MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga neapolitana DSM 4359 chromosome

Total Repeats: 39321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011978	GAA	2	6	212208	212213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099192
4502	NC_011978	CCA	2	6	212358	212363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099192
4503	NC_011978	T	6	6	212366	212371	0 %	100 %	0 %	0 %	222099192
4504	NC_011978	AGA	2	6	212583	212588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099193
4505	NC_011978	CT	3	6	212593	212598	0 %	50 %	0 %	50 %	222099193
4506	NC_011978	TTC	2	6	212611	212616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099193
4507	NC_011978	TGA	3	9	212642	212650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099193
4508	NC_011978	GAA	2	6	212690	212695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099193
4509	NC_011978	ATG	2	6	212746	212751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099193
4510	NC_011978	CCG	2	6	212807	212812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222099193
4511	NC_011978	CTT	2	6	212841	212846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099193
4512	NC_011978	TC	3	6	212900	212905	0 %	50 %	0 %	50 %	222099194
4513	NC_011978	TCT	2	6	212912	212917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099194
4514	NC_011978	ATCT	2	8	212997	213004	25 %	50 %	0 %	25 %	222099194
4515	NC_011978	TGA	2	6	213008	213013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099194
4516	NC_011978	CTT	3	9	213093	213101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099194
4517	NC_011978	CTC	2	6	213111	213116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099194
4518	NC_011978	ATC	2	6	213244	213249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099194
4519	NC_011978	CTT	2	6	213282	213287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099194
4520	NC_011978	CGA	2	6	213326	213331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099194
4521	NC_011978	CTT	2	6	213398	213403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099194
4522	NC_011978	T	7	7	213408	213414	0 %	100 %	0 %	0 %	222099194
4523	NC_011978	GTA	2	6	213447	213452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099194
4524	NC_011978	ACC	2	6	213484	213489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099194
4525	NC_011978	TTC	2	6	213490	213495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099194
4526	NC_011978	GA	3	6	213553	213558	50 %	0 %	50 %	0 %	222099194
4527	NC_011978	GTA	2	6	213624	213629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099194
4528	NC_011978	TCC	2	6	213668	213673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099194
4529	NC_011978	CGA	2	6	213689	213694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099194
4530	NC_011978	TTC	2	6	213726	213731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099194
4531	NC_011978	GTT	2	6	213765	213770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099194
4532	NC_011978	GA	3	6	213793	213798	50 %	0 %	50 %	0 %	222099194
4533	NC_011978	CAA	2	6	213860	213865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099194
4534	NC_011978	TTTC	2	8	213892	213899	0 %	75 %	0 %	25 %	222099194
4535	NC_011978	TAT	2	6	213942	213947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222099194
4536	NC_011978	A	7	7	214040	214046	100 %	0 %	0 %	0 %	222099195
4537	NC_011978	AAC	2	6	214076	214081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099195
4538	NC_011978	GAAG	2	8	214085	214092	50 %	0 %	50 %	0 %	222099195
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4540	NC_011978	CAA	2	6	215063	215068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099196
4541	NC_011978	A	6	6	215115	215120	100 %	0 %	0 %	0 %	222099196
4542	NC_011978	TCG	2	6	215221	215226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099197
4543	NC_011978	GCC	2	6	215268	215273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222099197
4544	NC_011978	TTTC	2	8	215278	215285	0 %	75 %	0 %	25 %	222099197
4545	NC_011978	GAA	2	6	215304	215309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099197
4546	NC_011978	AGAC	2	8	215312	215319	50 %	0 %	25 %	25 %	222099197
4547	NC_011978	TTG	2	6	215323	215328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099197
4548	NC_011978	TCC	2	6	215492	215497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099197
4549	NC_011978	GTG	2	6	215559	215564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099197
4550	NC_011978	AAG	2	6	215678	215683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099197
4551	NC_011978	CAG	2	6	215736	215741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099197
4552	NC_011978	AG	3	6	215769	215774	50 %	0 %	50 %	0 %	222099197
4553	NC_011978	TCA	2	6	215800	215805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099197
4554	NC_011978	GAGG	2	8	215831	215838	25 %	0 %	75 %	0 %	222099197
4555	NC_011978	GAAAA	2	10	215848	215857	80 %	0 %	20 %	0 %	222099198
4556	NC_011978	GTA	2	6	215864	215869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222099198
4557	NC_011978	TTC	2	6	215893	215898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099198
4558	NC_011978	TCA	2	6	215943	215948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099198
4559	NC_011978	TCA	2	6	215958	215963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099198
4560	NC_011978	GAA	2	6	216022	216027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099198
4561	NC_011978	CTCA	2	8	216052	216059	25 %	25 %	0 %	50 %	222099198
4562	NC_011978	TTG	2	6	216096	216101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099198
4563	NC_011978	GAAA	2	8	216109	216116	75 %	0 %	25 %	0 %	222099198
4564	NC_011978	GGA	2	6	216135	216140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099198
4565	NC_011978	TTG	2	6	216162	216167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222099198
4566	NC_011978	CT	3	6	216345	216350	0 %	50 %	0 %	50 %	222099198
4567	NC_011978	TGGAC	2	10	216379	216388	20 %	20 %	40 %	20 %	222099198
4568	NC_011978	GA	3	6	216427	216432	50 %	0 %	50 %	0 %	222099198
4569	NC_011978	TAC	2	6	216434	216439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099198
4570	NC_011978	TCCTC	2	10	216443	216452	0 %	40 %	0 %	60 %	222099198
4571	NC_011978	TTC	2	6	216461	216466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099198
4572	NC_011978	CTT	2	6	216541	216546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099198
4573	NC_011978	AAG	2	6	216572	216577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099198
4574	NC_011978	ACG	2	6	216578	216583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099198
4575	NC_011978	CGT	2	6	216607	216612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222099198
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4577	NC_011978	TCA	2	6	216621	216626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099198
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4581	NC_011978	A	6	6	216659	216664	100 %	0 %	0 %	0 %	222099198
4582	NC_011978	CG	3	6	216719	216724	0 %	0 %	50 %	50 %	222099198
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4587	NC_011978	GTG	2	6	216926	216931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099198
4588	NC_011978	AGGA	2	8	216951	216958	50 %	0 %	50 %	0 %	222099198
4589	NC_011978	CAA	2	6	216967	216972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222099198
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4593	NC_011978	GAAG	2	8	217087	217094	50 %	0 %	50 %	0 %	222099198
4594	NC_011978	GTG	2	6	217153	217158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099198
4595	NC_011978	CT	3	6	217184	217189	0 %	50 %	0 %	50 %	222099198
4596	NC_011978	AAG	2	6	217252	217257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099198
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4601	NC_011978	CTTT	2	8	217532	217539	0 %	75 %	0 %	25 %	222099198
4602	NC_011978	TAC	2	6	217613	217618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099198
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4604	NC_011978	GGAAC	2	10	217682	217691	40 %	0 %	40 %	20 %	222099198
4605	NC_011978	ACT	2	6	217731	217736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099198
4606	NC_011978	CT	3	6	217760	217765	0 %	50 %	0 %	50 %	222099198
4607	NC_011978	TTC	2	6	217782	217787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222099198
4608	NC_011978	AG	4	8	217788	217795	50 %	0 %	50 %	0 %	222099198
4609	NC_011978	GT	3	6	217815	217820	0 %	50 %	50 %	0 %	222099198
4610	NC_011978	GGT	2	6	217832	217837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222099198
4611	NC_011978	TC	3	6	217864	217869	0 %	50 %	0 %	50 %	222099198
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4615	NC_011978	GAG	2	6	217986	217991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222099198
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4620	NC_011978	AGA	2	6	218167	218172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099199
4621	NC_011978	CAC	2	6	218194	218199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099199
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4623	NC_011978	ATC	2	6	218288	218293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099199
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4992	NC_011978	ACC	2	6	234939	234944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222099214
4993	NC_011978	CAG	2	6	235162	235167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222099214
4994	NC_011978	TCC	2	6	235169	235174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222099214
4995	NC_011978	TAC	2	6	235223	235228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222099214
4996	NC_011978	C	6	6	235262	235267	0 %	0 %	0 %	100 %	222099214
4997	NC_011978	TG	3	6	235277	235282	0 %	50 %	50 %	0 %	222099214
4998	NC_011978	AGA	2	6	235556	235561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222099215
4999	NC_011978	ATA	2	6	235567	235572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222099215
5000	NC_011978	CATT	2	8	235600	235607	25 %	50 %	0 %	25 %	222099215

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