MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_011978	TCC	2	6	1107588	1107593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222100109
23003	NC_011978	TG	3	6	1107666	1107671	0 %	50 %	50 %	0 %	222100109
23004	NC_011978	AGA	2	6	1107724	1107729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100109
23005	NC_011978	GGAAG	2	10	1107765	1107774	40 %	0 %	60 %	0 %	222100109
23006	NC_011978	A	6	6	1107778	1107783	100 %	0 %	0 %	0 %	222100109
23007	NC_011978	ATC	2	6	1107805	1107810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100109
23008	NC_011978	TGT	2	6	1107827	1107832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100110
23009	NC_011978	TTC	3	9	1107844	1107852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100110
23010	NC_011978	CCTT	2	8	1107877	1107884	0 %	50 %	0 %	50 %	222100110
23011	NC_011978	CTT	3	9	1107882	1107890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100110
23012	NC_011978	AGA	2	6	1108001	1108006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100110
23013	NC_011978	GTG	2	6	1108053	1108058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100110
23014	NC_011978	AAG	2	6	1108059	1108064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100110
23015	NC_011978	GTGG	2	8	1108085	1108092	0 %	25 %	75 %	0 %	222100110
23016	NC_011978	GGC	2	6	1108124	1108129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100110
23017	NC_011978	TTC	2	6	1108282	1108287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100110
23018	NC_011978	GAC	2	6	1108290	1108295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100110
23019	NC_011978	GAA	2	6	1108316	1108321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100110
23020	NC_011978	AGAT	2	8	1108330	1108337	50 %	25 %	25 %	0 %	222100110
23021	NC_011978	G	6	6	1108341	1108346	0 %	0 %	100 %	0 %	222100110
23022	NC_011978	CT	3	6	1108389	1108394	0 %	50 %	0 %	50 %	222100110
23023	NC_011978	CGA	2	6	1108397	1108402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100110
23024	NC_011978	GAG	2	6	1108429	1108434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100110
23025	NC_011978	TGA	2	6	1108502	1108507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100110
23026	NC_011978	CATCA	2	10	1108596	1108605	40 %	20 %	0 %	40 %	222100110
23027	NC_011978	GGA	2	6	1108661	1108666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100110
23028	NC_011978	CGG	2	6	1108675	1108680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100110
23029	NC_011978	GGGA	2	8	1108713	1108720	25 %	0 %	75 %	0 %	222100110
23030	NC_011978	GGT	2	6	1108730	1108735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100110
23031	NC_011978	GA	4	8	1108821	1108828	50 %	0 %	50 %	0 %	222100110
23032	NC_011978	A	6	6	1108853	1108858	100 %	0 %	0 %	0 %	222100111
23033	NC_011978	TCT	2	6	1108863	1108868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100111
23034	NC_011978	TCGT	2	8	1108903	1108910	0 %	50 %	25 %	25 %	222100111
23035	NC_011978	AGA	2	6	1108998	1109003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100111
23036	NC_011978	TG	3	6	1109080	1109085	0 %	50 %	50 %	0 %	222100111
23037	NC_011978	GT	4	8	1109119	1109126	0 %	50 %	50 %	0 %	222100111
23038	NC_011978	ATA	2	6	1109140	1109145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100111
23039	NC_011978	GCAA	2	8	1109508	1109515	50 %	0 %	25 %	25 %	222100112
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23041	NC_011978	CTG	2	6	1109568	1109573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100112
23042	NC_011978	TGG	2	6	1109584	1109589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100112
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23045	NC_011978	ATT	2	6	1109659	1109664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100112
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23052	NC_011978	GCA	2	6	1109800	1109805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100113
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23055	NC_011978	TAC	2	6	1110052	1110057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100113
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23059	NC_011978	T	6	6	1110144	1110149	0 %	100 %	0 %	0 %	222100113
23060	NC_011978	TGG	2	6	1110205	1110210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222100113
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23089	NC_011978	AGGG	2	8	1111484	1111491	25 %	0 %	75 %	0 %	222100116
23090	NC_011978	TC	3	6	1111496	1111501	0 %	50 %	0 %	50 %	222100116
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23092	NC_011978	CA	3	6	1111526	1111531	50 %	0 %	0 %	50 %	222100116
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23101	NC_011978	GGA	2	6	1111990	1111995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100116
23102	NC_011978	GGAGA	2	10	1112021	1112030	40 %	0 %	60 %	0 %	222100116
23103	NC_011978	GGC	2	6	1112041	1112046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222100116
23104	NC_011978	GAT	3	9	1112080	1112088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100116
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23106	NC_011978	AG	3	6	1112201	1112206	50 %	0 %	50 %	0 %	222100117
23107	NC_011978	ACCC	2	8	1112210	1112217	25 %	0 %	0 %	75 %	222100117
23108	NC_011978	TCGGT	2	10	1112233	1112242	0 %	40 %	40 %	20 %	222100117
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23110	NC_011978	A	6	6	1112298	1112303	100 %	0 %	0 %	0 %	222100117
23111	NC_011978	GGA	2	6	1112351	1112356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100117
23112	NC_011978	GGA	2	6	1112438	1112443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100117
23113	NC_011978	AGC	2	6	1112465	1112470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100117
23114	NC_011978	GAA	2	6	1112673	1112678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100117
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23116	NC_011978	AG	3	6	1112724	1112729	50 %	0 %	50 %	0 %	222100117
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23227	NC_011978	TGA	2	6	1118221	1118226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100125
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23232	NC_011978	GAA	2	6	1118528	1118533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100126
23233	NC_011978	GA	3	6	1118577	1118582	50 %	0 %	50 %	0 %	222100126
23234	NC_011978	TGA	2	6	1118584	1118589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100126
23235	NC_011978	GAT	2	6	1118598	1118603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222100126
23236	NC_011978	AG	4	8	1118696	1118703	50 %	0 %	50 %	0 %	222100126
23237	NC_011978	GA	4	8	1118712	1118719	50 %	0 %	50 %	0 %	222100126
23238	NC_011978	ATC	2	6	1118743	1118748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100126
23239	NC_011978	TGC	2	6	1118797	1118802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100126
23240	NC_011978	AG	3	6	1118843	1118848	50 %	0 %	50 %	0 %	222100126
23241	NC_011978	A	7	7	1118853	1118859	100 %	0 %	0 %	0 %	222100126
23242	NC_011978	GTT	2	6	1118930	1118935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222100126
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23244	NC_011978	TTA	2	6	1119088	1119093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222100127
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23247	NC_011978	ATCC	2	8	1119177	1119184	25 %	25 %	0 %	50 %	222100127
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23264	NC_011978	A	6	6	1119898	1119903	100 %	0 %	0 %	0 %	222100129
23265	NC_011978	GCT	2	6	1119927	1119932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222100129
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23302	NC_011978	GATC	2	8	1121866	1121873	25 %	25 %	25 %	25 %	222100130
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23340	NC_011978	TCA	2	6	1123246	1123251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100131
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23345	NC_011978	ACG	2	6	1123560	1123565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100132
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23349	NC_011978	AG	3	6	1123757	1123762	50 %	0 %	50 %	0 %	222100132
23350	NC_011978	AGA	2	6	1123842	1123847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100132
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23471	NC_011978	AGA	3	9	1129637	1129645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100136
23472	NC_011978	GGA	2	6	1129667	1129672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100136
23473	NC_011978	GAA	2	6	1129700	1129705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100136
23474	NC_011978	ATC	2	6	1129719	1129724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222100136
23475	NC_011978	CAA	2	6	1129745	1129750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222100136
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23479	NC_011978	TAA	2	6	1129916	1129921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222100137
23480	NC_011978	AAG	3	9	1130001	1130009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100137
23481	NC_011978	CA	3	6	1130011	1130016	50 %	0 %	0 %	50 %	222100137
23482	NC_011978	AGA	2	6	1130049	1130054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100137
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23484	NC_011978	CA	4	8	1130160	1130167	50 %	0 %	0 %	50 %	222100137
23485	NC_011978	GCA	2	6	1130208	1130213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100137
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23489	NC_011978	AAG	2	6	1130275	1130280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222100137
23490	NC_011978	CAGAT	2	10	1130335	1130344	40 %	20 %	20 %	20 %	222100137
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23492	NC_011978	TCAT	2	8	1130472	1130479	25 %	50 %	0 %	25 %	222100137
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23494	NC_011978	TTC	2	6	1130566	1130571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100138
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23496	NC_011978	T	7	7	1130591	1130597	0 %	100 %	0 %	0 %	222100138
23497	NC_011978	CGA	2	6	1130619	1130624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222100138
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23499	NC_011978	TTC	2	6	1130856	1130861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222100138
23500	NC_011978	AGG	2	6	1130872	1130877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222100138

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