MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_011978	CCCAC	2	10	552259	552268	20 %	0 %	0 %	80 %	222099525
11503	NC_011978	AG	3	6	552279	552284	50 %	0 %	50 %	0 %	222099525
11504	NC_011978	TCT	2	6	552330	552335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099525
11505	NC_011978	AAC	2	6	552358	552363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099525
11506	NC_011978	CTT	2	6	552379	552384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099525
11507	NC_011978	ATA	2	6	552409	552414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099525
11508	NC_011978	GCT	2	6	552457	552462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099525
11509	NC_011978	GT	3	6	552480	552485	0 %	50 %	50 %	0 %	222099525
11510	NC_011978	CTC	2	6	552544	552549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099525
11511	NC_011978	GGT	2	6	552558	552563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099525
11512	NC_011978	TAC	2	6	552646	552651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099525
11513	NC_011978	GTG	2	6	552664	552669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099525
11514	NC_011978	AGG	2	6	552786	552791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099525
11515	NC_011978	GGT	2	6	552862	552867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099525
11516	NC_011978	CGC	2	6	552891	552896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222099525
11517	NC_011978	GAAAG	2	10	552906	552915	60 %	0 %	40 %	0 %	222099525
11518	NC_011978	TTC	2	6	552947	552952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099525
11519	NC_011978	AC	3	6	552979	552984	50 %	0 %	0 %	50 %	222099525
11520	NC_011978	ATT	2	6	553004	553009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222099525
11521	NC_011978	GGTC	2	8	553014	553021	0 %	25 %	50 %	25 %	222099525
11522	NC_011978	TCT	2	6	553055	553060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099525
11523	NC_011978	ACG	2	6	553061	553066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099525
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11525	NC_011978	CCTT	2	8	553094	553101	0 %	50 %	0 %	50 %	222099525
11526	NC_011978	AGGAT	2	10	553264	553273	40 %	20 %	40 %	0 %	222099526
11527	NC_011978	CAG	2	6	553297	553302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099527
11528	NC_011978	ACC	2	6	553320	553325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099527
11529	NC_011978	GCTC	2	8	553337	553344	0 %	25 %	25 %	50 %	222099527
11530	NC_011978	GAA	2	6	553460	553465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099527
11531	NC_011978	TGA	2	6	553513	553518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099527
11532	NC_011978	TAC	2	6	553731	553736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099527
11533	NC_011978	GAA	3	9	553802	553810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099527
11534	NC_011978	TCG	2	6	553894	553899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099527
11535	NC_011978	GAA	2	6	553923	553928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099527
11536	NC_011978	AGT	2	6	553955	553960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099527
11537	NC_011978	T	6	6	554011	554016	0 %	100 %	0 %	0 %	222099528
11538	NC_011978	CTT	2	6	554032	554037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099528
11539	NC_011978	CTT	2	6	554042	554047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099528
11540	NC_011978	TCA	2	6	554053	554058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099528
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11542	NC_011978	CGA	2	6	554290	554295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099528
11543	NC_011978	GA	3	6	554399	554404	50 %	0 %	50 %	0 %	222099528
11544	NC_011978	TTC	2	6	554409	554414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099528
11545	NC_011978	TCTCTT	2	12	554430	554441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099528
11546	NC_011978	TCGT	2	8	554442	554449	0 %	50 %	25 %	25 %	222099528
11547	NC_011978	TTC	2	6	554513	554518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099528
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11549	NC_011978	TCCGT	2	10	554529	554538	0 %	40 %	20 %	40 %	222099528
11550	NC_011978	AGA	2	6	554565	554570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099528
11551	NC_011978	GAG	2	6	554739	554744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099528
11552	NC_011978	CG	3	6	554836	554841	0 %	0 %	50 %	50 %	222099528
11553	NC_011978	TGGA	2	8	554853	554860	25 %	25 %	50 %	0 %	222099528
11554	NC_011978	TC	3	6	554893	554898	0 %	50 %	0 %	50 %	222099528
11555	NC_011978	CTT	2	6	554917	554922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099528
11556	NC_011978	TGA	2	6	554938	554943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099528
11557	NC_011978	ACGTT	2	10	554949	554958	20 %	40 %	20 %	20 %	222099528
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11559	NC_011978	TCT	2	6	554977	554982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099529
11560	NC_011978	AGA	2	6	554984	554989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099529
11561	NC_011978	GGT	2	6	554998	555003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099529
11562	NC_011978	GAA	2	6	555052	555057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099529
11563	NC_011978	ACACC	2	10	555153	555162	40 %	0 %	0 %	60 %	222099529
11564	NC_011978	ATG	2	6	555170	555175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099529
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11569	NC_011978	TGA	2	6	555390	555395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099529
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11587	NC_011978	GAC	3	9	556236	556244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099530
11588	NC_011978	CGT	2	6	556250	556255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099530
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11591	NC_011978	TCC	2	6	556326	556331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099531
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11601	NC_011978	GGT	2	6	556687	556692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099531
11602	NC_011978	T	6	6	556696	556701	0 %	100 %	0 %	0 %	222099531
11603	NC_011978	CCTT	2	8	556707	556714	0 %	50 %	0 %	50 %	222099531
11604	NC_011978	CCT	2	6	556718	556723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099531
11605	NC_011978	ACTCC	2	10	556741	556750	20 %	20 %	0 %	60 %	222099531
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11608	NC_011978	TAT	2	6	556799	556804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222099531
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11610	NC_011978	CTG	2	6	556892	556897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099532
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11618	NC_011978	CTG	2	6	557318	557323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099532
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11620	NC_011978	GA	3	6	557338	557343	50 %	0 %	50 %	0 %	222099532
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