MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_011978	GCGG	2	8	1200976	1200983	0 %	0 %	75 %	25 %	222100214
25002	NC_011978	AGG	2	6	1201005	1201010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100214
25003	NC_011978	TTC	2	6	1201019	1201024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100214
25004	NC_011978	AGA	2	6	1201051	1201056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100214
25005	NC_011978	CT	3	6	1201075	1201080	0 %	50 %	0 %	50 %	222100214
25006	NC_011978	AAG	2	6	1201136	1201141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100214
25007	NC_011978	G	6	6	1201288	1201293	0 %	0 %	100 %	0 %	222100214
25008	NC_011978	AGA	2	6	1201381	1201386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100215
25009	NC_011978	TTCGA	2	10	1201475	1201484	20 %	40 %	20 %	20 %	222100215
25010	NC_011978	TGG	2	6	1201554	1201559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100215
25011	NC_011978	CCAG	2	8	1201590	1201597	25 %	0 %	25 %	50 %	222100215
25012	NC_011978	CAA	2	6	1201716	1201721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100215
25013	NC_011978	CT	3	6	1201738	1201743	0 %	50 %	0 %	50 %	222100215
25014	NC_011978	CA	4	8	1201827	1201834	50 %	0 %	0 %	50 %	222100215
25015	NC_011978	A	6	6	1201859	1201864	100 %	0 %	0 %	0 %	222100215
25016	NC_011978	TTC	2	6	1201883	1201888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100215
25017	NC_011978	GTG	2	6	1201906	1201911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100215
25018	NC_011978	A	6	6	1201957	1201962	100 %	0 %	0 %	0 %	222100215
25019	NC_011978	TGG	2	6	1202036	1202041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100215
25020	NC_011978	GGGA	2	8	1202062	1202069	25 %	0 %	75 %	0 %	222100215
25021	NC_011978	AGA	2	6	1202087	1202092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100216
25022	NC_011978	TTC	3	9	1202111	1202119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100216
25023	NC_011978	TCA	2	6	1202181	1202186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100216
25024	NC_011978	GAT	3	9	1202188	1202196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100216
25025	NC_011978	TGT	2	6	1202283	1202288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100216
25026	NC_011978	CT	4	8	1202308	1202315	0 %	50 %	0 %	50 %	222100216
25027	NC_011978	TCC	2	6	1202326	1202331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100216
25028	NC_011978	GA	3	6	1202395	1202400	50 %	0 %	50 %	0 %	222100216
25029	NC_011978	TCT	2	6	1202487	1202492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100216
25030	NC_011978	ACC	2	6	1202501	1202506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100216
25031	NC_011978	ACC	2	6	1202522	1202527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100216
25032	NC_011978	GTG	3	9	1202528	1202536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100216
25033	NC_011978	TCT	2	6	1202565	1202570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100216
25034	NC_011978	ACGT	2	8	1202571	1202578	25 %	25 %	25 %	25 %	222100216
25035	NC_011978	TTC	2	6	1202591	1202596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100216
25036	NC_011978	AG	3	6	1202621	1202626	50 %	0 %	50 %	0 %	222100216
25037	NC_011978	TCA	2	6	1202700	1202705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100216
25038	NC_011978	CAT	2	6	1202758	1202763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100216
25039	NC_011978	GCC	2	6	1202903	1202908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100216
25040	NC_011978	TGA	2	6	1202928	1202933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100216
25041	NC_011978	TCT	2	6	1202979	1202984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100216
25042	NC_011978	TTC	2	6	1203038	1203043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100216
25043	NC_011978	TCT	2	6	1203048	1203053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100216
25044	NC_011978	A	6	6	1203056	1203061	100 %	0 %	0 %	0 %	222100216
25045	NC_011978	GGA	2	6	1203100	1203105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100217
25046	NC_011978	T	6	6	1203114	1203119	0 %	100 %	0 %	0 %	222100217
25047	NC_011978	TTTC	2	8	1203123	1203130	0 %	75 %	0 %	25 %	222100217
25048	NC_011978	TTC	2	6	1203136	1203141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100217
25049	NC_011978	TC	3	6	1203150	1203155	0 %	50 %	0 %	50 %	222100217
25050	NC_011978	A	7	7	1203275	1203281	100 %	0 %	0 %	0 %	222100217
25051	NC_011978	AGA	2	6	1203311	1203316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100217
25052	NC_011978	GAA	2	6	1203347	1203352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100217
25053	NC_011978	AGA	2	6	1203374	1203379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100217
25054	NC_011978	TCT	2	6	1203389	1203394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100217
25055	NC_011978	AG	3	6	1203397	1203402	50 %	0 %	50 %	0 %	222100217
25056	NC_011978	AAG	2	6	1203428	1203433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100217
25057	NC_011978	TTC	2	6	1203468	1203473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100217
25058	NC_011978	AGA	2	6	1203521	1203526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100217
25059	NC_011978	TCA	2	6	1203529	1203534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100217
25060	NC_011978	CT	3	6	1203583	1203588	0 %	50 %	0 %	50 %	222100217
25061	NC_011978	AGA	2	6	1203605	1203610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100217
25062	NC_011978	AGA	2	6	1203631	1203636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100217
25063	NC_011978	GGA	3	9	1203731	1203739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100217
25064	NC_011978	TTC	2	6	1203776	1203781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100217
25065	NC_011978	CT	3	6	1203783	1203788	0 %	50 %	0 %	50 %	222100217
25066	NC_011978	AGAA	2	8	1203852	1203859	75 %	0 %	25 %	0 %	222100217
25067	NC_011978	GAAAG	2	10	1203879	1203888	60 %	0 %	40 %	0 %	222100217
25068	NC_011978	T	7	7	1203940	1203946	0 %	100 %	0 %	0 %	222100217
25069	NC_011978	A	7	7	1203996	1204002	100 %	0 %	0 %	0 %	222100217
25070	NC_011978	AGC	2	6	1204004	1204009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100217
25071	NC_011978	GCT	2	6	1204025	1204030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100217
25072	NC_011978	AGA	2	6	1204033	1204038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100217
25073	NC_011978	GAA	2	6	1204083	1204088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100217
25074	NC_011978	GCAT	2	8	1204093	1204100	25 %	25 %	25 %	25 %	222100217
25075	NC_011978	GAA	2	6	1204113	1204118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100217
25076	NC_011978	CT	3	6	1204137	1204142	0 %	50 %	0 %	50 %	222100217
25077	NC_011978	AGT	2	6	1204156	1204161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100218
25078	NC_011978	CTT	2	6	1204168	1204173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100218
25079	NC_011978	ATG	3	9	1204179	1204187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100218
25080	NC_011978	TGA	2	6	1204228	1204233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100218
25081	NC_011978	CAC	2	6	1204316	1204321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100218
25082	NC_011978	GAAC	2	8	1204369	1204376	50 %	0 %	25 %	25 %	222100218
25083	NC_011978	TTC	2	6	1204462	1204467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100218
25084	NC_011978	GCC	2	6	1204545	1204550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222100218
25085	NC_011978	TCC	2	6	1204583	1204588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100218
25086	NC_011978	ATG	2	6	1204638	1204643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100218
25087	NC_011978	CAA	2	6	1204672	1204677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100218
25088	NC_011978	TCCAAC	2	12	1204703	1204714	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222100218
25089	NC_011978	ATC	2	6	1204812	1204817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100218
25090	NC_011978	CT	3	6	1204834	1204839	0 %	50 %	0 %	50 %	222100218
25091	NC_011978	GAC	2	6	1204865	1204870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100218
25092	NC_011978	CT	3	6	1204903	1204908	0 %	50 %	0 %	50 %	222100218
25093	NC_011978	CGG	2	6	1204933	1204938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100218
25094	NC_011978	GAG	2	6	1204946	1204951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100218
25095	NC_011978	TCA	2	6	1205143	1205148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100218
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25097	NC_011978	AG	3	6	1205165	1205170	50 %	0 %	50 %	0 %	222100218
25098	NC_011978	TTTC	2	8	1205172	1205179	0 %	75 %	0 %	25 %	222100218
25099	NC_011978	CGA	2	6	1205209	1205214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100218
25100	NC_011978	GAT	2	6	1205321	1205326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100218
25101	NC_011978	TTC	2	6	1205369	1205374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100218
25102	NC_011978	GA	3	6	1205377	1205382	50 %	0 %	50 %	0 %	222100218
25103	NC_011978	TCC	2	6	1205405	1205410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100218
25104	NC_011978	CT	3	6	1205411	1205416	0 %	50 %	0 %	50 %	222100218
25105	NC_011978	CGT	2	6	1205563	1205568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100218
25106	NC_011978	TCA	2	6	1205587	1205592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100218
25107	NC_011978	CTC	2	6	1205598	1205603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100218
25108	NC_011978	AC	3	6	1205658	1205663	50 %	0 %	0 %	50 %	222100219
25109	NC_011978	CT	3	6	1205694	1205699	0 %	50 %	0 %	50 %	222100219
25110	NC_011978	TCT	2	6	1205741	1205746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100219
25111	NC_011978	TG	3	6	1205763	1205768	0 %	50 %	50 %	0 %	222100219
25112	NC_011978	TCA	2	6	1205790	1205795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100219
25113	NC_011978	ATC	2	6	1205816	1205821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100219
25114	NC_011978	CTG	2	6	1205879	1205884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100219
25115	NC_011978	GA	3	6	1205885	1205890	50 %	0 %	50 %	0 %	222100219
25116	NC_011978	GAA	2	6	1205908	1205913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100219
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25118	NC_011978	AGC	2	6	1205938	1205943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100219
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25231	NC_011978	GAA	3	9	1212280	1212288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100225
25232	NC_011978	TGAA	2	8	1212314	1212321	50 %	25 %	25 %	0 %	222100225
25233	NC_011978	T	6	6	1212608	1212613	0 %	100 %	0 %	0 %	222100226
25234	NC_011978	CCA	2	6	1212633	1212638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100226
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25352	NC_011978	TTG	2	6	1217945	1217950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100234
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25355	NC_011978	TGC	2	6	1218174	1218179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100234
25356	NC_011978	CAC	2	6	1218187	1218192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100234
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25363	NC_011978	TTG	2	6	1218557	1218562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100234
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25471	NC_011978	A	6	6	1224230	1224235	100 %	0 %	0 %	0 %	222100240
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25473	NC_011978	TGC	2	6	1224263	1224268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100240
25474	NC_011978	GAA	2	6	1224298	1224303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100240
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