MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_011978	TCTT	2	8	646400	646407	0 %	75 %	0 %	25 %	222099615
13502	NC_011978	CCATC	2	10	646479	646488	20 %	20 %	0 %	60 %	222099615
13503	NC_011978	CAG	2	6	646531	646536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099615
13504	NC_011978	GT	3	6	646557	646562	0 %	50 %	50 %	0 %	222099615
13505	NC_011978	TGT	2	6	646573	646578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099615
13506	NC_011978	TCA	2	6	646587	646592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099615
13507	NC_011978	TTC	2	6	646677	646682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099615
13508	NC_011978	AGG	2	6	646688	646693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099615
13509	NC_011978	GCT	2	6	646748	646753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099615
13510	NC_011978	CTT	2	6	646767	646772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099615
13511	NC_011978	CCA	2	6	646911	646916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099615
13512	NC_011978	ATG	3	9	646940	646948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099615
13513	NC_011978	CCA	2	6	647004	647009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099615
13514	NC_011978	CT	3	6	647113	647118	0 %	50 %	0 %	50 %	222099615
13515	NC_011978	CAC	2	6	647137	647142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099615
13516	NC_011978	CAA	2	6	647176	647181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099615
13517	NC_011978	AAG	2	6	647239	647244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099615
13518	NC_011978	TGG	2	6	647245	647250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099615
13519	NC_011978	TG	3	6	647253	647258	0 %	50 %	50 %	0 %	222099615
13520	NC_011978	GTA	2	6	647308	647313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099615
13521	NC_011978	CCA	2	6	647316	647321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099615
13522	NC_011978	AC	3	6	647373	647378	50 %	0 %	0 %	50 %	222099615
13523	NC_011978	ACG	2	6	647393	647398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099615
13524	NC_011978	TCA	2	6	647432	647437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099616
13525	NC_011978	T	6	6	647498	647503	0 %	100 %	0 %	0 %	222099616
13526	NC_011978	GAG	2	6	647511	647516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099616
13527	NC_011978	AAG	2	6	647544	647549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099616
13528	NC_011978	A	6	6	647562	647567	100 %	0 %	0 %	0 %	222099616
13529	NC_011978	CAC	2	6	647750	647755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099617
13530	NC_011978	TCT	2	6	647973	647978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099617
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13532	NC_011978	CAC	2	6	648050	648055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099617
13533	NC_011978	GAT	2	6	648185	648190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099617
13534	NC_011978	TTC	2	6	648298	648303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099617
13535	NC_011978	AGAC	2	8	648328	648335	50 %	0 %	25 %	25 %	222099617
13536	NC_011978	AG	3	6	648360	648365	50 %	0 %	50 %	0 %	222099617
13537	NC_011978	GAA	2	6	648401	648406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099617
13538	NC_011978	CTTT	2	8	648483	648490	0 %	75 %	0 %	25 %	222099617
13539	NC_011978	GTC	2	6	648494	648499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099617
13540	NC_011978	TGG	2	6	648508	648513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099617
13541	NC_011978	ATG	2	6	648516	648521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099617
13542	NC_011978	CT	3	6	648633	648638	0 %	50 %	0 %	50 %	222099617
13543	NC_011978	AACA	2	8	648680	648687	75 %	0 %	0 %	25 %	222099617
13544	NC_011978	CCCAC	2	10	648699	648708	20 %	0 %	0 %	80 %	222099617
13545	NC_011978	GA	3	6	648728	648733	50 %	0 %	50 %	0 %	222099617
13546	NC_011978	AGA	2	6	648862	648867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099617
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13548	NC_011978	CTTTC	2	10	648929	648938	0 %	60 %	0 %	40 %	222099617
13549	NC_011978	CTT	2	6	648952	648957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099617
13550	NC_011978	TGAGA	2	10	648992	649001	40 %	20 %	40 %	0 %	222099617
13551	NC_011978	TC	3	6	649016	649021	0 %	50 %	0 %	50 %	222099617
13552	NC_011978	CTCA	2	8	649025	649032	25 %	25 %	0 %	50 %	222099617
13553	NC_011978	CGG	2	6	649270	649275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099617
13554	NC_011978	CGAT	2	8	649320	649327	25 %	25 %	25 %	25 %	222099617
13555	NC_011978	T	7	7	649380	649386	0 %	100 %	0 %	0 %	222099617
13556	NC_011978	CAA	2	6	649453	649458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099617
13557	NC_011978	TCT	2	6	649495	649500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099617
13558	NC_011978	CTT	2	6	649582	649587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099617
13559	NC_011978	T	6	6	649586	649591	0 %	100 %	0 %	0 %	222099617
13560	NC_011978	CAGC	2	8	649677	649684	25 %	0 %	25 %	50 %	222099617
13561	NC_011978	CAT	2	6	649739	649744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099618
13562	NC_011978	CTC	2	6	649750	649755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099618
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13564	NC_011978	TGT	2	6	649808	649813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099618
13565	NC_011978	TCT	2	6	649835	649840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099618
13566	NC_011978	CTT	2	6	649882	649887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099618
13567	NC_011978	TCT	2	6	649921	649926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099618
13568	NC_011978	AAG	3	9	649929	649937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099618
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13570	NC_011978	CTTT	2	8	649982	649989	0 %	75 %	0 %	25 %	222099618
13571	NC_011978	ATCTCT	2	12	650056	650067	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222099618
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13573	NC_011978	AATC	2	8	650356	650363	50 %	25 %	0 %	25 %	222099619
13574	NC_011978	GAG	2	6	650370	650375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099619
13575	NC_011978	TC	3	6	650399	650404	0 %	50 %	0 %	50 %	222099619
13576	NC_011978	CA	3	6	650423	650428	50 %	0 %	0 %	50 %	222099619
13577	NC_011978	GGAA	2	8	650507	650514	50 %	0 %	50 %	0 %	222099619
13578	NC_011978	ACA	2	6	650664	650669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099619
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13581	NC_011978	TTCC	2	8	650704	650711	0 %	50 %	0 %	50 %	222099619
13582	NC_011978	GTC	2	6	650786	650791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099619
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13586	NC_011978	ACC	2	6	651048	651053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099619
13587	NC_011978	CTG	2	6	651063	651068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099619
13588	NC_011978	GATC	2	8	651106	651113	25 %	25 %	25 %	25 %	222099619
13589	NC_011978	TGT	2	6	651149	651154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099619
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13591	NC_011978	TCT	2	6	651170	651175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099619
13592	NC_011978	TCCC	2	8	651320	651327	0 %	25 %	0 %	75 %	222099620
13593	NC_011978	CTTC	2	8	651369	651376	0 %	50 %	0 %	50 %	222099620
13594	NC_011978	TA	3	6	651490	651495	50 %	50 %	0 %	0 %	222099620
13595	NC_011978	T	6	6	651740	651745	0 %	100 %	0 %	0 %	222099621
13596	NC_011978	CAC	2	6	651761	651766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099621
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13599	NC_011978	CCAGAT	2	12	651923	651934	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222099621
13600	NC_011978	TCCAA	2	10	651958	651967	40 %	20 %	0 %	40 %	222099621
13601	NC_011978	GAA	2	6	652012	652017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099621
13602	NC_011978	TCC	2	6	652063	652068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099621
13603	NC_011978	AAC	2	6	652081	652086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099621
13604	NC_011978	CTG	2	6	652088	652093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099621
13605	NC_011978	AGA	2	6	652105	652110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099621
13606	NC_011978	GGT	2	6	652204	652209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099622
13607	NC_011978	CTG	2	6	652232	652237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099622
13608	NC_011978	TTC	2	6	652311	652316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099622
13609	NC_011978	TCA	2	6	652410	652415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099622
13610	NC_011978	CTTTC	2	10	652433	652442	0 %	60 %	0 %	40 %	222099622
13611	NC_011978	CTT	2	6	652496	652501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099622
13612	NC_011978	GTT	2	6	652526	652531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099622
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13614	NC_011978	CAC	2	6	652576	652581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099622
13615	NC_011978	GTC	2	6	652628	652633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099622
13616	NC_011978	TTC	2	6	652653	652658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099622
13617	NC_011978	T	6	6	652674	652679	0 %	100 %	0 %	0 %	222099622
13618	NC_011978	TAC	2	6	652718	652723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099622
13619	NC_011978	CTT	2	6	652724	652729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099622
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13621	NC_011978	AACC	2	8	652795	652802	50 %	0 %	0 %	50 %	222099622
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