MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_011978	AAG	2	6	1178541	1178546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100190
24502	NC_011978	TGA	2	6	1178552	1178557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100190
24503	NC_011978	TGT	2	6	1178603	1178608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100190
24504	NC_011978	TCC	2	6	1178622	1178627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100190
24505	NC_011978	GAA	2	6	1178640	1178645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100190
24506	NC_011978	ACC	2	6	1178707	1178712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100190
24507	NC_011978	ACC	2	6	1178728	1178733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100190
24508	NC_011978	ACG	2	6	1178744	1178749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100190
24509	NC_011978	TTC	2	6	1178821	1178826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100190
24510	NC_011978	GGC	2	6	1178856	1178861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100190
24511	NC_011978	CT	3	6	1178871	1178876	0 %	50 %	0 %	50 %	222100190
24512	NC_011978	AGG	2	6	1178887	1178892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100190
24513	NC_011978	TTC	2	6	1178897	1178902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100190
24514	NC_011978	TCT	2	6	1178911	1178916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100190
24515	NC_011978	CAT	2	6	1178988	1178993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100190
24516	NC_011978	AGATC	2	10	1179143	1179152	40 %	20 %	20 %	20 %	222100190
24517	NC_011978	TGTAGA	2	12	1179287	1179298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100190
24518	NC_011978	AAG	3	9	1179345	1179353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100190
24519	NC_011978	CAG	2	6	1179561	1179566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100191
24520	NC_011978	TCCACA	2	12	1179586	1179597	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222100191
24521	NC_011978	CAG	2	6	1179661	1179666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100191
24522	NC_011978	AAAG	2	8	1179679	1179686	75 %	0 %	25 %	0 %	222100191
24523	NC_011978	TCT	2	6	1179709	1179714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100191
24524	NC_011978	TCA	2	6	1179746	1179751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100191
24525	NC_011978	CTC	2	6	1179837	1179842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100191
24526	NC_011978	CT	3	6	1179849	1179854	0 %	50 %	0 %	50 %	222100191
24527	NC_011978	TCT	2	6	1179910	1179915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100191
24528	NC_011978	CTT	2	6	1179926	1179931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100191
24529	NC_011978	T	6	6	1179930	1179935	0 %	100 %	0 %	0 %	222100191
24530	NC_011978	T	6	6	1180027	1180032	0 %	100 %	0 %	0 %	222100191
24531	NC_011978	ATCT	2	8	1180135	1180142	25 %	50 %	0 %	25 %	222100191
24532	NC_011978	GGT	3	9	1180174	1180182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100192
24533	NC_011978	TTCT	2	8	1180194	1180201	0 %	75 %	0 %	25 %	222100192
24534	NC_011978	TTC	2	6	1180203	1180208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100192
24535	NC_011978	TGC	2	6	1180210	1180215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100192
24536	NC_011978	A	6	6	1180326	1180331	100 %	0 %	0 %	0 %	222100192
24537	NC_011978	TC	3	6	1180342	1180347	0 %	50 %	0 %	50 %	222100192
24538	NC_011978	GGGA	2	8	1180395	1180402	25 %	0 %	75 %	0 %	222100192
24539	NC_011978	CTC	2	6	1180471	1180476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100192
24540	NC_011978	CAT	2	6	1180570	1180575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100192
24541	NC_011978	AGG	2	6	1180632	1180637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100192
24542	NC_011978	AGA	2	6	1180699	1180704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100192
24543	NC_011978	AC	3	6	1180725	1180730	50 %	0 %	0 %	50 %	222100192
24544	NC_011978	GA	3	6	1180734	1180739	50 %	0 %	50 %	0 %	222100192
24545	NC_011978	GA	3	6	1180743	1180748	50 %	0 %	50 %	0 %	222100192
24546	NC_011978	CAT	2	6	1180774	1180779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100192
24547	NC_011978	TGA	2	6	1180788	1180793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100192
24548	NC_011978	ACG	2	6	1180809	1180814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100192
24549	NC_011978	GAG	2	6	1180847	1180852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100192
24550	NC_011978	AGG	2	6	1180869	1180874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100192
24551	NC_011978	AG	3	6	1180958	1180963	50 %	0 %	50 %	0 %	222100192
24552	NC_011978	AAG	2	6	1180967	1180972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100192
24553	NC_011978	GAAA	2	8	1180990	1180997	75 %	0 %	25 %	0 %	222100192
24554	NC_011978	CGT	2	6	1181023	1181028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100192
24555	NC_011978	GAA	2	6	1181036	1181041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100192
24556	NC_011978	AAG	2	6	1181046	1181051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100192
24557	NC_011978	TCT	2	6	1181114	1181119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100192
24558	NC_011978	CTT	2	6	1181174	1181179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100193
24559	NC_011978	AAG	2	6	1181196	1181201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100193
24560	NC_011978	TCG	2	6	1181269	1181274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100193
24561	NC_011978	T	6	6	1181294	1181299	0 %	100 %	0 %	0 %	222100193
24562	NC_011978	CTT	2	6	1181303	1181308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100193
24563	NC_011978	ATC	2	6	1181356	1181361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100193
24564	NC_011978	AAG	2	6	1181363	1181368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100193
24565	NC_011978	CTGA	2	8	1181376	1181383	25 %	25 %	25 %	25 %	222100193
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24567	NC_011978	CTT	2	6	1181480	1181485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100193
24568	NC_011978	ACG	2	6	1181488	1181493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100193
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24570	NC_011978	ATC	2	6	1181560	1181565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100193
24571	NC_011978	CTT	2	6	1181585	1181590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100194
24572	NC_011978	TCT	2	6	1181616	1181621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100194
24573	NC_011978	GCTC	2	8	1181642	1181649	0 %	25 %	25 %	50 %	222100194
24574	NC_011978	TCA	2	6	1181698	1181703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100194
24575	NC_011978	CTT	2	6	1181727	1181732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100194
24576	NC_011978	TTC	2	6	1181867	1181872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100194
24577	NC_011978	CAC	2	6	1181909	1181914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100194
24578	NC_011978	CCT	2	6	1181947	1181952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100194
24579	NC_011978	CGA	2	6	1181959	1181964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100194
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24582	NC_011978	TTCC	3	12	1182089	1182100	0 %	50 %	0 %	50 %	222100194
24583	NC_011978	AG	3	6	1182141	1182146	50 %	0 %	50 %	0 %	222100194
24584	NC_011978	TTTC	2	8	1182169	1182176	0 %	75 %	0 %	25 %	222100194
24585	NC_011978	TTC	2	6	1182251	1182256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100194
24586	NC_011978	GTC	2	6	1182338	1182343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100194
24587	NC_011978	AGA	2	6	1182447	1182452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100194
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24589	NC_011978	GTA	2	6	1182665	1182670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100194
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24591	NC_011978	CTT	2	6	1182741	1182746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100194
24592	NC_011978	ACA	2	6	1182796	1182801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100195
24593	NC_011978	TTC	2	6	1182825	1182830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100195
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24596	NC_011978	ATG	2	6	1182907	1182912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100195
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24598	NC_011978	TCA	2	6	1182928	1182933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100195
24599	NC_011978	AGA	2	6	1182936	1182941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100195
24600	NC_011978	CCAC	2	8	1182980	1182987	25 %	0 %	0 %	75 %	222100195
24601	NC_011978	GA	3	6	1183019	1183024	50 %	0 %	50 %	0 %	222100195
24602	NC_011978	GT	3	6	1183033	1183038	0 %	50 %	50 %	0 %	222100195
24603	NC_011978	CTT	2	6	1183043	1183048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100195
24604	NC_011978	TTC	2	6	1183060	1183065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100195
24605	NC_011978	CCA	2	6	1183118	1183123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100195
24606	NC_011978	CCTT	2	8	1183140	1183147	0 %	50 %	0 %	50 %	222100195
24607	NC_011978	CGTTC	2	10	1183197	1183206	0 %	40 %	20 %	40 %	222100195
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24611	NC_011978	GA	3	6	1183363	1183368	50 %	0 %	50 %	0 %	222100195
24612	NC_011978	TGA	2	6	1183376	1183381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100195
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24614	NC_011978	TCA	2	6	1183415	1183420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100195
24615	NC_011978	TCT	2	6	1183434	1183439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100195
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24617	NC_011978	ACC	2	6	1183480	1183485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222100195
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