MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_011978	TGA	2	6	1225770	1225775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100242
25503	NC_011978	CAA	2	6	1225842	1225847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100242
25504	NC_011978	CCA	2	6	1225899	1225904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100242
25505	NC_011978	GTTA	2	8	1225939	1225946	25 %	50 %	25 %	0 %	222100242
25506	NC_011978	TTCGA	2	10	1225976	1225985	20 %	40 %	20 %	20 %	222100242
25507	NC_011978	CCG	2	6	1225998	1226003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100242
25508	NC_011978	ATT	2	6	1226075	1226080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100242
25509	NC_011978	AG	3	6	1226112	1226117	50 %	0 %	50 %	0 %	222100242
25510	NC_011978	GAA	2	6	1226139	1226144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100242
25511	NC_011978	TA	3	6	1226239	1226244	50 %	50 %	0 %	0 %	222100242
25512	NC_011978	CAT	2	6	1226250	1226255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100242
25513	NC_011978	TTA	2	6	1226268	1226273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100242
25514	NC_011978	TC	3	6	1226274	1226279	0 %	50 %	0 %	50 %	222100242
25515	NC_011978	GTT	2	6	1226365	1226370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100242
25516	NC_011978	AAT	2	6	1226404	1226409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100242
25517	NC_011978	ACA	2	6	1226433	1226438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100242
25518	NC_011978	A	6	6	1226525	1226530	100 %	0 %	0 %	0 %	222100242
25519	NC_011978	TTC	2	6	1226579	1226584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100242
25520	NC_011978	TCC	2	6	1226623	1226628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100242
25521	NC_011978	ATTC	2	8	1226631	1226638	25 %	50 %	0 %	25 %	222100242
25522	NC_011978	CTC	2	6	1226690	1226695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100243
25523	NC_011978	TCCG	2	8	1226716	1226723	0 %	25 %	25 %	50 %	222100243
25524	NC_011978	TG	3	6	1226770	1226775	0 %	50 %	50 %	0 %	222100243
25525	NC_011978	GAT	2	6	1226777	1226782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100243
25526	NC_011978	TCCTC	2	10	1226821	1226830	0 %	40 %	0 %	60 %	222100243
25527	NC_011978	CT	3	6	1226946	1226951	0 %	50 %	0 %	50 %	222100243
25528	NC_011978	CAA	2	6	1226986	1226991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100243
25529	NC_011978	TCACAC	2	12	1226994	1227005	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222100243
25530	NC_011978	TCT	2	6	1227030	1227035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100243
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25532	NC_011978	TTG	2	6	1227070	1227075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100243
25533	NC_011978	TCT	2	6	1227116	1227121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100243
25534	NC_011978	AG	3	6	1227132	1227137	50 %	0 %	50 %	0 %	222100243
25535	NC_011978	CGT	2	6	1227304	1227309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100243
25536	NC_011978	AGA	2	6	1227534	1227539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100243
25537	NC_011978	TTCC	2	8	1227715	1227722	0 %	50 %	0 %	50 %	222100243
25538	NC_011978	TC	3	6	1227768	1227773	0 %	50 %	0 %	50 %	222100243
25539	NC_011978	TGA	2	6	1227784	1227789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100243
25540	NC_011978	A	6	6	1227818	1227823	100 %	0 %	0 %	0 %	222100243
25541	NC_011978	GAA	2	6	1227911	1227916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100243
25542	NC_011978	AGT	2	6	1228096	1228101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100243
25543	NC_011978	ATG	2	6	1228113	1228118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100243
25544	NC_011978	TGA	2	6	1228213	1228218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100243
25545	NC_011978	TGG	2	6	1228237	1228242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100243
25546	NC_011978	AAG	2	6	1228263	1228268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100243
25547	NC_011978	T	6	6	1228283	1228288	0 %	100 %	0 %	0 %	222100243
25548	NC_011978	AAG	2	6	1228338	1228343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100243
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25550	NC_011978	TAA	2	6	1228387	1228392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100244
25551	NC_011978	TAT	2	6	1228423	1228428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100244
25552	NC_011978	AAT	2	6	1228547	1228552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100244
25553	NC_011978	T	6	6	1228593	1228598	0 %	100 %	0 %	0 %	222100244
25554	NC_011978	ACA	2	6	1228613	1228618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100244
25555	NC_011978	CAG	2	6	1228704	1228709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100244
25556	NC_011978	AGA	2	6	1228738	1228743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100244
25557	NC_011978	TCA	2	6	1228764	1228769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100244
25558	NC_011978	CAG	2	6	1228780	1228785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100244
25559	NC_011978	T	6	6	1228821	1228826	0 %	100 %	0 %	0 %	222100244
25560	NC_011978	TAT	2	6	1228840	1228845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100244
25561	NC_011978	ATA	2	6	1228849	1228854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100244
25562	NC_011978	GA	3	6	1228920	1228925	50 %	0 %	50 %	0 %	222100244
25563	NC_011978	GCA	2	6	1228937	1228942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100244
25564	NC_011978	TAT	2	6	1229115	1229120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100244
25565	NC_011978	TTTC	2	8	1229127	1229134	0 %	75 %	0 %	25 %	222100244
25566	NC_011978	AAC	2	6	1229149	1229154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100244
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25570	NC_011978	TCT	2	6	1229303	1229308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100244
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25577	NC_011978	TAT	2	6	1229688	1229693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100244
25578	NC_011978	GAG	2	6	1229697	1229702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100244
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25584	NC_011978	C	6	6	1230195	1230200	0 %	0 %	0 %	100 %	222100245
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25587	NC_011978	AGAT	2	8	1230545	1230552	50 %	25 %	25 %	0 %	222100246
25588	NC_011978	TCT	2	6	1230594	1230599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100246
25589	NC_011978	AGGA	2	8	1230641	1230648	50 %	0 %	50 %	0 %	222100246
25590	NC_011978	TCA	2	6	1230792	1230797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100246
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25598	NC_011978	TC	3	6	1231231	1231236	0 %	50 %	0 %	50 %	222100246
25599	NC_011978	GAA	2	6	1231250	1231255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100246
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25601	NC_011978	GA	3	6	1231349	1231354	50 %	0 %	50 %	0 %	222100246
25602	NC_011978	TCC	3	9	1231404	1231412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100246
25603	NC_011978	TTA	2	6	1231414	1231419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100246
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25605	NC_011978	GA	4	8	1231467	1231474	50 %	0 %	50 %	0 %	222100246
25606	NC_011978	GGA	2	6	1231491	1231496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100246
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25609	NC_011978	AC	3	6	1231580	1231585	50 %	0 %	0 %	50 %	222100246
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25615	NC_011978	AAAG	2	8	1231724	1231731	75 %	0 %	25 %	0 %	222100246
25616	NC_011978	CTT	2	6	1231786	1231791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100246
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25972	NC_011978	CCT	2	6	1250206	1250211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100266
25973	NC_011978	TTC	2	6	1250220	1250225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100266
25974	NC_011978	TGT	2	6	1250233	1250238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100266
25975	NC_011978	ATC	2	6	1250352	1250357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100266
25976	NC_011978	GAAGG	2	10	1250365	1250374	40 %	0 %	60 %	0 %	222100266
25977	NC_011978	GAA	2	6	1250384	1250389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100266
25978	NC_011978	GTG	2	6	1250416	1250421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100266
25979	NC_011978	CGA	2	6	1250449	1250454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100266
25980	NC_011978	GA	3	6	1250492	1250497	50 %	0 %	50 %	0 %	222100266
25981	NC_011978	AGA	2	6	1250589	1250594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100266
25982	NC_011978	GTC	2	6	1250645	1250650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100266
25983	NC_011978	CGG	2	6	1250674	1250679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100266
25984	NC_011978	AG	3	6	1250732	1250737	50 %	0 %	50 %	0 %	222100266
25985	NC_011978	CCT	2	6	1250739	1250744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100266
25986	NC_011978	GTC	2	6	1250816	1250821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100266
25987	NC_011978	TTC	2	6	1250845	1250850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100266
25988	NC_011978	CGT	2	6	1250851	1250856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100266
25989	NC_011978	GTCGAA	2	12	1250858	1250869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222100266
25990	NC_011978	GAA	2	6	1250945	1250950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100266
25991	NC_011978	TCT	2	6	1250974	1250979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100266
25992	NC_011978	TGCTC	2	10	1251216	1251225	0 %	40 %	20 %	40 %	222100267
25993	NC_011978	GT	3	6	1251240	1251245	0 %	50 %	50 %	0 %	222100267
25994	NC_011978	GAG	2	6	1251251	1251256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100267
25995	NC_011978	TCGA	2	8	1251271	1251278	25 %	25 %	25 %	25 %	222100267
25996	NC_011978	TCTT	2	8	1251364	1251371	0 %	75 %	0 %	25 %	222100267
25997	NC_011978	CTT	2	6	1251450	1251455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100267
25998	NC_011978	TTC	2	6	1251469	1251474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100267
25999	NC_011978	AGGTG	2	10	1251491	1251500	20 %	20 %	60 %	0 %	222100267
26000	NC_011978	TCA	2	6	1251554	1251559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100267

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