MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_011978	CGT	2	6	1438566	1438571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100446
30002	NC_011978	TCCTC	2	10	1438578	1438587	0 %	40 %	0 %	60 %	222100446
30003	NC_011978	TCA	2	6	1438680	1438685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100447
30004	NC_011978	CCT	2	6	1438722	1438727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100447
30005	NC_011978	CT	3	6	1438763	1438768	0 %	50 %	0 %	50 %	222100447
30006	NC_011978	TC	4	8	1438773	1438780	0 %	50 %	0 %	50 %	222100447
30007	NC_011978	CCT	2	6	1438781	1438786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100447
30008	NC_011978	TC	3	6	1438794	1438799	0 %	50 %	0 %	50 %	222100447
30009	NC_011978	AGA	2	6	1438894	1438899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100447
30010	NC_011978	CT	3	6	1438924	1438929	0 %	50 %	0 %	50 %	222100447
30011	NC_011978	GAC	2	6	1438946	1438951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100447
30012	NC_011978	AGA	2	6	1439056	1439061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100447
30013	NC_011978	T	7	7	1439070	1439076	0 %	100 %	0 %	0 %	222100447
30014	NC_011978	GAAA	2	8	1439088	1439095	75 %	0 %	25 %	0 %	222100447
30015	NC_011978	A	6	6	1439093	1439098	100 %	0 %	0 %	0 %	222100447
30016	NC_011978	AG	4	8	1439166	1439173	50 %	0 %	50 %	0 %	222100447
30017	NC_011978	CAT	2	6	1439186	1439191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100447
30018	NC_011978	GGA	2	6	1439289	1439294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100448
30019	NC_011978	TCA	2	6	1439373	1439378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100448
30020	NC_011978	GGA	2	6	1439402	1439407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100448
30021	NC_011978	CAC	2	6	1439617	1439622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100448
30022	NC_011978	AAG	2	6	1439696	1439701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100448
30023	NC_011978	AAC	2	6	1439788	1439793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100448
30024	NC_011978	TCA	2	6	1439808	1439813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100448
30025	NC_011978	TGA	2	6	1439940	1439945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100448
30026	NC_011978	TCC	2	6	1440179	1440184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100448
30027	NC_011978	TTTC	2	8	1440228	1440235	0 %	75 %	0 %	25 %	222100448
30028	NC_011978	TCCA	2	8	1440266	1440273	25 %	25 %	0 %	50 %	222100448
30029	NC_011978	CCA	2	6	1440281	1440286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100448
30030	NC_011978	TCC	2	6	1440323	1440328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100448
30031	NC_011978	CTT	2	6	1440370	1440375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100448
30032	NC_011978	TCC	2	6	1440466	1440471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100448
30033	NC_011978	CTT	2	6	1440717	1440722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100449
30034	NC_011978	GCT	2	6	1440730	1440735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100449
30035	NC_011978	TCA	2	6	1440753	1440758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100449
30036	NC_011978	CT	3	6	1440764	1440769	0 %	50 %	0 %	50 %	222100449
30037	NC_011978	AAG	2	6	1440781	1440786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100449
30038	NC_011978	T	6	6	1440820	1440825	0 %	100 %	0 %	0 %	222100449
30039	NC_011978	GTA	2	6	1440874	1440879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100449
30040	NC_011978	GTT	2	6	1440934	1440939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100449
30041	NC_011978	CCA	2	6	1440945	1440950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100449
30042	NC_011978	GAA	2	6	1440955	1440960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100449
30043	NC_011978	TGC	2	6	1440967	1440972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100449
30044	NC_011978	TGA	2	6	1441008	1441013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100449
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30048	NC_011978	GCT	2	6	1441124	1441129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100449
30049	NC_011978	ATG	2	6	1441150	1441155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100449
30050	NC_011978	CCT	2	6	1441192	1441197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100449
30051	NC_011978	TCT	3	9	1441274	1441282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100449
30052	NC_011978	ACG	2	6	1441413	1441418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100449
30053	NC_011978	GT	3	6	1441434	1441439	0 %	50 %	50 %	0 %	222100449
30054	NC_011978	GGA	2	6	1441447	1441452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100449
30055	NC_011978	TCGA	2	8	1441459	1441466	25 %	25 %	25 %	25 %	222100449
30056	NC_011978	GAA	2	6	1441480	1441485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100449
30057	NC_011978	CA	3	6	1441505	1441510	50 %	0 %	0 %	50 %	222100449
30058	NC_011978	ACC	2	6	1441579	1441584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100449
30059	NC_011978	TC	3	6	1441683	1441688	0 %	50 %	0 %	50 %	222100449
30060	NC_011978	CGT	2	6	1441695	1441700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100449
30061	NC_011978	TC	3	6	1441830	1441835	0 %	50 %	0 %	50 %	222100449
30062	NC_011978	GA	3	6	1441895	1441900	50 %	0 %	50 %	0 %	222100449
30063	NC_011978	AAG	2	6	1441901	1441906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100449
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30065	NC_011978	TTC	3	9	1441997	1442005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100449
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30067	NC_011978	TCCT	2	8	1442054	1442061	0 %	50 %	0 %	50 %	222100449
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30073	NC_011978	CT	3	6	1442424	1442429	0 %	50 %	0 %	50 %	222100450
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30103	NC_011978	CTTT	2	8	1443760	1443767	0 %	75 %	0 %	25 %	222100452
30104	NC_011978	CTT	2	6	1443793	1443798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100452
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30106	NC_011978	TC	3	6	1443890	1443895	0 %	50 %	0 %	50 %	222100452
30107	NC_011978	TCC	2	6	1443899	1443904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100452
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30109	NC_011978	TACC	2	8	1443960	1443967	25 %	25 %	0 %	50 %	222100452
30110	NC_011978	GTA	2	6	1444031	1444036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100452
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30112	NC_011978	GTA	2	6	1444262	1444267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100452
30113	NC_011978	TC	3	6	1444269	1444274	0 %	50 %	0 %	50 %	222100452
30114	NC_011978	TGG	2	6	1444434	1444439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100452
30115	NC_011978	GTA	3	9	1444493	1444501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100452
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30118	NC_011978	TCC	2	6	1444698	1444703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100452
30119	NC_011978	CTC	2	6	1444828	1444833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100453
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30130	NC_011978	CAT	2	6	1445275	1445280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100453
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30232	NC_011978	T	6	6	1449916	1449921	0 %	100 %	0 %	0 %	222100458
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30235	NC_011978	AGA	2	6	1449999	1450004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100458
30236	NC_011978	GAT	2	6	1450074	1450079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100458
30237	NC_011978	AGGA	2	8	1450121	1450128	50 %	0 %	50 %	0 %	222100458
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30350	NC_011978	CT	3	6	1454867	1454872	0 %	50 %	0 %	50 %	222100463
30351	NC_011978	CA	3	6	1454906	1454911	50 %	0 %	0 %	50 %	222100463
30352	NC_011978	TTC	2	6	1454930	1454935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100463
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30465	NC_011978	TC	3	6	1460354	1460359	0 %	50 %	0 %	50 %	222100469
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30469	NC_011978	GGA	2	6	1460556	1460561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100469
30470	NC_011978	TTTC	2	8	1460608	1460615	0 %	75 %	0 %	25 %	222100469
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30491	NC_011978	TTC	2	6	1461655	1461660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100470
30492	NC_011978	TCG	2	6	1461709	1461714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100470
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30496	NC_011978	TTC	2	6	1461838	1461843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100470
30497	NC_011978	CCAC	2	8	1461850	1461857	25 %	0 %	0 %	75 %	222100470
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30499	NC_011978	C	6	6	1461967	1461972	0 %	0 %	0 %	100 %	222100470
30500	NC_011978	CTGTC	2	10	1461981	1461990	0 %	40 %	20 %	40 %	222100470

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