MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011978	AAAG	2	8	621235	621242	75 %	0 %	25 %	0 %	222099594
13002	NC_011978	TC	3	6	621302	621307	0 %	50 %	0 %	50 %	222099594
13003	NC_011978	TCT	2	6	621624	621629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099595
13004	NC_011978	ACG	2	6	621681	621686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099595
13005	NC_011978	GCC	2	6	621812	621817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222099595
13006	NC_011978	ATG	2	6	621837	621842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099595
13007	NC_011978	GAA	2	6	621850	621855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099595
13008	NC_011978	GTA	2	6	621878	621883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099595
13009	NC_011978	TCT	2	6	621932	621937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099595
13010	NC_011978	AGA	2	6	622005	622010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099595
13011	NC_011978	TAG	2	6	622071	622076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099595
13012	NC_011978	TCT	2	6	622179	622184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099595
13013	NC_011978	CTG	2	6	622235	622240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099595
13014	NC_011978	ATC	2	6	622278	622283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099595
13015	NC_011978	GAG	2	6	622328	622333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099595
13016	NC_011978	CAT	2	6	622426	622431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099596
13017	NC_011978	GGTT	2	8	622440	622447	0 %	50 %	50 %	0 %	222099596
13018	NC_011978	AGT	2	6	622532	622537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099596
13019	NC_011978	TCG	2	6	622580	622585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099596
13020	NC_011978	AAG	2	6	622599	622604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099596
13021	NC_011978	TCT	2	6	622658	622663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099596
13022	NC_011978	TCC	2	6	622794	622799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099596
13023	NC_011978	CCG	2	6	622808	622813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222099596
13024	NC_011978	CT	3	6	622844	622849	0 %	50 %	0 %	50 %	222099596
13025	NC_011978	TTC	2	6	622903	622908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099596
13026	NC_011978	GTG	2	6	622966	622971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099596
13027	NC_011978	AAG	2	6	623046	623051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099596
13028	NC_011978	TGC	2	6	623055	623060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099596
13029	NC_011978	CCA	2	6	623079	623084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099596
13030	NC_011978	CT	3	6	623138	623143	0 %	50 %	0 %	50 %	222099596
13031	NC_011978	CTG	2	6	623171	623176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099596
13032	NC_011978	TTC	2	6	623227	623232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099596
13033	NC_011978	GTA	2	6	623265	623270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099596
13034	NC_011978	GGC	2	6	623328	623333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099596
13035	NC_011978	TTG	2	6	623383	623388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099596
13036	NC_011978	TGAAG	2	10	623408	623417	40 %	20 %	40 %	0 %	222099596
13037	NC_011978	CA	3	6	623424	623429	50 %	0 %	0 %	50 %	222099596
13038	NC_011978	TCT	2	6	623460	623465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099596
13039	NC_011978	CTG	2	6	623488	623493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099596
13040	NC_011978	ACC	2	6	623574	623579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099596
13041	NC_011978	TGA	2	6	623585	623590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099596
13042	NC_011978	TCT	2	6	623650	623655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099596
13043	NC_011978	CTT	2	6	623656	623661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099596
13044	NC_011978	TCC	2	6	623679	623684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099596
13045	NC_011978	CTG	2	6	623892	623897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099596
13046	NC_011978	GT	3	6	623924	623929	0 %	50 %	50 %	0 %	222099596
13047	NC_011978	CTG	2	6	623963	623968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099596
13048	NC_011978	TGA	2	6	624068	624073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099596
13049	NC_011978	TC	3	6	624074	624079	0 %	50 %	0 %	50 %	222099596
13050	NC_011978	TGG	2	6	624234	624239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099596
13051	NC_011978	AAC	2	6	624273	624278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099596
13052	NC_011978	CTGCT	2	10	624538	624547	0 %	40 %	20 %	40 %	222099597
13053	NC_011978	GT	3	6	624563	624568	0 %	50 %	50 %	0 %	222099597
13054	NC_011978	GCA	2	6	624639	624644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099597
13055	NC_011978	AAC	2	6	624648	624653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099597
13056	NC_011978	AG	3	6	624699	624704	50 %	0 %	50 %	0 %	222099597
13057	NC_011978	CCAT	2	8	624745	624752	25 %	25 %	0 %	50 %	222099597
13058	NC_011978	GAAA	2	8	624756	624763	75 %	0 %	25 %	0 %	222099597
13059	NC_011978	AGA	2	6	624893	624898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099597
13060	NC_011978	GGT	2	6	624932	624937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099597
13061	NC_011978	TGT	2	6	624971	624976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099597
13062	NC_011978	GTGA	2	8	624987	624994	25 %	25 %	50 %	0 %	222099597
13063	NC_011978	ACA	2	6	625111	625116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099597
13064	NC_011978	ACA	2	6	625150	625155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099597
13065	NC_011978	TGG	2	6	625322	625327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099597
13066	NC_011978	A	6	6	625347	625352	100 %	0 %	0 %	0 %	222099597
13067	NC_011978	AGG	2	6	625368	625373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099597
13068	NC_011978	TCTG	2	8	625384	625391	0 %	50 %	25 %	25 %	222099597
13069	NC_011978	TTC	2	6	625458	625463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099597
13070	NC_011978	GGA	2	6	625541	625546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099597
13071	NC_011978	TCT	2	6	625585	625590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099598
13072	NC_011978	CAG	2	6	625591	625596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099598
13073	NC_011978	CT	3	6	625600	625605	0 %	50 %	0 %	50 %	222099598
13074	NC_011978	CGGA	2	8	625719	625726	25 %	0 %	50 %	25 %	222099598
13075	NC_011978	TCA	2	6	625760	625765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099598
13076	NC_011978	GATG	2	8	625795	625802	25 %	25 %	50 %	0 %	222099598
13077	NC_011978	T	6	6	625820	625825	0 %	100 %	0 %	0 %	222099598
13078	NC_011978	ATC	2	6	625891	625896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099598
13079	NC_011978	TGT	2	6	625904	625909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099598
13080	NC_011978	GAG	2	6	625977	625982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099598
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13082	NC_011978	TGG	2	6	626037	626042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099598
13083	NC_011978	TTC	2	6	626076	626081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099598
13084	NC_011978	TCA	2	6	626137	626142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099598
13085	NC_011978	TC	3	6	626167	626172	0 %	50 %	0 %	50 %	222099598
13086	NC_011978	AGGA	2	8	626202	626209	50 %	0 %	50 %	0 %	222099598
13087	NC_011978	TCCT	2	8	626223	626230	0 %	50 %	0 %	50 %	222099598
13088	NC_011978	T	6	6	626313	626318	0 %	100 %	0 %	0 %	222099598
13089	NC_011978	TA	3	6	626421	626426	50 %	50 %	0 %	0 %	222099598
13090	NC_011978	TTG	2	6	626435	626440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099598
13091	NC_011978	CTCC	2	8	626588	626595	0 %	25 %	0 %	75 %	222099598
13092	NC_011978	TCAT	2	8	626669	626676	25 %	50 %	0 %	25 %	222099598
13093	NC_011978	TCCC	2	8	626679	626686	0 %	25 %	0 %	75 %	222099599
13094	NC_011978	CTT	2	6	626692	626697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099599
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13097	NC_011978	GAT	2	6	626824	626829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099599
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13101	NC_011978	TGA	2	6	627151	627156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099599
13102	NC_011978	CCA	2	6	627166	627171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099599
13103	NC_011978	CTT	2	6	627184	627189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099599
13104	NC_011978	TCT	2	6	627209	627214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099599
13105	NC_011978	AGA	2	6	627216	627221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099599
13106	NC_011978	TCATC	2	10	627229	627238	20 %	40 %	0 %	40 %	222099599
13107	NC_011978	AGA	2	6	627258	627263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099599
13108	NC_011978	GTGGA	2	10	627287	627296	20 %	20 %	60 %	0 %	222099599
13109	NC_011978	TTCT	2	8	627319	627326	0 %	75 %	0 %	25 %	222099599
13110	NC_011978	TC	3	6	627340	627345	0 %	50 %	0 %	50 %	222099599
13111	NC_011978	TGTC	2	8	627346	627353	0 %	50 %	25 %	25 %	222099599
13112	NC_011978	TCTG	2	8	627365	627372	0 %	50 %	25 %	25 %	222099599
13113	NC_011978	TG	3	6	627457	627462	0 %	50 %	50 %	0 %	222099599
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13116	NC_011978	CT	4	8	627605	627612	0 %	50 %	0 %	50 %	222099599
13117	NC_011978	TTC	2	6	627624	627629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099599
13118	NC_011978	TCT	2	6	627646	627651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099599
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13121	NC_011978	TGT	2	6	627844	627849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099599
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13483	NC_011978	CTGAAG	2	12	645817	645828	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222099614
13484	NC_011978	GTC	2	6	645866	645871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099614
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13486	NC_011978	GA	3	6	645910	645915	50 %	0 %	50 %	0 %	222099614
13487	NC_011978	TCT	2	6	645965	645970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099614
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13491	NC_011978	TCT	3	9	646136	646144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099614
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13499	NC_011978	GTT	2	6	646304	646309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099614
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