MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011978	ATG	2	6	235737	235742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099215
5002	NC_011978	GAA	2	6	235753	235758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099215
5003	NC_011978	ATC	2	6	235837	235842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099215
5004	NC_011978	TGGAT	2	10	235868	235877	20 %	40 %	40 %	0 %	222099215
5005	NC_011978	CT	3	6	235886	235891	0 %	50 %	0 %	50 %	222099215
5006	NC_011978	TGA	2	6	235909	235914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099215
5007	NC_011978	CA	3	6	235935	235940	50 %	0 %	0 %	50 %	222099215
5008	NC_011978	CCA	2	6	236062	236067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099215
5009	NC_011978	TGC	2	6	236120	236125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099215
5010	NC_011978	AAC	2	6	236152	236157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099215
5011	NC_011978	TTG	2	6	236239	236244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099215
5012	NC_011978	AGA	2	6	236278	236283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099215
5013	NC_011978	ACC	2	6	236307	236312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099216
5014	NC_011978	ACA	2	6	236508	236513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099216
5015	NC_011978	T	6	6	236521	236526	0 %	100 %	0 %	0 %	222099216
5016	NC_011978	TTC	2	6	236574	236579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099216
5017	NC_011978	ATG	2	6	236592	236597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099216
5018	NC_011978	ATG	2	6	236691	236696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099216
5019	NC_011978	TGCTA	2	10	236708	236717	20 %	40 %	20 %	20 %	222099216
5020	NC_011978	TG	3	6	236736	236741	0 %	50 %	50 %	0 %	222099216
5021	NC_011978	TGC	2	6	236769	236774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099216
5022	NC_011978	CCA	2	6	236860	236865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099216
5023	NC_011978	GTT	3	9	236890	236898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099216
5024	NC_011978	CCT	2	6	236901	236906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099216
5025	NC_011978	CTGG	2	8	236912	236919	0 %	25 %	50 %	25 %	222099216
5026	NC_011978	AT	3	6	237128	237133	50 %	50 %	0 %	0 %	222099216
5027	NC_011978	CGAGT	2	10	237140	237149	20 %	20 %	40 %	20 %	222099216
5028	NC_011978	CAG	2	6	237215	237220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099216
5029	NC_011978	GCAC	2	8	237258	237265	25 %	0 %	25 %	50 %	222099216
5030	NC_011978	TCA	2	6	237313	237318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099216
5031	NC_011978	AGT	2	6	237377	237382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099217
5032	NC_011978	AAT	2	6	237397	237402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099217
5033	NC_011978	CTG	2	6	237599	237604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099217
5034	NC_011978	TAA	2	6	237663	237668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099217
5035	NC_011978	A	6	6	237678	237683	100 %	0 %	0 %	0 %	222099217
5036	NC_011978	TGA	2	6	237765	237770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099217
5037	NC_011978	AGA	2	6	237815	237820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099217
5038	NC_011978	CAA	2	6	238077	238082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099217
5039	NC_011978	GTA	2	6	238176	238181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099218
5040	NC_011978	AAC	2	6	238212	238217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099218
5041	NC_011978	GCT	2	6	238231	238236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099218
5042	NC_011978	AAT	2	6	238250	238255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099218
5043	NC_011978	CAT	2	6	238266	238271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099218
5044	NC_011978	CCA	2	6	238304	238309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099218
5045	NC_011978	ATT	2	6	238366	238371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222099218
5046	NC_011978	TGC	2	6	238437	238442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099218
5047	NC_011978	TCA	2	6	238505	238510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099218
5048	NC_011978	CA	3	6	238513	238518	50 %	0 %	0 %	50 %	222099218
5049	NC_011978	AGA	2	6	238528	238533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099218
5050	NC_011978	TCGCA	2	10	238626	238635	20 %	20 %	20 %	40 %	222099218
5051	NC_011978	ACT	2	6	238744	238749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099218
5052	NC_011978	TCA	2	6	238766	238771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099218
5053	NC_011978	GAT	2	6	238782	238787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099218
5054	NC_011978	GT	3	6	238793	238798	0 %	50 %	50 %	0 %	222099218
5055	NC_011978	AAG	2	6	238983	238988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099218
5056	NC_011978	GTA	2	6	239057	239062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099219
5057	NC_011978	TCT	2	6	239100	239105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099219
5058	NC_011978	TTC	2	6	239268	239273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099219
5059	NC_011978	TTC	2	6	239353	239358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099219
5060	NC_011978	TC	3	6	239361	239366	0 %	50 %	0 %	50 %	222099219
5061	NC_011978	TC	3	6	239410	239415	0 %	50 %	0 %	50 %	222099219
5062	NC_011978	TATT	2	8	239466	239473	25 %	75 %	0 %	0 %	222099219
5063	NC_011978	TTC	2	6	239646	239651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099219
5064	NC_011978	GGA	2	6	239682	239687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099219
5065	NC_011978	TC	3	6	239787	239792	0 %	50 %	0 %	50 %	222099219
5066	NC_011978	AAT	2	6	239939	239944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099219
5067	NC_011978	CTG	2	6	239956	239961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099219
5068	NC_011978	CCACTT	2	12	239980	239991	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222099219
5069	NC_011978	GAA	2	6	240038	240043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099219
5070	NC_011978	CCA	2	6	240046	240051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099219
5071	NC_011978	CAT	2	6	240071	240076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099219
5072	NC_011978	TGG	2	6	240091	240096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099219
5073	NC_011978	ACC	2	6	240157	240162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099219
5074	NC_011978	GAAA	2	8	240681	240688	75 %	0 %	25 %	0 %	222099220
5075	NC_011978	AGG	2	6	240698	240703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099220
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5077	NC_011978	TCT	2	6	240729	240734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099220
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5079	NC_011978	TCCT	2	8	240744	240751	0 %	50 %	0 %	50 %	222099220
5080	NC_011978	CAT	2	6	240752	240757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099220
5081	NC_011978	T	6	6	240784	240789	0 %	100 %	0 %	0 %	222099220
5082	NC_011978	TGA	2	6	240791	240796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099220
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5085	NC_011978	T	6	6	240950	240955	0 %	100 %	0 %	0 %	222099220
5086	NC_011978	AGT	2	6	241064	241069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099220
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5089	NC_011978	CTT	2	6	241222	241227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099220
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5091	NC_011978	AAGC	2	8	241254	241261	50 %	0 %	25 %	25 %	222099220
5092	NC_011978	ATT	2	6	241347	241352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222099220
5093	NC_011978	CTTT	2	8	241364	241371	0 %	75 %	0 %	25 %	222099220
5094	NC_011978	CTC	2	6	241372	241377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099220
5095	NC_011978	CTCTT	2	10	241384	241393	0 %	60 %	0 %	40 %	222099220
5096	NC_011978	CGG	2	6	241493	241498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099220
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5098	NC_011978	GTGAT	2	10	241666	241675	20 %	40 %	40 %	0 %	222099221
5099	NC_011978	ACC	2	6	241683	241688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099221
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5101	NC_011978	GTG	2	6	241773	241778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099221
5102	NC_011978	CGA	2	6	241781	241786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099221
5103	NC_011978	T	7	7	241817	241823	0 %	100 %	0 %	0 %	222099221
5104	NC_011978	AACA	2	8	241848	241855	75 %	0 %	0 %	25 %	222099221
5105	NC_011978	CGG	2	6	241862	241867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222099221
5106	NC_011978	GGT	2	6	241941	241946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099221
5107	NC_011978	A	6	6	242099	242104	100 %	0 %	0 %	0 %	222099221
5108	NC_011978	GCAA	2	8	242212	242219	50 %	0 %	25 %	25 %	222099221
5109	NC_011978	GCAC	2	8	242222	242229	25 %	0 %	25 %	50 %	222099221
5110	NC_011978	AGGA	2	8	242240	242247	50 %	0 %	50 %	0 %	222099221
5111	NC_011978	GAA	2	6	242331	242336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099221
5112	NC_011978	TCG	2	6	242365	242370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099221
5113	NC_011978	AC	3	6	242377	242382	50 %	0 %	0 %	50 %	222099221
5114	NC_011978	GA	3	6	242482	242487	50 %	0 %	50 %	0 %	222099221
5115	NC_011978	GACA	2	8	242522	242529	50 %	0 %	25 %	25 %	222099221
5116	NC_011978	AG	3	6	242535	242540	50 %	0 %	50 %	0 %	222099221
5117	NC_011978	GAG	2	6	242547	242552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099221
5118	NC_011978	GAT	2	6	242610	242615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099221
5119	NC_011978	TGA	2	6	242632	242637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099221
5120	NC_011978	AGA	2	6	242702	242707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099221
5121	NC_011978	CTT	3	9	242771	242779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099222
5122	NC_011978	T	7	7	242778	242784	0 %	100 %	0 %	0 %	222099222
5123	NC_011978	TGT	2	6	242793	242798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099222
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5132	NC_011978	TC	3	6	243372	243377	0 %	50 %	0 %	50 %	222099222
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5246	NC_011978	T	7	7	249238	249244	0 %	100 %	0 %	0 %	222099228
5247	NC_011978	AGA	2	6	249407	249412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099228
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5254	NC_011978	CAG	2	6	249780	249785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099229
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5351	NC_011978	CTT	2	6	255171	255176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099234
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5353	NC_011978	A	6	6	255343	255348	100 %	0 %	0 %	0 %	222099234
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5360	NC_011978	CTTC	2	8	255813	255820	0 %	50 %	0 %	50 %	222099235
5361	NC_011978	GAA	2	6	255833	255838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099235
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5363	NC_011978	C	6	6	255956	255961	0 %	0 %	0 %	100 %	222099235
5364	NC_011978	ACA	2	6	255977	255982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099235
5365	NC_011978	GTTT	2	8	256002	256009	0 %	75 %	25 %	0 %	222099235
5366	NC_011978	AAG	2	6	256039	256044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099235
5367	NC_011978	TCT	2	6	256077	256082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099235
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5490	NC_011978	T	7	7	261571	261577	0 %	100 %	0 %	0 %	222099243
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5492	NC_011978	ATC	2	6	261746	261751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099243
5493	NC_011978	TTC	2	6	261815	261820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099243
5494	NC_011978	CAC	2	6	261871	261876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099243
5495	NC_011978	AAG	3	9	261884	261892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099243
5496	NC_011978	GTT	2	6	261895	261900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099243
5497	NC_011978	TCT	2	6	261916	261921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099243
5498	NC_011978	TTC	2	6	261951	261956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099243
5499	NC_011978	GTG	2	6	262015	262020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099243
5500	NC_011978	GAA	2	6	262084	262089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099243

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