31506	NC_011978	TGAA	2	8	1510752	1510759	50 %	25 %	25 %	0 %	222100523
31507	NC_011978	GC	3	6	1510827	1510832	0 %	0 %	50 %	50 %	222100523
31508	NC_011978	TGC	2	6	1510885	1510890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100523
31509	NC_011978	TTCTA	2	10	1510915	1510924	20 %	60 %	0 %	20 %	222100523
31510	NC_011978	TCC	2	6	1511030	1511035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100523
31511	NC_011978	CTC	2	6	1511061	1511066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100523
31512	NC_011978	A	6	6	1511090	1511095	100 %	0 %	0 %	0 %	222100523
31513	NC_011978	TGG	2	6	1511116	1511121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100523
31514	NC_011978	AAC	2	6	1511131	1511136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100523
31515	NC_011978	AATG	2	8	1511192	1511199	50 %	25 %	25 %	0 %	222100523
31516	NC_011978	CA	3	6	1511231	1511236	50 %	0 %	0 %	50 %	222100523
31517	NC_011978	TGT	2	6	1511329	1511334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100523
31518	NC_011978	AAG	2	6	1511356	1511361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100523
31519	NC_011978	TGA	2	6	1511404	1511409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100523
31520	NC_011978	AT	3	6	1511479	1511484	50 %	50 %	0 %	0 %	222100524
31521	NC_011978	AAGGA	2	10	1511499	1511508	60 %	0 %	40 %	0 %	222100524
31522	NC_011978	GTA	2	6	1511572	1511577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100524
31523	NC_011978	GCT	2	6	1511639	1511644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100524
31524	NC_011978	TGG	2	6	1511681	1511686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100524
31525	NC_011978	GTTC	2	8	1511735	1511742	0 %	50 %	25 %	25 %	222100524
31526	NC_011978	A	6	6	1511796	1511801	100 %	0 %	0 %	0 %	222100524
31527	NC_011978	ACTT	2	8	1511823	1511830	25 %	50 %	0 %	25 %	222100524
31528	NC_011978	T	7	7	1511842	1511848	0 %	100 %	0 %	0 %	222100524
31529	NC_011978	GGTAT	2	10	1511860	1511869	20 %	40 %	40 %	0 %	222100524
31530	NC_011978	A	6	6	1511909	1511914	100 %	0 %	0 %	0 %	222100524
31531	NC_011978	GA	3	6	1512101	1512106	50 %	0 %	50 %	0 %	222100524
31532	NC_011978	AGA	2	6	1512206	1512211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100524
31533	NC_011978	TAA	2	6	1512290	1512295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100524
31534	NC_011978	AAG	2	6	1512313	1512318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100524
31535	NC_011978	A	8	8	1512342	1512349	100 %	0 %	0 %	0 %	222100524
31536	NC_011978	TAG	2	6	1512370	1512375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100524
31537	NC_011978	AAT	2	6	1512440	1512445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100524
31538	NC_011978	ACA	2	6	1512451	1512456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100524
31539	NC_011978	ATGG	4	16	1512471	1512486	25 %	25 %	50 %	0 %	222100524
31540	NC_011978	CAA	2	6	1512551	1512556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100524
31541	NC_011978	A	6	6	1512608	1512613	100 %	0 %	0 %	0 %	222100524
31542	NC_011978	GGT	2	6	1512614	1512619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100524
31543	NC_011978	GC	3	6	1512629	1512634	0 %	0 %	50 %	50 %	222100524
31544	NC_011978	AGG	2	6	1512782	1512787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100524
31545	NC_011978	AGC	2	6	1512848	1512853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100524
31546	NC_011978	AC	3	6	1512873	1512878	50 %	0 %	0 %	50 %	222100524
31547	NC_011978	A	6	6	1512996	1513001	100 %	0 %	0 %	0 %	222100524
31548	NC_011978	TGT	2	6	1513022	1513027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100524
31549	NC_011978	AGTATC	2	12	1513078	1513089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222100524
31550	NC_011978	GAA	3	9	1513124	1513132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100524
31551	NC_011978	AAG	2	6	1513160	1513165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100524
31552	NC_011978	GGA	2	6	1513206	1513211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100524
31553	NC_011978	CTC	2	6	1513228	1513233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100524
31554	NC_011978	ACC	2	6	1513241	1513246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100524
31555	NC_011978	A	6	6	1513279	1513284	100 %	0 %	0 %	0 %	222100524
31556	NC_011978	TGC	2	6	1513289	1513294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100524
31557	NC_011978	GA	3	6	1513298	1513303	50 %	0 %	50 %	0 %	222100524
31558	NC_011978	GAT	2	6	1513318	1513323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100524
31559	NC_011978	T	6	6	1513423	1513428	0 %	100 %	0 %	0 %	222100525
31560	NC_011978	TGC	2	6	1513532	1513537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100525
31561	NC_011978	AACAT	2	10	1513557	1513566	60 %	20 %	0 %	20 %	222100525
31562	NC_011978	T	6	6	1513589	1513594	0 %	100 %	0 %	0 %	222100525
31563	NC_011978	TCA	2	6	1513612	1513617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100525
31564	NC_011978	AAGA	2	8	1513618	1513625	75 %	0 %	25 %	0 %	222100525
31565	NC_011978	CG	3	6	1513702	1513707	0 %	0 %	50 %	50 %	222100525
31566	NC_011978	GACC	2	8	1514132	1514139	25 %	0 %	25 %	50 %	222100526
31567	NC_011978	TCT	2	6	1514199	1514204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100526
31568	NC_011978	GTT	2	6	1514205	1514210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100526
31569	NC_011978	CTG	2	6	1514280	1514285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100526
31570	NC_011978	TTC	2	6	1514291	1514296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100526
31571	NC_011978	ACT	2	6	1514360	1514365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100526
31572	NC_011978	CT	3	6	1514406	1514411	0 %	50 %	0 %	50 %	222100526
31573	NC_011978	GAT	2	6	1514420	1514425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100526
31574	NC_011978	TC	3	6	1514427	1514432	0 %	50 %	0 %	50 %	222100526
31575	NC_011978	TCA	2	6	1514466	1514471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100526
31576	NC_011978	CAG	2	6	1514492	1514497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100526
31577	NC_011978	CTT	2	6	1514521	1514526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100526
31578	NC_011978	GAT	2	6	1514531	1514536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100526
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31581	NC_011978	TC	3	6	1514742	1514747	0 %	50 %	0 %	50 %	222100527
31582	NC_011978	TGA	2	6	1514810	1514815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100527
31583	NC_011978	TGG	2	6	1514847	1514852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100527
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31585	NC_011978	CTT	2	6	1514923	1514928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100527
31586	NC_011978	T	6	6	1514927	1514932	0 %	100 %	0 %	0 %	222100527
31587	NC_011978	AAG	2	6	1514935	1514940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100527
31588	NC_011978	TAT	2	6	1514959	1514964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100527
31589	NC_011978	GGA	2	6	1515051	1515056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100527
31590	NC_011978	GAG	2	6	1515217	1515222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100527
31591	NC_011978	AGA	2	6	1515237	1515242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100527
31592	NC_011978	GTG	2	6	1515340	1515345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100527
31593	NC_011978	ATC	2	6	1515346	1515351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100527
31594	NC_011978	TAC	2	6	1515391	1515396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100527
31595	NC_011978	GC	3	6	1515420	1515425	0 %	0 %	50 %	50 %	222100527
31596	NC_011978	GAAA	2	8	1515441	1515448	75 %	0 %	25 %	0 %	222100527
31597	NC_011978	TAC	2	6	1515463	1515468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100527
31598	NC_011978	TAT	2	6	1515760	1515765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100527
31599	NC_011978	AAAC	2	8	1515791	1515798	75 %	0 %	0 %	25 %	222100527
31600	NC_011978	TAA	2	6	1515824	1515829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100527
31601	NC_011978	CAG	2	6	1515903	1515908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100527
31602	NC_011978	GAA	2	6	1515968	1515973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100527
31603	NC_011978	TAC	3	9	1515988	1515996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100527
31604	NC_011978	AGC	2	6	1516080	1516085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100527
31605	NC_011978	TCT	2	6	1516149	1516154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100527
31606	NC_011978	GAA	2	6	1516156	1516161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100527
31607	NC_011978	AGG	2	6	1516208	1516213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100527
31608	NC_011978	GAAA	2	8	1516237	1516244	75 %	0 %	25 %	0 %	222100527
31609	NC_011978	TGC	2	6	1516296	1516301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100527
31610	NC_011978	TG	3	6	1516327	1516332	0 %	50 %	50 %	0 %	222100527
31611	NC_011978	GAT	2	6	1516351	1516356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100527
31612	NC_011978	AGA	2	6	1516401	1516406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100527
31613	NC_011978	GTC	2	6	1516408	1516413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100527
31614	NC_011978	ATA	2	6	1516471	1516476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100527
31615	NC_011978	AGA	2	6	1516515	1516520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100527
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31617	NC_011978	AGA	2	6	1516584	1516589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100527
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